兩個階段
第一階段
只是生成兩分子的主要中間代謝產物：3-磷酸-甘油醛。
第二階段
發生氧化還原反應，釋放能量合成ATP，同時形成兩分子的丙酮酸。
EMP途徑的第一階段中，葡萄糖在消耗ATP的情況下被磷酸化，形成葡萄糖-6-磷酸。葡萄糖-6-磷酸進一步轉化為果糖-6-磷酸，然後再次被磷酸化，形成果糖-1，6-二磷酸。在醛縮酶催化下，果糖-1，6-二磷酸裂解成兩個三碳化合物：3-磷酸甘油醛與磷酸二羥丙酮。此階段的反應並不涉及電子轉移。
(1 )葡萄糖+ATP____己糖激酶__6-磷酸葡萄糖+ADP
(2)6-磷酸葡萄糖__磷酸己糖異構酶_6-磷酸果糖
(3)6-磷酸果糖 _ 磷酸果糖激酶_1,6-二磷酸果糖
(4)1,6-二磷酸果糖_醛縮酶_3-磷酸甘油醛+磷酸二羥基丙酮
(5)磷酸二羥基丙酮__磷酸甘油異構酶__3-磷酸甘油醛
在第二階段中，3-磷酸甘油醛首先轉化為1，3-二磷酸甘油酸，此過程是氧化反應，輔酶NAD+接受氫原子，形成NADH。同時3-磷酸甘油酸接受無機磷酸被磷酸化。與上述的葡萄糖-6-磷酸的有機磷酸鍵不同，二磷酸甘油醛中的兩個磷酸鍵屬於高能磷酸鍵。在其後來的1，3-二磷酸甘油酸轉變成3-磷酸甘油酸及磷酸烯醇式丙酮酸轉變成丙酮酸的反應過程中，高能磷酸鍵的能量轉移導致ATP的合成。
6)3-磷酸甘油醛+NAD++H3PO4__3-磷酸脫氫酶_1,3-二磷酸甘油酸+NADH(EMP 途徑中第一個氧化還原反應)
(7)1,3-二磷酸甘油酸+ADP_磷酸甘油酸激酶_ 3-磷酸甘油酸(EMP途徑第一個產生ATP)
(8)3-磷酸甘油酸___變位酶__2-磷酸甘油酸
(9)2-磷酸甘油酸__烯醇化酶(脫去一分子水) 烯醇式磷酸丙酮酸
(10)烯醇式磷酸丙酮酸+ADP___丙酮酸激酶_丙酮酸+ATP
在EMP途徑第一階段有兩分子的ATP用於糖的磷酸化，但最終產生出四個分子的ATP。因此，通過EMP途徑，每氧化一個分子的葡萄糖淨得兩分子ATP。在形成1，3-二磷酸甘油醛的過程中，兩分子NAD+被還原為NADH。
調控位點
有三個，均為單向反應點：
1：己糖激酶調控位點，激活劑：ATP，抑制劑：G-6-P和ADP。
2：磷酸果糖激酶（限速酶）調控位點，激活劑：ADP，AMP，F-1,6-P，F-2，6-P。抑制劑：ATP，檸檬酸，NADH。
3：丙酮酸激酶調控位點，激活劑：F-1,6-P，抑制劑：ATP，肝內Ala有變構抑制作用。
此三個位點在糖異生時被繞過。
