主席缺位時，由副主席依全黨代表大會通過順位代理，並於三個月內按規定選舉新主席，補足原任未滿任期。補選的新主席應提名副主席若干人，經中央常務委員會同意即可任命。主席缺位而所遺任期不足一年時，由副主席依全黨代表大會通過順位代理，至次任主席就職時終止。
全黨代表大會閉會期間，主席可以提名副主席，經中央常務委員會同意任命，並於全黨代表大會召開時，提請追認。
選舉資格
候選人資格須為國民黨黨員，曾任中央評議委員或中央委員，未曾受停止黨權一年以上、撤銷黨籍、開除黨籍或註銷黨籍的黨紀處分，經黨員百分之三以上聯署，可以申請登記為國民黨主席選舉候選人。
選舉程式
國民黨主席的選舉事務，一般由國民黨中央委員會組織發展委員會辦理，受選舉監察委員會的監督。國民黨主席由黨員以無記名單記投票法選舉。黨主席選舉於任滿當年全黨代表大會舉行的三個月前，與全黨代表大會代表的選舉同時辦理。
黨主席選舉設選舉監察委員會，其成員由中央委員會權責單位就中央評議委員、中央委員中推薦若干人，提請中央常務委員會通過後組成，並互推一人為召集人，掌理下列事項：
1，候選人資格審查工作。
2，投開票監察事項。
3，選舉風紀事項處理。
黨主席候選人領表、聯署及登記程式如下：
1，領表
2，聯署
3，登記
4，繳交作業費
5，領取黨員資料
審定的候選人名單，其號次由主席選舉監察委員會以抽籤決定。選舉監察委員會可以舉辦電視政見說明會，經候選人協商同意後，可以舉辦辯論會。
黨員參加聯署推薦及投票，以入黨滿四個月，具有黨權者為限，並應親自進行。同一選舉人以聯署一名被聯署人為限，同時為兩人以上聯署無效。選舉人名冊於選舉人所屬黨部公開閱覽，並接受更正。選舉人出席投票需持投票通知單及黨證或身份證。
主席選舉投票由中央委員會規劃於“直轄市”、縣（市）設投票區，每一投票區視實際需要，設若干投開票所。投開票所有主任管理員、主任監察員各一人，管理員、監察員若干人，辦理投開票工作。海外地區黨員的聯署及其投票方式由中央委員會另定。
投票完畢後，主任管理員會同主任監察員將投票匭密封，並將投票所改為開票所，進行開票工作。黨主席選舉候選人以得投票數過半的票數者當選。如無人得投票數過半時，就得票比較多的前兩名重新投票，以得票比較多者當選；票數相同時，再重新投票。
黨主席選舉結果由選舉監察委員會審定，並造具選舉結果清冊與當選人名單，陳報中央委員會公告。黨主席的當選證書由中央評議委員會主席團主席致送。
中國國民黨歷任領袖
孫中山
張靜江
胡漢民
蔣中正
蔣經國
李登輝
連戰
馬英九
