美國的巡航飛彈潛艇
西方一直僅僅發展兩個類型——攻擊潛艇和彈道飛彈潛艇。雖然美國在上世紀50年代末建造了大比目魚號，但服役沒有幾年就將其改裝成了攻擊型潛艇。美國巡航飛彈潛艇也是在近幾年才出現的。美國海軍在近幾年將數艘俄亥俄級核潛艇改裝成巡航飛彈潛艇。這些潛艇仍用垂直發射系統作為巡航飛彈的發射平台，並裝備了22發戰斧巡航飛彈，其中兩發裝備核彈頭。剩下的兩個發射筒則為特種部隊裝備特殊裝備而用。這些發射筒也可以被用作無人飛行器或遙控潛水裝置的發射或裝載平台。為潛艇增加觀導能力。如果這種俄亥俄級潛艇滿載154發彈頭的戰斧巡航飛彈，其火力將相當於一個巡航飛彈驅逐艦戰鬥群或者2艘飛彈巡洋艦。俄亥俄號在2006年年初已經改裝完畢，下水試航。同期密西根號和佛羅里達號開始進場改裝。而喬治亞號也在早些時候開始了改裝。預計在2008年前，美國將擁有4艘以上的俄亥俄級巡航飛彈潛艇。
蘇俄的巡航飛彈潛艇
蘇俄早在上世紀50年代就開始了巡航飛彈的研究，並取得了重大成果。當時蘇聯的經濟無法支撐像美國一樣建造大量航母戰鬥群。以尼米茲級及其戰鬥群為例，航母要50億美元，各種護航艦艇的建造費用總和也高達20~50億，外加艦載機、潛艇等等費用相當高昂。當時蘇俄沒有經濟實力建造同等的航母艦隊但卻要抗衡美國的航母優勢，於是發明了巡航飛彈潛艇這一類型，目的是用幾艘例如奧斯卡級核潛艇就能足以平衡掉美國1個航母編隊（蘇俄的巡航飛彈潛艇主要裝備的是反艦飛彈）。同時也剩下數十億美元。其中J級潛艇是世界上第一級列裝部隊的巡航飛彈潛艇。而現在最著名的巡航飛彈潛艇則是俄羅斯海軍的阿庫拉級。它裝備SS-N-19型潛射反艦飛彈，並且反潛和隱身能力也較其前輩提高不少。《簡氏戰艦年鑑》曾評價奧斯卡級：“它不僅能夠消滅掉一個航母戰鬥群，還能順手把水下的潛艇也消滅掉。”
現役的巡航飛彈潛艇
俄羅斯
Oscar class 奧斯卡級
美國
Ohio class 俄亥俄級（改裝型）
退役的巡航飛彈潛艇
俄羅斯
Juliet class J級
Echo class E-I級
Papa class P級
Yankee Notch class Y級Notch型（楊基級Notch型）
Charlie class C級
