國內大事
１９９９年９月１６日，上海浦東國際機場正式通航。1999年9月16日，上海浦東國際機場正式通航。浦東國際機場一期工程總投資130多億元，占地12平方公里，標誌著上海成為中國第一個擁有兩大國際機場的城市。
1999年9月16日，第十二屆全國發明展覽會在寧波市舉行。來自全國29個省、市、自治區以及港澳台地區的40多個代表團參展，共展出發明成果1400餘項，簽訂技貿契約621個；有1萬多名中外來賓參加各項活動，10.2萬人參觀展覽會。
1999年9月16日，南寧市在中央文明委召開的“表彰全國精神文明建設創建工作先進單位電視電話會議”上，榮獲“全國創建文明城市工作先進城市”稱號。
1999年9月16日，颱風約克吹襲香港，香港天文台懸掛歷來最長的十號颶風信號。
1999年9月16日，由南陽21世紀議程管理辦公室組織並主辦的“99南陽環保餐桌論壇暨綠色飯店創建活動”正式拉開帷幕，王建民副市長出席了動員會並致辭。
1999年9月16日，北京市第十一屆人民代表大會常務委員會第十三次會議討論通過了《北京市實施＜中華人民共和國節約能法＞管理辦法》，從1999年12月1日開始執行。
1999年9月16日，廣東省副省長盧鍾鶴到順德市視察碧桂園學校，對該校“保證基礎，發展個性，服務社會”的教育模式以及把學校作為一種產業、企業家和教育家聯合辦學經營的作法給予肯定。
1999年9月16日16時30分，9910號強熱帶風暴在珠海登入，順德平均風力達6～8級，極大風力8～10級。這是1983年以來襲擊珠江口並直襲順德市的一次強熱帶風暴。受強熱帶風暴影響，全市受災作物2．66千公頃，水產養殖損失0．504千公頃，經濟總損失0．49億元。另珠海中心溝魚塘、蝦塘受浸走魚，經濟損失達867．6萬元。
1999年9月16日，在南京舉行了南海海上觀音8.8米三面立像模型研討會，聽取了美術界和雕塑界權威專家的意見。
1999年9月16日，中國現代國際關係研究所研究員閻學通博士來到人民日報網路版主持強國論壇，就當前中美關係、台海危機等問題與網友交流。
1999年9月16日，中央精神文明建設委員會命名永流鎮劉家村全國創建文明村鎮工作先進單位。
1999年9月16日，陝西省人民政府舉行了新聞發布會，向全世界發布了秦始皇陵和漢景帝陽陵的重大考古新發現，國內外一百多位記者參加了盛會。
1999年9月16日，在微軟ATC2000年會上，世傑榮獲“十佳微軟授權培訓中心”，併名列中國第一名。 當時是安徽省唯一的“十佳”。
1999年9月16日，《科學時報·成才導刊》創刊，對開4版，每周一期。2000年9月17日，《成才導刊》改為《大學周刊》。
1999年9月16日，中央精神文明建設指導委員會授予華聯超市總部“全國建設文明行業工作先進單位”的光榮稱號。
1999年9月16日至17日，在杭州環湖飯店舉行“中日尺八交流國際研討會“。來自中、日、韓三國的專家學者代表50餘人。日本都山流大師範西川秀利、靜岡縣琴古流尺八加藤史芳一行11人參加了研討會。17日上午全體會議代表參謁護國寺，日本尺八團員在大殿門前跪奏尺八名曲《虛鈴》。
1999年9月16日，江蘇省、南京市台聯、市台盟在白沙屯鈑店舉行了兩岸台胞迎中秋、慶國慶聯歡會。
1999年9月16日，湖北省環境保護局關於國營四四Ｏ四廠放射性廢物井被挖事件提出處理意見（鄂環函【1999】139號）。
1999年9月16日，長城所網站域名更改為gei.bestinfo.net.cn。
1999年9月16日，中華人民共和國農業部代表團正式訪問摩爾多瓦。
1999年9月16日，上海市閘北區檔案局高峰、陳勇、俞志祥同志被閘北區政府評為閘北區1997—1999年三年一度閘北區檔案系統先進工作者。
1999年9月16日，濟南市工商銀行大觀園儲蓄所獲“全國創建文明行業工作先進單位”榮譽稱號。
1999年9月16日，康佳榮獲“全國精神文明建設先進單位”稱號。
1999年9月16日，第四屆“東北文學獎”在哈爾濱揭曉。共評選出一、二等獎20部（長篇小說15部，兒童長篇小說5部）。吉林省張笑天的《太平天國》、馬昭的《世紀之門》獲長篇小說一等獎。女作家金葉的《都市少年》獲兒童長篇小說一等獎。女作家杜保平的《女人無牌坊》、劉慶的《風過白榆》、蘇赫巴魯的《漠南神筆》獲長篇小說二等獎。
1999年9月16日，得利斯村被中央精神文明建設指導委員會授予“全國創建文明村鎮工作先進單位”。
1999年9月16日至17日，中國電信在湖南召開全國電子商務工作座談會，明確了電子商務的發展目標。
1999年9月16日，國務院批准昌平撤縣設區，昌平政治、經濟和社會各項事業進入了新的發展階段。由於縣十一屆人大代表是1998年12月16日選舉產生的，換屆時間較短。
1999年9月16日，由饒江峰組織，饒大成經辦，經中國食品工業協會審查，南豐蜜桔乾酒、甜酒通過“國家質量達標食品”認證。
1999年9月16日，中央精神文明建設指導委員會在中南海召開電視電話會議，隆重表彰在全國精神文明創建工作中取得突出成績的58個創建文明城市工作先進城市和城區，500個創建文明村鎮工作先進縣（市）、鎮、村，500個創建文明行業工作先進單位，503個精神文明建設先進單位。中共中央政治局委員、書記處書記、中央文明委主任丁關根出席會議並講話。中共中央政治局委員、中央文明委副主任李鐵映主持了會議。這次表彰活動是對多年來民眾性精神文明創建活動的一次集中檢閱，是精神文明建設成果的一次充分展示，也是向新中國建國50周年奉獻的一份厚禮。
1999年9月16日，石家莊市獲得“全國創建文明城市工作先進城市”稱號，成為首批進入該行列的十個省會城市之一。
1999年9月16日，仰韶集團榮獲“全國精神文明建設工作先進企業”，中央文明委頒發了匾額和證書。
1999年9月16日，以鄭陽、李文耀為團長的香港道教一灣聖壇道教參訪團一行40人來茅山道院參訪，市宗教局張樹民局長、丁明金副局長、市道協朱易經會長、楊世華、鄭志平道長接待陪同。
1999年9月16日，聯合基因為集團專家委員會名譽主任談家偵先生慶賀90華誕，談家楨先生在參觀公司並聽取公司負責人的匯報後，對公司的科研和產業化工作給予了充分肯定。
1999年9月16日，新加坡副總理李顯龍到蘇州出席中新工業園區聯合委員會第四次會議後訪問上海。
1999年9月16日，錦繡中華公司榮獲“全國創建文明行業工作先進單位”稱號。
1999年9月16日，南京市獲“全國精神文明創建工作先進城市”稱號。同時，南京長途汽車站、侵華日軍南京大屠殺遇難同胞紀念館被授予“全國創建工作先進單位”稱號，江寧縣鎖石村、雨花台區丁牆村被授予“全國創建工作先進村”稱號。
1999年9月16日，海信集團有限公司在濟南中豪大酒店召開“網際揚帆，世紀海信——海信計算機公司Internet戰略發布會”，發布了包括網路伺服器、IP電話、掌上電腦、機頂盒、HUB、網路導航軟體等眾多產品，同時創造性地提出了i-Device（Internet接入設備）概念，指出要迅速完善海信電腦i-Device產品體系，在繼續保持“海信電腦—領先的Internet PC”產品優勢的前提下，積極發展與PC技術相關或類似的i-Device產品，形成i-Device完整產品家族，成為國內領先的家庭信息消費與中小企業Internet方案提供商，協助集團完成向信息家電、智慧型家電的產業結構升級，將海信電腦建設成為國內第一流的Internet高科技知名品牌。
1999年9月16日，中國纖維檢驗局、中華全國供銷合作總社棉麻局聯合下發《關於加快1993年度以前入庫儲備棉公證檢驗進度的緊急通知》，決定將1993年度以前入庫的12.5萬噸國儲棉輪換出庫，要求由專業纖檢機構對出庫棉花全部實施公證檢驗，棉花交易市場依據公證檢驗結果對外報價。
1999年9月16日，經北京市政府同意，北京市首都公路發展有限責任公司正式揭牌運轉，負責北京高速公路建設、運營管理、融資和相關產業開發。此舉當時是北京市委、市政府深化城市基礎設施建設融資體制和企業運營機制改革的一項重要舉措。
1999年9月16日，上海市菸草專賣局專賣稽查總隊成立。
國際大事
1999 年9月16 日，德國友好人士向中國駐德使館 贈送慶祝中華人民共和國成立50周年的紀念海報樣本。1999年9月16日，德國友好人士向中國駐德使館贈送慶祝中華人民共和國成立50周年的紀念海報樣本。
1999年9月16日，俄政府頒布《關於反恐怖主義措施的決定》。俄軍開始對車臣恐怖分子發起猛烈反擊。
