感染
厭氧菌厭氧菌產生感染的條件：厭氧菌大量存在正常人體各腔道內，特別是腸道、口腔和陰道，與需氧菌共同構成這些器官的正常菌群；厭氧菌少部分為單獨感染，大部分與需氧菌混合感染。多數女性生殖道感染致病厭氧菌，可致宮內或在分娩時直接污染新生兒。早產低體重、宮內窘迫或窒息、胎膜早破（24小時以上）、產傷、產婦敗血症或生殖道炎症均是產生感染的重要條件。
厭氧菌感染的發病機理：厭氧菌缺乏完整的呼吸酶系統，只能在無氧環境中發酵，利用氧以外的其他物質作為受氫體，當機體氧化還原電勢降低時，可使厭氧菌在組織中繁殖。血液供應不足、組織壞死、需氧菌在傷口內生長均可導致氧化還原電勢降低，因此血管疾患、注射腎上腺素、寒冷、休克、水腫、創傷、外科手術、異物、惡性腫瘤及需氧菌感染均可誘發厭氧菌感染。破傷風桿菌和肉毒桿菌分別由其外毒素造成機體的中毒反應，某些桿菌如產黑色素桿菌可產生大量氨，有的厭氧菌感染細胞的協同作用似乎是發病的重要的先決條件，也有些厭氧菌感染有引起血栓性靜脈炎與膿毒性肺栓塞的傾向。
外科感染和發病的因素取決於機體的防禦能力、細菌毒力及環境因素三者是否異常。然而，一般感染的發生可能與一或二或全部因素的異常有關，而厭氧菌感染最突出的條件是環境因素，如果沒有適合的環境，厭氧菌則不能生存，就談不上感染。當然如果細菌本身的毒力不強，缺乏一定的致病性，也不會引起各種病理損害。
特點
絕大多數屬內源性感染：當全身或局部情況改變時，厭氧菌會乘虛而入，如休克、全身性疾病，或盆腔、胃腸道手術後、肛周、會陰部膿腫，或塊狀組織壞死。
以混合感染為主：Anderson指出，厭氧菌培養陽性中僅15%為單一性，85%為多種菌混合感染；而新生兒外科只有11.76%為單一性，88.24%為多種菌混合感染。並存菌有非溶血性鏈球菌、大腸桿菌、表皮葡萄球菌和金黃色葡萄球菌，膽管感染為大腸桿菌和厭氧菌混合感染。大腸桿菌為厭氧菌（如脆弱類桿菌）提供生長所需的過氧化物酶，同時需氧菌的存在又降低了氧化還原電位，為厭氧菌繁殖創造了條件。
感染區組織腐敗及分泌物惡臭，有氣體形成：這些惡臭的分泌物或壞死組織中混有氣體，尤其脆弱類桿菌，常被誤認為氣性壞疽。
遲緩性感染：尤其是無芽胞厭氧菌感染，臨床上很少出現急性炎症，治療效果亦差。
全身表現與其他菌感染相似，如高熱、寒戰、飲食下降等，但發熱時間長（10天～3個月）或持續低熱，好發於夏、秋季，常規抗生素無效，病程遷延，厭氧菌培養陽性。
診斷依據
各種症狀容易產生厭氧菌感染的危險因素：結腸、直腸、會陰部及膽管手術後，惡性腫瘤、敗血症等患者；早產低體重、宮內窘迫或窒息、胎膜早破、產傷及產婦生殖道炎症，動物咬傷。
厭氧菌引起的感染性疾患有：結膜炎、中耳炎、肺炎、肛門膿腫、新生兒壞死性小腸結腸炎、腹腔炎等。
典型臨床表現：感染區有氣體形成或皮下氣體及無消化道穿孔的氣腹；分泌物惡臭，約半數以上為厭氧菌感染，分泌物暗紅或黑色，經紫外線照射呈紅色螢光，為硫磺顆粒；膿腫或分泌物塗片有細菌，而普通培養無菌生長，厭氧菌培養為陽性。
試用滅滴靈治療，臨床症狀顯著好轉。
防治
相關書籍根據發病原因提出以下預防措施：
（1）臨床醫生要牢固樹立整體觀念，了解微生物平衡對機體的保護意義和免疫機能低下對宿主的嚴重危害，應調動機體防禦能力控制消除感染。
（2）充分重視消毒隔離，有效地控制感染、切斷傳播途徑，特別是外科醫生要有最嚴格的無菌觀念，保護病人
（3）加強圍生期的護理，儘量避免早產、宮內窘迫或窒息、胎膜早破和產傷，如一旦出現以上情況，應早期診斷，及時正確管理。
（4）嚴格控制手術指征，加強圍生期手術管理，改善營養和全身情況，提高免疫功能。儘量減少手術創傷和出血，縮短手術及麻醉時間。
抗厭氧菌治療原則：
（1）防止厭氧密閉傷口的形成：應清除失活組織，切除腫瘤，充分引流膿液及氣體，舒通梗阻管道，改善局部組織血液供應，提高組織內的氧張力。
（2）中和毒素：用抗毒素血清中和相應外毒素的毒性。
（3）抗菌藥的套用：臨床厭氧菌種類繁多，不同種類的厭氧菌對各種抗生素敏感性不同。有報導應從以下幾方面考慮：抗菌譜要寬，對脆弱類桿菌作用要強；防止細菌耐藥性的產生，脆弱類桿菌產生β-內醯胺酶破壞β-內醯胺環，對青黴素和多種頭孢菌類藥物耐藥；藥物不良反應，青黴素可出現嚴重過敏反應，氯黴素致再生障礙性貧血，氯林可黴素可致假膜性腸炎的危險性；藥物動力學特點，尤其藥物在組織中的擴散能力，藥物成本。總之，絕大多數厭氧菌感染為混合感染，所以在抗生素的選擇上要做到需氧菌和厭氧菌的兩兩兼顧。
厭氧菌/微需氧菌鑑定
目前鑑定厭氧菌/微需氧菌的方法較多，但培養鑑定法始終是可靠性與準確性最高的鑑定方法。
厭氧/微需氧培養設備
厭氧培養設備包括：厭氧袋、厭氧罐和厭氧工作站
微需氧培養設備包括：微需氧罐和微需氧工作站
由於厭氧袋、厭氧罐（微需氧罐）只能對培養階段的樣品提供相應的氣體環境，卻無法提供操作階段的氣體環境，再因操作不便、耗材成本高等原因，而逐漸趨於淘汰。而既可操作又可培養全過程式的厭氧工作站（微需氧工作站）已越來越成為厭氧/微需氧培養的必選設備。
一般而言，各製造品牌（包括國產與進口）的厭氧工作站與微需氧工作站均為獨立機型，厭氧工作站無法進行微需氧培養，微需氧工作站無法進行厭氧培養。這就給微生物實驗室的使用者帶來了採購與使用的高成本投入，也讓原本就擁擠緊張的微生物實驗室更加空間危機。
英國Electrotek（依萊泰科）厭氧/微需氧工作站首次實現了“一箱雙用”，既可厭氧又可微需氧，成為當前該設備技術的前沿代表。
厭氧/微需氧培養基
用於厭氧菌和微需氧菌培養的培養基。
其根據用途不同主要分為：增菌培養基、選擇性培養基與鑑定培養基。
目前該實驗材料已普遍實現國產化，只有極少部分專業領域的培養基還需採用進口品牌。
