國內大事
1999年10月3日，南京鼓樓區檢察院反貪局副局長謝健被省委宣傳部、團省委和省青年聯合會授予“江蘇省十大傑出青年”稱號。
1999年10月3日至14日，國務委員、國務院秘書長兼國家行政學院院長王忠禹應法國國立行政學院、歐洲行政學院和希臘內政部邀請率領12人代表團訪問法國、荷蘭、希臘。國家行政學院常務副院長張志堅隨團出訪。訪問期間，張志堅和希臘共和國國家公共行政中心主任帕薩斯分別代表兩院在雅典簽署《中華人民共和國國家行政學院和希臘共和國國家公共行政中心合作框架協定》。
1999年10月3日，貴州麻嶺風景區纜車墜毀事故中一共有14人不幸罹難，當時纜車中一共有36人；另外，麻嶺風景區也就是馬嶺河風景區。
1999年10月3日下午，中國宋慶齡基金會主席黃華在宋慶齡故居會見了從美國和加拿大來京參加國慶觀禮活動的孫、宋海外親屬及友人。
1999年10月3日，由中美合作生產上海飛機製造廠製造的MD-90-30幹線客機在上海首飛成功。10月28日通過FAA適航審查。
1999年10月3日，三峽工程永久船閘南線五閘首保護層最後一方石碴被運往碴場，至此，由武警水電部隊第四支隊擔負的永久船閘南線開挖全線告捷，這標誌著永久船閘主體開挖工程圓滿結束。
1999年10月3日下午5時10分，碧空澄潔，桂花飄香，中共中央政治局常委、全國政協主席李瑞環同志到武夷山與民眾歡度國慶五十華誕。受到了省領導陳明義、習近平、游德馨，南平市領導林克敏、李川和武夷山市領導陳祥龍、張建光等的熱烈歡迎。
1999年10月3日，在第八屆亞洲青年田徑錦標賽上，如皋籍運動員秦旺萍一人連奪100米、200米、4×100米3枚金牌，震驚亞洲田徑體壇，被譽為亞洲“女飛人”。
1999年10月3日，朝鮮商業省副相、朝中友協副會長金峰鐵一行5人到岳陽訪問，副市長葛送培等會見並宴請。
1999年10月3日，《阜新日報·星期天》出刊。該刊主要報導經濟新聞，它順應經濟體制改革時代潮流的需要，以百姓關注為切入點，深受廣大民眾的喜愛。
1999年10月3日，朱鎔基總理在中央民族工作會議閉幕會上講話指出，黨中央高瞻遠矚，把握大局，審時度勢，提出了加快中西部地區發展特別是實施西部大開發的戰略決策，這為少數民族和民族地區加快發展提供了重要的歷史機遇。對此，我們要有高度的歷史責任感和緊迫感，同時又要從實際出發，按客觀規律辦事。從現在起，就要抓緊研究和制定規劃，採取更加有力的措施，有步驟、分階段地達到目標。
1999年10月3日，上海衛視“星期視點”播放“海上名園——豫園歷史文物古蹟專題介紹”紀錄片。
1999年10月3日20時，9914號颱風在太平洋海面生成，先由西向東移動，經菲律濱群島北部進入南海，6～7日開始北折，從南海北抬進入台灣海峽，於9日上午10時左右在福建省龍海～廈門之間登入，登入後颱風緩慢向北移動，颱風眼穿越廈門市，中心在廈門市上空停留近5個小時，連續7個小時廈門市出現12級以上陣風，瞬間極大風速47.1米/秒。
1999年10月3日，禹作敏在天河醫院因心臟病忽然發作，經搶救無效離開了人世，終年69歲。
國際大事
索尼公司名譽會長盛田昭夫1999年10月3日上午10點25分，索尼公司創始人之一、索尼公司名譽董事長盛田昭夫因肺炎在東京都濟生會中央醫院逝世，享年78歲。
1999年10月3日，為慶祝新中國成立50周年，挪威首都奧斯陸開始舉行為期一周的中國電影回顧展。
1999年10月3日－5日，第30屆太平洋島國論壇在帛琉舉行。會議決定將該組織的名稱改為“太平洋島國論壇”。會議還原則同意在本地區締結一項自由貿易協定。
1999年10月3日，正值圭委邊界問題國際仲裁一百周年。圭舉行紀念活動，而委宣布該仲裁無效，重申對圭境內的埃塞奎博地區擁有主權。
