學科建設與研究方向
經濟學所的研究方向主要包括四大領域。
一，中國轉型期的政治經濟學。主要通過對馬克思經濟學與西方經濟學的比較研究，揭示馬克思經濟學與西方經濟學在研究對象、方法等方面的對立和聯繫，借鑑西方經濟學中的合理成分，為建立適應社會主義市場經濟和改革發展需要的新政治經濟學體系奠定理論基礎。
二，西方政治經濟學。著重研究、介紹和梳理西方政治經濟學，包括新馬克思主義經濟學、國際政治經濟學、總量經濟學中的政治經濟學、新制度經濟學、法和經濟學、公共選擇理論、規制的政治經濟學以及比較政治經濟學的最新發展，為構建中國的新政治經濟學體系提供借鑑。
三，新經濟史。運用包括產權理論、國家理論和意識形態理論在內的制度變遷理論，分析中外經濟史，主要包括中國市場經濟史研究和中外經濟關係史研究，旨在為中國社會主義市場經濟體制的選擇和現代化模式選擇提供理論基礎和經驗證據。
四，經濟思想史。著重從現代經濟學的角度審視經濟學科的歷史發展，特別是吸收諸如熊彼特《經濟分析史》和馬克·布勞格《經濟理論回顧》等西方學者有關經濟思想史的研究成果，重新評價馬克思的《剩餘價值理論》和中國傳統的經濟思想史成果。
為了拓寬學術研究空間，經濟學研究所還相繼成立了“中國經濟史研究中心”、“中俄轉型經濟比較中心”、“政治經濟學研究中心”、“中國企業發展研究中心”、“戰略與政策研究中心”等專業研究機構，新近參與人文社科學院與經濟管理學院、公共管理學院等聯合成立的校級研究機構“清華大學華商研究中心”。與國內外學術團體建立起廣泛的學術聯繫，圍繞中國轉型經濟與制度變遷、中國土地制度與城市化進程、經濟全球化、人口與經濟長期發展等問題，展開了各種學術交流與研討活動，取得了較大的學術和社會影響。
