NWChem

NWChem

NWChem是運行在高性能並行超級計算機和通常工作站集群上的計算化學軟體,可以用在大多數計算平台上。NWChem使用標準量子力學描述電子波函或密度,計算分子和周期性系統的特性,還可以進行經典分子動力學和自由能模擬。

分子的電子結構

1) 下面的方法計算原子坐標的能量,解析一階導和二階導。

自恰場(SCF)或Hartree-Fock(RHF,UHF)

高斯密度泛函理論(DFT),使用正常的N3和N4標度的局域,非局域(梯度校正)和雜化(局域,非局域和HF)的自旋限制交換-關聯勢

2) 下面的方法計算原子坐標的能量和解析一階導。二階導由一階導的有限差分計算。

自恰場(SCF)或Hartree-Fock(RHF,UHF,高自旋ROHF)

高斯密度泛函理論(DFT),使用正常的N3和N4標度的局域和非局域交換相關勢(RHF或UHF)

自旋-軌道DFT(SODFT),使用多種局域和非局域交換相關勢(UHF)

MP2,包括使用凍芯以及RHF和UHF參考的半直接MP2

完全活性空間SCF(CASSCF)

束縛DFT

加入經驗性長程色散校正的DFT-D方法

3) 下面的方法僅用於計算能量。一階導和二階導由能量的有限差分計算。

CCSD,CCSD(T),CCSD+T(CCSD),使用RHF參考

二級微擾修正的選擇CI。選擇參考組態的CI+微擾修正可以進行激發態的能量計算,並可以對激發態進行幾何最佳化。

使用RHF參考的完全直接MP2

分解恆等積分近似MP2(RI-MP2),使用RHF和UHF參考

使用RHF,UHF,RDFT,或UDFT參考的CIS,TDHF,TDDFT,和Tamm-Dancoff TDDFT用於激發態計算

用於閉殼層和開殼層體系的CCSD(T)和CCSD[T](TCE模組)

使用RHF,UHF,或ROHF參考的UCCD,ULCCD,UCCSD,ULCCSD,UQCISD,UCCSDT,和UCCSDTQ

使用RHF,UHF,或ROHF參考的UCISD,UCISDT,和UCISDTQ

使用RHF或UHF參考的非正則UMP2,UMP3,和UMP4

EOM-CCSD,EOM-CCSDT,EOM-CCSDTQ用於閉殼層和開殼層體系激發能、躍遷矩和激發態偶極矩的計算

CCSD,CCSDT,CCSDTQ用於閉殼層和開殼層體系偶極矩的計算

在TCE模組中,用二次近似的單雙耦合簇模型(CC2)計算激發能

4) 下面的方法可用於計算分子特性。

使用限制或非限制參考的耦合簇線性回響

用線性回響方法計算CCSD和CCSDT級別的基態動態極化率

用線性回響方法計算CCSDTQ級別的動態偶極極化率

5) 對所有的方法,下面的操作都適用。

單點能

幾何最佳化(最小值和過渡態)

整個從頭勢能曲面上的分子動力學

如果不能用解析導數,自動計算數值的一階和二階導

笛卡爾坐標的簡正振動分析

Morokuma及其合作者的ONIOM混合方法

產生電子密度檔案用於圖形顯示

求解靜態和單電子特性

原子局部電荷的靜電勢匹配(CHELPG方法,可以加上RESP限制或電荷約束)

6) 對於閉殼層和開殼層的SCF和DFT:

COSMO能量

7) 另外,自動提供到以下程式的接口:

NBO包。

Python

8) 密度泛函:

數十種LDA和GGA泛函(VWN,Becke97,Becke98,HCTH系列,OPTX,MPW91等),以及meta-GGA泛函。

相對論影響

以下的方法可以在量化計算中包含相對論:

無自旋單電子Douglas-Kroll近似用於所有量子力學方法及其梯度。

Dyall的無自旋改進Dirac哈密頓量近似用,於Hartree-Fock方法及其梯度。

通過自旋-軌道勢包含單電子自旋-軌道影響。這個選項用於DFT及其梯度,但不能用對稱性。

對於DFT,可以用無自旋的和自旋-軌道的ZORA

贗勢平面波電子結構

1) 下面的模組使用贗勢平面波DFT,計算能量,結構最佳化,數值二階導,以及從頭分子動力學。

PSPW(贗勢平面波),Gamma點程式,用於計算分子、液體、晶體、表面。

Band,標準的能帶結構代碼,用於計算具有小帶隙(如半導體和金屬)的晶體和表面。

GAPSS,周期體系電子結構LCAO模組(聚合物,表面和固體的高斯方法),使用包含多種局域和非局域交換相關勢的高斯DFT,用於計算能量(4.6以上新版本不包含這個模組)

2) 計算使用:

共軛梯度和有限記憶體的BFGS最小化

Car-Parrinello(擴展拉格朗日動力學)

常溫恆定能量下Car-Parrinello模擬

在Car-Parrinello中固定原子的笛卡爾坐標和SHAKE束縛

贗勢庫

Hamann和Troullier-Martins模守恆贗勢,可以用半芯校正

自動的波函初始猜測,現在使用LCAO

Vosko和PBE96交換關聯勢(自旋限制與非限制)

非周期正交模擬單元,用於計算帶電或高度極化的分子

用周期和自由空間邊界條件,正交模擬晶胞

大、小平面波展開之間的轉換模組

到DRIVER,STEPPER和VIB模組的接口

通過使用點電荷計算極化率

Mulliken分析,點電荷分析,DPLOT分析(波函,密度,和靜電勢繪圖)

BAND加入費米模糊技術

BAND加入二分量相對論波函

BAND加入HGH自旋-軌道勢

BAND加入Hilbert分解並行FFT

PSPW加入Car-Parrinello QM/MM

非立方晶胞現在可以產生Wannier軌道

PSPW使用新的並行分解,用於FFT格點和軌道

PSPW加入分數占據的分子軌道

二維處理器格點用於PSPW

PSPW加入Born-Oppenheimer動力學選項

分子動力學

1) 以下功能用於經典分子模擬:

單構型能量求解

能量最小化

分子動力學模擬

自由能模擬

2) 經典和量子描述的組合,執行:

QM/MM能量最小化和分子動力學模擬

使用任何能計算梯度的量子力學方法進行量子動力學模擬

3) 通過用DIRDYVTST模組,用戶可以為POLYRATE程式寫輸入檔案,計算化學反應速率常數,包括量子力學振動能和隧穿的貢獻。

DNTMC

新的動力學核理論Monte Carlo模組,用於確定分子團簇的幾率分布和蒸發率。

Python

NWChem內植了Python程式語言,用戶可以很容易地組合和控制NWChem的許多高級功能,進行複雜的操作。

並行工具和庫

ParSoft

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