中華人民共和國國防科技工業局主要負責組織管理國防科技工業計畫、政策、標準及法規的制定與執行情況監督。
國家國防科技工業局的主要職能：
研究擬訂國防科技工業和軍轉民發展的方針、政策和法律、法規；制定國防科技工業及行業管理規章；
組織國防科技工業的結構、布局、能力的最佳化調整工作；組織軍工企事業單位實施戰略性重組；
研究制定國防科技工業的研發、生產、固定資產投資及外資利用的年度計畫；
組織協調國防科技工業的研發、生產與建設，以確保軍備供應的需求；
擬訂核、航天、航空、船舶、兵器工業的生產和技術政策、發展規劃、實施行業管理；
負責組織管理國防科技工業的對外交流與國際合作；
以中國國家原子能機構（CAEA）的名義組織協調政府和國際組織間原子能方面的交流與合作；
以中國國家航天局（CNSA）的名義組織協調政府和國際組織間航天活動方面的交流與合作。
根據主要職能，國防科技工業局內設17個職能機構（司、局）：
（一）辦公廳
組織協調機關的政務工作；負責國防科技工業局新聞宣傳、出版工作的行政管理；組織起草重要綜合性檔案。
（二）政策法規司
研究擬定國防科技工業發展和軍轉民的方針、政策；制定行政規章；指導軍工行業的法制建設。
（三）體制改革司
組織研究和實施國防科技工業體制改革；組織國防科技工業的結構、布局、能力調整工作。
（四）綜合計畫司
組織編制行業發展規劃和計畫；安排相關投資項目。
（五）經濟協調司（民口配套辦公室）
組織科研生產資格審查和許可；指導軍轉民科技開發和技術改造工作。
（六）財務司
編制各項費用的年度預算、決算；負責國有資產管理、財務監督。
（七）科技與質量司
組織科研成果、專利的保護和推廣；制定質量、計量標準和安全、技術規範並監督檢查；組織質量保證體系認證。
（八）系統工程一司（國家航天局）
組織實施航天工業軍轉民發展規劃和重大民品項目；指導軍工電子的行業管理。
（九）系統工程二司（國家原子能機構、國家核事故應急辦公室、核電辦公室）
組織核電建設；組織實施核、兵器工業軍轉民發展規劃和重大民品項目；承辦國家核事故應急協調委員會的日常工作。
（十）系統工程三司（船舶行業管理辦公室）
組織實施航空、船舶工業軍轉民發展規劃和重大民品項目。
（十一）安全生產監督管理局（民爆器材監督管理局）
承擔重點企事業單位安全生產的監督管理；負責民用爆破器材生產、流通的行業管理；負責民用爆破器材生產、經銷的安全生產監督管理和產品質量的監督管理；負責民爆器材行政許可項目的審批。
（十二）安全保密局
組織管理國防科技工業保密工作，指導協調國防科技工業的國家安全、保衛工作。
（十三）國際合作司
組織管理對外交流與國際合作。
（十四）人事教育司
組織人才教育、培訓和交流；歸口管理社會團體。
（十五）機關黨委
負責機關和在京直屬單位的黨群工作。
（十六）離退休幹部局
負責機關離退休幹部的管理工作；對直屬單位和軍工集團公司離退休幹部工作進行指導。
（十七）機關服務中心(機關服務局)
負責國防科技工業局相關辦公條件保障和後勤服務工作。
主要領導
黨組書記、局長：陳求發
黨組成員、副局長：
孫來燕（兼任國家航天局局長）、虞列貴
黃 強 、王毅韌
黨組成員：胡亞楓
