形態特徵
水鼠耳蝠水鼠耳蝠體形小，但較須鼠耳蝠稍大，前臂長35.5毫米。耳正常，不甚狹長，其外側邊緣顯凹形，外緣有8個皺褶，耳向前折轉不達吻端。耳屏狹長，前緣呈直線形，後緣中間凸，先端鈍圓，其長為耳長之半，基部寬。距細長無距緣膜，不具櫛狀短毛，但有稀少灰白短毛。脛長約為15.2毫米，後足甚發達，其長（連爪）逾脛長之半（6%）。尾較短，尾突不超過2.5毫米。
水鼠耳蝠全身被以木褐色短絨毛，尖端有光澤，較須鼠耳蝠平齊。上體被木褐色短毛。毛基較毛尖的褐色稍淡，下體胸部、腹部、喉部、鼠蹊部、側體均被黑灰色短絨毛，其尖端灰白色，故下體呈灰黑色混雜灰白色。翼膜亦木褐色。
水鼠耳蝠頭骨較小，吻部祖短。腦顱圓而光滑，近額骨部顯著隆起。眶間寬闊，約等於後頭寬之半。聽泡發達，可見明顯的螺旋狀骨迷路。顱骨人字嵴不甚明顯。
水鼠耳蝠上頜犬齒及前臼齒銳利。上頜大前臼齒（Pm ）與犬齒之間距離較窄。Pm 緊靠犬齒，稍靠近齒列線。下頜臼齒有小而明顯的原小尖。下頜Pm亦小於Pm，並位於齒列線中。下頜犬齒超出大前臼齒（Pm）之高度。齒式=38。
棲息環境
水鼠耳蝠的棲息場所包括樹洞和木材建築物（木製水樓或房頂棚），垂直海拔為800-1500米，棲息環境除適宜的溫度外，要求黑暗、寂靜、空氣流通，有房梁與木棟橫桿，出入飛行方便等。
生活習性
水鼠耳蝠往往有其它種類共同棲窟，如貴州菊頭蝠、絨毛菊頭蝠、大蹄蝠和中蹄蝠等。通常由幾十隻形成不太大的群，有時20多隻的雌、雄、幼獸棲息在一處。隱蔽地的溫度可達36-38℃。它們白天很少活動，後肢將軀體掛起，有的匍匐而棲，當受到驚動或刺激時，耳殼稍稍豎起，耳尖向後彎曲，母獸即先飛起，幼獸或咬住母獸乳頭，並用爪抓著母獸腹部隨母獸飛出，飛行時發出響亮的叫聲。
當黃昏夜幕降臨（6月-7月）20點左右，水鼠耳蝠從縫隙爬出突然下跌，同時展翅飛行，飛行緩慢而平穩；遇到昆蟲時，可突然轉彎360度。它們在大樹林緣上空、草地，水塘上空貪婪地覓食，食量甚大，食膜翅目或鞘翅目的昆蟲，午夜返回棲息地，用指爪鉤掛實物而爬入隱蔽所縫隙，凌晨3-4點又出來覓食。
分布範圍
分布於阿爾巴尼亞、安道爾、奧地利、白俄羅斯、比利時、保加利亞、中國、克羅地亞、捷克共和國、丹麥、愛沙尼亞、芬蘭、法國、德國、希臘、匈牙利、印度、愛爾蘭、義大利、日本、哈薩克斯坦、朝鮮民主主義人民共和國、韓國、拉脫維亞、列支敦斯登、立陶宛、盧森堡、馬其頓、摩爾多瓦、黑山、荷蘭、挪威、波蘭、葡萄牙、羅馬尼亞、俄羅斯聯邦、聖馬利諾、塞爾維亞、斯洛伐克、斯洛維尼亞、西班牙、瑞典、瑞士、土耳其、烏克蘭、英國。
在中國分布於江蘇、浙江、安徽、江西、福建、海南、四川、雲南、貴州等地。
水鼠耳蝠繁殖方式
水鼠耳蝠秋季交配，卵子不立刻受精，精細胞保存在雌體輸卵管內到翌年春天，當食物（ 昆蟲） 出現時，才進行受精開始卵裂，胚胎髮育。5-7月產仔，每胎1仔，2個月後發育成熟。
亞種分化
| 序號 | 中文名 | 學名 | 命名者與年代 |
| 1 | 水鼠耳蝠指名亞種 | Myotis daubentonii daubentonii | Kuhl, 1817 |
| 2 | 水鼠耳蝠福建亞種 | Myotis daubentonii laniger | Crespon, 1844 |
| 3 | 水鼠耳蝠東北亞種 | Myotis daubentonii loukashkini | Shamel, 1942 |
（資料來源： ）
種群現狀
種群分布不零散。該種在其分布區內數量非常多，是許多地方從1950年記錄起種群數量一直保持增長的唯一蝙蝠物種。其種群數量仍呈上升趨勢，而且沒有面臨的主要威脅。
保護級別
列入《世界自然保護聯盟》（IUCN）2008年瀕危物種紅色名錄ver 3.1——無危（LC）。
翼手目百科(二）
| 翼手目是哺乳動物中僅次於齧齒目動物的第二大類群,現生種共有19科185屬962種,除極地和大洋中的一些島嶼外,分布遍於全世界。 |
