聖靈運動

後在抵抗軍圍剿下，拉奎娜逃往肯亞。近年來比較活躍的是由拉奎娜之弟約瑟夫·科尼（JOSEPHKONY）率領的“聖靈抵抗軍”，他們駐紮在蘇丹南部，經常出沒於烏蘇邊界，進行武裝騷擾活動，擾亂北部地區社會治安。多年來，抵運政府對科尼叛匪持強硬態度，不斷進行軍事圍剿。1999年12月，穆塞韋尼總統和蘇丹總統巴希爾在肯亞首都奈洛比簽署和平協定，雙方承諾停止支持並遣散境內對方的反政府武裝。但由於協定未得到切實執行，該反政府武裝依然較為活躍。