中心下設教學和行政機構兩部分,分管培訓期間的教學與日常工作。行政機構的職能是保障整個培訓計畫的順利開展、實施,包括與中國氣象局、商務部等國家培訓主管部門的聯繫, 制訂培訓計畫,發布招生信息,答覆學員申請以及培訓期間日常事務與活動的安排和
學員所在國國旗陣列世界氣象組織(World Meteorological Organization, WMO)作為聯合國系統的一個專門機構,始終把幫助世界範圍,尤其是開發中國家的氣象和水文部門的教育和培訓作為其工作重點之一,並為此積極採用各種途徑來開展教育與培訓的工作,其中包括建立世界氣象組織區域培訓中心。目前已在全球各地建立了23個區域培訓中心,南京區域培訓中心被譽為世界氣象組織在全球最活躍的五大區域培訓中心之一。
中國工程院院士陳聯壽在中心授課自培訓中心成立以來,根據氣象科技的發展和國內外氣象服務的不同要求,培訓的時間從兩周至七個月不等,內容涉及氣象專業的各個方
WMO教育培訓司長Wilson先生在中心授課中心擁有先進的實驗設備,如EOS-MODIS系統、SGI Altix3700 BX2並行計算機系統、極軌和靜止衛星雲圖接收機、人工氣候箱、虛擬實驗室、多卜勒雷達系統、多媒體網路系統和電化教學系統等。
智協飛教授帶領學員到工廠參觀實習培訓所用的教材和光碟資料隨著氣象領域的最新發現不斷更新。中心所開發的套用軟體在分析天氣數據以及作天氣預測方面位於世界前列。經過培訓,學員可以大大提高自己的氣象知識和業務水平,以便在回國後套用於本國的氣象實踐。
WMO秘書長雅羅先生參觀區域培訓中心世界氣象組織和許多學員派送國對我中心的工作給予了高度評價。世界氣象組織秘書長雅羅先生(Mr. Michel Jarraud )、原世界氣象組織主席鄒競蒙先生、齊爾曼博士(Dr. J. W. Zillman)和原世界氣象組織秘書長奧巴西教授(Prof. G. O. P. Obasi)曾多次來中心訪問,並對南京世界氣象組織區域培訓中心為世界氣象事業所做的巨大貢獻表示衷心的感謝。
