呼瑪河有魚類9科33種,其中蛙科魚類4種,茵魚科1種、狗色科1種、鯉科19種、杴科3種、鯰科1種、鮑科2種、塘蹬科1種、塢科1種。其中蛙科的大馬哈色、哲羅色、細鱗包和茵魚科的苗色等為我國特產的冷水性魚類。呼瑪河的水溫、水質、環境適合冷水性魚類產卵繁殖和人工流放,歷史上就是大馬哈魚產卵場,也是我國保護較好的大馬哈魚繁殖地。大馬哈魚及其卵經濟價值較高,深受國內外歡迎。但由於捕撈過度及生境污染,產量日益減少。從解放後最高年產量4500噸,減少到1987年不足700噸。區內哲羅魚也是一種很名貴魚類,堪稱佳肴上品。哲羅魚是淡水中兇猛的食肉魚類,但5年才性成熟,繁殖能力低。除魚類外,陸生動物有駝鹿、紫韶、蔭、抱、狐狸、雪免、花尾核雞、黑琴雞等。動物區系分區屬 I A。屬國家保護動物級的有紫紹,二級的有駝鹿、旗、雪免、花尾愫雞、黑琴雞等。 日本人稱哲羅魚為“夢幻中的神魚”。一些垂釣愛好者千里迢迢專程來我國釣哲羅魚,他們認為一生中如能釣到一條哲羅魚就是最大的喜事,是吉星高照,
植物資源
保護區陸生植物有落葉松、樟子松、黑撣、白伸、楊樹、柞樹等d藥用植物有300多種。水生植物有野稗、兩棲彭、水兢、香蒲等。浮游植物有30種。植物區系分屬 I A2,屬國家重點保護的植物一級的有人參,三級的有椅了松、核桃揪、黃聚、水曲柳、刺五加、黃蔑 。