HU蛋白

HU蛋白是一個異聚體,由HupA和HupB組成。兩個亞基都與彼此相關,並與IHF亞基也相關,所有三個二聚體(α2,αβ,β2)結合到雙鏈DNA和單鏈DNA以及RNA。雙鏈DNA結合位點對特異HU-DNA複合物延伸至36bp,DNA共晶物和模型試驗暗示如IHF,HU蛋白戲劇性地結合DNA。

基本資料

體內交叉連線試驗表明HU主要形式是αβ,但是α2β2同源二聚體可以在指數早期被檢測到。在指數期,估計大約30000分子HU每細胞,在所有已知的小得核酸輔助蛋白中,HU明顯地對質粒超螺鏇起最大作用。HU在體外限制超螺鏇,如核小體,當與超螺鏇的或開放環狀質粒DNA及一種酶如小牛胸腺TopoI共孵育時,它可以產生高度超螺鏇的環狀質粒DNA,其中酶可移除正負超螺鏇(如下)。在蛋白和DNA的最佳超螺鏇比率,2.5HU二聚體限制一個超螺鏇。假定這一數據反映了活細胞內的情況,HU將對應12000超螺鏇或者大約△LK的16%和40%限制性拓撲。HU也提高了短於連續長度的DNA片段的環狀連線。

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