科學研究
蔬菜花卉研究所下設8個研究室，
種質資源室：基因庫的管理與維護，國內外種質資源的收集與保存，國內外種質資源的評價、創新與利用，國內外特菜的引進與利用。
生物技術室：蔬菜花卉細胞與基因工程、分子標記技術及套用研究。
十字花科育種室：甘藍類、白菜類等蔬菜新品種的選育與示範，雄性不育的研究與利用，小孢子培養技術研究與套用。
茄科育種室：鮮食番茄、加工番茄、辣椒、茄子、馬鈴薯等茄科蔬菜專用新品種的選育與示範，茄科作物基因重組與遺傳操作，抗逆生理與遺傳。
葫蘆科育種室：黃瓜、西瓜、南瓜、甜瓜等瓜類蔬菜專用新品種的選育與示範，加工及功能食品原料品種的選育，抗逆遺傳材料的創新。
栽培與采後技術室：栽培設施的設計與園區規劃，設施栽培、無公害化生產技術的研究與開發，采後處理與加工技術的研究與開發。
植物保護室：主要病蟲害的發生規律研究，綜合防治技術及其套用基礎研究與開發，育種材料的抗性鑑定技術研究與套用。
花卉室：國內外花卉資源的收集、評價與利用，花卉育種與生產技術的研究與開發，優質花卉種苗快繁技術的研究與開發。
科技成果
截止到2011年，研究所主持和參加了一大批國家級重大科研項目和省部級、北京市科研項目，包括國家攻關、“863”高科技計畫、“973”基礎研究項目、“948”引進項目，以及國家自然科學基金項目、國際合作項目等，在蔬菜花卉種質資源和遺傳育種研究、蔬菜栽培及病蟲害綜合防治研究、蔬菜生物技術育種研究等方面取得了一系列重要進展和成果。特別是研究所組織引進、研究的塑膠地膜覆蓋栽培技術使我國蔬菜及農作物栽培方式發生重要變革，產生了巨大的社會經濟效益；“中甘”甘藍、“中蔬”番茄、“中椒”甜椒、“中農”黃瓜等蔬菜系列新品種的育成，推動了中國蔬菜遺傳育種研究的發展。
截止到2007年，研究所共獲得科技成果獎勵165項，其中主持完成的國家級獎勵15項，參加完成的國家級獎勵6項，省部級成果獎43項。先後培育出180多個優質、豐產、抗病的蔬菜新品種。這些成果的推廣套用，極大地促進了中國蔬菜花卉科技和產業的發展，為農民增收、農村經濟發展和社會主義新農村建設做出了突出貢獻。
合作交流
研究所先後與美國、荷蘭、日本、法國等20餘個國家的農業科研單位、大學以及聯合國開發計畫署（UNDP）、國際馬鈴薯中心（CIP）、國際生物多樣性中心等國際機構建立了廣泛的科技合作與交流關係。主持了聯合國開發計畫署援助的“蔬菜無土栽培”、“提高馬鈴薯育種和繁種能力”項目，參加了歐盟“生物技術在油菜遺傳改良上的套用”、“用原生質體培養技術培育抗真菌、細菌病害茄子育種材料”，主持中荷戰略科學聯盟計畫中的“白菜類作物和馬鈴薯有益人體健康的微量營養品質性狀的基因組學研究”、“馬鈴薯基因組測序”項目等60多個項目。組建了“中荷園藝作物基因組分析實驗室”。與美國聖尼斯、日本龍井等蔬菜種子公司開展了甘藍、番茄、黃瓜合作育種研究。
截止2007年，該所選派出國學習和短期訪問人員近600人次，邀請來自美國、荷蘭等39個國家和地區的專家、學者來該所訪問和講學超過500名；先後舉辦了多期面向開發中國家的蔬菜、花卉國際培訓班。與中國園藝學會聯合召開了“園藝作物遺傳資源”、“園藝作物品種改良”、“生物技術在園藝作物上的套用”等國際學術會議。
發展歷程
一、1958年建所中國農業科學院蔬菜研究所，由中國農業科學院建議，經國務院規劃委員會批覆（科字第278號文），中央農業部黨組和北京市人民政府批准，於1958年9月22日成立。其前身是華北農業科學研究所園藝系蔬菜研究室。成立時的蔬菜所，以蔬菜研究室和北京市農林局國營彰化農場為基礎，受中國農業科學院和北京市農業科學院雙重領導，但以北京市農業科學院為主，對外掛二塊牌子，即中國農業科學院蔬菜研究所和北京市農業科學院蔬菜研究所。所址在北京市海淀區彰化村。當時未任命所長。朱明凱任副所長，主管全面工作，王泉山任第二副所長。建所初期在機構設定上，設有行政辦公室、技術辦公室和試驗農場。1959年全所職工195人，其中科技人員25人，行政人員8人，工人162人。來自原華北所人員19人，其中科技人員13人。行政管理人員1人，工人5人。
二、1960年由於1960年底國家面臨經濟困難時期，根據中央精簡機構的指示，農業部決定將原屬中國農業科學院建制的部分研究所下放歸所在省、市、自治區直接領導。當時根據1960年12月發出的（60）黨發第210號文"關於下放大豆等十一個所在省建制和直接領導的決定"的精神，蔬菜所以整建制完全下放到北京市由北京市農業科學院領導。
1960年後，所內結構設定有行政辦公室、技術辦公室、品種研究室、栽培研究室、植保研究室、生理研究室和試驗農場。朱明凱任副所長。
1962年黨中央、國務院根據國家科委農業組擴大會議呈報的《關於大力加強農業科技工作促進生產的若干緊急建議》，發出了[62]519號文《關於充實和調整農業科學研究機構的通知》，根據形勢發展需要，1962年8月本所下放到北京市的原華北所12名科技人員從北京市彰化村遷回中國農業科學院，並於1962年12月經農業部（62）農原震字第41號文批准蔬菜所正式歸回中國農業科學院建制，重新成為中國農業科學院的一個直屬研究所。所址設在中國農業科學院內前植物檢疫室舊址。1962年至1965年，研究所有很大發展，職工隊伍人數逐年增長，尤以1963年增長最多。1962年底，全所職工僅28人，1963年增加45人，1964年增加21人，1965年增加11人，截至1965年統計，全所職工已達到105人。
未任命所長，由朱明凱和張繼增任副所長，朱明凱主持工作，1966年5月又任命陳靜夫為副所長。該所機構設4室1組。由行政辦公室總管全所人事、黨務、文書、基建和總務以及科研業務；由育種研究室、栽培貯藏研究室、植保研究室和生理生化研究組開展有關科學研究。
1966年5月"文化大革命"開始，1967年1月後，所領導機構被民眾組織代替。
1970年8月中國農業科學院進行體制改革，並精簡機構。同年11月執行農林部（據農業部檔案1970～1970.7至1979.1中央農業部撤銷，成立農林部"下同）（70）農林辦字第11號文，蔬菜所再次以整制下放北京市，並經北京市革委會研究決定與北京市農業科學研究所蔬菜研究室合併（註：1962年7月北京市農業科學院建制撤銷，成立北京市農科所）。當時中國農業科學院蔬菜所下放人員共80人。下放前期仍維持蔬菜研究室的建制，隸屬北京市農科所領導，並開始恢復科研工作。研究室臨時負責人為李樹德（主管業務）和王勇、張立志、徐玲珍（主管政工）。1973年成立室領導小組，成員有馬熙彩、張光榮、李樹德、陳杭和陳淑英。1975年3月北京市革委會批准恢復北京市農林科學院建制，同時也恢復了蔬菜研究所的建制。所址位於雙清路原北京林學院內森工樓。所領導成員有賈俊林、朱明凱、李樹德、陳杭。
機構設定：辦公室、政工組、科研生產組、資料組以及引種及品種資源室、育種及良種繁育室、栽培室及農村基點組和實驗室。
1976年10月黨中央一舉粉碎了"四人幫"，長達10年之久的"文化大革命"即告結束，蔬菜所也在整頓、調整中逐步恢復業務工作。
1978年2月農林部、國家物資總局、財政部聯合發出（78）農林（科）字第15號、（78）物計字第47號、（78）財農字第9號文"關於加強農林科教工作和調整農林科教體制的函"，決定將原下放北京市的中國農業科學院蔬菜所歸回中國農業科學院（註：1970年8月～1978年2月中國農業科學院建制撤銷，成立中國農林科學院）。由此，蔬菜所恢復原建制，成為中國農業科學院的一個直屬研究所。所址開始仍在林學院，1980年遷至中國農業科學院東門外。
1978年12月黨的十一屆三中全會勝利召開，開始了撥亂反正的進程，決定將工作的重點轉移到社會主義經濟建設上來。隨著黨和國家對科學事業的重視和關懷，對知識分子政策的落實，蔬菜所的科技隊伍不斷壯大。1978年從北京市回中國農業科學院時該所共有職工73人，1981年6月發展至182人，1987年12月增加達240人。
1979年4月任命朱明凱為所長，曹維政、李樹德、張紀增、劉紅、朱德蔚為副所長。1979年8月任命宋法明為副所長。1983年2月任命李樹德為所長。1984年12月任命王德檳為副所長。1985年3月任命趙清源為副所長。
機構設定：領導機構設黨委會、所務會；管理機構設黨委辦公室、人事處、科研處、行政處辦公室；研究室設品種資源研究室、育種研究室、栽培研究室、植物保護研究室、中心實驗室和情報資料室；學術評議和科研工作決策、諮詢機構是學術委員會。
1987年12月3日，根據國家科委（87）國科發綜字0806號，農牧漁業部（1987）農（人）農函字第17號批文"關於同意中國農業科學院蔬菜所更名的復函"，中國農業科學院蔬菜研究所更名為中國農業科學院蔬菜花卉研究所，原隸屬關係不變，除承擔原有蔬菜研究任務外，還承擔花卉研究工作。
蔬菜所自更名為蔬菜花卉所以來，科研、開發、精神文明建設逐年穩步發展。1997年12月，全所職工為223人。
1987年李樹德仍為所長。1988年5月任命朱德蔚為所長，趙清源、方智遠為副所長。1991年1月任命張松林為副所長。1995年2月任命方智遠為所長，張松林、蔣淑芝為副所長。1997年3月任命屈冬玉為副所長。
機構設定：領導機構設黨委會、所務會；管理機構設黨辦和人事處、科研處、行政處、科技開發諮詢服務部（1996年後改為科技成果開發處）、溫室農場管理處；研究室設蔬菜遺傳資源研究室、蔬菜遺傳育種室、蔬菜栽培和儲藏加工研究室（1996年後稱蔬菜栽培及采後技術研究室）、植物保護研究室、花卉研究室、生理生化實驗室和文獻信息編輯室；學術評議和科研工作決策、諮詢機構是學術委員會。
2000年11月任命屈冬玉為蔬菜花卉所所長，蔣淑芝為所黨委書記兼副所長，杜永臣、孫日飛為副所長。
2001年為適應農業科技發展的需要，對該所研究室的設定進行了調整，按學科分為：生物技術研究室、種質資源研究室、十字花科育種研究室、茄科育種研究室、葫蘆科育種研究室、栽培與采後技術研究室、植物保護研究室、花卉研究室。
2002年12月任命杜永臣為所長兼黨委副書記。
2003年10月，對該所的管理及服務機構進行了整合，調整後的機構設定為：科研處、綜合處、財務處和服務中心。
歷屆領導
朱明凱(1979.4-1983.1任中國農業科學院蔬菜所所長)
1911年2月生，廣東省台山縣人。中國共產黨黨員。1956－1983年任北京市農科院蔬菜所所長，中國農科院蔬菜花卉所副所長、所長，曾任中國園藝學會、北京市蔬菜學會副理事長，《園藝學報》副主編，中國農科院顧問，第二屆農業部科學技術委員會委員；1964－1969年全國第三屆人大代表，1978－1983年北京市第五屆政協委員等。
延安時期，積極從事以品種引種為重點的園藝和經濟作物的農業科研工作，選育出優良蔬菜、水果、經濟作物等70多個新品種進行推廣。推廣的"甘露西瓜"由於質量好，周恩來總理將該瓜空運到重慶招待客人。1939和1940年連續兩年獲陝甘寧邊區模範婦女的榮譽稱號。1943年在陝甘寧邊區《解放日報》發表了"種菜法"、"番茄王"等文章。
1958年參與籌建中國農科院蔬菜研究所。蔬菜所成立後，任副所長主持全面工作(無正所長)，在研究條件十分簡陋的情況下，帶領科技人員進行蔬菜品種資源蒐集、育種、選種、防治病蟲害和豐產栽培技術研究。此後，在研究所兩次下放北京市，兩次回中國農科院的機構變動過程中，逐步建立和發展研究室，配齊相關專業和人才。
1962年，組織專家研究編制了1963－1972年我國蔬菜科技發展規劃，提出了在以後十年中蔬菜科技工作的重點研究課題和目標。1962－1963年組織召開了全國性的"蔬菜育種研究座談會"和"蔬菜品種資源研究座談會"。
1965年選育出質量好、商品率高的洋蔥品種540號、601號。1978年主持了馬鈴薯研究組工作。1983年，主持"六五"國家重點科技攻關"馬鈴薯新品種選育"研究課題，選育出早熟抗病的馬鈴薯新品種"京豐1號"。培養碩士研究生4名。
參加編寫了《中國蔬菜栽培學》、《中國農業百科全書蔬菜卷》等著作。《中國蔬菜栽培學》獲1990年"第五屆全國優秀科技圖書"一等獎。
（1983.2-1988.4任中國農業科學院蔬菜花卉所所長）
1929年7月生，北京市人，中國共產黨黨員。1953年畢業於北京農業大學園藝系，1956年-1960年在莫斯科季米里亞捷夫農學院園藝系果蔬育種教研室讀研究生，獲蘇聯生物學副博士學位。1953年-1955年在華北農業科學院研究所園藝系蔬菜研究室工作。1962年-1970年和1978年後在中國農業科學院蔬菜所工作；1960年-1962年和1970年-1978年下放在北京市農科院蔬菜研究所工作。60年代以後先後任番茄品種選育項目主持人、研究室副主任、副所長、所長、所學術委員會主任等職。還兼任中國園藝學會常務理事、副理事長，農業部科學技術委員會委員，中國農科院學術委員會常務委員，全國農作物品種審定委員會委員、顧問，中國地膜研究會常務理事，中國花卉協會常務理事，中國食品協會常務理事，中國發明協會發明展覽評審，國家自然科學基金學科評審組成員，國家發明獎評審會特邀審查員，《園藝學報》主編，《中國蔬菜》主編，日本國科學基金會國際獎國外推薦人，農業部蔬菜專家顧問組組長，
農業部、輕工業部罐藏番茄加工適應性研究協作組主持人。任"六五"、"七五"國家科技攻關"蔬菜新品種選育技術"課題第一主持人，"八五"第二主持人，農業部重點課題"蔬菜花卉新品種選育及配套栽培技術研究"主持人。
截止到1999年，主持、參加番茄育種研究工作，先後育成"北京10號"、"早粉2號"、"大粉1號"、"大粉2號"、"大黃1號"、"蔬研11號"、"中蔬4號"、"中蔬5號"、"中蔬6號"、"中雜4號"等10餘個番茄新品種。其中早粉2號是我國最早育成、推廣面積最大的早熟粉果品種。代替了國外引入的早熟品種，並成為早熟番茄育種的優良親本，1989年獲國家科技進步三等獎。1993年獲國家發明二等獎一項。參與對全國番茄病毒病毒源鑑定及株系分化研究。1997年該項成果獲國家科技進步二等獎，在任所領導期間，在中國農科院率先開展科技體制改革，為本所的鞏固和發展做出了重要貢獻。1974年以來倡導並與其領導一起組織了全國蔬菜科研協作攻關，全國蔬菜雜種利用科研協作，對推動這些方面的研究和推廣發揮了極其重要的作用。“六五"、"七五"國家重點科技攻關"蔬菜新品種選育技術"課題，對改善我國蔬菜生產和供應，減少農藥污染有重要意義，大大提高了我國蔬菜抗病育種工作水平。
1997年，中華農業科教基金會授予他"中華農業科教獎、農業科研獎"。主持或參加撰寫的專著10部，發表論文50餘篇，主要有：《中國蔬菜栽培學》、《中國農業百科全書蔬菜卷》、《中國主要蔬菜抗病育種進展》、《中國農業科技四十年》以及《中國蔬菜科學技術發展戰略構想》、《蔬菜科技和生產現狀及其建議》等，其中《中國蔬菜栽培學》一書1990年獲第五屆全國優秀科技圖書一等獎。
（1988.4-1995.1任中國農業科學院蔬菜花卉所所長）
1938年11月出生，江蘇省啟東縣人。中國共產黨黨員。1962年7月畢業於北京農業大學園藝系蔬菜專業，之後分配到中國農業科學院蔬菜研究所工作，1979年任該所副所長，1980年任所黨委副書記，1986年任所黨委書記，1988年任所長兼所黨委書記，1994年11月任中國農業科學院副院長。1997年擔任農業部第五屆科學技術委員會委員。兼任中國園藝學會秘書長、常務理事、理事長，農業科技管理研究會理事、副理事長，中國農業技術推廣學會副理事長。1995年至2001年期間任中國農業科學院學術委員會副主任。
60年代中至1978年主要在四川渡口基點工作，任基點組長，推廣蔬菜科研成果，主持番茄等蔬菜作物育種，為當地工礦區蔬菜生產的發展做出了重要貢獻。1978年回院後，繼續從事番茄雜交育種研究。配置出－批優良雜交組合。
截止到1994年，"六五"、"七五"、"八五"、"九五"期間主要從事國家科技攻關項目"番茄新品種選育及育種技術研究"，與課題組的同志一起先後育成多個番茄優良品種，其中"中蔬4號"、"中蔬5號"和"中蔬6號"番茄新品種先後成為華北地區中熟番茄品種中面積最大的主栽品種，產生了顯著的社會效益和經濟效益；在抗病育種研究中參與了為害番茄的病毒種群及其株系分化研究；明確了番茄TMV抗性為顯性基因遺傳，CMV受多基因控制。先後獲國家發明二等獎(第三完成人)及國家科技進步二等獎、國家科技進步三等獎(第四完成人)各l項。"八五"期間還主持並完成聯合國開發計畫署(UNDP)援助項目(獲資助65萬美元)"蔬菜無土栽培技術研究"。 近幾年來還主持國際遺傳資源研究所資助項目"不同類型芋頭種類資源的RAPD和酶譜分析"，承擔國家自然科學基金項目"白菜分子連鎖圖譜的構建和親緣關係的RAPD分析"，均取得重要進展。培養碩士、博士生多名，發表論文30餘篇，任主編出版著作3部。1979年－1994年，先後擔任研究所副所長、所長、黨委書記期間，在中國農業科學院率先開展科技體制改革，為蔬菜花卉所的發展做出了重要貢獻。
（1995.2-2000.11任中國農業科學院蔬菜花卉所所長）
蔬菜遺傳育種專家。1939年9月3日生於湖南衡陽，中國共產黨黨員。1964年7月畢業於武漢大學，同年8月份配到中國農業科學院工作，1988.5～2000.11先後任蔬菜花卉研究所副所長、所長兼所黨委書記。
蔬菜花卉研究所研究員、所學術委員會主任、博士生導師。中國工程院院士，農業輕紡環境學部副主任。中國農業科學院學術委員會副主任。全國第九屆、第十屆政協委員，全國政協提案委員會委員，國務院學位委員會學科評議組召集人，國家農業轉基因安全委員會委員，科技部"十五""863"計畫"生物技術與現代農業"領域專家委員會委員，中國農學會副會長，中國園藝學會副理事長，園藝學報主編，北京市科協副主席，北京市學位委員會副主任，農業部科學技術委員會委員等。武漢大學、中國農業大學、西南農業大學、華中農業大學、湖南農業大學、東北林業大學、北京農學院等學校的兼職教授。
1970年開始從事甘藍遺傳育種研究，1970－1971、1978年至今任甘藍育種課題組組長，與課題組同志一起，70年代初在國內首先突破甘藍自交不親和系。1973年育成我國第一個甘藍雜交種"京豐一號"。後又相繼育成不同類型的甘藍新品種20餘個，並在全國30餘個省（市、區）廣泛推廣，種植面積占全國甘藍總栽培面積的60～70%。1979年在國內外首次發現甘藍顯性雄性不育材料， 90年代突破甘藍雄性不育系選育與利用技術，選育出一批不育株率及不育度達到100%、經濟性狀及配合力優良的甘藍顯性核基因雄性不育系和孢子雄性不育系。並利用雄性不育系配製出5個通過國家審定的甘藍新品種，並開始大規模進行制種利用。
80年代以來，先後主持或參加科技部、農業部、北京市科委、國家自然科學基金委多項科研課題。包括國家科技攻關專題、課題，"863"計畫子課題，農業部科技重點項目、"948"項目，北京市科技重點項目等。參與多項國家重點科研項目立項、諮詢、評估。
截止到2004年，主編或參編科技著作10餘部，主要有《甘藍栽培技術》（1991年）第一作者；《中國蔬菜抗病育種進展》（1996年）副主編；《蔬菜優質高產栽培的理論基礎》（1999年） 副主編；《蔬菜學》（2004年）主編。先後在《Euphytica》、《中國農業科學》、《園藝學報》、《中國蔬菜》等刊物上發表論文60餘篇。培養碩士、博士生10餘人。
獲國家級及省部級科技獎勵11次。其中1985年獲國家發明一等獎1項（第二名）， 1991及1998年兩次獲國家科技進步二等獎各1項(第一名)，獲發明專利2項(第一發明人)。1986年獲人事部授予的國家級有突出貢獻中青年專家稱號、1988年獲首都勞動獎章、1988年和2001年兩次獲全國五一勞動獎章、1995年10月獲何梁何利科學與技術進步獎、1999年獲人事部傑出人才一等功獎勵、2000年獲全國先進工作者稱號。
（2000.11-2002.12任中國農業科學院蔬菜花卉所所長）
博士，研究員，中國共產黨黨員。1979年9月入湖南農業大學園藝系讀書，1983年7月畢業獲學士學位，1983年8月入中國農科院研究生院學習遺傳育種，1986年7月畢業獲碩士學位，1986年7月至今在中國農科院蔬菜花卉所工作， 1988年8月－1993年10月任助理研究員，1993年11月－1999年2月任副研究員，1999年3月至今任研究員，1996年2月獲荷蘭瓦赫寧根大學博士，1997年3月－2000年11月任副所長，2000年11月任所長，2001年12月31日至今任中國農科院副院長。
主要從事馬鈴薯育種研究，先後承擔國家科技攻關項目、國際合作項目等16項，已主持篩選出10餘份炸片炸條品質優良新品系，參加或主持育成並推廣了"中薯1號"、"中薯2號"、"中薯3號"、"中薯4號"4個馬鈴薯新品種，為發展二季作和冬作農業提供了技術基礎；在2n配子遺傳與育種技術研究方面取得重要進展，提出了控制花粉形成的有效基因為2－4個的新觀點，此結果已在國際權威刊物發表，達到國際同類先進水平，並獲1998年農業部科技進步二等獎（第一主持人）。作為主要執行人之一承擔的聯合國開發計畫署（UNDP）項目，被UNDP、經貿部、農業部評為完成得最好的單位之一；1998年參與籌建美國百事集團－中國農科院農業發展中心並開展合作，結合專業特點積極開展科技扶貧，在深入貴州貧困縣多次調查的基礎上，開展"貴州省推廣脫毒馬鈴薯溫飽工程"國務院貴州扶貧項目，該項目的順利實施推動了科技扶貧工作，受到中央領導、省領導和有關部門的重視和肯定，2000年獲中國農科院科技進步二等獎。多次參與國際組織的項目評估和專家顧問活動。1997年同團中央青農部、中青農村發展中心一道發起了"建設農業高新技術示範園"活動，社會影響較大。任副所長期間，分管科研、科技成果開發、國際合作等方面均取得較好成績，本所國際合作項目總金額達100多萬美元，為提高該所的經濟實力和國際知名度作出了較大的貢獻。截止到2004年，在國內外學術刊物上發表論文44篇，其中獲獎論文3篇、39篇為第一作者，參加編寫著作11本，約100萬字。
在任領導
所長杜永臣杜永臣 博士，研究員，蔬菜花卉所所長，番茄育種課題組組長，博士生導師，中國農業科學院二級崗位傑出人才，農業部有突出貢獻中青年專家，享受政府特殊津貼。兼任國家自然科學基金、北京市自然科學基金和河北省自然科學基金的評審專家，中國園藝學會副秘書長，中國農業科學院學術委員會委員，天津市農業生物技術中心學術委員，農業部全國番茄區域試驗負責人。
主要從事番茄遺傳育種和抗逆形成的生理、生化機制和抗逆材料的鑑定、篩選技術；利用分子標記、基因工程等生物技術、現代育種技術篩選和創造抗逆、抗病、優質育種材料；選育保護地和露地番茄優良新品種；研製國家番茄新品種DUS測試指南及番茄產品質量標準等。截止到2011年，“九五”主持和參加國家重點科技攻關項目番茄育種專題的“番茄耐低溫材料選育研究”、“番茄抗病材料選育研究”、“番茄育種技術研究”、農業部“948”項目、教育部、人事部回國留學人員資助項目、國際合作項目等各類項目11項。
育成的“保護地番茄優良品種中雜9號和中雜8號”2000年獲國家科技進步二等獎，本人第3名，兩品種已累計推廣250多萬畝，創經濟效益7.5億多元。特別是中雜9號成為了北方廣大粉果番茄種植地區保護地生產的主栽品種。主持選育出的“中雜12”保護地番茄新品種2000年通過河北省和北京市品種審定。最新成的“中雜11”番茄獲國家攻關後補助二等獎，並在2001年通過全國品種審定；截止到2011年，共發表論文30多篇。
孫日飛 博士，研究員，蔬菜花卉所副所長，白菜育種課題組負責人，博士生導師，中國農業科學院三級崗位傑出人才，學科帶頭人。兼任北京蔬菜學會副秘書長，《園藝學報》編委，《中國蔬菜》編委，第三屆全國農作物品種審定專家，第五屆北京市農作物品種審定委員，國家推廣計畫專家。
主要從事大白菜遺傳育種研究。截止到2011年，主持“八五”、“九五”國家攻關課題和農業部重點高新技術與基礎研究及重點開放實驗室項目、國際合作歐盟項目10餘項。十五期間，國家863計畫“蔬菜高效育種技術及優質、高產、多抗、專用新品種選育2001AA241121” 課題首席科學家。主持十五攻關重大專項“中南地區無公害蔬菜生產關鍵技術集成與產業化示範”；主持十五攻關“大白菜種質資源創新與利用研究”；主持北京市自然科學基金“大白菜自交不親和基因的分子鑑別”研究。
首次在國內育成了無苗期黃化，有蜜腺，生長和結籽正常，轉育容易，育性穩定的新型大白菜細胞質雄性不育系。研究了培養基成分、培養條件對大白菜游離小孢子培養的影響，建立了理想的培養體系，獲得大量小孢子再生植株，這些DH單株正用於新品種培育和分子遺傳學研究。首次發現了兩個與抗TuMV-C4基因連鎖的標記和5個與抗TuMV-C1緊密連鎖的AFLP標記。
1992年“國家農作物種質資源資料庫系統”獲國家科技進步三等獎，第八名；1995年“用組培獲得100%不育群體的白菜制種技術”獲國家發明專利，第四發明人；1996年“組培繁育大白菜親本制種技術”獲北京市科技進步一等獎，排名第4位。1999年“大白菜2n配子發生的細胞學機制及套用研究”獲農業部科技進步三等獎，排名第5位。
張寶璽 碩士，研究員，蔬菜花卉所副所長，茄科育種室主任，辣椒育種課題組組長，碩士生導師。中國農業科學院三級崗位傑出人才，中國農科院首批跨世紀科技開發與推廣帶頭人，中國農學會第三屆全國優秀農業科技工作者，享受政府特殊津貼。中國園藝學會辣椒分會副會長，全國蔬菜品種鑑定委員會委員，北京政協海淀區政協委員。
主要從事辣椒遺傳育種研究工作。對辣椒的主要植物學性狀、抗病性、抗逆性、細胞生物學、分子輔助選育技術等進行了較系統的研究。創新和選育了大批優異育種材料和新品種，育成甜辣椒新品種14個，甜椒的選育在國內處領先水平。'中椒'系列品種在全國的推廣產生了巨大的社會經濟效益。
截止到2011年，參加和主持了國家、部級科技攻關項目、國家基金項目、"863"項目等。獲多項國家、省部級科技成果。西藏作物品種資源考察獲國家科技進步二等獎（集體獎） ；早熟豐產抗病毒病甜椒中椒2號的選育獲農業部科技進步三等獎（第四名）；優質抗病豐產甜椒新品種中椒4、5號的育成，獲國家科技進步二等獎、國家'八五'科技攻關重大科技成果（第三名）；甜辣椒中椒6號和中椒7號的育成，獲中國農科院科學技術一等獎、北京市科技進步二等獎（第一名）。發表論文30餘篇。
胡鴻，碩士，研究員，蔬菜花卉所副所長。碩士生導師。中國園藝學會副秘書長，北京市蔬菜學會副秘書長。
主要從事蔬菜貯藏保鮮與采後處理技術研究以及科研管理工作。截止到2011年，主持或參加國家科技支撐、“863”、北京市有關蔬菜貯藏研究方面的項目30餘項。在主要蔬菜采後生理、采後商品化處理技術和貯藏保鮮技術的研究以及科研計畫管理等方面取得一定成績。“蔬菜流通體系綜合保鮮技術的研究與實施”1992年獲國內貿易部和北京市科技進步二等獎。“蔬菜采後處理工藝設計與實施”2001年獲北京市科技進步三等獎。結合試驗研究的進展，共發表論文40餘篇。
科技成果
截止到2007年，研究所主持和參加了一大批國家級重大科研項目和省部級、北京市科研項目，包括國家攻關、“863”高科技計畫、“973”基礎研究項目、“948”引進項目，以及國家自然科學基金項目、國際合作項目等，在蔬菜花卉種質資源和遺傳育種研究、蔬菜栽培及病蟲害綜合防治研究、蔬菜生物技術育種研究等方面取得了一系列重要進展和成果。特別是我所組織引進、研究的塑膠地膜覆蓋栽培技術使我國蔬菜及農作物栽培方式發生重要變革，產生了巨大的社會經濟效益；“中甘”甘藍、“中蔬”番茄、“中椒”甜椒、“中農”黃瓜等蔬菜系列新品種的育成，推動了中國蔬菜遺傳育種研究的發展。
截止到2007年，研究所共獲得科技成果獎勵165項，其中主持完成的國家級獎勵15項，參加完成的國家級獎勵6項，省部級成果獎43項。先後培育出180多個優質、豐產、抗病的蔬菜新品種。這些成果的推廣套用，極大地促進了中國蔬菜花卉科技和產業的發展，為農民增收、農村經濟發展和社會主義新農村建設做出了突出貢獻。
產業開發
北京中蔬園藝良種研究開發中心
中心依託中國農科院蔬菜花卉所的技術優勢、作為中國農科院蔬菜花卉所科技成果轉化視窗的高新技術科技型企業。通過特約繁殖、區域合作行銷和特約經銷等形式，在全國建立了20多個良繁基地、40多個區域推廣示範、行銷中心和特約經銷處，並培養了一支精幹的科技開發與行銷隊伍。在良種生產和經營上，憑藉技術依託單位的成果優勢，積極與國內外大型企業進行聯合，在一些主要蔬菜種子上初步實現了一定規模的產業化生產與經營；作為中國農業科學院蔬菜花卉研究所的成果轉化視窗，經營包括甘藍、青（辣）椒、番茄、黃瓜、大白菜、西瓜、馬鈴薯、南瓜、甜瓜、西葫蘆、茄子、苦瓜及各種特菜蔬菜新品種100多個，擁有成熟的蔬菜、花卉栽培等成果和技術多項。經銷的品種都經過嚴格的純度、芽率等各項指標的檢驗，符合或超過國家良種標準。設有市場行銷部、生產加工部和財務管理部。截止到2011年，職工51人，其中科技人員39人，工程院院士1人，博士生導師4人，博士8人，碩士16人。
中蔬卉園科技培訓中心（中蔬卉園賓館）
截止到2011年，中蔬卉園賓館擁有客房53間（標準間39間，3人間14間），共120個床位。客房內設有彩電、電話、浴室、噴淋及空調等現代化設施，大中小會議室為舉辦各種會議提供良好的場所；餐廳，代辦火車票、機票，汽車出租等業務為賓客提供一條龍服務；客房整潔舒適，餐廳佳肴風味獨特；服務溫馨熱情、周到有素，前廳寬敞明亮，為各地賓客下榻和召開各種會議提供一流服務。該中心位於海淀區皂君廟路5 號，地理位置優越、購物方便、交通便利。
北京蔬卉科技開發公司
集科研、生產和貿易為一體的綜合性現代園藝高科技股份制企業。主要從事新優花卉的引種、示範與推廣；生產優質鮮切花、盆花和草花的種苗、種球、種子；承攬園林綠化工程的設計與施工；經銷園藝生產配套產品；向賓館、飯店、超市、企事業單位提供新優特蔬菜、禮品盒菜的包裝配送；經銷鮮切花、花籃、花束；常年從事技術人員培訓及技術諮詢、技術轉讓業務。公司設有銷售部、生產部、後勤部和科研部。截止到2011年，高級、中級職稱及多年從事科研、生產與開發的技術骨幹20餘人；擁有500平方米花卉組織培養中心，10800平方米現代化實驗與優質種苗生產溫室，300畝花卉生產示範基地和優質草花制種基地。
人才隊伍
知名專家朱明凱：蔬菜遺傳育種專家，第三屆全國人民代表大會代表。
李樹德：蔬菜遺傳育種專家，中華農業科教獎農業科研獎獲得者
朱德蔚：蔬菜遺傳育種專家，俄羅斯農業科學院院士
方智遠：蔬菜遺傳育種專家，中國工程院院士，第十屆全國政協委員、國家級有突出貢獻中青年專家，全國“五一”勞動獎章、何梁何勵科學與技術進步獎獲得者
劉紅： 蔬菜遺傳資源專家，全國三八紅旗手
孫培田：蔬菜遺傳育種專家，國家級有突出貢獻中青年專家
蔣名川：蔬菜栽培專家
張紀增：蔬菜學家，首批進藏、援蒙蔬菜專家
程天慶：蔬菜育種專家，
陶辛秋：蔬菜栽培專家，
尹彥： 蔬菜育種專家，
鄭光華：蔬菜栽培專家，
王耀林：蔬菜栽培專家，全國農業勞模，農業部有突出貢獻中青年專家
高級職稱人員：
方智遠
杜永臣
張寶璽
張志斌
劉玉梅
孫日飛
謝丙炎
李錫香
連 勇
劉廣樹
顧興芳
李寶聚
胡 鴻
蔣衛傑
金黎平
張友軍
黃三文
蔣淑芝
王曉武
徐兆生
劉 肅
楊麗梅
尚慶茂
葛 紅
劉富中
謝開雲
明 軍
於賢昌
趙 華
韓 旭
龔一帆
副級職稱人員：
劉 佳
楊宇紅
高儉德
賀超興
陳 紅
李瑞雲
梁 勵
張學傑
高 苹
錢 洪
王先覺
張思遠
劉 春
李君明
王長林
卞春松
吳青君
沈 鏑
王孝宣
章時蕃
屠康明
張天明
莊 木
范翠蓉
余宏軍
劉 偉
張淑江
莊飛雲
張延國
高富欣
張秀新
王懷松
王少麗
閆書鵬
武 劍
朱路芳
莫 青
陳 潔
史艷華
王小琴
徐寶雲
龐萬福
研究生教育
研究所是中國最早開展蔬菜學科研究生培養的農業科研單位。1984年、1996年分別獲得碩士學位和博士學位授予權，2003年批准為園藝學博士後流動站。
截止到2007年，研究所有博士生導師13人，碩士生導師22人，共培養研究生132人，其中博士30餘人。
同時，與荷蘭瓦赫寧根大學合作培養了13名博士研究生。
每年有60餘名來自國內院、校的研究生在研究所進行合作研究。
