概述
元太祖成吉思汗世祖即位，登用老成，大新製作，立朝儀，造都邑，遂命劉秉忠、許衡酌古今之宜，定內外之官。其總政務者曰中書省，秉兵柄者曰樞密院，司黜陟者曰御史台。體統既立，其次在內者，則有寺，有監，有衛，有府；在外者，則有行省，有行台，有宣慰司，有廉訪司。其牧民者，則曰路，曰府，曰州，曰縣。官有常職，位有常員，其長則蒙古人為之，而漢人、南人貳焉。於是一代之制始備，百年之間，子孫有所憑藉矣。
中央官制
三公
三公：太師、太傅、太保各一員，正一品，銀印，以道燮陰陽，經邦國。又有所謂大司徒、司徒、太尉之屬，或置，或不置。其置者，或開府，或不開府。
中書省
（1）中書令一員，銀印，典領百官，會決庶務。
（2）右丞相（註：元朝以右為上，與前代不同）、左丞相各一員，正一品，銀印，統六官，率百司，居令之次。令缺，則總省事，佐天子，理萬機。
（3）平章政事四員，從一品，掌機務，貳丞相，凡軍國重事，無不由之。
（4）右丞一員，正二品，左丞一員，正二品，副宰相裁成庶務，號左右轄。
（5）參知政事二員，從二品，副宰相以參大政，而其職亞於右、左丞。
（6）參議中書省事，秩正四品，典左右司文牘，為六曹之管轄，軍國重事鹹預決焉。
（7）右司、左司，郎中二員，正五品；員外郎二員，正六品；都事二員，正七品。
六部
吏部，掌天下官吏選授之政令。
戶部，掌天下戶口、錢糧、田土之政令。。
禮部，掌天下禮樂、祭祀、朝會、燕享、貢舉之政令。
兵部，掌天下郡邑郵驛屯牧之政令。
刑部，掌天下刑名法律之政令。
工部，掌天下營造百工之政令。
以上六部各置尚書三員，正三品；侍郎二員，正四品；郎中二員，從五品；員外郎二員，從六品，又以吏、戶、禮為左三部，以兵、刑、工為右三部。各置尚書二員，侍郎二員，郎中四員，員外郎六員，總領三部之事。六部下設有各類分工精細、名目繁多的院、台、府、監、庫、司、局、寺、倉、署、所等官署，職數和品階一應俱全。
樞密院
樞密院，秩從一品，掌天下兵甲機密之務。凡宮禁宿衛，邊庭軍翼，征討戍守，簡閱差遣，舉功轉官，節制調度，無不由之。
置知院六員，從一品；同知四員，正二品；副樞二員，從二品；僉院二員，正三品；同僉二員，正四品；院判二員，正五品；參議二員，正五品；經歷二員，從五品；都事四員，正七品；承發兼照磨二員，正八品；架閣庫管勾一員，正九品；同管勾一員，從九品；掾史二十四人，譯史一十四人，通事三人，司印二人，宣使一十九人，銓寫二人，蒙古書寫二人，典吏一十七人，院醫二人。
樞密院下設有客省使、斷事官、行樞密院、右衛、左衛、中衛、前衛、後衛等官署。
御史台
御史台，秩從一品。大夫二員，從一品；中丞二員，正二品；侍御史二員，從二品；治書侍御史二員，正三品，掌糾察百官善惡、政治得失。
後定置御史大夫二員、中丞二員、侍御史二員、治書侍御史二員，品秩如上；經歷一員，從五品；都事二員，正七品；照磨一員，正八品；承發管勾兼獄丞一員，正八品；架閣庫管勾兼承發一員，正九品；掾史一十五人，譯史四人，知印二人，通事二人，宣使十人，台醫二人，蒙古書寫二人，典吏六人，庫子二人。
御史台下設有殿中司、察院、行御史台、肅政廉訪司等官署。
大宗正府
大宗正府，秩從一品。國初未有官制，首置斷事官，曰札魯忽赤，會決庶務。凡諸王駙馬投下蒙古、色目人等，應犯一切公事，及漢人奸盜詐偽、蠱毒厭魅、誘掠逃驅、輕重罪囚，及邊遠出征官吏、每歲從駕分司上都存留住冬諸事，悉掌之。至元二年，置十員。三年，置八員。九年，降從一品銀印，止理蒙古公事。以諸王為府長，余悉御位下及諸王之有國封者。又有怯薛人員，奉旨署事，別無頒受宣命。十四年，置十四員。十五年，置十三員。二十一年，置二十一員。二十二年，增至三十四員。二十八年，增至四十六員。大德四年，省五員。十一年，四十一員。皇慶元年，省二員，以漢人刑名歸刑部。泰定元年，復命兼理，置札魯忽赤四十二員，令史改為掾史。致和元年，以上都、大都所屬蒙古人並怯薛軍站色目與漢人相犯者，歸宗正府處斷，其餘路府州縣漢人、蒙古、色目詞訟，悉歸有司刑部掌管。正官札魯忽赤四十二員，從一品；郎中二員，從五品；員外郎二員，從六品；都事二員，從七品；承發架閣庫管勾一員，從八品；掾史十人，蒙古必闍赤十三人，通事、知印各三人，宣使十人，蒙古書寫一人，典吏三人，庫子一人，醫人一人，司獄二員。
宣政院
宣政院，秩從一品，掌釋教僧徒及吐蕃之境而隸治之。遇吐蕃有事，則為分院往鎮，亦別有印。如大征伐，則會樞府議。其用人則自為選。其為選則軍民通攝，僧俗並用。至元初，立總制院，而領以國師。二十五年，因唐制吐蕃來朝見於宣政殿之故，更名宣政院。
定置院使一十員，從一品；同知二員，正二品；副使二員，從二品；僉院二員，正三品；同僉三員，正四品；院判三員，正五品；參議二員，正五品；經歷二員，從五品；都事三員，從七品；照磨一員，管勾一員，並正八品；掾史十五人，蒙古必闍赤二人，回回掾史二人，怯里馬赤四人，知印二人，宣使十五人，典吏有差。
太禧宗禋院
太禧宗禋院，秩從一品，掌神御殿朔望歲時諱忌日辰禋享禮典。天曆元年，罷會福、殊祥二院，改置太禧院以總制之。初，院官秩正二品，升從一品，置參議二員，改令史為掾史。二年，改太禧宗禋院，置院使六員，增副使二員，立諸總管府為之屬。凡錢糧之出納，營繕之作輟，悉統之。定置院使都典制神御殿事六員，同知兼佐儀神御殿事二員，副使兼奉贊神御殿事二員，僉院兼祗承神御殿事二員，同僉兼肅治神御殿事二員，院判供應神御殿事二員，參議二員，經歷二員，都事二員，管勾、照磨各一員，掾史二十人，譯史四人，知印二人，怯里馬赤二人，宣使一十五人，斷事官四員，客省使大使、副使各二員。
儲政院
儲政院，秩正二品。至元十九年，立詹事院，備左右輔翼皇太子之任，置左、右詹事各一員，副詹事、詹事丞、院判各二員，吏屬六十有二人，別置宮臣賓客二員，左右諭德、左右贊善各一員，校書郎二員，中庶子、中允各一員。三十一年，太子裕宗既薨，乃以院之錢糧選法工役，悉歸太后位下，改為徽政院以掌之。大德九年，復立詹事院，尋罷。十一年，更置詹事院，秩從一品，設官十二員。至大四年罷。延佑四年復立，七年罷。泰定元年，罷徽政院，改立詹事如前。天曆元年，改詹事院為儲慶使司。二年罷，復立詹事院。未幾，改儲政院，院使六員，正二品；同知二員，正三品；僉院二員，從三品；同僉二員，正四品；院判二員，正五品；司議二員，從五品；長史二員，正六品；照磨二員，管勾二員，俱正八品；掾史一十二人，譯史四人，回回掾史二人，通事、知印各二人，宣使十人，典吏六人。
地方政權
行中書省（職同中央中書省）
行中書省，凡十一，秩從一品，掌國庶務，統郡縣，鎮邊鄙，與都省為表里。國初，有征伐之役，分任軍民之事，皆稱行省，未有定製。中統、至元間，始分立行中書省，因事設官，官不必備，皆以省官出領其事。其丞相，皆以宰執行某處省事系銜。其後嫌於外重，改為某處行中書省。凡錢糧、兵甲、屯種、漕運、軍國重事，無不領之。至元二十四年，改行尚書省，尋復如舊。至大二年，又改行尚書省，二年復如舊。每省丞相一員，從一品；平章二員，從一品；右丞一員，左丞一員，正二品；參知政事二員，從二品，甘肅、嶺北二省各減一員；郎中二員，從五品；員外郎二員，從六品；都事二員，從七品；掾史、蒙古必闍赤、回回令史、通事、知印、宣使，各省設員有差。舊制參政之下，有僉省、有同僉之屬，後罷不置。丞相或置或不置，尤慎於擇人，故往往缺焉。河南江北等處行中書省，統有十二路、七府。
江浙等處行中書省，統有三十路、一府。
江西等處行中書省，統有十八路。
湖廣等處行中書省，統有三十路、三府。
陝西等處行中書省，所轄之地，惟陝西四路、五府。
四川等處行中書省，統有九路、五府。
遼陽等處行中書省，統有七路、一府。
甘肅等處行中書省，統有七路、二州。
嶺北等處行中書省。國初，太祖定都於哈剌和林河之西，因名其城曰和林，立元昌路。中統元年，世祖遷都中興，始置宣慰司都元帥府。大德十一年，改立和林等處行中書省，右丞相、左丞相各一員。至大四年，省右丞相。皇慶元年，改嶺北等處行中書省，設官如上，治和寧路，統有北邊等處。
雲南等處行中書省，統有三十七路、五府。
征東等處行中書省。至元二十年，以征日本國，命高麗王置省，典軍興之務，師還而罷。大德三年，復立行省，以中國之法治之。既而王言其非便，詔罷行省，從其國俗。至治元年復置，以高麗王兼領丞相，得自奏選屬官，治瀋陽，統有二府、一司、五道。
宣慰使司（職同中央宣政院）
宣慰司，掌軍民之務，分道以總郡縣，行省有政令則布於下，郡縣有請則為達於省。有邊陲軍旅之事，則兼都元帥府，其次則止為元帥府。其在遠服，又有招討、安撫、宣撫等使，品秩員數，各有差等。
宣慰使司，秩從二品。每司宣慰使三員，從二品；同知一員，從三品；副使一員，正四品；經歷一員，從六品；都事一員，從七品；照磨兼架閣管勾一員，正九品。凡六道：山東東西道，益都路置。河東山西道，大同路置。淮東道，揚州置。浙東道，慶元路置。荊湖北道，中興路置。湖南道。天臨路置。宣慰使司都元帥府，秩從二品，使三員，同知二員，副使二員，經歷二員，知事二員，照磨兼架閣管勾一員。
諸路萬戶府
上萬戶府，管軍七千之上。達魯花赤一員，萬戶一員，俱正三品，虎符；副萬戶一員，從三品，虎符。中萬戶府，管軍五千之上。達魯花赤一員，萬戶一員，俱從三品，虎符；副萬戶一員，正四品，金牌。
下萬戶府，管軍三千之上。達魯花赤一員，萬戶一員，俱從三品，虎符；副萬戶一員，從四品，金牌。其官皆世襲，有功則升之。每府設經歷一員，從七品；知事一員，從八品；提控案牘一員。
鎮撫司，鎮撫二員，蒙古、漢人參用。上萬戶府正五品，中萬戶府從五品，俱金牌；下萬戶府正六品，銀牌。
上千戶所，管軍七百之上。達魯花赤一員，千戶一員，俱從四品，金牌；副千戶一員，正五品，金牌。
中千戶所，管軍五百之上。達魯花赤一員，千戶一員，俱正五品，金牌；副千戶一員，從五品，金牌。
下千戶所，管軍三百之上。達魯花赤一員，千戶一員，俱從五品，金牌；副千戶一員，正六品，銀牌。
彈壓二員，蒙古、漢人參用。上千戶所從八品，中下二所正九從九品內銓注。
上百戶所，百戶二員，蒙古一員，漢人一員，俱從六品，銀牌。
下百戶所，百戶一員，從七品，銀牌。
諸路總管府
諸路總管府，至元初置。二十年，定十萬戶之上者為上路，十萬戶之下者為下路，當衝要者，雖不及十萬戶亦為上路。上路秩正三品，達魯花赤一員，總管一員，並正三品，兼管勸農事，江北則兼諸軍奧魯，同知、治中、判官各一員。下路秩從三品，不置治中員，而同知如治中之秩，余悉同上。至元二十三年，置推官二員，專治刑獄，下路一員。經歷一員，知事一員或二員，照磨兼承發架閣一員，司吏無定製，隨事繁簡以為多寡之額；譯史、通事各一人。散府
秩正四品，達魯花赤一員，知府或府尹一員，領勸農奧魯與路同；同知一員，判官一員，推官一員，知事一員，提控案牘一員。所在有隸諸路及宣慰司、行省者，有直隸省部者，有統州縣者，有不統縣者，其制各有差等。諸州
中統五年，並立州縣，未有等差。至元三年，定一萬五千戶之上者為上州，六千戶之上者為中州，六千戶之下者為下州。江南既平，二十年，又定其地五萬戶之上者為上州，三萬戶之上者為中州，不及三萬戶者為下州。於是升縣為州者四十有四。縣戶雖多，附路府者不改。上州：達魯花赤、州尹秩從四品，同知秩正六品，判官秩正七品。中州：達魯花赤、知州並正五品，同知從六品，判官從七品。下州：達魯花赤、知州並從五品，同知正七品，判官正八品，兼捕盜之事。參佐官：上州，知事、提控案牘各一員；中州，吏目、提控案牘各一員；下州，吏目一員或二員。諸縣
至元三年，合併江北州縣。六千戶之上者為上縣，二千戶之上者為中縣，不及二千戶者為下縣。二十年，又定江淮以南，三萬戶之上者為上縣，一萬戶之上者為中縣，一萬戶之下者為下縣。上縣，秩從六品，達魯花赤一員，尹一員，丞一員，簿一員，尉一員，典史二員。中縣，秩正七品，不置丞，余悉如上縣之制。下縣，秩從七品，置官如中縣，民少事簡之地，則以簿兼尉。後又別置尉，尉主捕盜之事，別有印。典史一員。巡檢司，秩九品，巡檢一員。諸軍
唯邊遠之地有之，各統屬縣，其秩如下州，其設官置吏亦如之。
諸蠻夷長官司。西南夷諸溪洞各置長官司，秩如下州，達魯花赤、長官、副長官，參用其土人為之。
各處脫脫禾孫，掌辨使臣奸偽。正一員，從五品；副一員，正七品。
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宣政院——忽必烈即位後，以八思巴為國師，一二六九年，新字製成後，又加號“帝師”，“大寶法王”，統領全國佛教。（王磐：《行狀》，見《佛祖歷代通載》）朝廷立總制院，管領佛教僧徒及吐蕃境內事務，仍以帝師統領。
一二八八年十一月，改總制院為宣政院，用唐朝吐蕃使臣朝見的宣政殿殿名作為院名。宣政院置院使二員，由朝廷命官任領。吐蕃有事，則設分院往治。宣政院官員軍民通攝，僧俗並用，是元朝設立的一個特殊的機構。它既是管理全國佛教事務的機關，又直接統領吐蕃的政務和軍事。
