無頜總綱
盲鰻綱盲鰻目 Myxiniformes - 盲鰻
鰭甲魚綱
Order Arandaspidiformes †
Order Pteraspidiformes †
花鱗魚目 Thelodontiformes †
七鰓鰻目 Petromyzontiformes - 八目鰻
缺甲魚目 Anaspidiformes †
鎧甲魚目 Galeaspidiformes †
頭甲魚目 Cephalaspidiformes †
有頜總綱
盾皮魚綱蔭鰩魚目 Rhenaniformes †
胴甲魚目 Antiarchiformes †
棘胸甲魚目 Acanthothoraciformes †
褶齒魚目 Ptyctodontiformes †
瓣甲魚目 Petalichthyiformes †
葉鱗魚目 Phyllolepiformes †
節甲魚目 Arthrodiriformes †
全頭亞綱 Holocephali
Superorder Paraselachimorpha †
枕鰭鮫目 Iniopterygiformes †
瓣齒鯊目 Petalodontiformes †
Order Eugeneodontiformes †
口鯊目 Orodontiformes †
Order Desmiodontiformes †
爪齒鮫目 Helodontiformes †
全頭總目 Holocephalimorpha
Order Cochliodontiformes †
Order Menaspiformes †
銀鮫目 Chimaeriformes
板鰓亞綱 Elasmobranchii
裂口鯊總目 Cladoselachimorpha †
裂口鯊目 Cladoselachiformes †
異棘鯊總目 Xenacanthimorpha †
異棘鯊目 Xenacanthiformes †
鮫總目 Euselachii (=Selachimorpha)
Order Ctenacanthiformes †
弓鮫目 Hybodontiformes †
異齒鮫目 Heterodontiformes - 異齒鮫
須鮫目 Orectolobiformes - 鯨鯊、護士鯊
白眼鮫目 Carchariniformes - 白眼鮫、雙髻鯊
鯖鮫目 Lamniformes - 大白鯊、姥鯊、長尾鯊
六鰓鮫目 Hexanchiformes
角鮫目 Squaliformes
扁鮫目 Squatiniformes - 扁鯊
鋸鮫目 Pristiophoriformes - 鋸鯊
鰩目 Rajiformes - 鰩、鱝、뚉
柵棘魚目 Climatiiformes †
棘魚目 Acanthodiformes †
銼棘魚科 Ischnacanthiformes †
肉鰭魚亞綱 Sarcopterygii腔棘下綱 Coelacanthimorpha
腔棘魚目 Coelacanthiformes - 腔棘魚
肺魚四足下綱 Dipnotetrapodomorpha
角齒魚目 Ceratodontiformes - 澳洲肺魚
雙鰾肺魚目 Lepidosireniformes - 美洲肺魚
根齒魚下綱 Rhizodontimorpha †
根齒魚目 Rhizodontiformes †
骨鱗下綱 Osteolepimorpha †
骨鱗魚目 Osteolepiformes †
輻鰭魚亞綱 Actinopterygii軟質下綱 Chondrostei
Order Cheirolepiformes †
多鰭魚目 Polypteriformes
古鱈目 Palaeonisciformes †
Order Tarrasiiformes †
Order Phanerorhynchiformes †
龍魚目 Saurichthyiformes †
鱘形目 Acipenseriformes - 鱘魚
Order Ptycholepiformes †
Order Pholidopleuriformes †
Order Perleidiformes †
盧加魚目 Luganoiiformes †
新鰭下綱 Neopterygii
全骨魚派 Holostei
半椎魚目 Semionotiformes - 雀鱔
弓鰭魚目 Amiiformes
堅齒魚目 Pycnodontiformes †
劍鼻魚目 Aspidorhynchiformes †
Order Pachycormiformes †
真骨魚派 Teleostei
叉鱗魚目 Pholidophoriformes †
薄鱗魚目 Leptolepidiformes †
Order Tselfatiformes †
骨舌魚亞派 Osteoglossomorpha
乞丐魚目 Ichthyodectiformes †
骨舌魚目 Osteoglossiformes - 紅龍、象魚
海鰱亞派 Elopomorpha
海鰱目 Elopiformes - 海鰱
北梭魚目 Albuliformes - 北梭魚
鰻形目 Anguilliformes - 淡水鰻、海鰻
囊鰓鰻目 Saccopharyngiformes
Order Crossognathiformes †
鯡形亞派 Clupeomorpha
Order Ellimmichthyiformes †
鯡形目 Clupeiformes - 沙丁魚
真骨魚亞派 Euteleostei
Superorder Ostariophusi
無耳鰾系 Anotophysi
鼠�目 Gonorynchiformes - 虱目魚
骨鰾系 Otophysi
鯉形目 Cypriniformes - 鯉魚
脂鯉目 Characiformes - 食人魚
鯰形目 Siluriformes - 鯰魚
裸背魚目 Gymnotiformes - 長刀魚、電鰻
原棘鰭總目 Protacanthopterygii
狗魚目 Esociformes - 狗魚
胡瓜魚目 Osmeriformes - 胡瓜魚
鮭形目 Salmoniformes - 鮭魚、鱒魚
巨口魚總目 Stenopterygii
巨口魚目 Stomiiformes - 巨口魚
辮魚目 Ateleopodiformes
圓鱗總目 Cyclosquamata
仙女魚目 Aulopiformes - 仙女魚
燈籠魚總目 Scopelomorpha
燈籠魚目 Myctophiformes - 燈籠魚
月魚總目 Lampridiomorpha
月魚目 Lampridiformes - 月魚
銀眼鯛總目（須�總目） Polymixiomorpha
銀眼鯛目 (須�目) Polymixiiformes
Order Ctenothrissiformes †
副棘鰭總目 Paracanthopterygii
鮭鱸目 Percopsiformes
Order Sphenocephaliformes †
鼬魚目 (鼬䲁目) Ophidiiformes - 鼬魚
鱈形目 Gadiformes - 鱈魚
蟾魚目 Batrachoidiformes
��目 Lophiiformes - ��
棘鰭總目 Superorder Acanthopterygii
鯔形系 Mugilomorpha
鯔形目 Mugiliformes
銀漢魚系 Atherinomorpha
銀漢魚目 Atheriniformes
頜針魚目 Beloniformes - 針魚、秋刀魚
�形目 Cyprinodontiformes - 食蚊魚
鱸形系 Series Percomorpha
奇金眼鯛目 Stephanoberyciformes
金眼鯛目 Beryciformes - 金眼鯛
海魴目 Zeiformes
刺魚目 Gasterosteiformes - 海馬
合鰓魚目 Synbranchiformes - 黃鱔
�形目 Scorpaeniformes - 獅子魚
鱸形目 Perciformes - 鱸魚、�魚、蝦虎魚、鯖魚、鯧魚、旗魚、鮪魚
鰈形目 Pleuronectiformes - 比目魚
�形目 Tetraodontiformes (=Plectognathi) - 河豚、翻車魚
