滯留髮票產生的原因
1.屬於購進免稅貨物用，專用發票不得認證；2.屬於購進非應稅項目用，專用發票不得認證；
3.銷貨方未將專用發票交給購貨方，造成存根聯滯留；
4.購貨方接到專用發票超過180日認證期而無法認證抵扣，造成存根聯滯留；
5.購貨方在小規模納稅人期間取得對方開具的專用發票不能抵扣；
6.購貨方發生走逃或註銷。
一般情況下，增值稅專用票的稅務管理很嚴格，稅局一旦發現問題會予以追究。實際中，各地稅局會要求存在滯留髮票的公司必須對滯留的原因加以說明，同時也會對存在疑點的公司進行現場檢查。有些公司存在滯留髮票，目的是想偷漏稅，隱瞞銷售收入同時隱瞞抵扣發票，使稅負從表面上看與正常公司相符，這就造成很多該抵扣的發票不去稅局抵扣，造成發票滯留。
滯留髮票的處理
1、企業若取得不能抵扣的專用發票，一個途經是要銷貨方重新開具普通發票，另一個途經是把發票拿去認證抵扣，但同時做全額進項轉出。2、購貨方購進屬於免稅貨物用、非應稅項目用，要求銷貨方開具普通發票。
3、購貨方屬於小規模納稅人期間，要求銷貨方開具普通發票。
4、購貨方接到專用發票超過180日認證期而無法認證抵扣，購貨方要自我檢討一下管理流程，應在180日內儘快認證。
