概述
在民國西南各軍閥派系中，滇系?算得上是一股重要的勢力。曾經以一隅之地對抗勢如日中天的北洋軍閥，迫使袁世凱取消帝制，贏得了護國戰爭的勝利。戰後護國三傑之首的唐繼堯稱滇黔川鄂豫陝湘閩八省聯帥，自製印章“東亞大陸主人”。其時滇軍善戰名動天下。雲南陸軍講武堂
要談滇系軍閥，不妨先從雲南陸軍講武堂談及新軍第十九鎮談起。1907年8月，雲南創辦了一所新式的軍事學校，就是雲南陸軍講武堂。但是，到了1908年3月，講武堂又告停辦。1909年，當時的雲南總督錫良重辦，延聘李根源、李烈鈞、方聲濤、趙康時、沈汪度、唐繼堯、張開儒、庾恩暘 等一批日本士官學校的畢業生擔任教官，李根源任講武堂總辦。雲南講武堂的規模較大，開設甲、乙、丙三個班。甲班學員第一期為一百二十人，來源於陸軍第十九鎮的管帶、督隊官、隊管、排長等。乙班學員第一期為一百人，來源於巡防營的管帶、幫帶、哨官、哨長等三十歲以下，文理通順者。丙班學員第一期為二百人，來源於貢生、稟生、中學學生，年齡在十六至二十二歲之間，學成後用來補充下級軍官。以後，又從丙班學員中挑選成績優秀者一百名，特授學術，為特別班。由於講武堂總辦李根源以及其他教職員工多為同盟會員和激進分子，雲南講武堂實際上成了培養民主革命戰士的新式軍事學校。辛亥革命前夕，講武堂甲、乙、丙三班畢業，特別班也提前畢業一百人，分配到新軍第十九鎮各營擔任下級軍官或見習軍官，成為辛亥雲南起義的基本骨幹力量。雲南新軍從1902年開始編練，到1909年暫編成陸軍第十九鎮，共有步、馬、炮等二十一營。第十九鎮統制為鍾麟同，總參議為靳雲鵬，兵備處總辦為王振畿，都是清廷的鷹犬。但是，第十九鎮卻也聚集一大批革命黨人，充當各級軍官。如鎮參謀官殷承瓛 、統帶羅佩金、管帶李鴻祥、唐繼堯、劉存厚、雷飈、謝汝翼、韓鳳樓、李鳳樓等。他們都是日本士官學校的畢業生，同盟會員。1911年2月，蔡鍔由廣西被調入雲南擔任第十九鎮第三十七協統領。蔡鍔是梁啓超的學生，1903年在士官學校第三期畢業。做過廣西新軍混成協統領。蔡鍔在政治上追隨梁啓超，到雲南後，蔡鍔同李根源等革命黨人相處很融洽，同情他們的革命主張。
1911年武昌起義的訊息傳到雲南，革命黨人十分振奮，決心起義回響。蔡鍔等人頻頻在唐繼堯或劉存厚家裡舉行密談，商量起義計畫。大家公推蔡鍔任總指揮，決定舊曆九月初九重陽節（新曆10月30日）發動。雲南都督李經羲（李鴻章之侄）以及鍾麟同、靳雲鵬、王振畿等有所覺察，想將李根源、羅佩金、李鴻祥、謝汝翼等革命黨人調職或撤職，但九月初九夜，革命黨人發動了起義（史稱“重九起義”），次日上午攻占了督署，中午控制了昆明全城。與起義軍頑抗的鐘麟同、王振畿被俘後處死，靳雲鵬化裝成轎夫逃出城外；李經羲以下很多官員被俘。蔡鍔、李根源等與李經羲有舊誼，饋送川資護送出境。雲南其他地方也先後發動起義，雲南全省很快被革命黨人控制。
11月3日，雲南軍政府成立，舉蔡鍔為都督，李根源為軍政部長兼參議院長，殷承瓛為參謀部總長，韓建鐸為軍務部總長，張惟聰為省議會議長。不久，李根源任滇軍第二師師長兼迤西國民軍總司令，羅佩金繼任軍政部長。雲南獨立後，軍政府立即著手整編軍隊，改革弊政，清理財務，平定匪亂，使全省政局很快趨於穩定。雲南與四川歷來關係密切，不但地理上互相鄰接，而且雲南的財政要靠四川協濟。而此時，四川的局面仍在混亂之中，雲南軍政府決定以援助四川獨立的名義，於11中旬組成謝汝翼、李鴻祥兩個梯團入川，並以韓建鐸為援川軍總司令。
雲南軍政府原來並無援黔計畫，但在已經宣布獨立，組織了軍政府的貴州省，立憲派分子、舊官僚與革命黨的矛盾和鬥爭十分激烈，立憲派和舊官僚為了打擊革命黨人，請求蔡鍔派兵入黔。蔡鍔命令率師北伐的雲南軍政府軍政部次長唐繼堯，順路入黔解決貴州兩黨爭鬥。1912年2月，唐繼堯以“代平黔亂”為名率軍進逼貴陽。3月，在貴州立憲派的支持和配合下，唐繼堯指揮滇軍推翻了貴州革命政府，奪取政權，隨即被貴州立憲派控制的省議會推舉為貴州臨時都督。5月，袁世凱正式任命唐繼堯為貴州都督。就這樣，滇軍以武力在貴州建立了軍事統治，唐繼堯因此也跨進入軍閥的行列。
蔡鍔領導了雲南重九起義，出任雲南都督，在南北議和期間，他對袁世凱的陰謀活動曾有所揭露。但是，隨著清帝宣布退位和袁世凱的上台，他追隨老師梁啓超，變成了擁袁派。1912年2月，南北爭都事起，他是袁世凱建都北京的支持者。6、7月間，同盟會為組閣問題與袁世凱發生一系列衝突，他以政府擁護派自居，積極作袁後盾。在地方，他支持唐繼堯控制貴州，聯絡黔、蜀、桂各都督為袁世凱“保障西南”。在中央，他先後倡議軍人不入黨和解散一切政黨，以瓦解同盟會，並且極力反對《臨時約法》，主張給予袁世凱以自由解散議會和任命國務員之權。1913年3、4月，“宋教仁被刺案”和“善後大借款”事件相繼發生，他無視全國輿論，為袁世凱多方辯護。及至“二次革命”爆發，他又不顧孫中山、黃興等國民黨人對他的善意爭取，公然奉袁世凱之命派兵入川，參加鎮壓重慶熊克武的起義。
蔡鍔的擁袁始終堅持以愛國為前提，最終還是為了維護共和政體，為了改良政治。儘管蔡鍔屬於擁袁派，但仍然受到袁世凱的猜忌。袁世凱鎮壓二次革命之後，於1913年10月將蔡鍔調往北京，擔任陸軍部編譯處副總裁、全國經界局督辦等職，想利用他的才幹整頓日顯暮氣的北洋軍。而雲南都督一職，蔡鍔力薦唐繼堯繼任，獲得袁世凱批准。11月，唐繼堯率部回滇任都督，掌握了雲南軍政大權，控制了全部滇軍，開始了以他為首的舊滇軍閥對雲南的統治。
護國戰爭撼天下
唐繼堯出任雲南總督後，在雲南繼續奉行蔡鍔先前確立的方針。他雖然是老同盟會員，但是，此時，他和革命黨人已經不是一條心，他限制和阻止革命黨人進入雲南，甚至親自審訊並殺害過孫中山派往雲南的革命黨人。但是，雲南畢竟不是袁世凱直接控制的地方，它經過辛亥革命血與火的考驗，同盟會的影響根深蒂固，民主共和觀念深入人心。因此，當1915年袁世凱帝制陰謀日益公開以後，不少雲南籍或與雲南有某種歷史關係的革命黨人，都利用雲南富於革命傳統而又地處邊陲等有利條件，紛紛假借各種名義奔赴雲南，從事反袁秘密活動。前雲南同盟會支部長呂志伊，暗中與軍界的羅佩金、李曰垓、楊蓁、鄧泰中等舊同盟會同志密敵反袁方略，聯絡滇軍中各級軍官和士兵，使滇軍上下統一了思想和行為。8月間，袁世凱使人組織籌安會鼓吹帝制的訊息傳到雲南，雲南輿論公開反對，尤其是《覺報》，旗幟鮮明地公開反對帝制，發表了一系列重要文章。與此同時，軍界也在加緊密籌武裝討袁，這時，爭取唐繼堯反袁，成為滇軍將領的首要任務。唐繼堯出任雲南都督後，袁世凱又授他為將軍府開武將軍，極力拉攏，而唐繼堯也無反袁之心。當滇軍將領派出原旅長黃毓成、團長鄧泰中、楊蓁為代表向他進言時，唐繼堯仍以不了解在京的蔡鍔的意向和各省各方的真相，以及雲南只有兩師兵力，且財力匱乏等原因而不肯公開宣布反袁。唐繼堯的曖昧態度，激起了滇軍將領的強烈不滿。10月間，他們開會決議：一、於適當時期，要求唐氏表示態度；二、如唐氏反對帝制，則仍擁其為領袖；三、如中立，則將他送往安南；四、如贊成帝制，則殺之。11月上旬，唐繼堯通過明查暗訪，發現如不再表示反袁的立場，兩師滇軍就不是他所能掌握的了。另外，他也了解到蔡鍔也轉向反袁，因此，他迅速改變態度，要把反袁的領導權抓到手，以鞏固自己在雲南的統治。1915年12月19日，蔡鍔歷盡艱辛，回到了雲南昆明。
蔡鍔自1913年10月奉調入京後，先後擔任過政治會議委員，約法會議議員資格審定會會員、參政院參政、將軍府將軍、全國經界局督辦等職。在籌安會發生前，蔡鍔還沒有公開反袁，而是力圖通過擁戴袁世凱以維護共和政體。1915年8月，由袁世凱一手操縱的籌安會成立，袁世凱要恢復帝制的野心昭然若揭，蔡鍔感到失望，從此追隨老師梁啓超走上積極反袁的道路。之後，蔡鍔秘密聯絡雲、貴舊部和各方反袁勢力，準備發動軍事討袁。為了麻痹袁世凱，他依約裝出與梁啓超分家的樣子；對所任各職，他比以前更為主動和積極；在生活上，他故意表現出沉迷酒色，與京中名妓小鳳仙時有往來。
儘管如此，袁世凱對蔡鍔秘密聯絡雲、貴舊部的訊息已有所聞。10月14日，袁世凱派軍警突然藉故搜查蔡鍔住宅，雖未查出證據，但蔡鍔已深感北京不可久留，經和梁啓超等密商，決定儘快逃出北京回雲南發動起義。11月初，蔡鍔以喉疾為由，要求赴天津就醫，袁世凱沒有懷疑，準假七天，這樣，蔡鍔名正言順地到了天津。之後，蔡鍔避過了袁世凱派來的耳目，於11月18日乘船再往日本“治病”，12月初抵達東京。袁世凱無奈，只得準假兩月，並促他“早日回國銷假任事”。隨後蔡鍔悄悄離開日本，經上海、香港轉赴越南河內，途中挫敗了袁世凱幾次行刺陰謀，終於在12月19日到達昆明。
抵滇當日，蔡鍔便不顧旅途勞頓，立即開始了各項準備工作。12月21日，唐繼堯在其寓所召集了蔡鍔、李烈鈞、任可澄、羅佩金、劉祖武、張子貞、方聲濤、顧品珍、熊克武、黃毓成、殷承瓛 、由雲龍、籍忠寓、劉雲峰、楊蓁、唐繼虞、李曰垓、戴戡、孫永安、龔振鵬、戢翼翹、但懋辛、周官和、王伯群、李雁賓、瘐恩暘 等雲南省內外重要人士參加緊急會議，會上宣讀了梁啓超起草的討袁通電，決定成立“護國軍”討袁。至於都督人選，唐繼堯和蔡鍔推讓不止，最後只好公決由唐繼堯任中華民國雲南都督府都督兼護國軍第三軍總司令，留守雲南，為事實上的首領。蔡鍔任護國軍第一軍總司令官，率部出征；並推李烈鈞任護國軍第二軍總司令官兼籌餉局總辦。其出兵總方略是，第一軍北出四川，第二軍東進廣西，第三軍居中策應，以四川為戰略進攻的重點。12月25日，唐繼堯、任可澄正式發出反帝制通電，限袁世凱25日10時以前答覆。12月25日，未見袁世凱答覆，唐繼堯、任可澄、劉顯世、蔡鍔、戴戡遂聯名發出二次通電，宣布雲南即日起獨立，護國戰爭爆發。
護國戰爭的重要戰役有四川瀘納之戰、湘西之戰、滇桂邊之戰等，這裡主要介紹瀘納之戰和滇桂邊之戰。
雲南宣布獨立次日，即12月26日，護國軍第一軍總司令部在昆明成立。總司令官蔡鍔，參謀總長羅佩金、參謀處長殷承瓛 、秘書處長李曰垓、副官處長何鵬翔、軍需處長陳之階，劉雲峰、趙又新、顧品珍各為第一、二、三梯團團長，鄧泰中、楊蓁、董鴻勛、何海清、祿國藩、朱德各為一、二、三、四、五、六支隊長。1916年初，蔡鍔率第一軍經貴州比節入川，取納溪、瀘州。1月5日，袁世凱令曹錕、張敬堯組織征滇軍，入川進攻護國軍，以張敬堯為統領。護國軍入川順利，接連攻占燕子坡、橫江、安邊，於1月21日攻下敘州。2月2日，川軍劉存厚師在納溪倒戈反袁，劉自任護國川軍總司令，迎蔡鍔軍入納溪。2月5日，滇、川護國軍會攻瀘州，2月7日，張敬堯率征滇軍殺至，護國軍退回納溪，北洋軍窮追不已，護國軍攻瀘之役變為納溪保衛戰，在北起長江，南抵永寧，縱橫百里的廣闊戰場上展開頑強抵抗，戰況異常激烈。2月28日，護國軍發起總反攻，朱德率部直撲陶家瓦房吳佩孚司令部，打得張敬堯落馬，吳佩孚手足無措。但由於護國軍兵少彈乏，未能逆轉危局，3月7日，被迫退往永寧大州驛。3月17日，護國軍再次發起總反攻，得熊克武、但懋辛等四川義軍配合，進攻勢如破竹，不數日，克納溪、江安，圍張敬堯於瀘州城內。鑒於大勢已去5月22日，四川將軍陳宦宣布獨立。同日，蔡鍔去電促張敬堯倒戈反袁，不久，親赴瀘州勸說張敬堯。張敬堯將北洋軍所余軍械、子彈、馬匹、糧秣等悉送蔡軍，離部離川。6月13日，護國軍進駐瀘州。
1916年1月，護國軍第二軍總司令部在昆明成立，第二軍總司令官為李烈鈞，參謀總長為何國鈞，張開儒、方聲濤分任第一、二梯團團長。第二軍的戰略目標是東出桂、粵，轉道入贛。唐繼堯將準備開往湘西的第三軍一部也調往桂粵方向，以增加第二軍的兵力，保證攻粵計畫的完成。袁世凱令廣東陸軍第一師師長、龍濟光之兄龍覲光為雲南查辦使，率粵軍抵南寧，準備由百色、西林進攻雲南。於是，雙方軍隊在滇桂邊境的富州、廣南一帶展開激虞。2月底3月初，雙方互為攻守，呈僵持狀態。3月15日，廣西將軍陸榮廷宣布獨立，使護國軍士氣大振。3月16日，方聲濤部舉行反攻，收復龍潭。這時，另一支護國軍從貴州興義進入廣西西隆，進而抄襲龍軍黃恩錫部的後路，迫使黃恩錫率部逃遁。坐鎮百色的龍覲光被馬濟、陸裕光等率領的桂軍包圍，繳械投降，接受改編。龍軍右翼軍司令李文富見狀，也率部投降。此後，護國第二軍進入廣東活動，成為護法軍政府的重要支柱。滇桂邊之戰粉碎了袁世凱迂迴襲滇的計畫，保障了護國軍大後方的安全。
護國戰爭爆發之後，貴州、廣西、浙江等省也相繼宣布獨立，袁世凱在內外壓力之下，於1916年3月22日被迫宣布撤消帝制，但仍想當大總統，結果又遭到各方反對。廣東、陝西、四川、湖南等省又相繼宣布獨立。西南護國各省，還於5月8日在廣東肇慶組織護國軍務院，推舉唐繼堯為軍務院撫軍長，蔡鍔、羅佩金等滇系將領也出任撫軍。但由於唐繼堯坐鎮昆明，軍務院實際為桂系岑春煊、陸榮廷等把持。6月6日，袁世凱病死，護國戰爭勝利結束。不久，南北議和，護國軍務院也於7月14日宣告撤消。
川滇黔軍閥混戰
滇軍憑藉護國戰爭，將勢力擴展到了四川。袁世凱病死、護國戰爭結束後，以唐繼堯為首的滇系軍閥也正式形成。護國戰爭結束後，以梁啓超為首的進步黨人希望在西南建立自己的根據地，所以梁啓超極力與北京政府段祺瑞接洽，為他的學生蔡鍔在四川謀取職位。7月6日，北京政府任命蔡鍔為四川督軍兼省長。
對於蔡鍔入主四川，唐繼堯並非很高興。早在護國戰爭之初，蔡鍔率軍入川作戰時，唐繼堯就唯恐蔡鍔部在與北洋軍作戰中發展壯大，於己不利，因而對蔡鍔的護國軍第一軍多方掣肘，無論在經費、兵員、武器各方面都未予必需的援助。蔡鍔被任命為四川督軍，鑒於蔡鍔的聲望，唐繼堯難以反對。對入川的滇軍，他更無法進行遙控。
然而，蔡鍔就任川督不久，病勢即日漸惡化，最後實在無法堅持正常的工作，只得電請北京政府準假養病。8月7日，北京政府批准蔡鍔暫離職休養。8月9日，蔡鍔離開成都，到瀘州等地休息治病。但是，蔡鍔的病日趨嚴重，不得不於8月底離川東渡日本治療。蔡鍔離川前，保舉入川滇軍總參謀長羅佩金暫署四川督軍，入川黔軍總司令戴戡為四川省長兼軍務會辦。蔡鍔到日本後，仍醫治無效，於11月8日在日本逝世，享年僅三十四歲。
蔡鍔病逝後，羅佩金出任四川督軍。由於羅佩金早已傾向唐繼堯，因此唐繼堯得以遙控入川的滇軍。
當時，入川滇、黔軍占據了四川省大片地方和成都、重慶等重要城鎮。羅佩金完全拋開蔡鍔的“重建四川”的計畫，秉承唐繼堯的旨意，盡力搜刮四川的財富，掠奪鹽稅，強令四川人民負擔入川滇、黔軍的軍餉，由此，與四川軍民矛盾日深。羅佩金又奉行“強滇弱川”政策，擴充入川滇軍，壓制川軍。1916年冬，羅佩金召開編遣會議，裁減川軍，激起川軍五師長聯名通電控訴。1917年3月，羅佩金又以武力解散川軍第四師，川軍將領深感禍將及己，第二師師長劉存厚乘機聯絡川軍各部共謀驅羅。
1917年4月18日，劉存厚率部圍攻駐成都皇城之羅佩金部，劉羅之戰爆發。滇軍用煤油噴射四周民房，聲言“亮城”，防止川軍憑藉民房伏擊。劉存厚亦以大炮、地雷進擊，很多炮彈落在民房區。雙方巷戰達七晝夜，死傷慘重。由於滇軍增援部隊趙又新部在資陽、內江地區遭到川軍第二師的阻擊，羅佩金孤立無援，被迫交出督印，於4月24日率部從成都退往簡陽、自貢等地。在戰爭期間，北京政府電令免羅佩金四川督軍職，調為將軍府超武將軍；免劉存厚川軍第二師師長職，調為將軍府崇武將軍，兩人停止戰爭，進京供職。同時任命劉雲峰為川軍第二師師長，戴戡暫代四川督軍。劉羅之戰是西南軍閥史上的第一次軍閥混戰。是役，成都民房被毀三千餘間，民眾死傷八千餘人，財產損失無數。
劉羅之戰後，緊接著又爆發了川軍劉存厚與黔軍戴戡的劉戴之戰，結果黔軍又被趕出成都遭殲滅，戴戡身亡。滇黔聯軍在與川軍作戰中連連失利，退入川南，四川脫離了滇系軍閥的控制，使唐繼堯十分惱怒和失望。1917年7月，針對張勛復辟，段祺瑞解散國會，孫中山南下廣州領導反對北洋軍閥的護法運動。唐繼堯認為有機可乘，決定利用護法，把滇系勢力重新深入四川，於是通電回響護法。但是，唐繼堯並非站在孫中山的護法旗幟之下，而是另樹一幟，宣布“靖國”，把滇黔所部八軍編成靖國軍，號稱“滇黔靖國聯軍”，唐繼堯自任總司令，以楊蓁為總參謀長，以顧品珍、趙又新、瘐恩暘 、黃毓成、張開儒、方聲濤、張熙、葉荃分任八個軍總司令，加上黔軍王文華第一師，共七十多營約四萬人。11月14日，唐繼堯以川軍劉存厚阻礙滇軍為名，率滇黔聯軍誓師出發，發動了四川靖國戰爭。
唐繼堯將滇黔靖國聯軍總司令部駐在貴州畢節，然後揮軍入川。滇軍顧品珍部由瀘州東下，聯合黔軍王文華部突襲重慶。12月3日，北京政府派入四川的四川查辦使吳光新和四川督軍周道剛撤出重慶。吳光新部一直退入湘鄂邊境，周道剛則敗走永川。形成戰局的關鍵性轉折。12月4日，滇黔聯軍進入重慶，向川南進擊，於12月14日占領瀘州。12月8日北京政府任命劉存厚為四川督軍，在成都令川軍第一、二、三師重新部署，以對付滇黔聯軍的進攻。12月21日，川軍熊克武、但懋辛、石青陽等通電加入靖國聯軍，推舉熊克武為四川靖國各軍總司令，並推舉唐繼堯為滇川黔靖國聯軍總司令。1918年1月9日，熊克武召集川、滇、黔靖國各軍將領在重慶開會，決定兵分三路，直取成都。東路由滇軍顧品珍、趙又新統領；中路由黔軍袁祖銘、王天培統領；北路由川軍第五師但懋辛統領。2月20日，三省聯軍攻入成都，劉存厚等部退往陝南漢中地區。至此，唐繼堯以奪取和控制四川為目標的靖國戰爭基本結束。
唐繼堯控制了滇、黔、川三省，聲勢顯赫，更加飛揚跋扈。2月25日，他自任熊克武為四川督軍兼省長。3、4月間，他借援鄂、援陝名義，又連續任命八個總司令，即以黃復生、葉荃、王文華、顧品珍為援鄂第一、二、三、四各路總司令；以石青陽、顏德基、李國定、丁澤煦為援陝第一、二、三、四各路總司令。此外，他還安插王文華為重慶鎮守使，趙又新為四川軍務會辦，顧品珍為敘瀘鎮守使，葉荃為夔萬鎮守使等。
唐繼堯為了牢固地控制四川，並進一步向陝西、湖北擴張，便以商討北伐為名，決定於1918年9月在重慶召開川、滇、黔、鄂、豫五省聯軍會議，並就任“五省聯軍總司令”職。會議除了川、滇、黔軍主要將領外，還有湖北靖國軍總司令黎天才、河南靖國軍總司令王天縱等。
9月10日，唐繼堯以貴州畢節到達重慶南面的綦江，故意逗留一周之久，以顯示“聯帥”的威風。9月17日，他才前呼後擁、戒備森嚴的情況下到達重慶。這一天，重慶全城戒嚴，唐繼堯在二十一響禮炮和盛大的儀仗伴隨下，乘坐八抬綠呢大橋入城，然後乘其黃驃坐馬，足登金鐙，浩浩蕩蕩，威風凜凜，進入行轅。
在重慶聯軍會議上，唐繼堯拋出一份早已草擬的以“準備北伐案”為題的《川滇黔三省同盟計畫書》。他和貴州督軍劉顯世早已簽了字，現在就等四川督軍熊克武簽字。這份同盟計畫書的主要內容有：四川兵工廠作北伐軍械彈藥補充，歸聯軍管轄支配，實則全歸滇黔軍所有；造幣廠亦歸聯軍管轄支配；四川全省厘稅，包括鹽稅、並稅、酒稅等，作北伐軍軍餉的補充，實則是作滇黔軍的軍餉；資中、資陽、簡陽、敘府、瀘州、重慶、萬縣及自流井、榮縣、威遠和會理、寧遠、酉陽、秀山各屬，凡川東南財富之區，悉作滇黔軍所有；上述各項由聯軍總部在重慶特設機構主持辦理。對於這份實則“亡川”的同盟書，熊克武拒絕簽字。唐繼堯無奈，於10月2日發布援鄂援陝命令後，會議草草收場。唐繼堯也於10月8日離開重慶，經瀘州返回昆明。
唐繼堯利用孫中山護法這塊招牌，打著靖國的旗號，以滇、川、黔、鄂、豫、陝、湘、閩八省聯軍總司令自命，使他的聲威達到頂峰。這時，北洋直系軍閥為對付皖系段祺瑞，鼓吹以“和平”方式解決西南爭端，以唐繼堯、陸榮廷為代表的西南軍閥立即回響。1919年2月南北和議開始以後，直系吳佩孚與西南軍閥的勾結進一步加緊。隨後，雙方共同簽訂了《救國同盟條約草約》。這樣，唐繼堯與孫中山為首的革命黨人的距離愈來愈遠。
由於熊克武拒絕在《川滇黔三省同盟計畫書》上籤字，唐繼堯完全控制四川的野心未能實現。唐繼堯深感熊克武是他企圖控制四川的最大障礙，他想法分化拉攏熊克武的部屬，脅迫其就範。1919年6月22日，在唐繼堯的授意下，滇軍將領顧品珍、趙又新等在重慶發起成立了川滇黔俱進會。參加該會的，有黔軍將領袁祖銘等；熊克武的得力部將但懋辛、余際唐、呂超；與熊克武有矛盾的民軍首領黃復生、盧師諦等。公推顧品珍、余際唐、袁祖銘為會長，並發表了通電和成立宣言，主張維護西南護法政府，加強三省密切合作，促進共同利益的發展。其實該會的真正目的是為分化熊部並最終倒熊。
1920年春，川軍將領呂超、石青陽等策劃倒熊克武，反動了倒熊之戰，唐繼堯乘機鼓動支持。3月，唐繼堯下令免去熊克武四川靖國軍總司令職。5月，又任命呂超為四川靖國軍總司令。5月下旬，川軍呂超、石青陽等率部從綿陽、中江攻成都；滇軍顧品珍、趙又新部從川南攻成都；黔軍王文華部與川軍黃復生部在重慶、綦江一帶攻熊系余際唐部。熊克武見局勢於己不利，遂宣告辭去四川督軍職。後得舊川軍將領支持，發起反擊，但失利。7月10日，熊克武離開成都，退往川北保寧一帶。7月18日，呂超率軍入成都，通電就任川軍總司令，兼任川滇黔聯軍副總司令。
川軍呂超部雖然進入成都，然而，滇黔軍卻凌駕於呂超之上，並設立了三省聯軍總部，以唐繼堯為統帥，要把川省軍、民、財各政統歸聯軍總部管理，川省中央稅收及地方財政收與四川兵工廠、造幣廠，全歸聯軍總部支配，這是過去唐繼堯強令熊克武接受但遭到熊拒絕的條件，他又企圖強令呂超接受。呂超同樣深感事關重大，未予同意。
這時，出身於四川的滇軍將領朱德深感政治形式不利，上書唐繼堯指出，只有放棄地盤主義，分化反對力量，高唱北伐，取得大義名分，出兵武漢才能解救目前的困局，此書一公開，獲得在川各方將領的一致叫好，熊可武也表示願意追隨北伐，可唐繼堯乾脆拒絕了這個建議。朱德長嘆：“西蜀偏安庸者據，逐鹿中原是雄材”。唐繼堯的回電也證實了他名為靖國，實為圖川的事實，激起了川軍將領的普遍不滿和反對。熊克武、劉存厚等聯合起來，決定以武力驅逐滇黔軍，發動靖川之戰。1920年8月6日，劉存厚在漢中組織靖川軍，自任總司令，委任田頌堯為第一路司令，唐廷牧為第二路司令，張印本為第三路司令。熊克武部亦進行了整編，委任但懋辛為第一軍軍長，劉湘為第二軍軍長，劉成勛為第三軍軍長。熊、劉共推劉湘為前敵總指揮，兩軍分道出發，夾擊成都。川軍各部，亦相機通電回響。9月8日，川軍攻入成都，消滅呂超部隊，接著，川軍集結兵力八十一營仰攻在龍泉山頂布陣的滇軍5個旅，滇軍百戰之餘，視川軍各部為烏合鳥聚，人數雖少，卻很自信。以逸待勞迎擊川軍，打到第五日中午，川軍氣勢已弱，滇軍亂戰怪傑朱德率先在中午擊破川軍正面，一口氣追擊到成都城下，甚至迂迴到城北駟馬橋，意欲切斷川軍退路，川軍各部知道這是最後關頭了，失敗了就再沒機會翻本了，高唱著為川人爭人格，不退反進，在成都東門打了個五進五出，最後，厭戰的滇軍終於不想打了，與朱德齊名的金漢鼎對顧品珍說，這樣殺來殺去有什麼意思，白白的被川人視為侵略者，不如帶這些雲南健兒回家，關起門來搞自治。9月21日，滇軍撤離龍泉山陣地。由滇軍叛逃到川軍的楊森知道滇軍雖敗不亂，為防止滇軍捲土重來，建議發起追擊戰，並充當先鋒晝夜強行軍，連克簡陽、資陽、隆昌等縣。10月3日，咬住滇軍趙又新部，將其圍困於瀘州，擊斃了對他恩重如山的軍長趙又新，顧品珍無心再戰，率軍回滇。10月上旬，川軍分三路直攻駐重慶的黔軍，黔軍總司令王文華逃往上海，殘部由盧燾代總司令率領，逃回貴州。靖川之戰，滇黔軍完全退出川境。
入川滇軍將領顧品珍原來就不滿意唐繼堯強驅滇軍入川混戰，更不同意倒熊之戰。這次率部離川返滇，決定乘機聯合第八軍軍長葉荃發動倒唐，與熊克武達成默契，並得其資助。1920年12月，先回滇的葉荃計畫襲取昆明。不料唐繼堯已得知葉荃部下告密，調集重兵迎擊，葉軍連遭敗績，幾乎全軍覆沒。後葉軍退往玉溪方向，而唐軍尾隨追擊。顧品珍乘唐軍兵力分散，遠離省城之機，於1921年2月初突然進軍昆明。唐繼堯措手不及，無力抵抗，於2月7日舊曆除夕倉皇逃至蒙自，企圖收集部隊反攻。2月8日，顧品珍率部進入昆明。顧品珍一面派民意代表“勸”唐繼堯出國遊歷，一面派兵進逼。唐繼堯不得已委任李友勛為第二衛戍區司令，龍云為近衛團長，同駐蒙自地區，作為日後東山再起的力量，然後率少量親信護衛乘滇越鐵路火車向南出走，流落香港。顧品珍即以滇軍總司令名義總攬軍民政務。倒唐之戰的結果，使顧品珍取代了唐繼堯在雲南的統治地位。
顧品珍執掌雲南軍政大權後，起用了一些滇軍舊將。如羅佩金，在1917年劉羅之戰失敗後回滇閒居，顧品珍委任他為迤南巡閱使。但是，顧品珍也與某些將領不和，如葉荃（雲南雲州人），後來出走廣州，在孫中山大本營中，任參軍長。又如楊蓁（雲南昆明人），原任第三衛戍司令，也與顧意見不合，被逐入粵。對唐繼堯舊部親信，顧品珍更是處處防範並加以打擊。
唐繼堯到達香港後，積極籌劃，準備返回雲南奪權，返滇之戰隨即打響。1921年秋，唐繼堯親信李友勛、龍雲等部借回響孫中山討伐桂系軍閥陸榮廷的名義，進兵廣西，攻下柳州。這時，唐繼堯即令所有在兩廣的滇軍，迅速脫離北伐大本營，開往柳州，與李友勛、龍雲部匯合。1922年2月，唐繼堯將集中在柳州的四千餘人編為第一、二、三、四軍。李友勛任第一軍軍長、龍雲任第一軍的前敵司令，率部返滇攻打顧品珍部。在回滇途中，李友勛被廣西自治軍擊斃，龍雲即代理第一軍軍長，繼續向顧品珍部進攻。顧品珍率部在滇東抵抗。3月，顧品珍戰死於路南天生關鵝毛寨，餘部潰散。第八旅旅長范石生、第一梯團長楊希閔部到廣東投孫中山。羅佩金則逃亡迤西，5月3日，被土匪普小洪捕殺於苴卻。
1922年3月，唐繼堯返回昆明，重新控制雲南軍政大權。唐繼堯將所部滇軍擴編為“建國軍”，自任川、滇、黔、鄂、豫、陝七省“建國聯軍總司令”。1922年，在貴州軍閥內訌中，劉顯世下台，流亡昆明，貴州實際已脫離了滇系軍閥的控制。這年底，唐繼堯已經在雲南重新站穩了腳跟，他組織了滇、貴聯軍，自任總司令，以劉顯世為副總司令決定重新控制貴州。1923年3月，唐繼堯以其兄唐繼虞為東南宣撫使兼滇貴聯軍前敵總指揮，率軍進入貴州。3月12日，貴州省長袁祖銘退入四川。唐繼堯、劉顯世聯名委任唐繼虞為貴州軍事善後督辦，劉顯世恢復貴州省省長職。唐繼虞將貴州分為五區、十餘分區，設定衛戍司令，進行嚴密控制，貴州再次淪入滇系軍閥的手中。
唐繼堯雖然控制了貴州，但是，其主力也被牽制在貴州這個貧瘠的省份，難以向外擴張。為了擺脫這種局面，唐繼堯只得和黔軍袁祖銘妥協。1924年，唐繼堯決定乘第二次直奉戰爭、吳佩孚下台之機，擺脫困境，問鼎中原，向外擴張，於10月份派出毛鴻翔、何麟書、盧燾為代表，與袁祖銘進行和平交接貴州的談判。到12月間，雙方達成了《滇黔和解協定》，主要內容為：駐黔滇軍全部由黔入湘，由袁祖銘派彭漢章回黔主政。1925年1月5日，唐繼堯通電黔境滇軍全部開拔，黔政概歸黔人自理。不久，唐繼堯即為占領兩廣而發動了第一次滇桂戰爭。
當孫中山在廣州組織大元帥府時，為了爭取唐繼堯，曾推舉他任副元帥職，但唐繼堯拒不就任。1925年初，唐繼堯趁孫中山北上病危之機，忽然通電就任副元帥，派出兩路大軍，假道廣西，聲稱前往廣州視事。1月下旬，龍雲率一路三萬餘人由雲南廣南府進發，占領廣西百色縣，沿各江直趨南寧。唐繼虞率一路二萬五千餘人由貴州榕江縣進入廣西，占領三江縣、融縣、直趨柳州。當時，桂軍李宗仁、黃紹竑部正在追擊沈鴻英，力量單薄，主動退出南寧。龍雲部即入駐南寧。桂軍以部分兵力牽制住南寧方面的滇軍，然而集中兵力，聯合半援的駐粵滇軍范石生部（總指揮楊蓁於6月在廣西遇刺身亡），先後在沙浦、慶遠、孫遠等地擊敗滇軍。柳州之唐繼虞部只好退回雲南。南寧之龍雲部也由於勢單力孤，被迫於7月上旬撤出南寧，退回雲南。
四鎮守使亂雲南
滇軍從廣西退回雲南後，雲南各界反唐繼堯的呼聲日高。當時，全國革命的激流洶湧澎湃，國民政府於1925年7月在廣州成立。1926年7月，廣州國民政府舉行北伐戰爭，橫掃兩湖和浙贛，北洋軍閥的統治已近末日。雲南人民對唐繼堯窮兵黷武，勾結北洋軍閥的行為十分憤恨。此外，自第一次滇桂戰爭後，唐繼堯乘機撤銷各軍番號，加強親信近衛部隊，寵信親族，排斥異己，也引起了不省滇軍將領強烈的不滿。1927年2月6日，蒙自鎮守使胡若愚、昆明鎮守使龍雲、昭通鎮守使張汝驥、大理鎮守使李選廷共同發動了雲南二·六政變（也稱雲南四鎮守使倒唐事件）。2月6日，四鎮守使發出聯名通電，要求唐繼堯驅逐肖小唐繼虞、陳維庚、李伯勛、白之瀚、李秉揚、李子由等。同時，胡若愚、張汝驥兩軍即向昆明進發。2月10日，胡若愚、龍雲等在宜良開會後，又以四鎮守使的名義發出通電，提出立即改組省政府，確立會議制度，提前成立軍事機構，統一軍權，清發欠餉，懲辦貪污，與廣州方面合作等要求。聲稱各項要求如唐氏不採納，勢必以兵戎相見。唐繼堯在各軍的軍事壓力下，被迫同意了這些要求，令唐繼虞等人出走，同意改組省政府。2月中旬，胡、張兩軍先後到達昆明。經過多次協商，最後決定廢除省長制，採取合議制，於3月初由各法團聯合會擬定組織大綱。根據組織大綱，推唐繼堯為雲南省政府總裁，推胡若愚、龍雲、張汝驥、李選廷、王人文、王九齡、周鍾岳、馬聰、張耀曾九人為省和委員會委員。在省務委員會之下，設軍政、內政、財政、外交、司法、教育、實業、交通八個廳。3月8日，新政府成立，總裁及省務委員宣布就職。在第一次省務委員會議上，公推胡若愚為省務委員會主席。
雲南二·六四鎮守使倒唐事件，名曰“兵諫”，實質政變，唐繼堯成了有名無實的“總裁”，他對雲南十四年之久的統治亦宣告結束。四鎮守使尤其是胡若愚、龍雲，都是唐繼堯一手提拔的部將，這次倒戈相向，令他氣憤交加。兩月後，即5月23日，唐繼堯病死，享年不過四十四歲。唐繼堯死後，舊滇系軍閥亦告結束。
二·六政變之後，蔣介石委任龍云為國民革命軍第三十八軍軍長，胡若愚為第三十九軍軍長，張汝驥為獨立第八師師長。雲南的實際大權操縱在胡若愚、龍雲之手。張汝驥倒向胡若愚一邊；而李選廷只有一個團的兵力，只求自保，不敢參與相爭。唐繼堯死後，胡若愚、龍雲、張汝驥各懷野心，為爭奪雲南的統治權，矛盾日益尖銳，不久即發生了六·一四政變，龍雲被囚禁。
1927年6月14日夜，胡若愚聯合張汝驥，突然派兵襲擊龍雲在昆明翠湖東路的住宅及第三十八軍軍部。一顆小型炮彈在龍雲住宅的花園爆炸，擊毀了門窗。龍雲的一隻眼睛被玻璃片砸傷，頓時鮮血淋漓，束手就擒，因為害怕他的武功高強，龍雲被胡若愚並在鐵籠子裡。龍雲的眼睛由於沒有得到及時治療，後來成為終生殘疾。這就雲南六·一四政變。
在六·一四政變生時，龍雲部主要將盧漢、朱旭、高蔭槐、周文人等趁混亂之機逃到滇西，邀請滇軍元老胡瑛代理第三十領先軍軍長，指揮部隊反擊昆明，在祥雲、祿豐等地展開激戰，擊潰胡若愚軍，乘勝進逼昆明。7月24日，胡若愚被迫挾持龍雲撤離，並將省主席的印信交給周鍾岳，請周轉告第三十八軍切勿追擊，他將保證龍雲的人身安全。7月25日，胡瑛率第三十八軍進入昆明，胡若愚退至昆明東郊大板橋時，恐怕第三十八軍追擊，於是便向龍雲表示和解，雙方達成了“板橋協定”，商定龍雲回昆明主持省政，胡若愚、張汝驥即行北伐，由龍雲在後方補充餉械。8月13日，龍雲回到昆明，接任第三十八軍軍長兼代雲南省政府主席，重新改造雲南省政府。
龍雲重新掌權後，並不遵守“板橋協定”，命盧漢、朱旭等部將胡若愚、張汝驥部包圍於曲靖，準備加以消滅。但此時，逃亡大理的唐繼虞趁昆明城防空虛，發兵進逼昆明，昆明危在旦夕。龍雲一面指揮部隊固守，一面派代表向胡、張疏通，表示不再為難，維護“板橋協定”。說成後，即將朱旭部調回昆明，將唐繼虞部擊退。
胡若愚、張汝驥被解圍後，也不執行“板橋協定”，卻與貴州周西成相勾結，聯合黔軍向昆明反擊。龍雲任命胡瑛為第三十八軍前敵總指揮，雙方在曲靖、宣威一帶反覆混戰，龍雲部將周西成之黔軍擊退，進而將胡、張部趕至川、滇、黔邊境。1928年1月，龍雲被蔣介石任命為雲南省政府主席，併兼國民革命軍第十三路軍總指揮，從而在雲南的地位逐漸鞏固。
1929年初，龍云為報周西成黔軍進犯滇東之仇，乃以胡瑛代理省主席，自率朱旭、張鳳春等師進軍貴州，發動了滇黔戰爭。與此同時，黔軍將領李燊 也在蔣介石及龍雲的支持下，由湖北宜昌率部回黔倒周西成。在龍雲和李燊 的聯合攻擊之下 ，周西成節節潰敗，4月間，周西成部在鎮寧一帶被擊潰，周西成也被擊斃。
滇黔戰爭爆發後，胡若愚、張汝驥認為有機可乘，聯合龍部叛將孟坤，分別從川南、滇東北合攻昆明，龍胡之戰又爆發。龍雲急調入黔之滇軍，星夜趕回昆明增援，與胡、張部激戰於昆明碧雞關。龍雲採用參謀長孫渡所獻之反間計，由胡瑛寄信給孟坤，卻故意將信送往胡若愚、張汝驥處，信中暗示與孟坤已部署當合擊胡、張，使胡、張對孟坤大為懷疑。當龍雲部發動反擊時，胡、張不增援孟坤，使孟坤部幾乎全這覆滅。待胡、張知道上當時，後悔已晚，只有退往滇西。龍雲揮師追擊，胡、張節節敗退，由華坪、寧蒗退入四川鹽源、木里一帶。1930年春，張汝驥在鹽源戰敗被俘，押到雲南下關槍斃；孟坤在渡江進，翻船淹死；只有胡若愚隻身逃脫，後率殘部併入桂軍。
從1927年六·一四政變算起，這場龍胡之戰經歷了近三年。龍雲最後消滅了對手，統一了雲南，確立了他在雲南的統治地位，當上了“雲南王”，雲南從此也進入新滇系軍閥的統治時期。
彝王龍雲和盧漢
舊滇系以清末陸軍第十九鎮為基礎發展而成，其首領是唐繼堯；新滇系則由舊滇系演化而來，其首領是龍雲，已屬於國民黨新軍閥之列。新滇系的主要將領有盧漢、孫渡、朱旭、張鳳春、張沖、劉政富、安恩溥、龍雨巷、龔順壁等。其中盧漢，也是彝族人，是龍雲的同鄉（昭通炎山人），與龍雲的家僅有一山之隔。辛亥革命時，盧漢剛十六歲，跟隨龍雲投身滇軍，以後歷任排長、連長、營長、團長、旅長、師長，成為新滇系軍閥中僅次於龍雲的實權人物。龍雲掌握雲南軍政大權以後，即依附蔣介石，參與國民黨新軍閥之間的混戰。1930年中原大戰爆發，桂系李宗仁、白崇禧及張發奎率部北上入湘，企圖與馮玉祥、閻錫山會師中原。蔣介石命令龍雲發兵討桂，並許諾如攻下南寧，則委派盧漢為廣西省政府主席。龍雲欣然受命，挑起了第二次滇桂戰爭。5月，龍雲令盧漢為前敵總指揮，率領三個師共十五個團二萬餘人進入廣西，抄襲李宗仁的後路。滇軍先攻占百色，7月，包圍南寧。南寧守軍韋雲淞部憑城固守，而滇軍則因氣候惡劣，水土不服，疾病流行，致使軍心怠惰，士氣沮喪，攻打南寧城三月而未下。9月底，桂張軍從湖南撤回，白崇禧率部回援南寧。經過兩周激戰，至10月中旬，滇軍失敗，退出廣西。1931年2月，滇軍撤回昆明，經過整編，僅剩下六個團，損失大半。
這時，龍雲借整編部隊之機，削弱異己力量，提出“廢師改旅”的整軍方案，而他可以越過旅長直接指揮團長。盧漢、朱旭、張鳳春、張沖四個師長不服，於1931年3月10日以“清君側”為名，進行倒龍，演出了“四師長倒龍”一幕。龍云為了避免“二·六政變”時唐繼堯的下場，以“掃墓”為名，離開昆明回昭通，實際只到尋甸羊街躲避風險。龍雲離開昆明後，四個師長由誰來當主席，議論紛紛，爭執不下。最後，盧漢、張沖只好把龍雲請回來當省主席。龍雲重返昆明後，宣布四個師長以下犯上之罪，下令全部扣押起來，立即撤銷各師番號，實行廢師改旅。不久，他又將盧漢、朱旭、張沖釋放，另行安排工作。未獲釋的張觀春不服，說話激怒了龍雲，當場被打了兩耳光，一直關押到抗戰初期。
這之後數年，龍雲全力加強雲南的統治，並建立起忠於自己的滇軍系統，成立軍官學校，直接向法、德、比、捷等國購買軍火，武裝滇軍。此外，在1935年及1936年間，龍雲奉蔣介石之命，對長征路過滇黔邊境的中央紅軍進行防堵追剿，受到蔣介石的嘉獎。
抗日戰爭爆發之後，龍雲先後擔任軍事委員會委員長昆明行營主任、國民黨陸軍副總司令。他在雲南積極組織人力物力，支援全國抗戰，並編成三萬人的第六十軍，以盧漢為軍長，安恩溥、高蔭槐、張沖為師長，開赴抗日前線。之後，又新編成第五十八軍和新三軍，與第六十軍合組成第三十軍團。之後，第三十軍擴編為第一集團軍和第一方面軍。滇軍在抗日戰爭中，參與了徐州會戰、武漢會戰等，為國家民族作出重大貢獻。出身於滇軍的第三軍中將軍長唐淮源、第三軍第十二師（追贈）中將師長寸性奇、第七十九軍（追贈）中將軍長王甲本、第四十八軍第一七一師少將副師長周元等，都是為抗戰而犧牲的烈士。1942年5月，日寇從緬甸入侵滇西，龍雲領導雲南軍民奮起抗戰，於1945年1月收復滇西。由於滇西抗戰及中國遠征軍入緬作戰，國民黨蔣介石的嫡系杜聿明、宋希濂、關麟征等部乘勢進入雲南，打破了由滇系軍閥統治的雲南這個獨立王國。
1945年8月抗日戰爭勝利，蔣介石任命第一方面軍總司令盧漢為中國戰區越南方面受降主官，令其率第一方面軍開往越南。當滇軍開拔後，蔣介石即坐鎮西昌，親自指揮昆明防守司令官杜聿明，於10月3日凌晨突然占領昆明市各要害地區，包圍龍雲的住宅。龍雲在倉皇中逃上五華山。清晨，杜聿明派人給龍雲送去蔣介石的命令，免去他軍委會昆明行轅主任、雲南省政府主席及所兼各職；任命他為軍委會軍事參議院上將院長，由杜聿明接收雲南地方部隊。龍雲拒絕離開昆明去重慶任職。蔣介石先後派何應欽、宋子文來勸駕，又以武力相威逼。龍雲無奈，只得於10月6日乘飛機到重慶任職。蔣介石這次“小偷式政變”（龍雲語），從此結束了龍雲在雲南的十年統治。
此後，龍雲擔任軍事參議院院長、戰略顧問委員會副主任（代主任）等閒職，實質遭到蔣介石軟禁。1948年秋，龍雲得到訊息，蔣介石要劫持他到台灣，因而決心出走。在行政院救濟部署空運大隊隊長、美國人陳納德的幫助下，12月8日，龍雲乘飛機秘密離開南京，經上海轉廣州，於9月乘輪船到達香港。龍雲到香港後，即從事反蔣民主活動，加入中國民黨革命委員會，成為民革中央負責人之一。
再說盧漢，於是1945年9月20日率領總部人員直飛河內，9月28日在河內總部主持了日軍受降儀式。當幾乎全部滇軍進入越南以後，蔣介石發動了10月3日“小偷式政變”，以武力解除龍雲職務，改組雲南省政府。10月4日，何應欽以中國陸軍總司令身份飛往河內，名為視察，實則監視盧漢行動。接著，空軍副司令王叔銘飛往河內，向盧漢宣布蔣介石的命令，任盧漢為雲南省政府主席，未接任前，由親蔣的新任民政廳長李宗黃（雲南鶴慶人）代理。對此事變，盧漢也無可奈何。
蔣介石原想以李宗黃取代盧漢，但李宗黃與警備司令關麟征鎮壓昆明民主運動，遭到雲南各界的強烈不滿。就在昆明“一二·一慘案”（毆打、殺害愛國請願的師生）的當天，盧漢回到昆明就任雲南省政府主席。但蔣介石要把滇軍調往東北參加內戰，盧漢此時受到控制，被迫同意。他將滇軍兩個軍即曾澤生的第六十軍和盧浚泉的第九十三軍交由孫渡指揮，合編為第六兵團，孫渡任兵團司令，於1946年春開赴東北參加內戰，孫渡還兼任東北“剿總”副總司令。但是，不到兩月，即5月31日，第六十軍第一八四師就在師長潘朔端的率領下在海城起義。到1948年10月，第六十軍二萬餘人在軍長曾澤生率領下在長春起義。而第九十三軍則被東北解放軍消滅於錦州，軍長兼第六兵團司令官盧浚泉被俘虜，派到東北的滇軍就這樣瓦解了。
由於滇軍被調往東北打內戰，盧漢在統治雲南的幾年間，為了掌握自己的武裝，不斷建立和擴充新型的以保全團隊為牌號的滇軍。到1949年，已擴編有十七個保全團，組成了以余建勛為軍長的第七十四軍和以龍澤匯為軍長的第九十三軍。6月，迫於形勢，蔣介石撤銷了由國民黨中央接近指揮的設在昆明的雲南警備司令部，成立雲南綏靖公署，盧漢以綏靖公署主任兼省主席，正式合法地總攬了全省的軍政大權。
龍雲從南京逃到香港以後，積極參與反蔣民主活動，成為民革中央的負責人之一。他多次派人回雲南與盧漢聯繫，策動雲南起義。盧漢也看到人民解放軍戰爭的形勢迅猛發展，蔣家王朝崩潰在即，也不願充當蔣介石的殉葬品，暗中也在作起義的準備。他一面與中共地下黨和游擊隊聯絡，一面派人與西康省政府主席劉文輝以及西南軍政副長官鄧錫侯、潘文華相約，在適當的時候共同舉行反蔣起義。因而，他在雲南開放了一定限度的民主運動，放鬆了新聞限制，拒絕國民黨中央軍和桂系部隊進入雲南境內，反對在雲南發行銀元券，撤銷軍師長管區和警務處，停止徵兵征糧等。
8月15日，龍雲與黃紹竑 等四十四位國民黨高級軍政人員，在香港發表《我們對於現階段中國革命的認識和主張》的聲明，表示脫離國民黨反動集團，歸向人民，受到中國共產黨和人民民眾的歡迎。這事，史稱“香港起義”。同一天，香港報紙登出“雲南在龍雲的策動下，已準備成熟，即將舉行起義”的訊息。國民黨行政院長閻錫山獲悉後，主張即以武力解決雲南問題，代總統李宗仁也下令指派桂系部隊入滇震懾。蔣介石恐怕雲南落入桂系之手，於8月24日由台灣飛往重慶，連續發電報召盧漢赴渝。
盧漢顧慮重重，怕被扣留，稱病不去，一拖再拖。蔣介石派俞濟時到昆明催促，盧漢無奈，只好派民政廳長楊文清、省政府秘書長朱景暄代表他前往。但蔣介石一定要盧漢親自去面商，同時派出中央軍余程萬第二十六軍、李彌第八軍、劉伯龍第八十九軍分路向雲南進逼，形成對昆明的包圍之勢。另外，西南軍政長官張群多次來電催促，表示願意擔保全全。盧漢迫於形勢，不得已於9月6日飛往重慶。臨行前，盧漢對安恩溥、龍澤匯等人說：“我這次去重慶，吉凶難卜，萬一被扣，就插紅旗，通電起義，不要管我。”他指定軍事由龍澤匯負責，政務由安恩溥負責。
盧漢到重慶後，即主動向蔣介石提出辭職。當時，蔣介石要利用雲南作為反共基地，需要穩住這塊大後方的秩序，因而他不僅沒有扣留盧漢，反而表示交給盧漢全權處理雲南問題，並撥軍費銀元一百萬元以及武器、彈藥裝備補充雲南兩個軍，但是，要盧漢逮捕黑名單上的一大批共產黨員及進步人士。盧漢表面上同意，於9月8日下午即飛回昆明，立即通知了黑名單上的一些共產黨員迅速轉移。
9月9日下午，雲南的特務在軍統西南特區區長徐遠舉等的率領下進行大搜捕，共逮捕近五百人之多。這就是“九·九整肅”事件。經過殘酷的審訊後，準備槍決的有一百多人，其餘的也大多判了刑。國民黨保密局局長毛人鳳企圖借刀殺人，嫁禍盧漢，將處理人員的名單送交盧漢，要他立即批准。盧漢採取複審拖延的辦法，直到11月初，李宗仁逃往香港路過昆明，經盧漢請求，李宗仁同意從寬處理這批人員，盧漢即下令一律釋放。
11月下旬，貴陽、重慶相繼解放，人民解放軍已迫近雲南，盧漢將其第七十四軍和第九十三軍調往昆明及其附近地區，作好起義的準備工作。12月1日，盧漢下令成立昆明警備司令部，加強治安管理，維持社會秩序。
盧漢準備起義這一情報，國民黨國防部駐雲南區專員兼軍統局雲南站站長沈醉已經掌握，他電告毛人鳳，請求指示。由於時局緊張，怕殺了盧漢會導致雲南人民更加強烈的反抗，毛人鳳遲遲沒有下達命令，只命令沈醉嚴密地監視盧漢。12月6日，沈醉親自去見盧漢，對他進行試探，提出要在昆明進行一次大搜捕和大破壞，但盧漢搖搖頭說：“目前時局緊張，不能這樣做，免得人心混亂。”以此來應付沈醉。同一天，西南軍政長官張群飛到昆明，監視盧漢，要把雲南建成反共的基地。
12月8日，蔣介石召集駐滇各軍軍長余程萬、李彌等開會。盧漢即利用余程萬、李彌離開昆明的時機抓緊布置，並決定於12月9日夜舉行起義。9日下午，張群、余程萬、李彌等又回到昆明。盧漢突然派兵把張群軟禁在自己家中，然後把張群的圖章抄走，並以張群的名義發出通知，邀請國民黨中央駐滇軍事首腦於當晚九時在盧漢公館舉行緊急會議。結果，當國民黨第八軍軍長李彌、第二十六軍軍長余程萬、師長石補天、空軍第五軍區副司令沈延世、憲兵副司令李楚藩、軍統雲南站站長沈醉等依時到達後，亦遭到軟禁。晚上十時正，盧漢在五華山雲南省政府主席辦公室宣布了“雲南起義”的命令。同時向全國發出起義的通電，成立了以盧漢為主席的雲南人民臨時軍事委員會，作為臨時的最高權力機關。
12月10日，盧漢迫使李彌、余程萬、沈醉等發布手令，命令國民黨中央軍及軍統特務停止一切的活動，服從盧漢的指揮。但是，第八軍和第二十六軍並沒有執行手令，從12月16日起，三面包圍昆明，全面發起攻勢。盧漢指揮昆明軍民，開始了艱苦的昆明保衛戰。由於戰況危急，盧漢不得已將李彌、余程萬、石補天釋放。他們出去之前都滿口答應，歸隊後，一定製止部隊攻打昆明。但是，他們歸隊後，不但沒有停止對昆明的進攻，反而打得更加激烈。國民黨軍一度進占昆明飛機場，推進到昆明城邊，但仍被昆明人民和起義部隊擊退。到12月21日，敵軍得知人民解放軍即將進抵昆明，紛紛撤退，堅持了一周的昆明保衛戰勝利結束。不久，人民解放軍迅速進軍滇南、滇東，徹底消滅了國民黨在雲南的全部軍事力量。1950年2月20日，陳賡、宋任窮率領解放大軍進入昆明。3月，雲南省成立軍政委員會，盧漢任主任。
雲南起義，標誌著滇系軍閥的最終結束。新滇系軍閥的首領龍雲和盧漢，在歷史的轉折關頭，都站到了人民的一邊。
餘波後記
1950年1月3日，龍雲離開了避居一年的香港回大陸，於1月18日到達北京。在新中國期間，龍雲歷任中央人民政府委員、人民革命軍事委員會委員、西南軍政委員會副主席、西南行政委員會副主席、全國人大常委會委員、國防委員會副主席、全國政協常委、民革中央常務副主席等。1957年，龍雲被錯劃為右派分子。1962年6月27日，龍雲在北京病逝。1980年7月，中共中央給予他徹底平反。在新中國期間，盧漢歷任雲南省軍政委員會主任、西南行政委員會副主任、全國人大常委會委員、全國體委副主任、全國政協常委、國防委員會委員、民革中央常委等。1974年5月13日，盧漢在北京因肺癌逝世。
而擔任國民黨西南軍政長官公署副長官的孫渡，兵敗後逃匿隱藏，1952年在清匪反霸運動中被人民政府逮捕，被關押改造，1963年獲特赦，曾任雲南省政協委員。1967年逝世。
曾任滇軍團長、少將旅長，中將警察廳長勛二位的朱德，因親身經歷了護國戰爭的勝利和軍閥混戰的失敗，知道了信仰的力量，一隻沒有信仰的軍隊無論如何英勇，最終的結果也只能消失的無影無蹤，為了找到這個維護戰鬥力的信仰靈魂，棄官離職，赴德國留學，經過周恩來的老師張申府介紹並加入中國共產黨。1927年後成了紅軍的創建者和領導者。他在滇軍學到的知識和積累的經驗，他的游擊戰開創者和大兵團指揮經驗，後來統統在年期一代的紅軍將領和整個紅軍身上得到移植和再現。即使是毛，在兵法上也不過是他的學生。這在井岡山就是公認的了。建國後，無可爭辯的成為共和國第一元帥、從這個意義上講，狹義的滇軍不存在了，廣義的滇軍護國精神卻沒有消失。
還有就是黃埔軍校初建的時候，從雲南講武堂廣州分校借去了全套講義和大部教師，其中就有葉劍英，當時就有人說黃埔不過是講武堂的黃埔分校。
滇軍60軍長春起義後，改編為中國人民解放軍50軍，在韓戰第一個攻入漢城，這也是自1840年以來我軍第一個打進別國首都，現在守衛西藏的陸軍52旅就是這隻軍隊的濃縮。
