高粱基因組

高粱基因組

科學家利用全基因組鳥槍測序法完成了對高粱基因組的測序,高粱基因組測序的完成將促進該作物的改良,並有助於完成其他相關植物的測序工作。

高粱基因組高粱基因組

高粱是全球第五大禾穀類作物,在乾旱、半乾旱地區農業生產中占有極其重要的位置.高粱基因組相對較小(750Mbp),遺傳多樣性豐富,被認為是禾穀類作物比較基因組學研究的模式基因組之一.近年來,綜合運用AFLP等分子標記、BAC文庫、EST及cDNA作圖和FISH技術,加速了高粱高解析度基因組圖譜的構建.高粱基因測序、基因功能鑑定克隆,以及遺傳轉化,亦取得了長足的進展.高粱特有的多種適應逆境脅迫等優異基因資源發掘及其在作物改良中的套用前景廣闊。

序列的獲得

高粱基因組高粱基因組

高粱是一種穀物,作為糧食飼料纖維燃料作物廣泛種植。它耐熱、耐旱,是西非薩赫勒地區很多人口的一種主食作物。將該基因組與玉米水稻的基因組所做的對比,為了解草本及C4植物光合作用(這種光合作用在高溫時尤其能夠高效吸收碳)的演化提供了線索。另外,可能對高粱的抗旱性能有貢獻的蛋白編碼基因及miRNAs也可能被找到。高粱產量的提高一直落後於其他作物,其基因組序列的獲得有可能為該作物的改良產生非常重要的促進作用

RAPD標記的可用性

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Mg2+、酶及引物濃度是最佳化PCR反應的重要參數。經22個引物對高粱品系IS3620c和BTx623及其雜交F8的120株後代個體的DNA進行PCR擴增,在獲得的55個RAPD標記中,有42個標記定位於已存在的RFLP高粱遺傳圖譜中,實驗結果表明,RAPD標記可以穩定遺傳。

美國科學家完成測序

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科學家利用全基因組鳥槍測序法完成了對高粱基因組的測序。結果顯示,高粱基因組大約有3萬個基因,有7.3億個核苷酸,比大米約多75%。科學家以及工業界人士認為,高粱基因組測序的完成將促進該作物的改良,並有助於完成其他相關植物的測序工作。

美國能源部生物和環境研究中心副主任安娜·帕爾米薩諾說,這項研究是發展低成本、非糧食生物燃料的重要一步。美國孟德爾生物技術公司總裁尼爾·格特森則認為,這項成果將對生物燃料和可再生能源產業產生重要影響。

由於耐寒且生產生物燃料的效率高,高粱目前是美國僅次於玉米的第二大生物燃料作物。此外,隨著利用植物纖維生產乙醇的技術日趨成熟,高粱生長迅速的特點更讓其成為理想的生物燃料來源。

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