歷史
在北洋政府時代時，中華民國內閣最高首長為國務總理及國務卿。1928年10月3日，國民政府通過《中華民國國民政府組織法》，以行政院院長取代國務總理，並設定行政院成為全國最高行政機關。10月8日選任譚延闓為首任行政院院長。10月25日行政院成立，正式辦公。
中國民主社會黨籍知名學者張君勱在1947年起草憲法時，設計偏向內閣制，行政院院長由總統提名，經立法院同意後任命。總統政令以行政院院長副署為條件，近似內閣總理。由於國共內戰爆發，國民黨政府實行動員戡亂，憲法增設臨時條款賦予總統大權；中華民國政府播遷台灣後，蔣中正長期擔任總統，並以帶有軍事專政性質的《動員戡亂時期臨時條款》作為統治根基，導致憲法原始設計無法施行；僅有在蔣經國擔任“院長”時，政府體制一度形同內閣制。“中華民國”在台灣實行“總統”直選前後數次進行修憲，並增訂《“憲法”增修條文》後，行政院院長副署權被取消，行政院院長之任命亦改為不需經由立法院同意。當時指這個為“改良式的雙首長制”，但民進黨執政時期，除了唐飛以外，歷任行政院院長亦是民進黨籍，由執政黨一黨組閣。台灣學界認為現制的行政院院長近似“偏向總統制的雙首長制”，部分人士則認為“行政院院長”近似“總統”之幕僚長。
由於“憲法”並沒有明定副領導人（所謂的“副總統”）不應兼任行政院院長，因此在戒嚴時代，“副總統”陳誠、嚴家淦曾兼任“行政院院長”。在1996年間連戰則以“行政院院長”身份當選“副總統”，並續任“院長”，引來憲政爭議。“司法院”大法官於《釋字第419號解釋》中，認二者職務性質雖非顯不相容，但仍不宜兼任，此爭議最後因連戰請辭而劃下句點。
台灣民主進步黨在2000年至2008年執政期間，除了軍人出身的唐飛及省議員與宜蘭縣縣長出身的游錫堃外，大部分擔任“院長”者亦曾出任立法委員。
前院長
| 次序 | 姓名 | 到任時間 | 卸任時間 | 政黨 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 譚延闓 | 1928年10月25日 | 1930年9月22日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 宋子文 | 1930年9月25日 | 1930年11月24日 | 中國國民黨 |
| 2 | 蔣介石 | 1930年11月24日 | 1931年12月15日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 陳銘樞 | 1931年12月15日 | 1932年1月1日 | 中國國民黨 |
| 3 | 孫科 | 1932年1月1日 | 1932年1月29日 | 中國國民黨 |
| 4 | 汪精衛 | 1932年1月29日 | 1935年12月16日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 宋子文 | 1932年8月25日 | 1933年3月30日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 孔祥熙 | 1935年7月2日 | 1935年8月23日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 孔祥熙 | 1935年11月6日 | 1935年12月16日 | 中國國民黨 |
| 5 | 蔣介石 | 1935年12月16日 | 1938年1月1日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 孔祥熙 | 1936年12月13日 | 1937年4月6日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 王寵惠 | 1937年4月6日 | 1937年 5月29日 | 中國國民黨 |
| 6 | 孔祥熙 | 1938年1月1日 | 1939年12月11日 | 中國國民黨 |
| 7 | 蔣介石 | 1939年12月11日 | 1945年6月4日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 宋子文 | 1944年12月4日 | 1945年6月4日 | 中國國民黨 |
| 8 | 宋子文 | 1945年6月4日 | 1947年3月1日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 蔣介石 | 1947年3月1日 | 1947年4月23日 | 中國國民黨 |
| 9 | 張群 | 1947年4月23日 | 1948年5月24日 | 中國國民黨 |
後院長
| 任次 | 姓名 | 到任時間 | 卸任時間 | 政黨 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 翁文灝 | 1948年5月25日 | 1948年12月23日 | 中國國民黨 |
| 2 | 孫科 （二次） | 1948年12月23日 | 1949年3月24日 | 中國國民黨 |
| 3 | 何應欽 | 1949年3月24日 | 1949年6月13日 | 中國國民黨 |
| 4 | 閻錫山 | 1949年6月13日 | 1950年3月15日 | 中國國民黨 |
| 5 | 陳誠 | 1950年3月15日 | 1954年6月1日 | 中國國民黨 |
| 6 | 俞鴻鈞 | 1954年6月1日 | 1958年7月15日 | 中國國民黨 |
| 7 | 陳誠 （二次） | 1958年7月15日 | 1963年12月16日 | 中國國民黨 |
| 代理 | 王雲五 | 1963年7月1日 | 1963年9月16日 | 中國國民黨 |
| 8 | 嚴家淦 | 1963年12月16日 | 1972年6月1日 | 中國國民黨 |
| 9 | 蔣經國 | 1972年6月1日 | 1975年4月5日 | 中國國民黨 |
| 9 | 蔣經國 | 1975年4月5日 | 1978年5月19日 | |
| 代理 | 徐慶鍾 | 1978年5月19日 | 1978年6月1日 | 中國國民黨 |
| 10 | 孫運璇 | 1978年6月1日 | 1984年6月1日 | 中國國民黨 |
| 11 | 俞國華 | 1984年6月1日 | 1989年6月1日 | 中國國民黨 |
| 12 | 李煥 | 1989年6月1日 | 1990年6月1日 | 中國國民黨 |
| 13 | 郝柏村 | 1990年6月1日 | 1993年2月27日 | 中國國民黨 |
| 14 | 連戰 | 1993年2月27日 | 1997年9月1日 | 中國國民黨 |
| 15 | 蕭萬長 | 1997年9月1日 | 2000年5月20日 | 中國國民黨 |
| 16 | 唐飛 | 2000年5月20日 | 2000年10月6日 | 中國國民黨 |
| 17 | 張俊雄 | 2000年10月6日 | 2002年2月1日 | 民主進步黨 |
| 18 | 游錫堃 | 2002年2月1日 | 2005年2月1日 | 民主進步黨 |
| 19 | 謝長廷 | 2005年2月1日 | 2006年1月25日 | 民主進步黨 |
| 20 | 蘇貞昌 | 2006年1月25日 | 2007年5月21日 | 民主進步黨 |
| 21 | 張俊雄 （二次） | 2007年5月21日 | 2008年5月20日 | 民主進步黨 |
| 22 | 劉兆玄 | 2008年5月20日 | 2009年9月10日 | 中國國民黨 |
| 23 | 吳敦義 | 2009年9月10日 | 2012年2月6日 | 中國國民黨 |
| 24 | 陳冲 | 2012年2月6日 | 2013年2月18日 | 中國國民黨 |
| 25 | 江宜樺 | 2013年2月18日 | 2014年12月8日 | 中國國民黨 |
| 26 | 毛治國 | 2014年12月8日 | 現任 | 中國國民黨 |
