劇情簡介
高達seedC.E.70.02.11
地球聯合與Z.A.F.T.因為經濟的摩檫而引起對立，正處於膠著狀態，兩者試圖循外交手段來解決糾紛，但種種問題把兩方塞在岔道中，最後終於宣布開戰。
兩派的戰與和在所謂的“血染情人節”事件後變成了徹底的戰爭，情人節期間，人類利用核彈攻擊了新人類的衛星，造成大量傷亡。兩方勢力的全面開戰直接導致了一些事件的發生，比如將第三方中立勢力拖入戰鬥，也把一些少年捲入戰爭的鏇渦。
基拉·大和是一名的工業大學學生，曾與新人類勢力的最高權利人士薩拉議長的兒子阿斯蘭是非常要好的朋友，阿斯蘭回國後，基拉過著平靜的日子。一直到有一天與一幫朋友去學校，卻碰到ZAFT軍來這裡搶奪高達，基拉便因此得以進入高達內部開始駕駛高達，並與自己兒時的好朋友阿斯蘭作戰。
分集劇情
第1集
高達seedC.E.70年，追求政治經濟獨立的PLANT以“染血的情人節”事件為契機，與地球聯合之間正式爆發了武裝衝突。擁有MS的ZAFT軍在各地都對聯合軍取得了壓倒性的勝利，使得各方原先“地球軍將會以數量優勢取得勝利”的預測徹底落空了。11個月過去了，戰局依然呈現膠著狀態。基拉大和是在中立國奧布的資源衛星赫利奧波利斯上生活的一名普通的工業專科學校的學生。某一天，在前往研究室的時候，基拉被捲入了ZAFT軍奪取高達的作戰之中。利用突襲所產生的混亂，ZAFT軍很快奪取了5架高達中的3架。此時，正在尋找避難場所的基拉偶然發現了剩下的兩架高達，而前來奪取高達的ZAFT軍人之一，竟是他幼時的好友阿斯蘭·薩拉。
第2集
標題：その名はガンダム
基拉與地球聯合軍的軍官瑪琉一起乘上唯一未被奪走的強襲高達，離開了陷入爆炸之中的工場。但是，ZAFT軍的MS正守候在工場外面。負傷的瑪琉無法操作強襲高達，危急時刻，基拉代替瑪琉開始駕駛強襲高達，並修正了高達的作業系統。潛在能力被解放出來的強襲高達輕而易舉地擊破了ZAFT軍的MS。然而，危機解除後，基拉和他的朋友們卻被瑪琉以涉及軍事機密而“挾持”。同一時刻，前來接收高達的大天使號的殘餘人員在娜塔爾少尉的帶領下，啟動了大天使號；得知訊息的穆也回到了赫利奧波利斯的內部對大天使號進行援護。大天使號與ZAFT軍就在殖民地衛星的內部展開了激戰。
第3集
標題：崩壊の大地
在與ZAFT軍的拉烏激戰的時候，基拉駕駛強襲高達將赫利奧波利斯的壁轟開了一個大洞。驚訝於強襲高達的威力的拉烏選擇了撤退。基拉等人登上了大天使號。正當眾人驚詫於駕駛強襲高達的基拉只是個孩子的時候，穆看出了基拉是調整者。感覺到高達的威脅的拉烏選擇了再度攻擊大天使號，阿斯蘭也駕駛著剛強奪來的聖盾高達隨隊一同出擊。由於作業系統被基拉修改過，其他人根本無法駕駛強襲高達。隨著敵人的臨近，已決定不再駕駛高達的基拉不得不再度出擊。基拉與阿斯蘭，曾經的朋友在戰場上再次相逢。激烈的戰鬥中，早已傷痕累累的赫利奧波利斯開始解體。
第4集
標題：サイレントラン
帶著赫利奧波利斯解體時逃出的一艘救生艙，基拉回到了大天使號上，基拉等人的同學芙蕾也在這艘救生艙里。大天使號選擇前往友軍的軍事衛星阿爾特彌斯要塞；但這個行動被拉烏識破，並針對大天使號的路線立下了行動方案。作為友人，阿斯蘭一心希望基拉能回到調整者這邊來，因此對於拉烏的質問，他的回答是將說服基拉。被識破計畫的大天使號遭到拉烏隊的夾擊。為了減輕基拉的負擔，多爾等人志願來到艦橋協助瑪琉等人工作。被朋友們的行動及穆的言語所觸動的基拉，決定繼續駕駛強襲高達作戰。
第5集
標題：フェイズシフトダウン
在強襲高達面前出現的是被奪走的四架高達。混戰中，先行出擊的穆出其不意地襲擊了ZAFT軍的威薩利烏斯號，但伊扎克和迪亞克無視撤退命令，繼續攻擊基拉。能量消耗嚴重的強襲高達解除了相轉移裝甲，危急中，聖盾高達變形為MA形態強行將強襲高達帶走。在穆的援護下，強襲高達利用換裝補充了能量，艱苦地將伊扎克等人擊退。
第6集
標題：消えるガンダム
艱難地擺脫了ZAFT軍的追擊的大天使號逃入阿爾特彌斯要塞，然而在這裡等待著他們的是友軍士兵的槍口。雖然同在地球聯合內，但瑪琉等人所屬的是大西洋聯邦，而阿爾特彌斯要塞則是歐亞聯邦的勢力範圍。想要獲取高達的機密的阿爾特彌斯要塞司令加爾西亞軟禁了大天使號上的成員。克魯澤隊的尼科爾利用自己駕駛的迅雷高達特有的“海市蜃樓系統”破壞了阿爾特彌斯要塞的全周圍光波防禦帶發生系統，基拉趁隙駕駛強襲高達出來迎戰。但決戰高達及暴風高達此時已開始對要塞展開攻擊。在大天使號逃離之後，曾經誇稱“難攻不落”的阿爾特彌斯要塞開始崩壞。
第7集
標題：宇宙の傷跡
利用ZAFT軍攻擊阿爾特彌斯要塞的間隙，大天使號暫時逃離了克魯澤隊的攻擊。然而艦內卻出現了物資嚴重不足的新情況，為了解決這一問題，穆提出了利用位於碎石帶上的廢棄艦船上的物資的方案。另一方面，返回PLANT述職的拉烏和阿斯蘭，在國防委員長帕特利克·薩拉的指使下片面陳述了赫利奧波利斯事件。PLANT最高評議會內，強硬派勢力開始抬頭。為從“尤尼烏斯7”的殘骸中搬運物資的多爾等人擔當哨戒任務的基拉遭遇了一架偵察型金。為了保護多爾等人，基拉將偵察型金擊毀。在現場還發現了一艘救生艙，基拉將其帶回到大天使號上。
第8集
標題：敵軍の歌姫
高達seed第9集
標題：消えていく光
盼望已久的救援即將到來的訊息使大天使號艦內一片輕鬆。芙蕾的父親，地球聯合外務次官喬治·阿爾斯塔也隨先遣隊一同前來。但就在兩方匯合之際，克魯澤隊對先遣隊和大天使號發動了攻擊。芙蕾劫持了處於被軟禁狀態的拉克絲來到艦橋上，希望以拉克絲為質換得父親的安全，但就在此時喬治·阿爾斯塔所乘坐的“蒙哥馬利”號被擊沉。在先遣隊全滅、大天使號也岌岌可危的情況下，娜塔爾以拉克絲為人質，對克魯澤隊通訊，要求停火。
第10集
標題：分たれた道
因顧忌到拉克絲的人身安全，克魯澤隊停止了對大天使號的攻擊。芙蕾將父親的死歸咎於基拉不肯全力作戰。基拉與被軟禁的拉克絲相遇，言談之中自然而然地回憶起了阿斯蘭。得知兩人關係的基拉決意將拉克絲送回PLANT。通過塞等人的幫助，基拉駕駛著強襲高達將拉克絲還給了阿斯蘭。真正的訣別之後，被命運捉弄的兩人走上了截然不同的道路。
第11集
標題：目覚める刃
為了完成和朋友們的約定，基拉回到了大天使號上，並就私自放走拉克絲一事而受審。因其並非正式軍人，所以僅僅被要求反省便算完事。芙蕾聽到奪走父親生命的聖盾高達的駕駛員竟是基拉的好朋友，但她一反常態，為自己先前的表現向基拉道了歉，並開始主動接近基拉。
第12集
標題：フレイの選択
大天使號終於與地球聯合軍的第八艦隊匯合了。瑪琉就基拉為保護大天使號所做的一切而向其道謝。第八艦隊的哈爾巴頓提督親自來到大天使號上與老部下瑪琉見面，然後命令大天使號前往位於阿拉斯加的地球聯合軍的本部。其間，娜塔爾關於強行留下基拉的主張被哈爾巴頓駁回。塞等人從娜塔爾那裡收到了退伍許可證，然而此時芙蕾卻突然提出志願參軍。吃驚的塞等人撕掉了自己的退伍許可證，決心留在大天使號上盡一分力。在脫出用艦船前，朋友們將基拉的退伍許可證給了他，並且告之自己決心留下來。此時警報聲響起，總合了戰力的克魯澤隊再度全力襲來。基拉的腦海中浮現起瑪琉、哈爾巴頓以及避難的小女孩的話，放棄了自己的退伍許可證，回到強襲高達上待機。
第13集
標題：宇宙に降る星
位於地球軌道上的第八艦隊開始了與克魯澤隊壯絕的會戰。在數量上占絕對優勢的聯合軍艦隊被擁有4架高達的克魯澤隊打得毫無還手之力。大天使號緊急向地球降落，為了守護大天使號，基拉決定出擊。在掩護大天使號的同時，哈爾巴頓提督所在的旗艦與ZAFT軍的卡莫夫艦同歸於盡。戰鬥中，一直以來所保護的難民們所乘坐的救生船就在基拉的眼前被擊毀。以第八艦隊的重大犧牲為代價，大天使號終於降落到地球上。
第14集
標題：果てしなき時の中で
在與第八艦隊決戰的前夜，拉烏在威薩利烏斯號自己的房間裡回顧了自赫利奧波利斯遇襲以來的所有事情，並且提到了喬治·格雷恩——第一個調整者。喬治·格雷恩是在受精卵階段接受了人為遺傳因子操作而誕生的人，因此無論是智力還是身體，他都比一般人更加優秀，所取得的成就也令普通人望塵莫及。在乘坐自行設計的宇宙船執行木星探測任務的時候，喬治·格雷恩公布了自己出生的秘密。隨著調整者的逐漸增多，其與自然人的衝突也愈演愈烈，喬治·格雷恩本人也死於自然人的暗殺。
第15集
高達seed為了救起在突入大氣圈時因與決戰高達戰鬥而偏離了降落軌道的強襲高達，大天使號不得不修正了自己的航向，降落在位於ZAFT軍勢力範圍之內的非洲。得救的基拉由於戰鬥及突入大氣層時所受的傷害而發起了高熱。芙蕾意外地承擔起了照顧基拉的責任。受到嚴重刺激的基拉在芙蕾的安慰下，精神漸漸地平復下來，兩人的距離也慢慢地縮小了。抵抗組織“光明沙漠”的成員卡嘉莉發現了為了去阿拉斯加而在沙漠中前行的大天使號。
第16集
標題：燃える砂塵
非洲沙漠中，大天使號遭到有著“沙漠之虎”稱號的安迪·巴爾特菲爾德所率部隊的夜襲。基拉駕駛強襲高達出擊，但由於不習慣在沙漠中進行戰鬥而一度陷入了苦戰之中。就在這時，抵抗組織“光明沙漠”向大天使號伸出了援助的手，將巴爾特菲爾德隊的MS引入了地雷陣，擊退了敵人。
第17集
標題：カガリ再び、
依靠抵抗組織“光明沙漠”的幫助，大天使號艱難地打退了巴爾特菲爾德隊的猛攻。在與大天使號合流的“光明沙漠”的成員之中，基拉意外地發現了曾在赫利奧波利斯有過一面之緣的少女卡嘉莉。從“光明沙漠”的領導人塞布那裡，瑪琉等人得知了聯合軍的維多利亞基地已經陷落的訊息。目前唯一的方案，便是從紅海經印度洋、太平洋到達阿拉斯加。然而前進道路上最大的障礙，便是由“沙漠之虎”所率領的ZAFT軍。巴爾特菲爾德隊計畫對“光明沙漠”實施報復性攻擊。另一方面，大天使號上的眾人迎來了短暫的休息。正準備對強襲高達進行調整的基拉被捲入了塞和芙蕾的爭吵之中，芙蕾並且公然宣布了自己與基拉的關係。面對塞的詰問，基拉爆發了。這時，巴爾特菲爾德隊正式對“光明沙漠”所居住的村莊發動了攻擊。
第18集
標題：ペイバック
在事先進行過通告之後，巴爾特菲爾德隊以彈藥和糧食為目標對“光明沙漠”所居住的村莊發動了攻擊。在得知訊息趕過去救援的穆及“光明沙漠”成員到達村莊的時候，巴爾特菲爾德隊早已揚長而去。憤怒的“光明沙漠”的成員對巴爾特菲爾德隊實行了追擊，但由於實力過於懸殊，反使自己陷入了危機之中。基拉駕駛強襲高達趕到，擊退了巴爾特菲爾德隊。
第19集
標題：宿敵の牙
為了補充匱乏的物資，基拉和卡嘉莉等人潛入了ZAFT軍基地所在的巴拉迪亞的市場。兩人偶然與“沙漠之虎”安迪·巴爾特菲爾德相見，並捲入激進組織“藍色波斯菊”對“沙漠之虎”的暗殺行動之中。由於基拉和卡嘉莉遲遲不歸，大天使號被籠罩在不安的氣氛當中。格納庫內，塞試圖強行啟動強襲高達，但他的努力卻終告失敗。
第20集
標題：おだやかな日に
按照事先的約定，阿斯蘭來到拉克絲的家中作客。兩人談到了基拉，阿斯蘭得知基拉依舊保留著自己送給他的小鳥，心情鬱鬱不樂。在PLANT最高評議會上，穩健派和強硬派對採用繼續戰爭還是共存的不同手段展開了激烈的爭吵。另一方面，大天使號擬訂了強行突破“沙漠之虎”部隊的作戰計畫。
第21集
標題：砂塵の果て
伊扎克與迪亞克在直布羅陀基地與“沙漠之虎”部隊合流。大天使號與巴爾特菲爾德隊開始決戰，駕駛強襲高達的基拉也與安迪·巴爾特菲爾德交上了手。為了扭轉不利的局面，卡嘉莉駕駛空中霸王出擊。一番激戰過後，安迪·巴爾特菲爾德被重傷。
第22集
高達seed大天使號離開了光明沙漠，駛入紅海。基拉擊退了ZAFT古恩的進攻。
第23集
標題：運命の出會い
大天使號艱苦地打退了莫拉希姆隊的進攻，然而莫拉希姆隊依舊鍥而不捨地對大天使號實行追擊。卡嘉莉再度駕駛空中霸王出擊。與此同時，和尼高爾一起降落到直布羅陀基地的阿斯蘭被任命為薩拉隊的隊長，承擔起指揮對大天使號作戰的重任。阿斯蘭乘坐輸送機到卡奔塔利亞基地領取MS母艦，正巧被因機體中彈而偏離作戰區域的卡嘉莉發現。小戰過後，兩人同時落到一個無人島上。
第24集
標題：二人だけの戦爭
卡嘉莉駕駛的空中霸王與阿斯蘭所乘坐輸送機同時被擊落，兩人降落在同一個無人島上。在沙灘上遇到阿斯蘭的卡嘉莉被阿斯蘭以武力制服。由於電波障礙嚴重，兩人都無法與各自的部隊取得聯繫，只得在小島上度過了一夜。另一方面，基拉也在不停地尋找著卡嘉莉。天明的時候，兩人分別被各自的部隊救起。
第25集
標題：平和の國
大天使號與追擊的薩拉隊展開了激戰，由於作戰地點十分靠近中立國奧布的近海領域，因此雙方同時受到奧布軍的警告。卡嘉莉表明了自己是奧布公主的身份，幾乎被大破的大天使號進入了奧布的基地，薩拉隊被迫撤退。奧布的領導人烏茲米·納拉·阿斯哈向瑪琉等人表明了願意向大天使號提供協助的態度；但作為交換條件，奧布必須得到強襲高達的戰鬥數據，以及基拉必須到曙光社進行技術支持。
第26集
標題：モーメント
總集編。並添加了對五部集體的資料說明。
第27集
高達seed薩拉隊一行四人借著奧布內部親PLANT派的幫助秘密潛入了奧布。與奧布達成協定的大天使號開始在奧布的基地中進行修理工作；另一方面，曙光社的技術主任艾莉卡開始解析強襲高達的戰鬥數據。基拉來到曙光社，不但見到了曙光社正為奧布開發的M1Astray，還遇上了卡嘉莉。艾莉卡要求基拉協助曙光社開發M1Astray的作業系統。
第28集
標題：キラ
瑪琉向塞、多爾等人宣布了可以在軍隊本部與家人會面的訊息。除了芙蕾之外，眾人都十分興奮。在基拉調試M1Astray系統的閒暇里，卡嘉莉向基拉談起了自己加入抵抗組織的原因。塞等人和父母見了面。不願意見到父母的基拉在大天使號內等待著芙蕾，此舉卻被芙蕾認為基拉是在同情她，失態的芙蕾撕開了基拉心底的傷痕。基拉的父母單獨與烏茲米·納拉·阿斯哈會面，言談之中竟然牽涉著基拉出生的秘密。基拉成功地完成了改良M1Astray系統的任務；之後，在調整強襲高達時，阿斯蘭送給基拉的機械鳥突然飛走。追尋著機械鳥來到基地操場上的基拉意外地發現了秘密潛入的阿斯蘭。
第29集
標題：さだめの楔
修理完畢的大天使號即將從奧布的基地中出發。原本想與大天使號一起行動的卡嘉莉被父親的話所觸動，留在了奧布。在烏茲米、基拉的父母以及卡嘉莉等人的送別下，大天使號終於出發。阿斯蘭判斷出大天使號的行進路線，並在大天使號的必經之路上設伏。雙方在公海展開了激戰，依靠強襲高達的三種裝備，基拉在與薩拉隊四機的戰鬥中占了上風。為了掩護阿斯蘭，迅雷高達被使用劍裝備的強襲高達攔腰砍中，尼高爾戰死。
第30集
標題：閃光の刻
迅雷高達被擊破後，薩拉隊不得已撤退。勝利歸來的基拉受到整備班的祝賀，但他本人卻因為殺人以及與阿斯蘭的關係而無法釋懷。另一方面，薩拉隊的三人也因尼高爾的死而陷入痛苦之中，特別是阿斯蘭無法原諒尼高爾因自己的錯誤而戰死，決意殺掉基拉為尼高爾報仇。薩拉隊再度對大天使號發動了攻擊。強襲高達、空中霸王一號機與聖盾高達、決戰高達和暴風高達開始了慘烈的戰鬥。混戰中，大天使號遭受重創，多爾駕駛空中霸王二號機出擊。被穆擊落的迪亞克向大天使號投降。趕去支援基拉的多爾被阿斯蘭擊墜。憤怒的基拉和阿斯蘭均發動了SEED模式。一番死斗之後，阿斯蘭啟動了聖盾高達的自爆裝置並脫出，強襲高達和聖盾高達同歸於盡。
第31集
標題：慟哭の空
大天使號剛剛擺脫了薩拉隊的糾纏，卻又被奧斯曼隊追擊。在戰力嚴重缺損的情況下，瑪琉不得已放棄了對強襲高達和空中霸王二號機的搜尋救援工作，下令撤退。接受大天使號救援請求的奧布軍在基拉與阿斯蘭激戰的地方救起了阿斯蘭，並移交給ZAFT軍。被瑪爾基奧導師救起的基拉在拉克絲家裡甦醒過來。
第32集
標題：約束の地に
大天使號終於到達了阿拉斯加，但卻被命令在艦內待機。克魯澤告訴逐漸恢復的阿斯蘭，他因出色的表現而將被授予星雲勳章。塞一直安慰著因多爾在戰鬥中失蹤痛苦的米麗亞莉雅。大天使號的醫務室里，米麗亞莉雅對冷嘲熱諷的迪亞卡舉起了刀，被剛剛進來的塞攔住；隨後而來的芙蕾對迪亞克開槍，卻因被米麗亞莉雅撲住而射偏。
第33集
高達seed以維利亞姆·薩扎蘭德上校為首，地球聯合軍軍令部開始對大天使號上的指揮人員進行審議。另一方面，養傷中的基拉得到了拉克絲的精心照顧。雖然肯定了大天使號的戰績，但薩扎蘭德上校認為瑪琉對此前一系列的事態應負相當的責任。查問會結束後，薩扎蘭德還下達了穆、娜塔爾和芙蕾的轉屬命令。為了接受星雲勳章，阿斯蘭從地球乘坐太空梭返回PLANT。
第34集
標題：まなざしの先に
穆、娜塔爾和芙蕾三人告別了大天使號。隨後大天使號接到命令，由第八艦隊轉屬阿拉斯加守備軍第五護衛隊。由帕特利克·薩拉親自發布命令，ZAFT軍發動了SpitBreak作戰。然而其目標卻並非原先的巴拿馬，而是地球聯合軍總部所在的阿拉斯加。在聯合軍主力全往巴拿馬布防的情況下，作為守備隊的大天使號不得不出擊迎戰。正在拉克絲家裡休養的基拉得知了SpitBreak作戰發動的訊息，為大天使號上的友人們擔心不已。侵入聯合軍總部的克魯澤遇到了尚未離開的芙蕾。聽到克魯澤的聲音，芙蕾的眼前出現了父親的幻覺。克魯澤將芙蕾擊昏並帶走。拉克絲領著基拉來到自由高達的格納倉庫。帶著拉克絲的期盼，基拉駕駛著自由高達離開了PLANT。依靠著自由高達的強大力量，基拉輕易擊破了兩架攔截的MS，卻與剛從地球返回的阿斯蘭失之交臂。
第35集
標題：舞い降りる剣
“真·SpitBreak作戰”進行中。雖然ZAFT軍取得了壓倒性的優勢，但由於聯合軍的頑強抵抗所造成的傷亡也不少。克魯澤、穆和娜塔爾得知了聯合軍真正的作戰計畫，即以阿拉斯加基地為誘餌，把ZAFT軍吸引到這裡，然後使用半徑為10千米的破壞武器——“獨眼巨人”予其毀滅性的打擊。穆返回到大天使號上，並將聯合軍的真意告訴了瑪琉等人。瑪琉決定撤出戰場。然而，大天使號正被密密麻麻的ZAFT部隊重重包圍著。千鈞一髮之際，駕駛自由高達的基拉趕到，為大天使號解了圍。基拉將通過瑪琉得知的聯合軍的作戰方案，於是通告了正在交戰的雙方，並勸雙方停止交戰，迅速撤離阿拉斯加基地。“獨眼巨人”系統啟動，並造成了巨大的破壞。“SpitBreak作戰”失敗的訊息傳到了剛剛回到PLANT的阿斯蘭耳中，同時，他還得知了“在拉克絲的幫助下，新MS被奪取”的訊息。
第36集
標題：正義の名のもとに
由於“SpitBreak作戰”的失敗及自由高達被奪取，PLANT陷入一片混亂之中。PLANT最高評議會議長帕特利克·薩拉命令剛回到PLANT的阿斯蘭去搜尋自由高達被盜的協力人——拉克絲。另一方面，與大天使號合流的基拉與眾人商討今後的出路。因為大天使號是未經許可私自撤離戰場，所以返回聯合軍的話肯定會以敵前逃亡罪被拘捕，還不如流亡到奧布。阿斯蘭終於找到了拉克絲，然而對於拉克絲“戰鬥的意義”的疑問，他卻無以為答。被拉克絲告知基拉在地球上，阿斯蘭駕駛著正義高達開始出擊。
第37集
標題：神のいかずち
大天使號到達奧布，然而卻無法自由行動。奧布原代表烏茲米·納拉·阿斯哈接到了地球聯合“若不協力則視為敵對行為”的威脅。在地球聯合軍的另一處重要據點巴拿馬，於“SpitBreak作戰”中遭受嚴重失敗的ZAFT軍捲土重來，想要破壞巴拿馬的質量加速機（MassDriver）；聯合軍方面則投入了量產型MSGAT-01StrikeDagger以對抗，但在ZAFT軍的超級武器“貢格尼爾”（這個名稱來源於北歐神話中主神奧丁所使用的長矛）面前幾無抵抗之力。奧布將回收修復後的強襲高達轉交給了大天使號，換成可由自然人進行操作的作業系統之後，配給了穆駕駛。
第38集
標題：決意の炮火
巴拿馬之戰的結果是聯合軍高層（不如說是大西洋聯邦的人更合適）萬萬沒有想到的，焦慮的他們派藍色波斯菊的總帥穆爾塔·阿茲拉艾爾率領太平洋艦隊前往討伐“非我即敵”的奧布。隨同他們前往的除了量產型MS外，還有最新的三部GAT系列高達。聯合軍的太平洋艦隊兵臨城下，一直保持中立的奧布不得不準備開戰。大天使號決定幫助奧布抵抗聯合軍的技工，因此基拉駕駛的自由高達和穆駕駛的強襲高達與奧布的M1Astray一起並肩作戰。眾人陷入了與無視光束攻擊的禁斷高達、強力的接近戰型強奪高達以及高火力的災厄高達的苦戰之中。而在這時，前來援助基拉等人的，是阿斯蘭駕駛的正義高達和被釋放的迪亞克駕駛的暴風高達。
第39集
標題：アスラン
高達seed第40集
標題：暁の宇宙(そら)へ
聯合軍太平洋艦隊再度對奧布發起攻擊。戰鬥越發激烈，奧布本土岌岌可危，隨時都有可能陷落。奧布原代表烏茲米再三權衡後，決定放棄奧布本土。奧布的殘存部隊集中在宇宙艦草剃號及大天使號上，預備由質量加速機上向宇宙發進。在基拉和阿斯蘭兩人的聯手通力支援下，草剃號和大天使號成功地擺脫了太平洋艦隊的攻擊，自大氣圈脫出。臨行前，卡嘉莉終於知道了自己和基拉的兄妹關係。目送草剃號和大天使號離開後，仍留在奧布的烏茲米按下按鈕，進行了壯絕的自爆。
第41集
標題：ゆれる世界
脫離了大氣圈的草剃號和大天使號準備前往位於L4的廢棄了的殖民衛星群。在PLANT，帕特利克·薩拉的肅正行動仍在繼續；而克萊茵派也針鋒相對地在地下持續進行著反戰宣傳。一直追求以和平方式來解決爭端的前最高評議會議長西格爾·克萊茵在肅正行動中被射殺。芙蕾與克魯澤和伊扎克一起返回PLANT。聯合軍在奪回了維多利亞基地的質量加速機之後，為追擊大天使號而向宇宙發進。卡嘉莉向基拉告知了兩人的雙胞胎關係；阿斯蘭想回到PLANT，再次與父親好好談一談。另一方面，娜塔爾前往月面基地就任大天使級二號艦主天使號（Dominion）的艦長，軍銜也晉升為少校。
第42集
標題：ラクス出撃
阿斯蘭前往ZAFT的宇宙要塞“雅金·杜埃”與父親見面，但帕特利克·薩拉“這場戰爭的目的就是為了滅絕自然人”的回答讓阿斯蘭徹底死了心。為了從阿斯蘭那裡獲取自由高達與正義高達的所在，帕特利克將阿斯蘭拘禁起來；得知訊息的拉克絲等人立即開始行動起來。將脫出的阿斯蘭收容的，是以拉克絲為指揮官的ZAFT軍的新造戰艦“永恆號”，而艦長正是安德魯·巴特菲爾德。向宇宙要塞“雅金·杜埃”發進的永恆號遭到了ZAFT軍追擊隊的攻擊。危急時刻，駕駛自由高達的基拉出現，解救了永恆號。草剃號、大天使號和永恆號在L4的殖民衛星“門德爾”會合了。安迪、拉克絲這些“克萊茵派”的人，也與大天使號的眾人再度見面。
第43集
標題：立ちはだかるもの
得到ZAFT軍正在向大天使號駐留的L4殖民衛星群發進的訊息後，藍色波斯菊的總帥穆爾塔·阿茲拉艾爾帶著三架高達來到主天使號上，準備搶先一步對大天使號發動攻擊。另一方面，正在追擊永恆號途中的克魯澤，似乎對門德爾這個地方十分的熟悉。主天使號對大天使號、永恆號及草剃號所在的門德爾發動了突襲。除了未完成最終調試的永恆號之外，大天使號和草剃號先後出動迎戰。雙方交戰之前，娜塔爾向大天使號表明了自己的身份，勸眾人投降並表示願意在軍事法庭上作證；但被瑪琉婉言謝絕。在娜塔爾的出色指揮下，大天使號被打得毫無還手之力，草剃號也被牽制住無法行動。克魯澤隊於此時趕到。看著正在交戰的雙方，克魯澤決定帶著伊扎克秘密潛入門德爾。感應到克魯澤的存在的穆也和迪亞克回到了殖民衛星。前去幫助大天使號的基拉，自己也陷入了極其嚴重的境地。
第44集
標題：螺鏇の邂逅
危急時刻，基拉和阿斯蘭先後爆發了種能力，將不利局面扳了過來；克羅特等三人被打得一敗塗地，機體能量逐漸見底；與此同時，草剃號也擺脫了牽制，前來協助大天使號。見勢不妙的娜塔爾當機立斷，下令撤退。另一方面，穆和迪亞克在殖民衛星內部遇上了秘密潛入的克魯澤和伊扎克，四人捉對展開了激烈的MS戰。得知駕駛暴風高達的對方正是迪亞克的伊扎克大吃一驚，而迪亞克也要求和伊扎克談一談。發覺穆和迪亞克仍未歸來的基拉也前往殖民衛星內部，正好救下了被克魯澤擊傷的穆。在克魯澤的有意帶領下，穆和基拉來到了研究所內部。在研究所里，克魯澤不僅說出這裡就是基拉的出生地，而且還透露出一個驚天的秘密……
第45集
標題：開く扉
在殖民衛星門德爾的研究所內部，穆和基拉兩人因克魯澤說出的衝擊性的事實而受到極大的震撼：原來基拉是雙胞胎中唯一被進行遺傳基因操作而在人工子宮裡成功出生的新人類；而克魯澤竟然是穆的父親——阿爾塔·佛拉達的克隆體；克魯澤的最終目的，則是終結這個充斥著欲望的世界。穆和基拉留在了研究所里；克魯澤則返回了威薩利烏斯號上。克羅特等三人恢復過來後，主天使號再度對大天使號發動了攻擊；而強襲、暴風和自由三架高達均未返回的大天使號，只得由正義高達獨自應戰。另一方面，返回到威薩利烏斯號上的克魯澤，將“打開門的鑰匙”託付給了芙蕾之後，開始向大天使號發動攻擊。
第46集
標題：たましいの場所
戰鬥中，芙蕾帶著“打開門的鑰匙”乘上救生艙離開了威薩利烏斯號，並發出了救命信號。聽到芙蕾的聲音後，基拉迅即趕往救生艙，但卻為三個強化人所阻攔，救生艙被主天使號回收成功。終於得到了“打開門的鑰匙”里關於“中子干擾消除器”的情報，阿茲拉艾爾不禁大喜過望。遭到主天使號和ZAFT艦隊夾擊的大天使號等三艘戰艦突破了ZAFT艦隊的阻擊。草剃號和永恆號向ZAFT的旗艦威薩利烏斯號合力發動了攻擊。在曾經的部下阿斯蘭和迪亞克的敬禮中，亞迪斯艦長和威薩利烏斯號永遠地消失在漆黑的宇宙之中。由於主天使號的三個強化人都達到了活動的界限，ZAFT方面也失去了旗艦威薩利烏斯號，大天使號等終於在激戰中得以生還，但受傷醒來的基拉卻因未能救出芙蕾而十分愧疚，在拉克絲的膝上痛哭不已。
第47集
標題：悪夢は再び
得到了“中子干擾消除器”的情報的主天使號暫時撤離了戰鬥，向月球方向撤退，準備用核武器來壓制新人類。然後，從月面基地發進的地球聯合軍第六、第七艦隊帶著裝備了“中子干擾消除器”的核彈頭向ZAFT軍的宇宙要塞“博亞茲”進軍。沒有料想到地球方面會擁有“中子干擾消除器”的ZAFT軍被打得大敗。醉心於“博亞茲”的勝利的地球聯合軍，更進一步地向PLANT本國發射了核彈，幸好被駕駛自由高達和正義高達的基拉和阿斯蘭聯手阻止。焦慮不已的帕特利克·薩拉生怕“染血的情人節”的悲劇再現，決定對地球聯合軍的艦隊使用ZAFT方面的核武器——“Genesis（創世紀）”。
第48集
標題：怒りの日
ZAFT軍的秘密武器“創世紀”所放出的γ射線肆意地射向地球聯合軍的宇宙艦隊，地球聯合軍傷亡慘重。雖然深為“創世紀”的恐怖所震撼，藍色波斯菊的盟主阿茲拉艾爾卻主張繼續攻擊。在彼此的兵器的恐怖和被煽動的戰意驅動下，地球聯合軍和ZAFT軍開始向你死我活的戰場發進。另一方面，基拉等人為了阻止核武器和創世紀繼續造成破壞，決定介入地球聯合軍和ZAFT軍的死斗。最終之戰的序幕，即將拉開。
第49集
標題：終末の光
“創世紀”發動了第二波攻擊，直接摧毀了月面基地，從月面基地出發的地球聯合軍艦隊也被全滅。斷絕了後路和援軍的主天使號在阿茲拉艾爾的堅持下只得孤軍奮戰。在激烈的戰鬥中，M1Astray小隊成員大半陣亡，使得卡嘉莉的種能力覺醒；禁斷高達和災厄高達相繼被趕來協助的決戰高達和正義高達擊毀；穆所駕駛的強襲高達在與克魯澤駕駛的神翼高達的對決中受損，不得不暫時撤回大天使號。大天使號和主天使號仍然在持續地互相攻擊。娜塔爾不願意再繼續這種毫無意義的戰鬥，在阿茲拉艾爾舉槍威脅下仍然下令全員棄船，結果自己被阿茲拉艾爾射殺。阿茲拉艾爾單獨對大天使號發動了最後的進攻，穆駕駛強襲高達為大天使號擋住了這致命的一擊，自己卻壯烈犧牲（其實沒死）。萬分痛苦的瑪琉下令擊毀了主天使號。
第50集
標題：終わらない明日へ
感應到克魯澤的存在的基拉駕駛著自由高達與天命高達開始了死斗。混戰中，迪亞克所駕駛的暴風高達被天命高達的浮游炮擊中；駕駛決戰高達的伊扎克前來援救，卻被強奪高達所阻擊。決戰高達使用了暴風高達的大型光束炮，將無論是機體還是機師都到達極限的強奪高達擊毀，克羅特戰死。在與克魯澤的死斗中，基拉處於一邊倒的不利局面，流星系統也被擊毀。就在這時，基拉突然發現了逃生艇上的芙蕾，當兩人行將見面時，逃生艇被神翼高達的浮游炮擊毀，芙蕾死亡。草剃號和永恆號同時向創世紀開火，但由於相轉移裝甲的保護，創世紀安然無恙。阿斯蘭和卡嘉莉決定進入雅金·杜埃要塞內部來破壞創世紀。陷入瘋狂的帕特利克·薩拉將創世紀的下一個目標定為北美大陸的華盛頓，並開槍打傷了勸阻他的部下，最後被部下射殺。雅金·杜埃的自爆系統被啟動，然而自爆程式上還連帶著創世紀的發射命令。阿斯蘭決定以一己的犧牲讓正義高達在雅金·杜埃內部自爆來阻止創世紀的發射，卻被卡嘉莉勸阻。基拉與克魯澤的死斗也終於到了最後。神意高達的駕駛艙遭到自由高達光束劍的直擊，克魯澤死亡。雅金·杜埃發生爆炸，創世紀同時發射，神意高達首當其衝，自由高達也被波及。PLANT臨時最高評議會發布了停戰通告，戰爭終於結束。劫後餘生的阿斯蘭和卡嘉莉相擁而泣。在從大天使號上飛出的機械鳥的帶領下，阿斯蘭和卡嘉莉找到了飄浮在宇宙中的基拉。
——seed完結——
名詞解釋
專有名詞
SEED
高達seedMobileArmor（MA）/機動堡壘
被視為是地球連合軍標準宇宙戰鬥單位的泛用型單座重型戰鬥機。藉由重裝甲抵擋敵人的攻擊，在一對一的情況下足以擊落一個目標的火力，和可以與常規戰鬥機匹敵的機動性，MA被設計成為在戰鬥中以最小的代價換取最大的效力-換句話說,，將熟練的駕駛員的損失減到最少。然而，這些機器現在只能襯托ZAFT的革命性的戰鬥兵器MobileSuit（MS）。地球連合軍當初估計一台ZAFT的MS的戰鬥力量只是等同於不過2~3台MA，已經證明是錯誤的；根據統計，至少需要5台MA才能拿下一台MS。
關於MA，並沒有對其清楚的定義,不過，現在被認為是非人型的戰鬥機械的總稱。曾經是由戰鬥機和作業用機械發展而成的MA，一般認為泛用性比MS低，戰鬥力也比其弱。實際上，作為地球連合的主力MA的Moebius，和MS的戰鬥力之比為1：5，這個差別可以說是致命的。但是，在大戰初期活躍的MoebiusZero，單機就能充分地和MS對等對戰甚至在其之上。這樣強的秘密，就在於可以遠距離遙控操作的Gunbarrel，不過要使用這個武器需要駕駛員擁有特殊的才能（過人的空間掌握能力）。正因為這個緣故，表明著雖然MA的泛用性很低，但是如果選擇了適應戰鬥情況的武裝，進行力所能及的任務，也能發揮不亞於MS的戰鬥力。從這個含義來看，在Boaz攻略戰投入的核武裝的Moebius，可以說是MA的究極形態。
MobileSuit（MS）/機動戰士
ZAFT的革命性的戰鬥兵器，以關節聯動肢體給它超高的可動性和泛用性。當大多數的MS都是以人型存在，利用機械臂使用武器的時候，ZAFT也已經發展了有4隻腿的型號以適應地面的戰鬥。由於它們的複雜性，這些機器只能被調整者正常地操作，而地球連合軍以及其他國家為自然人努力開發的高度自動化作業系統在CE71年初還沒有成果。為了能在N-Jammer的影響下工作，MS被設計使用電池而並非核動力為它們提供電力驅動。結果，它們只能在再充電之前進行有限的活動，而且它們通常需要一艘太空船、潛水艇、或陸上戰艦提供後勤支持。MS的祖先是在宇宙空間工作的、以電力驅動的PowerSuit（強化宇宙服），在對木星航行的探險船齊奧爾科夫斯基由喬治·葛倫首次套用。在C.E.63，P.L.A.N.T.開始秘密設計用於軍事用途的機動戰士。第一個原型在C.E.65中完成，而且二年之後第一種量產型MSGINN開始投產。
Gundam/高達
無論大西洋聯邦還是ZAFT，對由大西洋聯邦開發的MS的稱呼是“G”。而“Gundam”，只是將“G”的作業系統的首字母連讀起來而已。
由大西洋聯邦開發的MS“G”的作業系統，其全稱呼為GeneralUnilateralNeuro-LinkDispersiveAutonomicManeuver，也就是“通過單方向的分散型神經連線進行自律機動的泛用統合型系統”。
而由ZAFT生產的MS“G”的作業系統，其全稱呼為Generation:UnsubduedNuclearDrive/AssaultModuleComplex。表示“無限制的核驅動使用世代的強襲模組複合體”。
C.E
CosmicEra，SEED/SEEDDESTINY時代的曆法。
AD.時代末期，石油資源枯竭、環境污染日趨嚴重，經濟不景氣之風暴席捲全世界。各個國家之間採用排他性的經濟封鎖政策。在此影響下，地球為幾大勢力分割。同時，民族、宗教紛爭更為激化，世界被捲入之後稱為R.C.War（ReconstructionWar/重組戰爭/又名第三次世界大戰）的促進國家統合、再編的大戰。在相當於CE01年的時期，在中亞戰線（克什米爾地區），核武器被使用（“最後之核”）。以此為契機，其後的世界紛爭結束的機會日漸升高。在相當於CE09年的時候，戰爭結束，在聯合國主導下，作為新的曆法:統一歷（CosmicEra）被制定。同時發表進行宇宙開發計畫的宣言。而將統一歷的元年，定在使用“最後之核”之年。
而SEED本篇發生的時間，位於CE70年。
Coordinator/調整者
為了誕生出先天擁有優秀能力的下一代，在受精卵階段就進行基因工程改造，籍此生出高智商和高生理機能的人類。調整者學習比普通人快，而且他們的身體相對比較強壯，對大部分先天性疾病免疫。但由於這些不同，他們被所謂的自然人，即未經基因工程提高的人類所妒嫉和排斥。近幾十年來,地球對遺傳基因的修正的禁令和反調整者情緒的高漲已經迫使大多數的調整者遷徙到宇宙的殖民地即是P.L.A.N.T。但是還是有一部分留在地球上、或在宇宙間為地球陣營工作的。進行一個調整者的遺傳基因的修改只能在胚胎髮育早期階段進行。然而，這些遺傳基因的提高能被調整者的孩子繼承。當自然人的父母生出他們的調整者孩子的時候,孩子是描述為第一代調整者,然後第一代調整者的孩子將會是第二代調整者,等等。
調整者的時代開始於C.E.15，喬治·葛倫在全世界的網路上公開他的出生秘密而且發表了相關的遺傳基因的工程技術的時候。然而，從那個時候開始關於全面禁止操作人類基因的法律持續了許多年，而且也從那個時候開始第一代調整者也秘密地誕生於統治階級的後代中。由於開發宇宙必須有適合宇宙環境的人類，加上C.E.29喬治·葛倫從外太空帶回的“Evidence01”使宗教界失去其權威，第一次調整者嬰兒潮在C.E.30開始（原因包括需求對技術的改進和成本的降低）。但當C.E.55，由於S2型流行感冒流行，導致自然人將原因歸咎於調整者針對喬治·葛倫被暗殺所作的報復行動，遺傳基因的修正再一次禁止在地球使用。
本來喬治·葛倫的初衷是“讓調整者成為連線過去與未來的橋樑”，但是在C.E.70開始，為了顯示與自然人不同，P.L.A.N.T內有相當大的勢力鼓吹調整者是“新人類".
Natural/自然人
相對調整者而言，沒有進行Coordinator基因改造或通過遺傳繼承調整者基因而出生的人類就稱為“Natural”。在CosmicEra時代，基因改造也用於預防遺傳疾病，但是只是受到“矯正”的基因改造的人仍然歸類為Natural。對調整者的羨慕和妒嫉已發展到迫害的階段。更甚者還有激進的反調整者團體BlueCosmos。
GeorgeGlenn/喬治·葛倫
出生於CE元年前16年、在匿名科學家研究團體的手裡誕生的第一位調整者。天生擁有高於自然人的智商和生理機能的喬治，20歲就獲得諾貝爾獎提名、運動健將、王牌飛行員、還任職於大西洋聯邦的連邦航空宇宙局（FASA）。CE15，他搭乘探險船齊奧爾科夫斯基開始到木星的單程7年航行，同時在全世界的網路上公開他的出生秘密而且發表了相關的遺傳基因的工程技術。
喬治到木星的旅程甚至引起進一步的爭論。在衛星Europa附近，他發現了化石即Evidence01，證明外太空生命的存在。在此之後，C.E.29返回地球的他在殖民地Zodiac專心從事對這一個化石的研究，同時從C.E.38開始利用他的新意念建造新的殖民地PLANT。但在C.E.53，喬治被一個因為自己非生為調整者而感到悲觀的少年所暗殺，此事成為一件激發自然人和調整者之間矛盾的事件。
BiologicalCPU/生體CPU
一種為了駕駛MS而人工地增強的人類。雖然平常的自然人沒有特別調整過的OS幫忙的話就不能操縱MS，但是這些被增強的人的能力等同於甚至超越一般的調整者。地球連合併非將他們分類為駕駛員，而是將他們視為計算機的中央處理單位的人類同等物。其中一種生體CPU被稱為“BoostedMan”。他們的腦部和腺體中經外科手術安裝了微植入物，戰鬥時將恐懼之類的情感抹煞，並提高其進攻性。他們也被給予一般劑量的γ-Glipheptin以提高他們的精力和反應速度，但是當藥物時效過後，他們就會遭受戒斷症狀，迫使他們從戰場撤離。“γ-グリフェプタン”（GammaGlipheptin，架空藥物）為來自兒茶酚胺的類似多巴胺和去甲腎上腺素這些和腦內信息傳達有關的物質。但是不能在體內生成，必須定期性的補充。耗盡的話思考能力降低，最終成為廢人而死。藥效是麻藥兼興奮劑。因此生體CPU們不能違背和背叛地球連合，地球連合通過這樣使他們保持忠誠。
戰鬥用調整者
地球連合軍在ZAFT尚未出現前，在調整者技術公布後研究出來的調整者。為了研究並擁有最強的士兵，經過多番失敗，終於完成了“索希斯”。為了控制它們，連合使用了心理控制，通過藥物消去了他們的感情，並讓他們服從他們的指揮官，並且不能攻擊自然人。但是由於大戰爆發，他們大部分被“廢棄”、“處理”或逃脫。
SuperCoordinator（日本名稱）/UltimateCoordinator（美國名稱）/超級調整者
指由GARMR&D的響博士負責的其中一項研究。調整者的身體情況除受基因影響外，母體也是一個重要的不確定因素。為了保證母體不會影響調整者的基因表達，響博士甚至想出利用人工子宮培育胚胎的方法。但是經過多次試驗，最終只有唯一一個“完成品”，那就是KiraYamato。
過人的空間辨識能力
使用線控式桶炮和龍騎兵系統的基本條件。在調整者內在SEED播放完畢後的現在還沒有公開擁有這種能力的人（新的外傳中有1人），在自然人里現在可知的只有4人。在GrimaldiFront時還存在15人的MoebiusZero的中隊，但是倖存者只有穆·拉·佛拉達。這種能力並不等同於NEWTYPE。
婚姻管制
PLANT實行的生育政策。
為了提高后代的質量，PLANT實行了婚姻管制，那就是“由優秀的人生出優秀的後代”，即根據基因的配合為其選擇配偶（阿斯蘭和拉克絲就是這種情況）。但是實行的結果是第三代調整者的出生率不斷下降（原因不詳）。貫徹“調整者是與自然人不同的新人種”的激進派堅持認為通過科技（例如人工子宮）能解決這個問題，而溫和派主張嘗試和自然人通婚，引入新的血脈。
OrderoftheNebula/星雲勳章
ZAFT軍對傑出軍人所授予的最高榮譽。
勞·盧·克魯澤因為在CE70.2.22的世界樹攻防戰中，駕駛GINN擊落MA37架，戰艦6艘而獲得此榮譽。
後來阿斯蘭因擊落Strike而獲得同樣的榮譽。
勢力
P.L.A.N.T
高達seed這些沙漏風格結構由二個直徑各十公里的圓盤狀的生活區組成，圍繞兩者之間的中央區的一點鏇轉從而產生人造地心引力。錨定每個生活區和中央區的是中央高達30公里的軸心塔和邊緣網路分布的高強度固定索，而且一組高速電梯在軸心塔內部連結生活區和中央區。固定於中央區外面的一組反射鏡，用於將太陽光反射進生活區的內部。
P.L.A.N.T是由12個區域（稱為“市”）組成，每個“市”有自己專長的部門。這些市按羅馬的月份排列，而每個市由10個殖民衛星組成，以Januarius市為例，命名為JanuariusOne、JanuariusTwo....如此類推。
P.L.A.N.T的建造在C.E.38開始,由大西洋聯邦，歐亞聯邦和東亞共和國出資籌建。最初P.L.A.N.T被一個由這些出資國組成的理事會全權管理，但是在C.E.53P.L.A.N.T的管理已轉交給由居民推舉的PLANT評議會。藉由C.E.70在P.L.A.N.T和地球之間敵意的產生，P.L.A.N.T變成一個獨立的國家，由PLANT評議會統治。
ZodiacAllianceofFreedomTreaty(ZAFT)/自由條約黃道同盟
PLANT的軍隊。ZAFT是一個由平民的志願者組成的民兵，而且組織沒有正式的等級結構，因此，它的成員被描述成"指揮官"和"船長".ZAFT軍的成員被組織進入按照指揮官之名命名的獨立隊伍，而且就像現代的美國海軍的戰鬥小組那樣在陸地、海洋、天空、外太空都能表現出眾。ZAFT是由經過遺傳基因改造的調整者組成，因此它的戰鬥力並不遜於在數字上占優的地球聯合軍。
ZAFT的士兵在進入軍隊前都在軍校接受各種各樣的訓練，在每一屆總成績的前10名將獲得象徵著精英的紅衣。
ZAFT本來是一個被稱為ZodiacAlliance的政治組織，在C.E.50中由SiegelClyne和派屈克·薩拉成立。ZodiacAlliance在C.E.65改稱成今天的名字，而且三年之後它被重新組織變成一個裝備機動戰士的軍事組織。ZAFT軍隊現在直接由PLANT最高評議會控制，對派屈克·薩拉擔任委員的國家防衛委員會負責。
EarthAlliance/地球聯合
一個由曾贊助PLANT建立的理事國和他們的地球盟友組成的對ZAFT的國際聯盟。地球聯合併不是一個單一的政治實體，而是像一些暗中矛盾重重的國家為了對付共同的敵人而合作的組織。在地球聯合裡面占主導地位是大西洋聯邦、歐亞聯邦和東亞共和國。南美合眾國和南非統一機構是在戰爭的開始被大西洋聯邦併吞的。
當聯合國的領導在CE70.2.7哥白尼月面城市的一個恐怖活動中遇害的時候，大西洋聯邦發表了對PLANT的宣戰公告並帶頭組成地球聯合。
地球聯合的總部在JOSH-A。在C.E.71年初其他主要的要塞包括台灣的高雄宇宙港，中美洲的巴拿馬宇宙港，非洲東部的維多利亞宇宙港，和托勒密宇宙基地。
OpposeMilitancy&NeutralizeInvasionEnforcer(OMNIEnforcer)/反戰反侵略主張者（地球聯合軍）
地球聯合軍的正式名稱。前身是大西洋聯邦的宇宙警察機關，後來成為大西洋連邦宇宙軍（FSF）後和東亞共和國航空宇宙軍組成現在的地球聯合軍。
OrbUnion/奧布
太平洋南部的一個島國，擁有和它細小的國土和貧乏的天然資源不相稱的相當龐大的工業和軍事力量。它的資產包括高度先進的尖端科技，來源於眾多活火山口的地熱能和對調整者的無差別政策。奧布也有自己的質量加速器並且擁有自己的宇宙殖民地，資源衛星Heliopolis。
在奧布複雜的政治體制中，力量集中在一個被選舉出來的議會和五個原來統治奧布的貴族的代表。奧布的代表，烏茲米納拉阿斯哈，從戰爭開始時就宣布了國家保持中立。然而,貴族之間存在不和，他們其中的一些正在秘密地通過協助大西洋聯邦進行Gundam開發計畫從而開發奧布自己的武裝技術。
軍隊和曙光社等位於淤能碁呂島（代表首長是薩哈克家），而本土和行政府位於ヤラファス*島。（ヤラファス是位於太平洋上的加羅林群島的雅浦島的神）
AtlanticFederation/大西洋聯邦
這一個國家是地球聯合中占主導地位的勢力。在戰爭之前，大西洋聯邦是贊助了PLANT的建造然後強迫他們的調整者居民成為經濟上的奴役的理事國中最有影響的一個。當聯合國的領導在哥白尼月面城市的一個恐怖活動中遇害的時候，大西洋聯邦帶頭組成地球聯合而且發表了對PLANT的宣戰公告。大西洋聯邦本來是由英國和北美的國家組成，但是因為南美合眾國在對PLANT戰爭的開始被地球聯合武力吞併了，所以現在它的領土也包括整箇中美洲和南美洲。它的主要軍事基地是位於北美洲西北端阿拉斯加的JOSH-A，行政首府是北美洲的華盛頓。
Terminal/終端
與各方面交換情報的NGO（非政府組織），也進行某種程度的情報評價。可以認為是象黑手黨般的流氓組織，或者是善意的地下組織，不過說不準只是單純的情報販子的工會。不屬於任何陣營，不過現在似乎對Lacus和大天使號持有好意。Terminal在全世界配置了代理人，似乎有著與各國政府的情報機關並駕齊驅的情報能力。
事件
《AlaskaDeclaration》/《阿拉斯加宣言》
CE70.2.7，身為理事國代表的大西洋連邦主張，認為針對月面會議的恐怖行動是PLANT方面所為，且這是PLANT對地球，也就是說斷定此為對自然人全體的宣戰公告。並且宣布設立“地球連合”這個國際組織，以取代已經崩潰的理事國。4天后即CE70.2.11，地球連合向PLANT宣戰，戰爭正式開始。
BloodyValentine/“血染情人節”
CE70.2.14，戰爭爆發後3天，地球連合軍發動第一次攻擊。其中連合軍出發前，由BlueCosmos所屬的將校發令，有一發核彈被秘密地搬入MA航空母艦羅斯福號。因為核彈攻擊，導致120座殖民衛星之一：食物生產殖民衛星Junius7遭受破壞，造成243,721人死亡（其中包括PLANT評議會的扎拉委員之妻）。地球連合後來宣稱這是PLANT方面的自爆作戰，但是在PLANT，這場屠殺成為大量年輕的調整者自願加入ZAFT軍的導火線。
尤利烏斯條約
C.E.71.09.27，隨著第2次Jachin=Due攻防戰的結束，連合和ZAFT之間的戰爭實際上結束了。一個月後，在非洲的南非統一機構的首都奈洛爾，雙方開始展開了談判（其中中立國斯堪的納維亞王國扮演中介角色）。經過長時間的談判，雙方在C.E72.03.10，在尤利烏斯7的上空，由地球連合大西洋聯邦的總統雅威格（アーヴィング）和PLANT臨時評議會議長艾琳·卡納巴簽訂了停戰條約，並在尤利烏斯7的殘骸建立了紀念碑。
條約締結後，因為雙方都有不滿，因此在PLANT，新的議長由GilbertDullindal擔任；而連合的總統則由被選舉出來的約瑟夫·柯普蘭（ジョゼフ・コープランド），擔任（背後有BlueCosmos撐腰）。ZAFT大部分撤離地球，不過通過以高隆等作為交換，換回加潘塔利亞和直布羅陀的控制權（名義是“監視”）。對於條約的維持，雙方均以中立國/中立組織（廢物商工會）等進行定期的監查。
故事年表
C.E.70
2/14，“血色情人節”事件爆發，PLANT所屬衛星“Junius7”被核彈攻擊，隨後崩壞。阿斯蘭的母親在襲擊中死亡。
C.E.71
PLANT對地球的能源與工業製品的供給繼續進行。擔任出資的理事國群保留此恩惠給自己並強大化。理事會轉而對PLANT加諸繁重的規範。然而，非宗主國就理事國獨占PLANT的利益之事，反對高漲。
1/25，在Heliopolis，為奪取連合的新型MS，克爾澤隊潛入。大約6小時後Heliopolis崩壞。大天使號為躲避克爾澤隊的追擊，靜默潛行。
1/27，大天使號入港由歐亞聯邦管理下的小行星Artemis，遭到拘留。
2/2，在“血染情人節”一周年紀念日之際，先於追悼慰靈團出發前往“Junius7”殘骸進行事前調查的拉克絲·克萊茵的乘船“SilverWind”遭到攻擊。
2/3，在PLANT評議會內，阿斯蘭·薩拉就聯合的MS進行證言。在同一天的議會內，巴特利葛·薩拉的發言表達其態度轉為強硬路線。議會開始再檢討“OperationOuroboros”。在碎石帶，基拉·大和救助拉克絲·克萊茵。
2/6，由第8艦隊先遣隊發出的通信到達大天使號。
2/7，大天使號企圖與第8艦隊先遣隊合流，但先遣隊被克爾澤隊消滅。同行的大西洋連邦阿爾斯塔事務次官死亡。
2/8，基拉獨斷地將拉克絲·克萊茵交給阿斯蘭。
2/11，大天使號與第8艦隊合流。就在此之前，與從Gamow出發的GAT－X系列三機交戰，伊扎克·修爾受傷。 2/13，芙蕾·阿爾斯塔等人正式加入地球連合軍。與第8艦隊合流的大天使號雖企圖降落地球，但受到克爾澤隊的追擊。為此，第8艦隊壞滅（“低軌道會戰”）。受到議會再檢討“Ouroboros”的壓力，非洲戰線強化。維多利亞宇宙港陷落（“第二次維多利亞攻防戰”）。
2/14，在PLANT，實施“血染情人節”追悼儀式。為維多利亞陷落的捷報錦上添花。大天使號降落到位於ZAFT勢力範圍內的非洲共同體——利比亞沙漠。伊扎克·修爾與堤亞哥·艾爾斯曼降落到直布羅陀基地。
2/15，安特留·巴爾菲盧特攻擊大天使號。大天使號與非洲共同體的抵抗組織“黎明之沙漠”合流。基拉與卡嘉莉·尤拉·阿斯哈重逢。
2/16，巴爾菲盧特隊焚毀“黎明之沙漠”的主根據地塔修。“黎明之沙漠”追擊巴爾菲盧特隊，造成“黎明之沙漠”多人死亡。
2/20，基拉與卡嘉莉在バナディーヤ與安特留·巴爾菲盧特相遇。
2/22，阿斯蘭·薩拉訪問克萊茵官邸。PLANT評議會內，決議強化“OperationOuroboros”。克萊茵議長與採取強硬路線的薩拉國防委員長的意見對立表面化。
2/26，伊扎克、堤亞哥與巴爾菲盧特隊合流。
2/28，巴爾菲盧特隊追擊大天使號亦遭失敗，巴爾菲盧特隊敗北。阿斯蘭與尼高爾從PLANT本國出發，前往地球。
3/3，大天使號離開紅海，在亞丁灣受到姆拉西木隊的攻擊，首次進行水上戰鬥。
3/6，阿斯蘭與尼高爾降落於直布羅陀基地，與伊扎克等人合流後，組成薩拉隊，並開始向卡潘塔利亞基地移動。
3/7，大天使號，在印度洋上與姆拉西木隊交戰。雖將其擊破，但是卡嘉莉行蹤不明。阿斯蘭前往卡潘塔利亞基地途中，輸送機遭受攻擊，阿斯蘭行蹤不明。
3/8，阿斯蘭與卡嘉莉在印度洋的無人島上，度過一夜。
3/15，大天使號到達馬六甲海峽，與早等在那裡的ZAFT部隊交戰（“馬六甲海峽突破戰”）。薩拉隊因為潛水航空母艦故障，因此並未參與戰鬥。大天使號雖未受到致命性的損害，但多處中彈受損。
3/23，大天使號，到達奧布近海。遭受薩拉隊的追擊。由於在馬六甲的中彈受損而陷入苦戰的大天使號乘機墜落以便進入奧布領海，在奧布的馭慮島入港。
3/25，基拉在馭慮島的地下基地，協助開發“M1Astray”。
3/28，薩拉隊潛入奧布。基拉與阿斯蘭隔著鐵絲網重逢。
4/1，PLANT評議會舉行議長選舉，巴特利葛·薩拉就任議長。薩拉議長明明白白地表示其強硬路線，將“Ouroboros”的強化版戰爭決策“OperationSpitbreak”在議會上提出。同日獲得表決通過。只是此時所提出的作戰目標是巴拿馬。
4/15，大天使號，從奧布出航。不久後受到薩拉隊的追擊。尼高爾·阿馬爾戰死。
4/17，薩拉隊在馬紹爾群島攻擊大天使號。多爾·克尼戰死。基拉·大和行蹤不明。同時，堤亞哥·艾爾斯曼成為俘虜。
4/18，加嘉莉收留脫出後而漂流的阿斯蘭。
4/21，基拉被摩盧基襖導師極隱密地帶到PLANT的アプリリウス市克萊茵官邸。
5/1，摩盧基襖導師向PLANT評議會提出《奧爾巴尼亞讓步案》，但遭到否決。
5/2，大天使號，到達阿拉斯加的JOSH-A。阿斯蘭自克爾澤隊轉屬（改隸），從卡潘塔利亞基地出發回國。
5/5，瑪琉·拉米亞斯出席查問會。“OperationSpitbreak”發動，但因為攻擊目標變更為阿拉斯加的JOSH-A，因此從發令到實際攻擊開始，共歷經72小時。基拉接受拉克絲託付的Freedom（“Freedom搶奪事件”）。
5/8，穆、娜塔爾與芙蕾因為改隸命令而從大天使號離職。“OperationSpitbreak”的第一波攻毀滅壞滅。此時，連合軍首腦群極秘密地以潛水艇脫逃。芙蕾·阿爾斯塔被勞·盧·克爾澤俘虜。一般的報導，均將JOSH-A的崩壞敘述為“ZAFT使用了新型強大破壞力的兵器”。歐亞連邦、東亞共和國對阿拉斯加作戰表達其不滿，與大西洋連邦之間生嫌隙。
5/10，巴特利葛·薩拉針對“Freedom搶奪事件”以及情報泄漏的懷疑，肅清克萊茵派。並將拉克絲·克萊茵與西格爾·克萊茵二人以叛國罪發出通緝令。
5/11，阿斯蘭在為轉用為農地而予以破壞的Junius市5區的劇場“WhiteSymphony”，與拉克絲見面。
5/15，大天使號脫離連合，在奧布入港。
5/17，阿斯蘭受領“Justice”，降落地球。5/25，ZAFT攻擊巴拿馬（“巴拿馬攻略戰”），使用了“Gleipnir”。另外，在此戰鬥中，連合初次將量產型MS“StrikeDagger”投入實戰。因為此作戰之故，ZAFT縮小非洲戰線，從直布羅陀基地大量導入兵力。質量加速器“PortaPanama”被“Gleipnir”破壞。
5/29，在地球聯合首腦會議內，軍事產業連合理事摩路達·阿滋拉艾魯唆使攻擊奧布。歐亞連邦與東亞共和國雖然反對攻擊奧布，但是被大西洋連邦強行通過。在該首腦會議中，亦決定發動“維多利亞奪回作戰”。這次由歐亞連邦與東亞共和國作為主力。
6/1，地球聯合，對保持中立的赤道聯合、斯堪的那維亞共和國以及奧布聯合首長國等國呼籲“非我即敵政策”
地球連合利用媒體等，對大眾做大規模的宣傳作戰。在台面下，則幾近恐嚇地要求各國政府加入聯合。
6/13，大西洋連邦的第4洋上艦隊南下，要求奧布解任阿斯哈代表、議會立刻解散並放棄武力。連合給予奧布48小時的考慮時間。
6/14，卡茨等11人從大天使號退艦。阿斯蘭在馬紹爾群島，與摩盧基襖導師會面。
6/15，阿斯哈代表拒絕大西洋連邦的要求，大西洋連邦發動“奧布解放作戰”。連合軍的新型GAT－X系列，“Calamity”、“Forbidden”與“Raider”初次投入實戰。奧布極秘密開發的MS“M1Astray”亦初次投入實戰。阿斯蘭駕駛“Justice”介入奧布戰爭。基拉與阿斯蘭，毫不掩飾地重逢。
6/16，阿斯哈代表懷著戰敗的覺悟，讓大天使號與草薙逃脫進入宇宙，並且和“Morgenroete”以及質量加速器“輝夜”、馭慮島的地下軍事設施共同自爆。由奧布下議院所選舉出來的臨時政府接受了大西洋聯邦的投降勸告，受大西洋聯邦所監護。
6/18，草薙與在軌道上的船體各部份進行大氣圈外的接合，與大天使號共同向L4開始移動。以歐亞連邦為主力的連合軍，侵略ZAFT占領下的維多利亞基地（第三次維多利亞攻防戰）。因“StrikeDagger”的大量投入，以及阿拉斯加戰役之後，ZAFT地上軍弱化之故，戰局朝向有利於聯合的方向推移。數種“StrikeDagger”變種機體和新型試作機等投入實戰，進行實戰評價。
6/20，娜塔爾·芭基露露就任大天使號級二號艦——主天使號艦長。
6/25，維多利亞宇宙港陷落。自爆裝置亦在啟動的前一刻，被特殊部隊突入所阻止。聯合奪回維多利亞後，維多利亞成為連合的主力宇宙港。
6/26，PLANT評議會在維多利亞陷落的同時，宣布加強宇宙戰力。勞·盧·克爾澤被召回本國。
6/27，勞·盧·克爾澤帶著芙蕾·阿爾斯塔從卡潘塔利亞基地出發。
6/28，摩路達·阿滋拉艾魯從維多利亞上宇宙。
6/30，大天使號一行，到達L4的殖民衛星Mendel。
7/1，阿斯蘭回到PLANT會見父親。拉克絲·克萊茵與安特留·巴爾菲盧特一齊奪取新造艦“永恆號”。
7/3，“Calamity”、“Forbidden”與“Raider”配屬於主天使號。摩路達·阿滋拉艾魯以觀察者的身分隨同搭乘此船艦。
7/5，“永恆號”到達Mendel，與大天使號以及草薙合流。
7/7，克爾澤隊，肩負追擊“永恆號”的任務，到達L4。
7/12，主天使號，在Mendel與大天使號等發生戰鬥。在Mendel，基拉以及穆與克爾澤碰面，基拉在此知道出生的秘密。芙蕾·阿爾斯塔帶著“NeutronJammerCanceler”的設計圖，前往主天使號。克爾澤隊的Nazca級戰艦“Vesalius”被擊沈，亞堤司艦長戰死。其後，以拉克絲·克萊茵為中心的“永恆號”下的船艦，一邊與奧布殘黨、PLANT的舊克萊茵派、連合的和平派等取得聯絡的同時，著手求取和平與早日終止戰爭。在摩盧基襖導師盡力下，“永恆號”一行獲得回收業組織等的強大力量，得以轉戰各地。
7/16，連合首腦會議秘密決議，決定開發“NeutronJammerCanceler”搭載型核彈，且編組“PeaceMaker”隊。芙蕾·阿爾斯塔，順利地脫離俘虜身份後，因為帶回“重大且有益”的情報而晉升，依其自身之希望，配屬於主天使號。
7/24，地球軍侵略直布羅陀基地（第二次卡薩布蘭加海面戰）。ZAFT放棄直布羅陀基地，從歐洲撤退。
8/8，地球軍發動以攻擊卡潘塔利亞基地為最終目標的“八·八作戰”，對大洋洲連合的攻擊激烈化。第一批“Ayersrock降下作戰”開始。地球軍將自維多利亞送上去的MS部隊降下，來自澳洲內陸的地上部隊與太平洋艦隊夾擊大洋洲聯合，以攻占澳洲東、北岸為目標。自此時起，從維多利亞宇宙港，MS、人員、物資陸續到達月球。開始流傳將發生大作戰。
9/11，地球聯合軍司令部發動以攻擊PLANT本國為最終目標的“Elvis作戰”，極秘密地從各方面集結戰力。 9/23，“Boaz攻略戰”。“PeaceMaker”隊進行核攻擊，Boaz陷落。
9/26，“第二次Jachin=due攻防戰”，雖對PLANT本國進行核攻擊，但是被前來介入的拉克絲·克萊茵等人阻止。ZAFT使用“GENESIS”，第一發擊破連合40%以上的戰力。
9/27，“GENESIS”第二發。將兼具補給任務的連合第二批攻擊部隊及月面Ptolemaios基地一齊破壞。主天使號被擊沉。娜塔爾·芭基露露與摩路達·阿滋拉艾魯戰死。穆·拉·佛拉達失蹤（後被地球軍救走並修改記憶，在第二季以“尼奧·羅阿諾克”的名義出現，於48集恢復記憶）。巴特利葛·薩拉為隨從槍殺。“Jachin=due”自爆，“GENESIS”亦因為進入內部自爆的“Justice”而崩壞。被抵抗組織所救出的艾琳·卡納巴等人，與舊克萊茵派議員共同向地球聯合要求停戰。
C.E.72
2099年
3月10日，地球聯合與PLANT臨時評議會在“尤尼烏斯7”的遺蹟上空締結了停戰條約。
條約規定禁止使用核引擎及中子干擾消除器，禁止海市蜃樓技術用於軍事途徑，還對MS的保有數進行了限制。
4月，ZAFT新世代MS“新千禧年系列”的第一期型“ZAKU”開始進行地上測試。同一年內非洲事件發生。
獲獎記錄
年份 頒獎方 獎項及獲獎者
2002第25回Animage大獎 年度最佳作品
2002《NEWTYPE》 年度最具人氣動畫
2003《NEWTYPE》 年度最具人氣動畫Top.1
2003第8屆神戶動畫獎 最佳電視動畫作品
2004《動感新勢力》 年度最具人氣動畫Top.2
2004 第3屆東京國際動畫博覽會 人設大賞（平井久司）
2004 第3屆東京國際動畫博覽會 年度最佳TV動畫作品
2004 第3屆東京國際動畫博覽會 年度最佳動畫作品
2013 日本“大家的聲音”網站最受歡迎高達系列作品TOP.2
評價
高達seed在故事初期的機械設定上，作品體現出了較高的素質，但是終究這部動畫的側重點並不在此，所以中後期部分在高達本身最具魅力的機械設定方面顯得有些力不從心。以人物設定而言，當在高達整個系列中天才機師已經不再稀罕，對於作品中幾位英俊瀟灑的年輕人來說，機師的本來意義比較薄弱，更像是一種類似稱謂的存在，真正致命的力量在“爆種”這一概念。
在音樂製作方面，本作最為突出的一點在於“歌姬”這一角色的營造，很明顯能夠看出向《MACROSS》致敬的影子，並且請來梶浦由記為作也算是一種對於定位的訴求。
本作在商業化方面取得很大成功。放送期間取得了平均6.2%，最高8%的出色收視率，DVD銷售量亦相當驚人，平均達5.8萬卷，OST原聲輯的銷售量亦佳。
細膩的感情描寫、華麗的人設以及高質量音樂，為高達系列吸引一大群新的年輕愛好者。正是因為擁有高人氣，令C.E.紀元成為繼U.C.紀元之後第二個擁有MSV的系列。
同時，主角們的偶像化和絕對正義化在這部作品中十分明顯，後期的機械設定也愈來愈華麗。一方面為高達帶來新的觀眾，另一方面，後期越來越“高大全”的主角們體現出個人英雄主義，遭致一部分觀眾的批評。
