基因和等位基因
1、基因(gene)：帶有可產生特定蛋白的遺傳密碼的DNA片段
2、基因庫(gene pool)：種群中存在的所有基因組和等位基因。
基因是成對結構，由兩個等位基因構成，每一等位基因來自一條同源染色體。這些等位基因可以相同或不同。
3、多型（Polymorphism）：在種群中許多等位基因的存在導致一種群中一種以上的表現型。
4、哈文定律（Hardy-weinberg law）：在一個巨大的隨機交配和沒有干擾基因平衡因素的種群中，基因型頻率將等代保持穩定不變。
變異和遺傳漂變
1、基因突變（genic mutation）某一遺傳密碼中的一個或幾個核苷酸(鹼基)的替換以及核苷酸的增加或者丟失。
2、染色體突變（chromosomes mutation）包括染色體形態結構和數目的變化。
3、遺傳漂變(genetic drift)基因頻率在小的種種里隨機增減的現象。
遺傳漂變是基因頻率的隨機變化，僅偶然出現，在小種群中似乎更明顯。種群中經歷顯著的遺傳漂變的基因頻率，可觀察到期隨時間"漂離"起始值。由於這種隨機變化是隨機的，不受自然遺傳的影響，頻率會呈現無方向性變化，增加、減少或上下波動。
4、適合度（fitness）
適合度（W）＝存活能力(L)×生育能力
適合度綜合了存活能力和生育能力，因此，某一基因型個體的適合度實際上就是它下一代的平均後裔數。
選擇類型
1、穩定選擇（stabilizing selection）：當環境條件對靠近種群的數量性狀常態分配線中間那些個體有利，處淘汰兩側的"極端"個體時，選擇屬於穩定型的。
2、定向選擇（directional selection）：當選擇對一側的"極端"個體有利，從而使種群的平均值向這一側移動，選擇屬定向型。
3、分裂選擇（disreptive selection）：使選擇對兩側的個體有利，而不利於中間的個體，從而使種群分成兩部分。
物種形成
物種形成過程大致分為三個步驟：
1、地理隔離：由於地理屏障引起，將兩個種群彼此隔開，阻礙了種群間個體交換，從而使基因交流受阻。
2、獨立進化：兩個地理上和生殖上的隔離的種群各自獨立地進化，適應於各自的特殊環境。
3、生殖隔離機制建立：假如地理隔離屏障消失，兩個種群的個體可以再次相遇和接觸，但由於建立了生殖隔離機制，基因交流已不可能，因而成為兩個種，物種形成過程完成。
形成生殖隔離的機制如下：
（1）交配前或合子前隔離機制
a.生態或生境隔離：相關種群生活在相同綜合地域的不同生境中。
b.季節或時間隔離：交配或花期發生在不同時間。
c.性隔離：不同種間性的相互吸引力很弱或缺乏。
d.機制隔離：生殖器或花的物理性不回響阻止了交配或花粉轉移
e.不同傳粉者隔離：在開花植物中，相關性可能特化吸引不同的傳粉者。
f.配子隔離：在體外受精的生物中，雌雄配子可能不相互吸引。
（2）交配後或合子隔離機制降低染合體的生存力或繁殖力
g.雜種不存活：雜合體存活力降代或不能存活。
h.雜種不育：雜種F1代的一種性別或兩種性別不能生產功能性配子。
i:雜種受損：F2代或回交雜種後體存活力或繁殖力降低。
形成方式
1、異域性物種形成（allopatric speciation）即地理物種形成、包括兩類：
①通過大花圍的地理隔離，分開的兩個種各自演化，形成生殖隔離機制。
②通過種群中少數個體從原種群中分離出去，到達它地並經地理隔離和獨立演化而成新種。
2、領域性物種形成（parapatric speciation）：出現在地理分布區相鄰的兩個種群間的物種形成。
3、同域性物種形成（sympatric specation）：在母種群分布區內部，由於生態位的分離，逐漸建立起若干子群，子群間由於逐步建立的和生殖隔離，形成基因庫的分離而形成新種。
親屬選擇和利他行為
1、親屬選擇(kin selection)：有具有相同基因間進行的自然選擇。
2、利他行為（altruistic behoviour）一個個體以犧牲自己的存活和生殖為代價，去幫助其他個體繁殖更高的後代。
個體如果能將自身基因複製到將來的世代中，那么其適合度就很高，留下許多後代是達到高適合度的一種途徑。但是基因複製品在個體的親屬中是共享的，所以支持親屬的產生也能成為個體增加，適合度有效途徑。因為近親比遠親共享更多的基因，所以人們可以期望在供者的花費與受者的親緣程度之間的平衡。
3.協同進化（coevolution）是一個物種的性狀對另一物狀的反應而進化，而後一物種的這一性狀本身又是對前一物種性狀的反應而進化。
物種間的協同進化，可產生在捕食者與獵物、寄生者與宿主、競爭物種之間及植物與植食性動物之間。
