中科院-實驗室概況
中國科學院重點實驗室是中國科學院基礎研究和高技術創新的重要力量，其定位與作用如路甬祥院長所示“開放實驗室是我院基礎研究和高技術前沿探索的核心和生長點，也是研究所的學術精華和前沿所在”，為適應科技發展的需要，原“中國科學院開放研究實驗室”更名為“中國科學院重點實驗室”。進入創新試點序列的研究所從事基礎性研究的單元均應按照重點實驗室的模式管理運行，條件成熟時可申請成為院重點實驗室。院擬在若干重點領域組建新的重點實驗室，如量子信息、光通訊、寬頻網路、(超級計算機)、光電子學與雷射技術、微機電系統、先進制造技術、分子納米結構、電離層物理、核物理、電漿物理、材料力學與材料設計、空間光學、生物信息學、組織工程與治療性克隆、腦智與認知科學、營養與健康、病毒學、中藥現代化、功能基因組、動物克隆與轉基因、生物能源與生物質轉化、離子束生物工程、分子生態學、環境與健康、清潔能源、化學地球動力學、礦物資源探查、陸地表層系統過程、海洋動力學、海洋環境、風沙物理與環境、精準農業、草原生態與畜牧、森林生態、濕地生態、綠洲生態、青藏高原生態與資源等。中國科學院重點實驗室體系現有162個實驗室，其中包括國家在中國科學院建設的10個國家實驗室、7個國家工程實驗室、75個國家重點實驗室（含與教育部部的4個聯合室，因中科大為中科院直屬高校，所以中科大重點實驗室劃歸中科院系統）、70個院重點實驗室。
中國科學院歷來重視加強基礎研究基地的建設，作
根據院知識創新工程試點工作的總體部署，面向世界科學前沿，面向國家戰略需求，堅持基礎性研究定位，堅持“開放、流動、聯合、競爭”運行機制，進一步培育交叉和前沿學科方向，進一步加強實驗室體系建設，適度擴大總體規模，最佳化學科結構布局，完善淘汰更新機制，加強資源綜合集成，成為我國基礎研究和高技術
堅持以人為本；堅持實驗室、項目、人才緊密結合；加強原始創新與技術創新有機聯繫。
發展目標總數達到160個左右，其中國家實驗室6至7個，國家重點實驗室70個左右，約20個成為世界公認的著名高水平實驗室，5至8個達到國際一流水平，形成學科齊全、布局合理的重點實驗室體系，在若干重要領域和方向進入國際前沿，取得一批有重大國際影響的原創性科研成果；在高技術領域，取得若干對我國經濟發展、國防建設和社會進步具有重大戰略意義的技術突破，成為我國具有國際先進水平的原始性知識創新和戰略性技術創新的重要基地。
重點任務圍繞重點發展領域，結合研究所學科定位和科技創新目標，推進重點實驗室學科布局與組織結構調整，撤消整合一批，新建升級一批，重點支持一批。
中科院-國家實驗室
| 序號 | 實驗室名稱 | 依託單位 |
| 1 | 北京正負電子對撞機國家實驗室 | 中科院高能物理研究所 |
| 2 | 蘭州重離子加速器國家實驗室 | 中國科學院蘭州近代物理研究所 |
| 3 | 國家同步輻射實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 4 | 瀋陽材料科學國家聯合實驗室 | 中國科學院金屬研究所 |
| 5 | 合肥微尺度物質科學國家實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 6 | 北京凝聚態物理國家實驗室 | 中國科學院物理研究所 |
| 7 | 北京分子科學國家實驗室 | 北京大學、中國科學院化學研究所 |
| 8 | 潔淨能源國家實驗室 | 中科院大連化學物理研究所 |
| 9 | 磁約束核聚變國家實驗室 | 中科院合肥物科院，西南核物理研究院 |
| 10 | 蛋白質科學國家實驗室 | 中國科學院生物物理研究所 |
中科院-國家重點實驗室
中科院-國家工程實驗室
| 序號 | 實驗室名稱 | 依託單位 |
| 1 | 工業酶國家工程實驗室 | 中國科學院微生物研究所等 |
| 2 | 中藥標準化技術國家工程實驗室 | 中國科學院上海藥物所 |
| 3 | 甲醇制烯烴國家工程實驗室 | 中國科學院大連化物所等 |
| 4 | 煤炭間接液化國家工程實驗室 | 中國科學院山西煤化所 |
| 5 | 信息內容安全技術國家工程實驗室 | 中國科學院計算技術研究所 |
| 6 | 遙感衛星套用國家工程實驗室 | 中國科學院遙感套用研究所等 |
| 7 | 真空技術裝備國家工程實驗室 | 中國科學院瀋陽科學儀器研製中心等 |
中科院-院重點實驗室
| 序號 | 實驗室名稱 | 依託單位 |
| 1 | 中國科學院半導體材料科學重點實驗室 | 中國科學院半導體研究所 |
| 2 | 中國科學院邊緣海地質重點實驗室 | 中科院廣州地球化學所、南海海洋所 |
| 3 | 中國科學院材料力學行為和設計重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 4 | 中國科學院材料物理重點實驗室 | 中國科學院合肥物質科學研究院 |
| 5 | 中國科學院系統生物學重點實驗室 | 中國科學院上海生命科學研究院 |
| 6 | 中國科學院電子顯微鏡重點實驗室 | 中國科學院物理研究所 |
| 7 | 中國科學院東亞區域氣候-環境重點實驗室 | 中國科學院大氣物理研究所 |
| 8 | 中國科學院動力大地測量學重點實驗室 | 中國科學院測量與地球物理研究所 |
| 9 | 中國科學院分子發育生物學重點實驗室 | 中國科學院遺傳與發育生物學研究所 |
| 10 | 中國科學院分子納米結構與納米技術重點實驗室 | 中國科學院化學研究所 |
| 11 | 中國科學院分子細胞生物學重點實驗室 | 中科院上海生命科學研究院（生化所） |
| 12 | 中國科學院複雜系統與智慧型科學重點實驗室 | 中國科學院自動化研究所 |
| 13 | 中國科學院幹細胞生物學重點實驗室 | 中國科學院上海生命科學研究院 |
| 14 | 中國科學院高功率微波與電磁輻射重點實驗室 | 中國科學院電子學研究所 |
| 15 | 中國科學院高溫氣體動力學重點實驗室 | 中國科學院力學研究所 |
| 16 | 中國科學院工程地質力學重點實驗室 | 中國科學院地質與地球物理研究所 |
| 17 | 中國科學院工程塑膠重點實驗室 | 中國科學院化學研究所 |
| 18 | 中國科學院管理、決策與信息系統重點實驗室 | 中國科學院數學與系統科學研究院 |
| 19 | 中國科學院光合作用與環境分子生理學重點實驗室 | 中國科學院植物研究所 |
| 20 | 中國科學院光化學重點實驗室 | 中國科學院化學研究所 |
| 21 | 中國科學院天文光學技術重點實驗室 | 中科院國家、上海、雲南天文台 |
| 22 | 中國科學院光學物理重點實驗室 | 物理研究所 |
| 23 | 中國科學院海洋生態與環境科學重點實驗室 | 海洋研究所 |
| 24 | 中國科學院核分析技術重點實驗室 | 中科院上海套用物理、高能物理所 |
| 25 | 中國科學院環境光學與技術重點實驗室 | 中國科學院合肥物科學研究院 |
| 26 | 中國科學院激發態物理重點實驗室 | 中國科學院長春光學精機械與物理所 |
| 27 | 中國科學院基礎電漿物理重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 28 | 中國科學院極端條件物理重點實驗室 | 中國科學院物理研究所 |
| 29 | 中國科學院膠體與界面科學重點實驗室 | 中國科學院化學研究所 |
| 30 | 中國科學院結構分析重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 31 | 中國科學院結構生物學重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 32 | 中國科學院可再生能源與天然氣水合物重點實驗室 | 中國科學院廣州能源研究所 |
| 33 | 中國科學院礦產資源研究重點實驗室 | 中國科學院地質與地球物理研究所 |
| 34 | 中國科學院離子束生物工程學重點實驗室 | 中國科學院合肥物質科學研究院 |
| 35 | 中國科學院離子束重點實驗室 | 中國科學院上海微系統與信息技術所 |
| 36 | 中國科學院粒子天體物理重點實驗室 | 中國科學院高能物理所 |
| 37 | 中國科學院量子光學重點實驗室 | 中國科學院上海光學精密機械研究所 |
| 38 | 中國科學院量子信息重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 39 | 中國科學院陸地生態過程重點實驗室 | 中國科學院瀋陽套用生態研究所 |
| 40 | 中國科學院陸地水循環及地表過程重點實驗室 | 中國科學院地理科學與資源研究所 |
| 41 | 中國科學院氣體地球化學重點實驗室 | 中國科學院地質與地球物理研究所 |
| 42 | 中國科學院殼幔物質與環境重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 43 | 中國科學院熱帶海洋環境動力學重點實驗室 | 中國科學院南海海洋研究所 |
| 44 | 中國科學院沙漠與沙漠化重點實驗室 | 中國科學院寒區旱區環境與工程所 |
| 45 | 中國科學院山地災害與地表過程重點實驗室 | 中國科學院成都山地災害與環境所 |
| 46 | 中國科學院射電天文重點實驗室 | 中科院紫金山、上海、國家天文台 |
| 47 | 中國科學院生態系統網路觀測與模擬重點實驗室 | 中國科學院地理科學與資源研究所 |
| 48 | 中國科學院實驗海洋生物學重點實驗室 | 中國科學院海洋研究所 |
| 49 | 中國科學院數學機械化重點實驗室 | 中國科學院數學與系統科學研究院 |
| 50 | 中國科學院炭材料重點實驗室 | 山西煤炭化學研究所 |
| 51 | 中國科學院同位素年代學和地球化學重點實驗室 | 中國科學院廣州地球化學研究所 |
| 52 | 中國科學院系統控制重點實驗室 | 中國科學院數學與系統科學研究院 |
| 53 | 中國科學院纖維素化學重點實驗室 | 中國科學院廣州化學有限公司 |
| 54 | 中國科學院選鍵化學重點實驗室 | 中國科學技術大學 |
| 55 | 中國科學院套用超導重點實驗室 | 中國科學院電工研究所 |
| 56 | 中國科學院有機氟化學重點實驗室 | 中國科學院上海有機化學研究所 |
| 57 | 中國科學院有機固體重點實驗室 | 中國科學院化學研究所 |
| 58 | 中國科學院真菌、地衣系統學重點實驗室 | 中國科學院微生物研究所 |
| 59 | 中國科學院真空物理重點實驗室 | 中國科學院物理研究所 |
| 60 | 中國科學院智慧型信息處理重點實驗室 | 中國科學院計算技術研究所 |
| 61 | 中國科學院動物生態與保護生物學重點實驗室 | 中國科學院動物研究所 |
| 62 | 中國科學院基因組科學與信息重點實驗室 | 中國科學院基因組研究所 |
| 63 | 中國科學院生物多樣性與生物地理學重點實驗室 | 中國科學院昆明植物研究所 |
| 64 | 中國科學院海洋生物資源可持續利用重點實驗室 | 中國科學院南海海洋研究所 |
| 65 | 中國科學院計算機系統結構重點實驗室 | 中國科學院計算技術研究所 |
| 66 | 中國科學院無線感測網與通信重點實驗室 | 中科院上海微系統與信息技術所 |
| 67 | 中國科學院特種無機塗層重點實驗室 | 中國科學院上海矽酸鹽研究所 |
| 68 | 中國科學院光電材料化學與物理重點實驗室 | 中國科學院福建物質結構研究所 |
| 69 | 中國科學院先進能源動力重點實驗室 | 中國科學院工程熱物理研究所 |
| 70 | 中國科學院綠色過程與工程重點實驗室 | 中國科學院過程工程研究所 |
