學校歷史
受洋務運動興辦新學潮流的影響，19世紀末（大約是1896年）鳳崗書院更名為鳳崗國小，辛亥革命勝利，南頭城光復。1914年新安縣復名為寶安縣。學校採用了新的教學體制，設立新的課程，採取新的教材和教法，鳳崗國小也更名為寶安縣立第一高等國小。1926年，學校擴大建制分立中學部，中學部設址於南頭古城東門外義學街的一間孔廟內，是年獨立，起名為寶安縣立第一初級中學（現南頭中學）。
抗日戰爭初期，日本侵略者推行愚民政策，拆毀了學校，將建房木料全數運往西麗（沙河）修建沙河橋，學校被迫搬遷，遷至南頭古城南門內西側文崗書院舊址（南頭中學現址），將空地上僅存的兩間水泥結構的房子經過修繕做為教室，因新校位於南頭城內九條主要街道之一的梧桐街，南頭古城又稱蓮城，學校更名為“蓮城國小”。
抗日戰爭期間，寶安縣立第一初級中學在日寇飛機狂轟爛炸下被徹底毀壞夷為平地，寶安縣立第一初級中學停辦。抗日戰爭勝利後，為恢復辦學，在鄉紳街坊的支持下，蓮城國小主動讓出校舍給寶安縣立第一初級中學，並協助寶安縣立第一初級中學恢復招生辦學，蓮城國小遷至南頭古城內的“文家祠”繼續辦學，辦學規模為一至六年級共六個教學班。
1949年學校更名為“九街國小”。
1958年至1962年，由於生源減少，學校減小辦學規模只辦初小，即一到四年級四個教學班，五、六年級轉入“十約國小”（南山實驗學校前身）就讀。
1963年寶安縣政府自南頭古城“育嬰堂”原址遷至西鄉，經寶安縣政府批准，九街國小自“文家祠”遷入原縣政府舊址南頭古城“育嬰堂”，學校辦學規模恢復為一至六年級六個教學班。
隨著辦學規模的進一步擴大，學校在育嬰堂周邊進行了擴建，新建了教學樓、綜合實驗大樓和幼稚園，教學規模也由原來的六個教學班擴大到今天的二十五個教學班。
1985年，為落實黨的宗教政策，學校搬出育嬰堂，將育嬰堂歸還給深圳市基督教會，並一直在現校址繼續辦學至今。
學校歷史變遷年表：
1806年——1886年 新安縣鳳崗書院、1896年——1914年 新安縣鳳崗國小堂、 1914年——1939年 寶安縣立第一高等國小、1939年——1949年 寶安縣蓮城國小、1949年——1984年 寶安縣九街國小
1984年——現在 深圳市南山區南頭城國小
歷任校長
解放前後學校歷任校長姓名順序表：
梁維甲、鄭福新、王佩芳、劉英泉、黃玉球、江德良、莫秀任、葉順英、劉寶榮、林樹生、羅冠雲、許啟泰、劉寶榮、葉小勇、紀鳳媛、趙春生（以上排列為按任職時間順序排列）
學校地址
廣東省深圳市南山區中山園路45號（郵編：518052）
