層級構成
現代農業產業技術體系由產業技術研發中心和綜合試驗站二個層級構成。每一個農產品設定一個國家產業技術研發中心（由若干功能研究室組成），研發中心設1名首席科學家和若干科學家崗位；在主產區設立若干綜合試驗站，每個綜合試驗站設1名站長。
在綜合考慮產學研方面的成就、學術威望、統籌能力和工作作風等因素的基礎上，經相關行業部門、學術團體、推廣機構、主產區專家代表推薦排序，我們篩選出了10個試點產業技術體系首席科學家。根據功能研究室和綜合試驗站的遴選標準，首席科學家組織本產業專家代表討論並徵求相關院士的意見後，提出了各功能研究室建設依託單位、綜合試驗站建設依託單位、各功能研究室的科學家崗位及綜合試驗站站長人選擬定名單。農業部科技司發函就擬定名單徵求了依託單位、有關學會和各省（自治區、直轄市）主管部門的意見。在此基礎上，形成了各產業技術體系試點建設依託單位和崗位人選的初步名單。
建設試點
2007年，農業部、財政部共同啟動了現代農業產業技術體系建設，選擇水稻、玉米、小麥、大豆、油菜、棉花、柑橘、蘋果、生豬、奶牛10個產業開展技術體系建設試點，針對每個大宗農產品設立一個國家產業技術研發中心，並在主產區建立若干個國家產業技術綜合試驗站。
到2008年底，啟動建設的50個現代農業產業技術體系共設50個產業技術研發中心，聘用50位首席科學家，涉及34個作物產品、11個畜產品、5個水產品。為此，中央財政2008年共投入了9.675億元專項資金。
基本思路
現代農業產業技術體系將按照優勢農產品區域布局規劃，依託具有創新優勢的中央和地方科研資源，針對每一個大宗農產品設立一個國家產業技術研發中心（由若干功能研究室組成），並在主產區建立若干個國家產業技術綜合試驗站。主要職能是圍繞產業發展需求，進行共性技術和關鍵技術研究、集成和示範；收集、分析農產品的產業及其技術發展動態與信息，為政府決策提供諮詢，向社會提供信息服務，為用戶開展技術示範和技術服務，為產業發展提供全面系統的技術支撐；推進產學研結合，提升農業區域創新能力，增強我國農業競爭力。在管理機制上，通過設立管理諮詢委員會、執行專家組和監督評估委員會等，確保決策、執行和監督三個層面權責明晰、相互制約、相互協作。調整和完善優勢農產品區域布局規劃，明確以產業需求為導向的建設現代農業產業技術體系的基本思路。
這樣做的好處是，圍繞產業發展需求，進行共性技術和關鍵技術研究、集成和示範；以農產品為單元，產業為主線，建設從產地到餐桌、從生產到消費、從研發到市場各個環節緊密銜接、環環相扣、服務國家目標的現代農業產業技術體系，提升農業科技創新能力，從而增強我國農業競爭力。
針對每一個農產品，設定一個國家產業技術研發中心和一個首席科學家崗位。每一個國家產業技術研發中心由若干個功能研究室組成，每個功能研究室設一名研究室主任崗位和若干個科學家崗位。
根據每一個農產品的區域生態特徵、市場特色等因素，在主產區設立若干個綜合試驗站，每個綜合試驗站設一名試驗站站長崗位。
批次目錄
批次 產業 首席科學家 單位
1 玉米 張世煌 中國農業科學院作物科學研究所
1 小麥 肖世和 中國農業科學院作物科學研究所
1 大豆 韓天富 中國農業科學院作物科學研究所
1 油菜 王漢中 中國農業科學院油料作物研究所
1 棉花 喻樹迅 中國農業科學院棉花研究所
1 柑橘 鄧秀新 華中農業大學
1 蘋果 韓明玉 西北農林科技大學
1 生豬 陳瑤生 中山大學
1 奶牛 李勝利 中國農業大學
2 大麥 張京 中國農業科學院作物科學研究所
2 高粱 鄒劍秋 遼寧省農業科學院
2 穀子 刁現民 中國農業科學院作物科學研究所
2 燕麥 任長忠 吉林省白城市農業科學院
2 馬鈴薯 金黎平 中國農業科學院蔬菜花卉研究所
2 甘薯 馬代夫 江蘇徐淮地區徐州農業科學研究所
2 木薯 李開綿 中國熱帶農業科學院
2 食用豆 程須珍 中國農業科學院作物科學研究所
2 花生 禹山林 山東省花生研究所
2 芝麻 張海洋 河南省農業科學院
2 向日葵 安玉麟 內蒙古自治區農牧業科學院
2 油用胡麻 黨占海 甘肅省農業科學院
2 麻類 熊和平 中國農業科學院麻類研究所
2 甘蔗 陳如凱 福建農林大學
2 甜菜 陳連江 中國農業科學院甜菜研究所
2 茶葉 楊亞軍 中國農業科學院茶葉研究所
2 蠶桑 向仲懷 西南大學
2 食用菌 張金霞 中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所
2 梨 張紹鈴 南京農業大學
2 葡萄 段長青 中國農業大學
2 桃 姜全 北京市農林科學院
2 荔枝 陳厚彬 華南農業大學
2 香蕉 張錫炎 中國熱帶農業科學院
2 天然橡膠 黃華孫 中國熱帶農業科學院橡膠研究所
2 大宗蔬菜 杜永臣 中國農業科學院蔬菜花卉研究所
2 西甜瓜 吳明珠 新疆維吾爾自治區農業科學院
2 牧草 韓建國 中國農業大學
2 肉牛 曹兵海 中國農業大學
2 肉羊 旭日乾 內蒙古大學
2 絨毛用羊 田可川 新疆維吾爾自治區畜牧科學院
2 蛋雞 楊寧 中國農業大學
2 肉雞 文杰 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
2 蜂 吳傑 中國農業科學院蜜蜂研究所
2 兔 秦應和 中國農業大學
2 水禽 侯水生 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
2 蝦 何建國 中山大學 查看
2 貝類 張國范 中國科學院海洋研究所
2 羅非魚 楊弘 中國水產科學研究院淡水漁業研究中心
2 大宗淡水魚類 戈賢平 中國水產科學研究院淡水漁業研究中心
2 鰈鮃類 雷霽霖 中國水產科學研究院黃海水產研究所
