動畫特別篇
目前日本已經播出了31集特別篇，其中20個一小時特別篇，9個二小時
特別篇一 - 第11話《鋼琴奏鳴曲<月光>殺人事件》一小時特別篇
日文名字：ピアノソナタ「月光」殺人事件
對應漫畫：VOL7F2-F7
收視率：12.9%
播映時間：1996年4月8日
劇情簡介：毛利一行人受到已故的麻生圭二先生的邀請前往月影島。可是自從上屆村長的追悼會舉行後，兇殺案便在《月光》奏鳴曲的伴奏下一件接一件的展開，川島先生、黑原村長相繼被害，鋼琴奏鳴曲《月光》成為案件的主要線索，到底誰才是殺人兇手呢？
特別篇二 - 第52話《霧天狗傳說殺人事件》一小時特別篇
日文名字：霧天狗伝說殺人事件
對應漫畫：VOL11F8-F10
收視率：17.9%
播映時間：1997年3月17日
劇情簡介：江戶川柯南，毛利蘭，毛利小五郎在一間寺院借宿時，發現一個和尚懸樑自盡了。在這個寺院中流傳著一個霧天狗的傳說，和尚的死法簡直就像被霧天狗殺死一樣，2年前雖然也發生過同樣的事情，但是警察卻認定為自殺。但是，對自殺的觀點保有懷疑態度的柯南，準備迎接這個天大詭計的挑戰……
特別篇三 - 第76話《柯南對怪盜基德》一小時特別篇
日文名字：コナンVS怪盜キッド
對應漫畫：VOL16F6-F9
收視率：21.7%
播映時間：1997年9月22日
劇情簡介：鈴木家收到了怪盜基德發出的要來偷取將在米花博物館展出的黑珍珠的預告函。柯南解讀了預告函向怪盜基德的現身地衝去。其後，基德又發出一封要在遊艇宴會上偷取黑珍珠的預告函……
特別篇四 - 第96話《走投無路的名偵探！連續兩大殺人事件》二小時特別篇
日文名字：追いつめられた名探偵！連続2大殺人事件
對應漫畫：VOL14F1-F8
收視率：22.4%
播映時間：1998年3月23日
劇情簡介：魔術師九十九元康的妻子來到小五郎的事務所。她覺得一個星期前被認為自殺的丈夫是不可能自殺的，希望小五郎儘快調查現場……柯南在那裡看到了有暗號的memo和被牌遮住的電話推理出了真正的犯人。蘭在看到以前的影集時發現柯南和新一小時候一模一樣。相信柯南就是新一所以把柯南帶到了新一家門口！正在這個時候有希子回來了。次日柯南和有希子一起去了有希子的同學數內家，那裡正在為了遺產起紛爭。這次解決案件的卻是……
特別篇五 - 第118話《浪花連續殺人事件》一小時特別篇
日文名字：浪花の連続殺人事件
對應漫畫：VOL19F5-F8
收視率：21.2%
播映時間：1998年9月21日
劇情簡介：本來是應服部平次之邀來大阪參觀的柯南、蘭、小五郎卻意外地捲入到連續殺人事件中。屍體墜落到柯南他們乘坐的巡邏車上。據稱這是連續殺人事件的第三個受害者的屍體。還有，從事件現場離開的中年女性也以相同手法被人殺害……
特別篇六 - 第129話《來自黑暗組織的女子！大學教授殺人事件》二小時特別篇
日文名字：黒の組織から來た 女大學教授殺人事件
對應漫畫：VOL18F6-VOL19F1
收視率：20.9%
播映時間：1999年1月4日
劇情簡介：柯南的班級轉來了灰原哀。隔壁班級的一個男孩因為哥哥下落不明而來委託少年偵探團。尋找的時候發現了一個黑衣女子的身影……。那個組織的真面目到底是？然後，博士和灰原和柯南去廣田教授家拿軟碟，可是……
特別篇七 - 第162話《飛天密室！工藤新一首次的事件》一小時特別篇
日文名字：空飛ぶ密室！工藤新一最初の事件
對應漫畫：VOL21F4-F7
收視率：19.8%
播映時間：1999年9月27日
劇情簡介：阿笠博士抽獎抽中了旅行券，於是小五郎、小蘭和偵探團去了沖繩，在飛機上小蘭夢見了以前和新一一起去洛杉磯時在飛機上發生的殺人事件。那么這就是新一最初的一頁……
特別篇八 - 第174話《二十年的殺意 新佛尼號連續殺人事件》二小時特別篇
日文名字：20年目の殺意シンフォニー號連続殺人事件
對應漫畫：VOL23F4-F9
收視率：14.6%
播映時間：2000年1月3日
劇情簡介：小蘭看到去小笠原參加免費海豚旅行的廣告之後，報名參加了。乘客中據說有當年蛟崎警官和小五郎一起追捕過的影子計畫師葉才三。服部收到了叫古川大的人寄來的信，也參加了這個旅行團。後來船上發生了爆炸，那個被燒死的男人是……？並且企圖解開謎題的平次也被人襲擊了。
特別篇九 - 第184話《詛咒假面的冷笑》一小時特別篇
日文名字：呪いの仮面は冷たく笑う
對應漫畫：動畫原創
收視率：20.1%
播映時間：2000年3月13日
劇情簡介：小五郎他們去參加為了交通事故的孤兒們的慈善活動，被邀請到發起者的社長家裡。社長蘇芳紅子在收集面具。連被稱作被詛咒的假面的面具也用來裝飾。為了不讓這些面具出來作怪，晚上0點就會把這件假面之屋鎖掉。當天晚上蘇芳紅子在自己的臥室被殺害，臥室上了兩道鎖，處於密室狀態。同時在蘇芳紅子的屍體周圍被詛咒的假面散落了一地。這真的是詛咒嗎？
特別篇十 - 第208話《通往迷宮的入口！巨大神像的憤怒》一小時特別篇
日文名字：迷宮への入り口 巨大神像の怒り
對應漫畫：動畫原創
收視率：18.6%
播映時間：2000年10月9日
劇情簡介：小五郎等人被邀請參加天部山纜車的揭幕儀式，然而當地居民中，反對纜車開通的呼聲不絕。第二天開幕式，在進入漆黑的通道的纜車中，堂本觀光的社長突然消失了。出了通道，纜車上的眾人發現社長的屍體出現在神像的手中。
特別篇十一 - 第219話《名偵探大聚會！工藤新一vs怪盜基德 》二小時特別篇
日文名字：集められた名探偵！工藤 新一vs.怪盜キッド
對應漫畫：VOL30F4-F7
收視率：17.6%
播映時間：2001年1月8日
劇情簡介：打算盜取鈴木財閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜KID，想起了以前關於鍾台的一個事件，那是工藤新一和怪盜KID的第一次交手。另一方面，小五郎的事務所里收到不明發信人的信函，而且裡面裝著支票。小五郎帶著小蘭、柯南一起到了“黃昏之館”。“黃昏之館”是大富翁烏丸蓮耶的別墅，一同被招待的還有其他名偵探。而後開始了在館中尋找財寶的遊戲，但偵探們一個一個消失，最後留下來的偵探是誰？召集偵探們的犯人的真實身份是……
特別篇十二 - 第263話《大阪雙重疑案！浪花劍客與太閤城》二小時特別篇
日文名字：大阪ダブルミステリー 浪花剣士と太閤の城
對應漫畫：VOL31F8-VOL32F4
收視率：19.5%
播映時間：2002年1月7日
劇情簡介：浪花的體育館正在舉行高中，大學劍道部的地區比賽。服部平次的改方學院是優勝的候補隊。而新內大的垂水在體育館的倉庫內被殺害。發現人是新內大的面谷，胴口，小手川，袴田。劍道部隊員。垂水之死的迷向平次挑戰。來大版觀光的柯南與平次一行偶遇秀吉愛好會旅行團（糟屋、福島、片桐、脇坂）。然而其中的一人，加藤在天守閣出燃燒並墜落。加藤緊握著平次的傘而死亡。
特別篇十三 - 第304話《震撼警政廳！1200萬人質》二小時特別篇
日文名字：揺れる警視庁 1200萬人の人侃
對應漫畫：VOL36F8-VOL37F1
收視率：17.0%
播映時間：2003年1月6日
劇情簡介：處理郵局強盜事件後，佐藤刑事想起了3年前的連續炸彈事件。忘不了用自己的生命來換取炸彈所在地點的松田刑事。然而，與3年前同一天的1月6日，又收到炸彈預告的傳真。發信人似乎與3年前連續炸彈事件的犯人是同一人。佐藤、高木2刑事與少年偵探團開始從傳真的文字內容推理炸彈的地點。
特別篇十四 - 第342話《豪斯登堡的新娘》一小時特別篇
日文名字：ハウステンボスの花嫁
對應漫畫：動畫原創
收視率：12.9%
播映時間：2003年11月17日
劇情簡介：由於受園子的邀請柯南和蘭為了要出席大賀財團繼承人大賀真哉的結婚酒宴乘新幹線去了豪斯登堡。在途中柯南一行人遇上了做玻璃小酒杯的員工高橋純一。但是第二天的結婚儀式前發生了新娘的化裝間裡的大賀家家寶紅寶石戒指失蹤事件。還有新娘香取茜草也不知道被誰綁架了……
特別篇十五 - 第345話《與黑色組織面對面 滿月之夜的雙重迷案》兩個半小時特別篇
日文名字：黒の組織と真っ向勝負 満月の夜の二元ミステリー
對應漫畫：VOL42F5-F10
收視率：16.7%
播映時間：2004年1月5日
劇情簡介：蘭收到暗示有殺人預告的萬聖節晚會邀請函的小五郎和園子兩個人去了晚會會場。另一方面、新一同樣收到了一份一樣的邀請函。而且新一和柯南是同一個人也漸漸暴露了。柯南用麻醉槍讓拚命阻止他的哀睡著了。在幽靈船會場上扮成亡靈船長的舉辦人是某遊戲開始了。但是發生了舉辦者被殺事件。與此同時，朱蒂出現在被一個人留在家裡的哀的面前，而新出醫生的真實身份是……
特別篇十六 - 第356話《怪盜基德令人驚異的空中漫步》一小時特別篇
日文名字：怪盜キッドの驚異空中歩行
對應漫畫：VOL44F7-F10
收視率：13.7%
播映時間：2004年4月12日
劇情簡介：園子的親戚，鈴木財閥的顧問次郎吉在報紙上發出了一張給基德的挑戰書。讓他來盜取大寶石“大海的奇蹟”……基德接受了挑戰，說他前一天會演一齣好戲。驚慌失措的警察們戒備森嚴，就在這種情況下，基德登場了！！幸運女神到底會向誰微笑？是偵探！？還是怪盜！？
特別篇十七 - 第383話《甲子園的奇蹟！向無形的惡魔挑戰》二小時特別篇
日文名字：甲子園の奇蹟！ 見えない悪魔に負けず嫌い
對應漫畫：VOL43F10-VOL44F3
收視率：12.5%
播映時間：2004年12月20日
劇情簡介：柯南一行人受平次之邀去甲子園觀看夏季高中棒球聯賽。但他們偶然拾得了一部電話，對方告知在第三回合、第六回合與第九回合比賽結束前，若不找到放在其餘地方的手機，他就引爆炸彈自殺。這時一條簡訊又顯示出了手機所在地點的暗號。柯南與平次能在坐滿5萬名觀眾的甲子園球場中找到這名放炸彈的男人嗎！？
特別篇十八 - 第425話《黑色衝擊! 組織之手伸來的瞬間》兩個半小時特別篇
日文名字：ブラックインパクト！組織の手が屆く瞬間
對應漫畫：VOL48F9-VOL49F4
收視率：13.1%
播映時間：2006年1月9日
劇情簡介：小五郎在與播音員水無怜奈的對話中得知她被惡作劇的門鈴所困擾一事，便與柯南及蘭一同前往怜奈的家。
小五郎等人雖然抓到了犯人,但此時，柯南卻從安裝的竊聽器中覺察到怜奈實際是黑色組織同黨一事。
隨後，黑色組織制定了於下午1點在代號為ADP的地點暗殺一個代號為DJ的人的計畫。密切關注著怜奈的FBI探員朱蒂決定與柯南聯手阻止暗殺計畫。為了阻止暗殺計畫，就要知道ADP和DJ的意思是什麼，柯南隨即展開了推理……
特別篇十九 - 第449話《總局刑警戀愛物語！虛假的結婚典禮》一小時特別篇
日文名字：本庁の刑事戀物語 偽りのウエディング
對應漫畫：VOl52F3-F5
收視率：11.8%
播映時間：2006年8月21日
劇情簡介：小五郎，柯南，蘭在東都迎賓館出席完婚禮後，在走廊碰見新郎打扮的高木刑警和新娘打扮的由美。其實，兩人是被強盜當作目標的新娘和新郎的替身。據說半年前，強盜潛入新娘的娘家，被新郎趕走的強盜在逃跑時留下了絕對不能忘記這份仇恨的恐嚇。
從被留下的菜刀驗出的指紋與連奪6條人命的連續盜竊殺人案罪犯的指紋相吻合，前天，充滿恐嚇意思的威脅信被人放入了新娘家的信箱裡。之後，在堤無津川的倉庫發現了被割喉焚燒的屍體，從燃燒殘留下的指甲上驗出了強盜的指紋……
特別篇二十 - 第452話《金比羅劇場的怪人》一小時特別篇
日文名字：こんぴら座の怪人
對應漫畫：動畫原創
收視率：9.1%
播映時間：2006年9月11日
劇情簡介：小五郎，柯南，蘭，園子為了看伊東玉之助的劇團的戲劇表演，而前往了有名的劇院：金丸座，與玉之助、蓮華，惠美等人再次相見。這次，劇團上演的是以《劇院魅影》為藍本改編的《金毘羅劇院魅影》的時代劇，玉之助飾演怪人，女演員輕部蘆美飾演女主角歌手。這之後，在彩排中大吊燈突然落下，由於蘆美額頭受了小傷，玉之助不得不在劇院，公開了被實際存在的怪人要求更換女主角的事情。原來團長宛已經收到了“換女主角，換蓮華！”的恐嚇信……
特別篇二十一 - 第479話《與服部平次在一起的三天》二小時特別篇
日文名字：服部平次との 3日間
對應漫畫：VOl54F6-VOL55F2
收視率：10.5%
播映時間：2007年7月16日
簡介：柯南，小蘭，服部平次，遠山和葉乘坐小五郎駕駛的租賃車來到觀賞櫻花的著名景點。在這裡，一位叫傅久的年輕修行僧在發現小五郎後很吃驚。原來傅久希望小五郎可以替他揭開一個謎團。據傅久講，前幾天，前來拜訪和尚的一名女性從房間消失了。小五郎等人拜訪寺院，柯南和平次決定弄清真相…。次日清晨，平次向柯南等人說出了自己即將出演，由日賣電視台企劃的偵探甲子園的事情。據說將聚集全國的高中生偵探，決出日本第一的企劃，自己將作為西部代表登場。柯南也作為平次的助手參加了在無人島舉行的偵探甲子園，這時，在《魔術快斗》活躍的名偵探，同時在第219話特別篇出現的高中生偵探白馬探也出現了！
特別篇二十二 - 第487話《本廳刑事戀物語8 左手的無名指》一小時特別篇
日文名字：本庁の刑事戀物語8 左手の薬指
對應漫畫：VOl56F1-F3
收視率：10.9%
播映時間：2007年10月15日
劇情簡介：走在警視廳的佐藤刑警被眾多同事紛紛注視著。此後，高木刑警被白鳥警長質問佐藤刑警所帶戒指的事情。此時，佐藤的手機響起。高木完全沒有搞清楚是怎么回事，而將視線望向佐藤，第一次注意到她左手無名指上戴著戒指。高木認為只有訂婚的人，才在左手無名指上佩戴戒指，備受打擊。同事們則誤認為是高木贈送的婚約戒指，而高木堅決否認是自己贈送的。就在此時，佐藤接到了小蘭打來的說有人死亡的電話。佐藤立刻決定和高木趕往現場。但是，高木太在意佐藤的戒指，一時沒有反應過來……
特別篇二十三 - 第488話《電視台的惡魔》一小時特別篇
日文名字：テレビ局の悪魔
對應漫畫：VOl57F5-F7
收視率：9.4%
播映時間：2007年10月22日
劇情簡介：柯南、少年偵探團、灰原和阿笠博士去日賣電視台參觀假面超人的拍攝。然而，由於拍攝的時間延遲了，於是柯南等人只好改為參觀電視台。在電視台里，他們恰巧遇見了“三途之III”的主唱撒旦鬼冢。鬼冢離開後，光彥才想起姐姐拜託自己問鬼冢要簽名的……柯南等人想法設法尋找鬼冢的休息室，終於，光彥順利得到了簽名。此時，AD三島突然面色慘白的跑進休息室、把鬼冢一行人帶到了會客室。原來，鬼冢所屬的藝人事務所社長---漆原典兒在會客室里被害了……
特別篇二十四 - 第489話《法庭對決Ⅲ 目擊者是檢察官》一小時特別篇
日文名字：法廷の対決III 目撃者は検察官
對應漫畫：動畫原創
收視率：10.1%
播映時間：2007年11月26日
劇情簡介：東京拘留所的接見室內，妃英理律師與嫌疑人竹內浩明會面。竹內因在酒鋪喝了酒後，用車撞上了受害者，之後逃逸。擔任此案公訴的九條檢察官認為應對竹內處以10日拘留。妃律師問訊了不被釋放的原因，但竹內什麼也沒回答。一方面，小五郎，柯南，蘭為了協助妃律師，前往警察署對事故車輛進行調查。觀察了車內布局的柯南對駕駛座位狹小的空間存在很大疑問。如果是男性的竹內坐在上面的話，太過於狹小了。據辦事員講，九條檢察官也注意到了座位的狹小問題。此後，小五郎等人從目擊事故的出租汽車司機那裡問清了事故的經過。根據司機回憶，現場查證的時候，九條檢察官認為存在犯人是女性的可能性……
特別篇二十五 - 第490話《服部平次vs工藤新一 滑雪場的推理對決》一小時特別篇
日文名字：服部平次 vs 工藤新一ゲレンデの推理対決
對應漫畫：VOL50F8-VOL51F1
收視率：8.8%
播映時間：2007年12月3日
劇情簡介：成為柯南的工藤新一給在大阪的服部平次打手機聊天，由於柯南這個月解決的案件比平次多一件而稍微炫耀了下。於是，平次打斷了新一打算繼續探討案件的念頭，卻回想起3年前滑雪場的事件…。3年前，平次與和葉所在的改方學園國中部來到山形縣的滑雪場。和葉從同學那裡聽到這座山上有雪女的民間傳說。故事裡，雪女對男人提出用銀色衣服和重要的東西進行交換，結果男人的心臟被奪走的銀衣傳說。據說4年前發生了與民間故事很相似的事件。此後，在滑雪場又發生了和民間故事相似的事件，平次與謎樣的國中生偵探的推理交戰開始了……
特別篇二十六 - 第515話《怪盜基德的瞬間移動魔術》一小時特別篇
日文名字：怪盜キッドの瞬間移動魔術
對應漫畫：VOl61F1-F4
收視率：9.6%
播映時間：2008年10月20日
劇情簡介：園子的叔叔鈴木財團的諮詢顧問次郎吉，計畫用傳說中的拖鞋紫紅趾甲當誘餌，來抓捕基德。次郎吉打算利用基德每次總是從高處出現這一登場方式，來作點文章。次郎吉在東京銀座的十字路口舉辦拖鞋的展示活動。這是個基德不能用滑翔機起飛的地點。隨後，柯南等人隨著民眾的目光，凝視著空中，高空中出現了駕駛滑翔機而來的基德。基德剛在展示台上站穩，次郎吉就對工作人員下達指示，將十字路口的四周用網圍了起來。網的高度達到了20米左右，次郎吉確信自己獲得了勝利，但基德在拿起拖鞋後，宣稱自己將使用瞬間移動的方式進行逃脫。
特別篇二十七 - 第516、517話《風林火山 迷宮的鎧甲武士》一小時特別篇
日文名字：風林火山迷宮の鎧武者
對應漫畫：VOL59F5-F10
收視率：10.8%
播映時間：2008年11月3日
劇情簡介：小五郎和柯南、小蘭拜訪居住在長野縣的一戶名叫虎田的人家，以便從現任家主虎田直信那裡獲知，有關不久前他的兒子義郎遭遇龍捲風摔死的事情。是誰對瀕死的義郎見死不救呢，直信的妻子達榮認為是和虎田家有過節的龍尾家窩藏兇手。另一方面，龍尾家的住宅內，平次與和葉正在聽現任家主龍尾為史講述，有關不久前他的兒子康司被人綁架殺害的事情。為史的母親盛代則認為義郎的死是對龍尾家充滿憎恨的虎田家的某人為了殺害康司的藉口罷了。接受各自委託的柯南、平次在調查案件的過程中相遇，便決定共同探究事件的真相。但是，柯南和平次在發現犯人前，一起新的殺人事件卻發生了…。
特別篇二十八 - 第521話《殺人犯 工藤新一》一小時特別篇
日文名字：殺人犯、工藤新一
對應漫畫：VOl62F5-F9
收視率：9.6%
播映時間：2009年1月19日
劇情簡介：收到自稱屋田誠人寄來的關於1年前工藤新一所破解的殺人事件的推理存在疑點的信的平次，約上小五郎、柯南、小蘭、和葉前往東奧穗村。平次等人在拜訪村公所的時候，柯南則獨自一人進入了森林。原來隨信還有附寄給新一的一封信，約在山中小屋見面。此時，柯南突然感到莫名的痛苦。原來柯南在感冒後，從阿笠博士那裡得到的藥，居然是小哀研究出的APTX4869的解毒剤的試製品。小蘭等人為尋找柯南，進入森林，卻意外與新一相見。但是，新一因喪失記憶，甚至連小蘭都忘記是誰了……
特別篇二十九 - 第522話《新一的真面目與蘭的眼淚》一小時特別篇
日文名字：新一の正體に蘭の涙
對應漫畫：VOl62F9-F10
收視率：11.3%
播映時間：2009年1月26日
劇情簡介：從山路滾落失去意識的蘭，夢見了在多羅碧加樂園一去不回的新一，醒來後，發現自己躺在一個山上的小屋裡。此時，平次他們推門而入，並對小屋和旁邊屋子進行了調查，發現了裝子彈的空盒和貼滿新一的新聞報導的牆壁，平次斷定這是死亡羅神的落腳點。
之後，平次又發現了柯南留下的腳印，開始懷疑出現在大家面前的“工藤新一”的真實身份。
平次召集大家來到刑警跟前，宣布刺傷報社記者的人就是“工藤新一”！！“工藤新一”在眾人面前痛哭流涕地述說原因，蘭對這樣的新一感到非常地陌生，死亡羅神的身影再次出現在屋外...!!
特別篇三十-合作製作《魯邦三世VS名偵探柯南》兩個小時特別版
日文名字：ルパン三世VS名探偵コナン
收視率：19.5%
播出時間：2009.3.26
劇情簡介：在維斯泥巴亞王國，女王－薩克拉死於獵槍走火事故，而王國的王子－吉爾，因母親由於自己的獵槍走火而過度自責，最後以手槍自殺身亡。慘劇的訊息迅速傳播，轟動各國新聞界，當然，也傳到了江戶川柯南和魯邦三世耳里……
女王及王子的死，使公主－米拉將繼承王位成為下屆女王。當米拉女王到日本訪問時，她遇見和她十分相似的蘭。米拉希望自由地玩一次，而蘭想一嘗當公主的滋味，因此她們換了衣著，但伯爵─基斯不公布公主失踨的訊息，並把蘭帶回國，而柯南亦偷偷地跟隨蘭上機……這個時候，魯邦準備向“女王皇冠”下手。
慘劇背後隱藏著怎樣的秘密？“平成年代的福爾摩斯，日本警察的救世主”工藤新一（江戶川柯南）對決“世紀大盜”魯邦三世！ 勝利歸向何方？
31.柯南VS平次 東西偵探推理對決 一小時特別篇
日文名字：コナン平次の推理対決VS物探偵
播出時間：2012.4.1
劇情介紹：服部平次到東京來，到了毛利偵探所，問柯南世良真純的事，這時真純出現了，去買咖喱的和葉打來了電話，她在飯店卻遇見了殺人案件，FBI搜查官聽見犯人在廁所說“小阿布”，以此為線索，平次與柯南展開一場推理對決，破案的關鍵是關西腔，平次解讀出了犯人的話的意思，最終由柯南推理出案件的全過程，而在嫌疑人中，有FBI搜查官，最終的犯人是會說關西話。犯人暴露後襲擊蘭和和葉。。。。。。
漫畫特別篇
第1卷FILE.1 消失的男人
FILE.2 綁票
FILE.3 殺機
FILE.4 突然死亡
FILE.5 幽靈大廈
FILE.6 最後王牌
FILE.7 銀行搶匪
FILE.8 名畫雅盜
FILE.9 毒害
FILE.1 復仇
FILE.2 遠方操作
FILE.3 肇事逃逸
FILE.4 縱火狂
FILE.5 藝人
FILE.6 不在場證明
FILE.7 綁架
FILE.8 兇器
FILE.1 靈異現象謀殺案 (上)
FILE.2 靈異現象謀殺案 (中)
FILE.3 靈異現象謀殺案 (下)
FILE.4 電玩玩家謀殺案 (上)
FILE.5 電玩玩家謀殺案 (下)
FILE.6 藍色列車謀殺案 (上)
FILE.7 藍色列車謀殺案 (下)
FILE.8 美食評論家謀殺案 (上)
FILE.9 美食評論家謀殺案 (下)
FILE.10 神秘鬼屋謀殺案
FILE.1 女兒節謀殺案 (上)
FILE.2 女兒節謀殺案 (下)
FILE.3 朋友的邀請函 (上)
FILE.4 朋友的邀請函 (下)
FILE.5 夏蕾綠
FILE.6 煙火之夜謀殺案 (上)
FILE.7 煙火之夜謀殺案 (下)
FILE.8 消失的新娘 (上)
FILE.9 消失的新娘 (下)
FILE.10 惡魔之雷 (上)
FILE.11 惡魔之雷 (下)
FILE.1 從天而降的男人 (上)
FILE.2 從天而降的男人 (下)
FILE.3 女大學生作家謀殺案 (上)
FILE.4 女大學生作家謀殺案 (下)
FILE.5 政治家不死兩次 (上)
FILE.6 政治家不死兩次 (下)
FILE.7 聽不到的留言 (上)
FILE.8 聽不到的留言 (下)
FILE.9 迷宮庭園謀殺案 (上)
FILE.10 迷宮庭園謀殺案 (下)
FILE.11 情人節的悲劇 (上)
FILE.12 情人節的悲劇 (下)
FILE.13 解開密室之謎！ (上)
FILE.14 解開密室之謎！ (下)
FILE.1 屍體
FILE.2 跳樓自殺
FILE.3 炸彈犯
FILE.4 密碼
FILE.5 偽裝自殺 (前篇)
FILE.6 偽裝自殺 (後篇)
FILE.7 尋寶去!!
FILE.8 奇特的綁架案件
FILE.9 切腹之佛
FILE.1 火箭的秘密 (前篇)
FILE.2 火箭的秘密 (後篇)
FILE.3 三個提示！ (前篇)
FILE.4 三個提示！ (後篇)
FILE.5 不相像的姊妹 (前篇)
FILE.6 不相像的姊妹 (後篇)
FILE.7 殺人如風隨形 (前篇)
FILE.8 殺人如風隨形 (後篇)
FILE.9 鬼屋殺人事件 (前篇)
FILE.10 鬼屋殺人事件 (後篇)
FILE.11 怪盜808號的收藏品 (前篇)
FILE.12 怪盜808號的收藏品 (後篇)
FILE.13 聖誕節殺人事件 (前篇)
FILE.14 聖誕節殺人事件 (後篇)
FILE.1 黑暗中的狙擊者
FILE.2 網球場殺人事件 (前篇)
FILE.3 網球場殺人事件 (後篇)
FILE.4 受詛咒的溜溜球(YOYO) (前篇)
FILE.5 受詛咒的溜溜球(YOYO) (後篇)
FILE.6 解讀密碼！！ (前篇)
FILE.7 解讀密碼！！ (後篇)
FILE.8 MK馬戲團殺人事件 (前篇)
FILE.9 MK馬戲團殺人事件 (後篇)
FILE.10 在單人牢房中 (前篇)
FILE.11 在單人牢房中 (後篇)
FILE.1 豪華郵輪殺人事件
FILE.2 消失的屍體 (前篇)
FILE.3 消失的屍體 (後篇)
FILE.4 日本第一的救護隊(前篇)
FILE.5 日本第一的救護隊(後篇)
FILE.6 怪盜史坦普 (前篇)
FILE.7 怪盜史坦普 (後篇)
FILE.8 幽靈摩天輪 (前篇)
FILE.9 幽靈摩天輪 (後篇)
FILE.10 聖誕夜的禮物
FILE.1 惡夢的逃避之行 (前篇)
FILE.2 惡夢的逃避之行 (後篇)
FILE.3 訊息 (前篇)
FILE.4 訊息 (後篇)
FILE.5 消失的女演員 (前篇)
FILE.6 消失的女演員 (後篇)
FILE.7 海濱的殺意 (前篇)
FILE.8 海濱的殺意 (後篇)
FILE.9 玩具熊之謎 (前篇)
FILE.10 玩具熊之謎 (後篇)
FILE.11 臥龍湖的怪事件 (前篇)
FILE.12 臥龍湖的怪事件 (後篇)
FILE.1 國中校園的死角
FILE.2 酒杯殺人事件 (前篇)
FILE.3 酒杯殺人事件 (後篇)
FILE.4 消失的戀人 (前篇)
FILE.5 消失的戀人 (後篇)
FILE.6 算命
FILE.7 黑暗的挑戰書
FILE.8 名著的陷阱 (前篇)
FILE.9 名著的陷阱 (後篇)
FILE.10 倒數計時
FILE.01 消失的愛情小說作家 (前篇)
FILE.02 消失的愛情小說作家 (後篇)
FILE.03 召來死神的接力賽跑
FILE.04 縱火謀殺案之謎 (前篇)
FILE.05 縱火謀殺案之謎 (後篇)
FILE.06 空白的一小時 (前篇)
FILE.07 空白的一小時 (後篇)
FILE.08 有不在場證明的殺人兇手 (前篇)
FILE.09 有不在場證明的殺人兇手 (後篇)
FILE.10 幽靈棲息的島嶼 (前篇)
FILE.11 幽靈棲息的島嶼 (後篇)
FILE.1 消失的收信郵件(前篇)
FILE.2 消失的收信郵件(後篇)
FILE.3 四個關鍵字(前篇)
FILE.4 四個關鍵字(後篇)
FILE.5 被隱藏的球(前篇)
FILE.6 被隱藏的球(後篇)
FILE.7 危險的味道(前篇)
FILE.8 危險的味道(後篇)
FILE.9 高級酒的快樂秘訣(前篇)
FILE.10 高級酒的快樂秘訣(後篇)
FILE.11 有名旅館的爆炸預告(前篇)
FILE.12 有名旅館的爆炸預告(後篇)
FILE.13 珍貴的郵戳(前篇)
FILE.14 珍貴的郵戳((後篇)
FILE.1 在霧裡…(前篇)
FILE.2 在霧裡…(後篇)
FILE.3 一族之寶(前篇)
FILE.4 一族之寶(中篇)
FILE.5 一族之寶(後篇)
FILE.6 音樂堂殺人事件(前篇)
FILE.7 音樂堂殺人事件(中篇)
FILE.8 音樂堂殺人事件(後篇)
FILE.9 槍聲的秘密(前篇)
FILE.10 槍聲的秘密(後篇)
FILE.11 屍體隱蔽
FILE.1 魔術師的終結(前篇)
FILE.2 魔術師的終結(後篇)
FILE.3 雪山的爆破殺人(前篇)
FILE.4 雪山的爆破殺人(後篇)
FILE.5 帆船之迷(前篇)
FILE.6 帆船之迷(後篇)
FILE.7 寂靜的殺人命令(前篇)
FILE.8 寂靜的殺人命令(後篇)
FILE.9 浪漫列車、瞬間殺人(前篇)
FILE.10浪漫列車、瞬間殺人(後篇)
FILE.11 恐怖的炸彈魔(前篇)
FILE.12 恐怖的炸彈魔(後篇)
FILE.1 阻擊70億的足跡(前篇)
FILE.2 阻擊70億的足跡(後篇)
FILE.3 糖果和茶(前篇)
FILE.4 糖果和茶(後篇)
FILE.5 迷之遊覽(前篇)
FILE.6 迷之遊覽(後篇)
FILE.7 青之暗號(前篇)
FILE.8 青之暗號(後篇)
FILE.9 危險的香味(前篇)
FILE.10 危險的香味(後篇)
FILE.11 來自遊戲王的訊息(前篇)
FILE.12 來自遊戲王的訊息(後篇)
FILE.1 復甦的槍彈（前篇）
FILE.2 復甦的槍彈（後篇）
FILE.3 寶石中的遺言
FILE.4 真空的殺人
FILE.5 密室的人體爆炸事件（前篇）
FILE.6 密室的人體爆炸事件（後篇）
FILE.7 看不到樣子的綁架犯（前篇）
FILE.8 看不到樣子的綁架犯（後篇）
FILE.9 湖畔別墅殺人事件（前篇）
FILE.10 湖畔別墅殺人事件（後篇）
FILE.11 從O型血到A型血（前篇）
FILE.12 從O型血到A型血（後篇）
FILE.1 尋找黃金卡普德斯！！（前編）
FILE.2 尋找黃金卡普德斯！！（後編）
FILE.3 惡魔的占卜殺人事件（前編）
FILE.4 惡魔的占卜殺人事件（後編）
FILE.5 被看中的寶石（前編）
FILE.6 被看中的寶石（後編）
FILE.7 被血塗滿的電視CM（前編）
FILE.8 被血塗滿的電視CM（前編）
FILE.9 灰姑娘的秘密（前編）
FILE.10 灰姑娘的秘密（後編）
FILE.11 喚來死亡的撲克臉（前編）
FILE.12 喚來死亡的撲克臉（後編）
FILE.13 危險的牙醫（前篇）
FILE.1 極寒世界的殺人（前篇）
FILE.2 極寒世界的殺人（後篇）
FILE.3 死之旋律（前篇）
FILE.4 死之旋律（後篇）
FILE.5 柯南走投無路（前篇）
FILE.6 柯南走投無路（後編）
FILE.7 柯南走投無路（後編）
FILE.8 名偵探VS完全犯罪（前編）
FILE.9 名偵探VS完全犯罪（後編）
FILE.10 犯人是編號10的人
FILE.1 悲哀的污垢唱機(前篇)
FILE 2 悲哀的污垢唱機(後篇)
FILE 3 波江星座的眼淚(前篇)
FILE.4 波江星座的眼淚(後篇)
FILE.5 留下的足跡(前篇)
FILE.6 留下的足跡(後篇)
FILE.7 熄滅的浮雕寶石和謎的犯罪行為時間(前篇)
FILE.8 熄滅的浮雕寶石和謎的犯罪行為時間(後篇)
FILE.9 冤罪·無實的罪(前篇)
FILE.10 冤罪· 無實的罪(後篇)
FILE.11 海底古蹟和下落不明的謎(前篇)
FILE.12 海底古蹟和下落不明的謎(後篇)
FILE.1 強盜TAXI(前篇)
FILE.2 強盜TAXI(後篇)
FILE.3 吉他下的用心(前篇)
FILE.4 吉他下的用心(後篇)
FILE.5 沉默的劍士(前篇)
FILE.6 沉默的劍士(後篇)
FILE.7 作祟的遇難者(前篇)
FILE.8 作祟的遇難者(後篇)
FILE.9 迷宮之京都 名偵探對決(前篇)
FILE.10 迷宮之京都 名偵探對決(後篇)
FILE.11 消失的兇器(前篇)
FILE.12 消失的兇器(後篇)
FILE.1 消失了的屍體(前篇)
FILE.2 消失了的屍體(後篇)
FILE.3 黑暗中蠢蠢愈動的影子(前篇)
FILE.4 黑暗中蠢蠢愈動的影子(中篇)
FILE.5 黑暗中蠢蠢愈動的影子(後篇)
FILE.6 名偵探自信滿滿(前篇)
FILE.7 名偵探自信滿滿(後篇)
FILE.8 沒有臉的刺客(前篇)
FILE.9 沒有臉的刺客(後篇)
FILE.10 死的迴轉
FILE.11 消失了的兇器(前篇)
FILE.12 消失了的兇器(後篇)
FILE.1 射中算命先生的謎(前篇)
FILE.2 射中算命先生的謎(後編)
FILE.3 假音樂會票的謎(前篇)
FILE.4 假音樂會票的謎(後編)
FILE.5 被瞄準了的中國人(前篇)
FILE.6 被瞄準了的中國人(後編)
FILE.7 復甦的木乃伊(前篇)
FILE.8 復甦的木乃伊(後編)
FILE.9 雷和珊瑚的謎(前篇)
FILE.10 雷和珊瑚的謎(後編)
FILE.11 消失了的娜拉貓(前篇)
FILE.12 消失了的娜拉貓(後編)
File.1 疑惑的泳裝秀（前篇）
File.2 疑惑的泳裝秀（後篇）
File.3 循環的A（前篇）
File.4 循環的A（中篇）
File.5 循環的A（後篇）
File.6 被隱藏在透明盒子內的真相（前篇）
File.7 被隱藏在透明盒子內的真相（後篇）
File.8 魔鬼的手機簡訊（前篇）
File.9 魔鬼的手機簡訊（後篇）
File.10 隱藏寶石的魔術（前篇）
File.11 隱藏寶石的魔術（中篇）
File.12 隱藏寶石的魔術（後篇）
File.1 浴室中也？！餵~這個事件…（前篇）
File.2 浴室中也？！餵~這個事件…（後篇）
File.3 看不見的強盜（前篇）
File.4 看不見的強盜（後篇）
File.5 柯南VS炸彈魔（前篇）
File.6 柯南VS炸彈魔（後篇）
File.7 神秘失蹤之謎（前篇）
File.8 神秘失蹤之謎（後篇）
File.9 不自然的碰面（前篇）
File.10 不自然的碰面（後篇）
File.11 聖母瑪麗婭的畫在哪裡？
FILE.1 30年前的暗號（前篇）
FILE.2 30年前的暗號（後篇）
FILE.3 鴿子幫個忙（前篇）
FILE.4 鴿子幫個忙（後篇）
FILE.5 背後的魔手（前篇）
FIIE.6 背後的魔手（後篇）
FILE.7 另一個自己（前篇）
FILE.8 另一個自己（後篇）
FILE.9 寄託于飛艇的願望（前篇）
FILE.10 寄託于飛艇的願望（後篇）
FILE.11 黑衣組織——出現（前篇）
FILE.12 黑衣組織——出現（後篇）
FILE.1 犯罪藝人（前篇）
FIIE.2 犯罪藝人（後篇）
FILE.3 凍僵的精靈（前篇）
FILE.4 凍僵的精靈（後篇）
FILE.5 海風是危險的香味（前篇）
FILE.6 海風是危險的香味（後篇）
FIIE.7 憂傷的“哀”色（前篇）
FILE.8 憂傷的“哀”色（後篇）
FIIE.9 被盜的七夕之星（前篇）
FILE.10 被盜的七夕之星（後篇）
FILE.1 復活的A·L·N（前篇）
FILE.2 復活的A·L·N（後篇）
FILE.3 珍貴的遺產!!（前篇）
FILE.4 珍貴的遺產!!（後篇）
FILE.5 情人節的甜蜜陷阱（前篇）
FILE.6 情人節的甜蜜陷阱（後篇）
FILE.7 W杯代表選手誘拐事件（前篇）
FILE.8 W杯代表選手誘拐事件（後篇）
FILE.1 忍者的寶藏（前篇）
FILE.2 忍者的寶藏（後篇）
FILE.3 恐龍的腳印和瑪麗亞像（前篇）
FILE.4 恐龍的腳印和瑪麗亞像（後篇）
F1LE.5 消失在南海的贖金（前篇）
FILE.6 消失在南海的贖金（後篇）
FILE.7 從野營地消失的屍體（前篇）
FILE.8 從野營地消失的屍體（後篇）
FILE.9 失蹤的校務員（前篇）
FILE.10 失蹤的校務員（後篇）
FILE.11 少女偵探團?!（前篇）
FILE.12 少女偵探團?!（後篇）
FILE.1 呼喚死亡的夏日香氣（前篇）
FILE.2 呼喚死亡的夏日香氣（後篇）
FILE.3 紅鞋子連續爆炸事件（前篇）
FILE.4 紅鞋子連續爆炸事件（後篇）
FILE.5 通往地獄的電梯（前篇）
FILE.6 通往地獄的電梯（後篇）
FILE.7 8張照片（前篇）
FILE.8 8張照片（後篇）
FILE.9 冰冷的殺意（前篇）
FILE.10 冰冷的殺意（後篇）
FILE.11 被偷走的海盜寶藏（前篇）
FILE.12 被偷走的海盜寶藏（後篇）
FILE.1 怪盜基德和黑色寶石之謎（前篇）
FlLE.2 怪盜基德和黑色寶石之謎（後篇）
FILE.3 爺爺的古董鍾（前篇）
FILE.4 爺爺的古董鍾（後篇）
FILE.5 被盯上的防範訓練（前篇）
FILE.6 被盯上的防範訓練（後篇）
FILE.7 金屬消失的村莊（前篇）
FILE.8 金屬消失的村莊（後篇）
FILE.9 人體自燃之謎（前篇）
FILE.10 人體自燃之謎（後篇）
FILE.11 由比正雪的財寶（前篇）
FILE.12 由比正雪的財寶（後篇）
File.1 摺紙館殺人事件（前篇）
File.2 摺紙館殺人事件（後篇）
File.3 消失的巨大煙花（前篇）
File.4 消失的巨大煙花（後篇）
File.5 被杉木精靈俯身的少年（前篇）
File.6 被杉木精靈俯身的少年（後篇）
File.7 最強格鬥家殺人事件（前篇）
File.8 最強格鬥家殺人事件（後篇）
File.9 乘坐SL的幽靈（前篇）
File.10 乘坐SL的幽靈（後篇）
File.11 被詛咒的鋼琴旋律（前篇）
File.12 被詛咒的鋼琴旋律（後篇）
FILE.1 去向不明的名畫<上篇>
FILE.2 去向不明的名畫<下篇>
FILE.3 裝在瓶子裡的SoS<上篇>
FILE.4 裝在瓶子裡的SoS<下篇>
FILE.5 被詛咒的香木<上篇>
FILE.6 被詛咒的香木<下篇>
FILE.7 機關屋的秘密<上篇>
FILE.8 機關屋的秘密<下篇>
FILE.9 連續鬼火放火事件<上篇>
FILE.10 連續鬼火放火事件<下篇>
FILE.11 蘭花盛開的魔女之森<上篇>
FILE.12 蘭花盛開的魔女之森<下篇>
國小館短篇
國小館的名偵探柯南動畫原創錄影。這些OVA都是附屬於國小館出版的一些兒童百科全書，隨同這些兒童讀物一起出售。內容則以科普為主，當然比較適合小學生觀看。目前已知的有以下幾部，長度大多在15-20分鐘之間，出版時間在1998-2003年之間。由於出版年代都比較早，都是錄影帶。而國內比較容易找到的只有“追尋謎一樣的水星怪獸”這一篇。
嘗試不可思議的實驗
神秘的邀請信事件
嘗試體驗繩文時代！
網際網路神秘郵件事件
來自金字塔的挑戰書！
追尋謎一樣的水星怪獸
探索古代恐龍之謎！
城市探險！收集動物標籤！
