衛智軍自1982年畢業留校以來一直從事草原管理學、草地學、草地生態學教學工作,參編《草地培育學》、《草地經營》,參譯《草地研究——基本問題與技術》等教科書,主編“十一”國家級規劃教材《草地經營與飼草料生產學》。參加的“草地資源管理與保護課程體系和課程內容改革與建設”教改項目獲內蒙古自治區優秀教學成果二等獎。多年從事草原管理、培育及草地生態等方面的科學研究,主持國家基金項目“科爾沁沙地土地資源最佳化配置研究”、內蒙古“十五”重點攻關項目“內蒙古不同類型放牧地合理利用研究”、內蒙古自然科學基金“草原放牧系統家畜採食過程與植物群落變化的關係”、中科院知識創新重大工程項目子課題“錫林郭勒盟典型草原劃區輪牧技術系統研究”等項目8項,先後參加國家基金、農業部及自治區科研項目20餘項。
