木星的內部結構也與眾行星不同,它沒有固體外殼,在濃密的大氣之下是液態氫組成的海洋。木星的內部是由鐵和矽組成的固體核,稱為木星核,溫度高達30000℃。木星核的外部絕大部分是氫,液態的氫分子層厚達14000多千米,液態的金屬層厚達45000多千米,這兩層合稱為木星幔。木星幔的外面是木星的大氣層,大氣中的成份和太陽差不多,88%是氫,11%是氦,其它的是甲烷、氨、水蒸氣、一氧化碳,僅占1%。木星大氣中的甲烷有些類似地球上的臭氧,具有吸引紫外線的作用。木星大氣中還有十分強烈和頻繁的閃電現象,平均每年約有250次。在木星的背面還發現了長達3萬千米的極光,證明木星大氣受到很多高能粒子的襲擊。它是除了地球以外第二個發現有極光現象的天體。
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