指沉積物中的有機質以及原油、油頁岩、煤中那些源於生物並具有明顯結構特徵的有機化合物。它們在分子結構上具有明顯的特異性，與其原始母質中相應化合物的分子結構有很大的相似性，在有機質熱演化過程中沉有變化或僅做了重排，從而成為傳遞有機物的組成、性質、生存環境、地球化學史等信息的生物標誌。
同義詞：生物標誌物 Biomarker
地球化學化石 Geochemical fossil
指紋化合物 Fingerprint compound
指紋化石 Fingerprint fossil
分子化石 Molecular fossil
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