總述
南直隸是明朝處於南方、直隸中央六部的府和直隸州的區域的總稱。明洪武初年建都南京應天府，將應天、蘇州、鳳陽等14個府和直隸州直屬中央六部，稱為直隸，區域大致相當於今江蘇、安徽、上海。
永樂初年移都北京(今北京市)後，撤消北平布政使司，將北平布政使司所轄府和州直隸州也直隸中央六部，遂稱北直隸，簡稱北直，區域大致相當於今北京、天津、河北等市省；原直隸區域遂改稱南直隸,簡稱南直。
辯誤
1、綜述
明朝的南、北直隸是一種特殊的存在，很多人都把南、北直隸認為是一種政區，其實是一種很大的誤解。南北直隸的府和直隸州與十三布政使司一樣，都是直接歸中央六部管轄的。南直隸是南京及附近府和直隸州的統稱；北直隸則是京師及附近府和直隸州的統稱。這個誤解就和把湖北省的江漢地區理解成一個政區一樣。
江漢地區只是一個統稱，包括仙桃、潛江、天門三市，三市都是縣級市，都直屬湖北省。
南北直隸也一樣，只是兩個統稱，北直八府二直隸州，南直十四府四直隸州，都是府級，也都直屬中央六部。
當然，二者之間還是有些不同的，如江漢地區有共同的中院，而南北直隸各府州的上級司法機構就是刑部了。
2、註解及歷史緣由
南北直隸本身沒有官署、沒有機構、沒有行政長官，順天府、應天府雖然是京府，但也還是府級，府尹是不能管其他府州的。沒官署、沒機構、沒長官自然就不能稱之為政區了。實際上，直隸用於現在的話說，就是“直接管轄的區域”，北直隸的意思就是“北邊(中央)直轄的區域”。
其實這一制度還源自元朝，我們的地圖上一般把元朝中書省直轄區域就用“中書省”表示，元朝的中書省用現在的話說，就是“國務院”。元朝對這一區域則用“腹里”一詞表示，明朝改用“直隸”表示。
後來撤消北平布政、按察兩司後，原直隸改稱南直隸，簡稱南直；而北平兩司原轄區域也是直轄區，因此稱為北直隸，簡稱北直。(同時撤消的還有北平都司，原轄衛所也由後軍都督府直隸了)
至於《明史》中的京師、南京嚴格的說也是錯誤的，因為京師指京師城，南京指南京城，它們本身也都不是政區。只能說用京師代指北直、用南京代指南直。
3、從“道”來分析
南北直隸也有巡道和守道，但正因為南北直隸不是政區，所以各道的參政、參議、副使、僉事們只能掛靠在鄰近的兩司。其中：北直隸密雲、大名、天津、霸州四道，由山東帶管；易州、口北、昌平、井陘、薊州、永平等六道，由山西帶管。
南直隸太倉、潁州、徐州三道，由山東帶管；蘇松、漕儲、常鎮、廬鳳、徽寧池太、淮揚六道，由浙江、江西、湖廣帶管
4、從中央戶部的職權分析
戶部：明朝戶部分十三清吏司，按布政司劃分，每個清吏司管本布政司的事務，另兼管中央部門、南京部門、都司衛所、五城、特殊機構如鹽司糧倉稅關等和南北直府州的事務。其中：北直八府二州事務歸福建司管(福建司還管福建八府一州，福建都司、行都司、大寧都司、萬全都司等事務，基本上北直事務也都歸福建司管了，當然還管一些重要糧倉等)。
南直十四府四州事務歸四川司管(四川司還管四川的府州、四川都司、行都司、中都留守司等事務，基本上南直事務也都歸四川司管了)。
到了清朝，直隸省(於北直設立)事務仍歸福建司；設江南省後，江南省(於南直設立)事務才劃歸新設的江南司管。
5、從中央刑部的職權分析
刑部：明朝刑部和戶部一樣，分十三清吏司，按本按察司(和布政司分區相同)劃分，每個清吏司管本按察司的事務，另兼管中央部門、南京部門、都司衛所、王府、五城、特殊機構如鹽司等和南北直府州的事務。其中：北直順天、永平、廣平三府歸雲南司管，保定、河間、真定、順德四府、保全州歸貴州司管，大名府歸四川司管，延慶州歸廣東司管。
南直應天府歸廣東司管，淮安、揚州二府歸河南司管，安慶、徽州二府歸廣西司管，寧國、池州二府歸湖廣司管，蘇州府歸貴州司管，松江府歸四川司管，廬州府歸江西司管，太平府歸陝西司管，鳳陽府、滁州歸山東司管，鎮江府、徐州歸山西司管，常州府、廣德州歸福建司管，和州歸浙江司管。
其中廣東、貴州、四川三司同時管有南北直的府州。
到了清朝，直隸省事務劃歸新設的直隸司；江南省事務劃歸新設的江南司，分成江蘇、安徽二省後，也將江南司分成江蘇、安徽兩司。
6、從中央監察御史的職權分析
監察御史：明朝監察御史分十三道，按布按兩司劃分，每道管本司事務，另兼管中央部門、南京部門、都司衛所、王府、五城、特殊機構如鹽司、土司等和南北直府州的事務。其中：北直順天、永平、廣平三府歸雲南道管，保定、真定二府歸廣西道管，河間、順德二府、保全州歸貴州道管，大名府歸河南道管，延慶州歸廣東道管
南直應天府歸廣東道管，常州、池州二府歸福建道管，安慶、徽州歸廣西道管，鎮江、太平二府歸山西道管，鳳陽府、徐、滁二州歸山東道管，松江府、廣德州歸四川道管，蘇州府歸貴州道管，揚州府歸河南道管，廬州府歸浙江道管，淮安府歸江西道管，寧國府歸湖廣道管，和州歸陝西道管
其中廣東、河南、廣西、貴州四道同時管有南北直的府州。
到了清朝，直隸省事務劃歸河南道，後劃京畿道；江南省事務劃歸新設的江南道。
7、結語
這從上面可以看出來，在區域涉及地方具體事務的中央衙門中，南北直各府州都是由中央直管的，而且每個部門管得還不一樣。府、直隸州的歷史與變更
南直隸：元屬江浙行中書省、淮南江北行中書省、河南江北行中書省。龍鳳元年(元至正十五年，1355)太平路改置太平府；
二年(1356)集慶路、鎮江路、廣德路分別改置應天府、江淮府、廣興府；
同年宋置江南行中書省，治應天府，轄應天府、太平府、江淮府、廣興府、常州路、揚州路、廬州路、安慶路；
同年江淮府更名鎮江府；
三年(1357)常州路改置長春府，尋更名常州府；寧國路、徽州路分別改置寧國府、新安府來屬；揚州路改置淮海府；
六年(1360)信州路改置廣信府，與鉛山直隸州來屬；
七年(1361)寧國府更名宣城府；池州路改置九華府，尋更名池州府來屬；安慶路改置寧江府；淮海府更名維揚府；饒州路改置鄱陽府來屬；
八年(1362)寧江府更名安慶府；鄱陽府更名饒州府，與廣信府、鉛山直隸州另屬江西行省；
十年(1364)置中書省，省江南行省入，所轄直屬中書省，俗稱直隸；
同年置江淮行中書省，治廬州府，廬州路改置廬州府來屬江淮行省；
十二年(1366)維揚府、宣城府分別更名揚州府、宣州府；淮安路、高郵府、安豐路來屬江淮行省；
同年省江淮行省入中書省，同時安豐路、淮安路分別改置壽春府、淮安府；同年湖州路、嘉興路分別改置湖州府、
嘉興府來屬；
吳元年(1367)壽春府降散州，濠州升臨濠府；新安府、宣州府分別更名徽州府、寧國府；平江路改置蘇州府，
與松江府來屬；
洪武元年(1368)高郵府降散州；同年定應天府為南京，為國都；
二年(1369)定臨濠府為中都，泗州、壽州分別升泗州直隸州、壽州直隸州；
四年(1371)泗州直隸州、壽州直隸州俱降散州；廣興府降廣德直隸州；
六年(1373)臨濠府更名中立府；七年(1374)中立府更名鳳陽府；
十一年(1378)改南京為京師；
十三年(1380)廢中書省，中書省直轄府州改為直屬六部，仍俗稱直隸；
十四年(1381)徐州升為徐州直隸州；湖州府、嘉興府另屬浙江行省；
二十二年(1389)和州、滁州分別升和州直隸州、滁州直隸州；
永樂十九年(1421)改京師為南京，直隸改稱南直隸；
洪熙元年(1425)復改南京為京師；
正統六年(1441)復改京師為南京；
萬曆末年常州府更名嘗州府。
應天府
府治在今江蘇省南京市轄附郭縣：上元縣、江寧縣
其他轄縣：句容縣、溧陽縣、溧水縣、高淳縣、江浦縣、六合縣
鳳陽府
府治在今安徽省鳳陽縣轄附郭縣：鳳陽縣
其他轄縣：臨淮縣、懷遠縣、定遠縣、五河縣、虹縣
屬州及其轄縣：壽州（霍丘縣、蒙城縣）；泗州（盱眙縣、天長縣）、宿州（靈璧縣）、潁州（潁上縣、太和縣）、亳州
淮安府
府治在今江蘇省淮安市楚州區（原縣級淮安市）轄附郭縣：山陽縣
其他轄縣：清河縣（淮陰）、鹽城縣、安東縣、桃源縣、沭陽縣
屬州及其轄縣：海州（贛榆縣）、邳州（宿遷縣、睢寧縣）
揚州府
府治在今江蘇省揚州市轄附郭縣：江都縣
其他轄縣：儀真縣、泰興縣
屬州及其轄縣：高郵州（寶應縣、興化市）、泰州（如皋縣）、通州（海門市）
蘇州府
府治在今江蘇省蘇州市轄附郭縣：吳縣、長洲縣
其他轄縣：吳江縣、崑山縣、常熟縣、嘉定縣
屬州及其轄縣：太倉州（崇明縣）
松江府
府治在今上海市松江區轄附郭縣： 華亭縣
其他轄縣：上海縣、青浦縣
常州府
府治在今江蘇省常州市轄附郭縣： 武進縣
其他轄縣：無錫縣、宜興縣、江陰縣、靖江縣
鎮江府
府治在今江蘇省鎮江市轄附郭縣： 丹徒縣
其他轄縣：丹陽縣、金壇縣
廬州府
府治在今安徽省合肥市轄附郭縣：合肥縣
其他轄縣：舒城縣、廬江縣
屬州及其轄縣：無為州（巢縣）、六安州（英山縣、霍山縣）
安慶府
府治在今安徽省安慶市轄附郭縣：懷寧縣
其他轄縣：桐城縣、灊山縣、太湖縣、宿松縣、望江縣
太平府
府治在今安徽省當塗縣轄附郭縣：當塗縣
其他轄縣：蕪湖縣、繁昌縣
池州府
府治在今安徽省池州市轄附郭縣： 貴池縣
其他轄縣：青陽縣、銅陵縣、石埭縣、建德縣、東流縣
寧國府
府治在今安徽省宣城市轄附郭縣：宣城縣
其他轄縣：南陵縣、涇縣、寧國縣、旌德縣、太平縣
徽州府
府治在今安徽省歙縣轄附郭縣：歙縣
其他轄縣：休寧縣、婺源縣、祁門縣、黟縣、績溪縣
徐州
州治在今江蘇省徐州市其他轄縣：蕭縣、沛縣、豐縣、碭山縣
滁州
州治在今安徽省滁州市其他轄縣：全椒縣、來安縣
和州
州治在今安徽省和縣其他轄縣：含山縣
廣德州
州治在今安徽省廣德縣其他轄縣：建平縣
