區位概況
地理位置花萼山國家級自然保護區是長江中上游兩大支流（漢江、嘉陵江）的發源地和分水嶺，其自然生態系統的穩定性對嘉陵江和江漢流域乃至長江流域中下游地區的生態安全都產生著關鍵性影響。四川花萼山自然保護區物種多樣性豐富，具有中國南方與北方、華東區與西南區動植物區系交匯的顯著特徵，特別是許多受國家重點保護的古老、孑遺、特有、珍稀、瀕危動植物種類殘存在保護區內，堪稱“物種避難所”。
花萼山自然保護區還具有豐富的文化多樣性。這裡是三國時期—代名士徐庶的隱居之處，又是清代名將張獻忠受困之地，更是第二次國內革命戰爭時期中國工農紅軍川陝根據地的腹地，革命史跡和古代文物遺蹟眾多。
綜上所述，從保護具有代表性的北亞熱帶森林生態系統、具有不可替代性的北亞熱帶地區的生物物種多樣性和優美獨特的自然景觀的角度，四川花萼山自然保護區從省級升為國家級具有極其重要的意義。保護區所在的萬源市是典型的”老、少、邊、窮”地區，國家級自然保護區的建立將達到以科學帶動致富，充分發揮以保護促進發展的作用。
地理位置
花萼山國家級自然保護區位於四川省東北部的萬源市境內，地處大巴山南麓的川陝鄂渝四省（市）交界處，地理位置為東經108°00′～108°27′，北緯31°55′～31°12′。東接重慶市城口縣，南連宣漢縣，西抵巴中市的平昌縣、通江縣，北臨陝西省鎮巴縣、紫陽縣。保護區總面積48203.39hm2，涉及11個鄉鎮，其中核心區面積為11600.36hm2，緩衝區面積為12987.79hm2，實驗區面積為23615.24hm2。1998年10月通過省級自然保護區評審，1999年1月6日四川省人民政府以川府函［1992］2號文批准，成立了四川花萼山自然保護區管理處，隸屬於萬源市環境保護局，並受四川省環境保護局指導。2007年，通過了國家級自然保護區的評審。
歷史沿革
功能分區2003年和2004年，萬源市林業局對保護區內的臘梅資源現狀作了深入調查。2005年，省環保局和萬源市政府委託四川省自然資源研究所組織生態學、植物學、魚類學、鳥類學、獸類學、昆蟲學、土壤學、地理學等多學科專家到保護區進行科考，為申請建立國家級自然保護區完成了綜合科學考察報告和總體規劃報告。2005年花萼山國家級保護區初審通過，並於當年4月派出專家組深入實地考察，12月通過正式評審並公示。2006年5月，萬源市環保局又特邀重慶大學、西南大學專家教授對花萼山作了進一步考察，完善了相關補充資料及時報送國務院。
2007年4月6日，歷時近5年申報的國家級自然保護區獲得國務院審定通過。
自然地理
花萼山岩體萬源市屬北亞熱帶潤濕季風氣候區，主要特點是氣候溫和、四季分明、雨熱同季、雨量充沛。據萬源市氣象站30年資料統計，年平均氣溫14.7℃，最冷月為1月，平均氣溫3.5℃，最熱為7月，平均氣溫25.3℃，日極端最低氣溫-9.4℃，日極端最高氣溫39.2℃；≥0℃的年總積溫為5397℃，≥10℃的年總積溫為4534℃，變幅為4930～4068℃；光照充足，年日照數時達2158.7小時，全年日照時數1395.8小時，日照率為33.7%，太陽輻射年總量為92.84卡/cm2；年霜期為129天，最長為165天，最短為88天；雨水充沛，年降水量為1169.3mm，最多年（1983年）為2218mm，最少年（1962年）為772mm。同時，氣候隨海拔高度變化較大，山地立體氣候特徵明顯。據萬源市八台山氣象觀測資料，海拔高度每升高100m，年平均氣溫下降0.55℃，變幅為0.47～0.66℃。雨量隨海拔升高而呈拋物線變化，海拔1900m以下，每升高100m，年降水量增加約50mm；海拔1900m以上，則降水量又隨升高而減少。
自然資源
紅豆杉保護區現已查明野生脊椎動物374種和亞種，其中獸類64種、鳥類196種，兩棲類23種、爬行類27種、魚類64種。其中國家I級重點保護野生動物有豹、雲豹、林麝、金雕種；國家II級重點保護野生動物有黃喉貂、水鹿、鬣羚、斑羚、金貓、大靈貓、豺、黑熊、獼猴、水獺、蒼鷹、鳶、赤腹鷹、普通鵟、紅隼、勺雞、白冠長尾雉、紅腹角雉、紅腹錦雞、領角鴞、雕鴞、黃腳魚鴞、大鯢等27種。
人文歷史
原國家軍委副主席劉華清題字2、限王坪的傳說：八大王剿四川時，張獻忠被困於此而故名。此地地勢險要而開闊，森林茂密，亦是修身習武聖地。
3、川東遊擊軍領袖、革命烈士李家俊，曾借萼山之名創辦進步革命刊物《萼山鍾》，白沙工農區建制時期，一批青年文學愛好者，曾創立過《萼山詩社》。
4、1929年巴山農民抗捐起義英雄項宗詩的出生地和起義地，就在核心區花熊坪。當時起義隊伍擂火藥的碓窩仍留遺址。
5、共和國主席、紅四方面軍總指揮李先念的部分骨灰撒在了花萼山。原國家軍委副主席劉華清曾為花萼山題字讚譽“花萼天下無”。
重點景觀
百藏堂在主峰“南天門”原有一座寺廟，名叫“祖師廟”，廟內供有徐庶全身塑像，也稱“花萼老祖”。相傳三國名士徐庶，南歸蜀漢，路經花萼山，隱身於此修練成仙。清嘉慶年間，雲貴提督羅思舉又重建廟宇和神像台，使其一舉聞名數省。
其他景觀還有飛龍峽、秀頂山、曹家峽、印巴寨、筍子梁、六面朝、西扇門、雞冠寨、燕子洞、九面阡、懸天觀、關門溶洞、南天門、九龍池、長洞湖、魚泉山、羊跳岩、項王坪、龍望塘、月亮坪、筆架山、觀王頂、萼山煙雨、萼山晨（霞）光等。民間藝人李易峰贊花萼山風光“雄貫大巴渝陝川，十鄉環繞拱萼冠，九龍九池九峰鼎，六面六角六路盤，紅英紅鵑紅紙廠，白谷白雁百花園，奇山奇水奇禽獸，別景別仙別洞天”。
