藥物研究中的蛋白質組學

藥物研究中的蛋白質組學

蛋白質組學分析 血管的蛋白質組學 血管細胞的蛋白質組學

基本信息

作 者:M·哈馬馳,周興茹,裴瑞卿著
叢 書 名:現代生物技術前沿

出 版 社:科學出版社
ISBN:9787030205629
出版時間:2008-04-01
版 次:1
頁 數:272
裝 幀:平裝
開 本:16開
所屬分類:圖書 > 醫學 > 藥學

內容簡介

《藥物研究中的蛋白質組學》探討的關鍵問題不是蛋白質組學本身,而是其在藥物研發中的套用。它不是一本介紹具體的蛋白質組學技術的工具書,而是一本指引藥物研發工作者如何以蛋白質組學技術為工具,達到新藥開發目的的概要性教科書。該書原作者對《藥物研究中的蛋白質組學》的構想很周到,書中不僅包括科學內容,還用一定篇幅介紹了科研工作中必需的管理性知識,它先從管理到技術,然後到套用,再回到管理,是一套完整的以蛋白質組技術進行藥物研發的知識體系。書中不僅介紹了最傳統的蛋白質二維凝膠電泳、質譜、液相色譜、晶片等蛋白質組學技術的基本原理,以及這些技術相互之間的綜合運用,還詳細介紹了它們在具體研究領域中的套用和進展。

目錄

譯者序

前言
第一篇 簡介
1 最佳化蛋白質組網路管理,促進藥物開發
1.1 引言
1.2 管理的任務和目標
1.3 網路
1.4 生物標記物的評估
1.5 藥物開發中蛋白質組網路的建設
1.6 管理網路的實現:腦蛋白質組計畫
1.6.1 國立基因組研究網路:人腦蛋白質組計畫
1.6.2 人類蛋白質組組織:國際腦蛋白質組計畫
2 蛋白質組數據的標準化、存儲和交換
2.1 引言
2.2 蛋白質分析工具
2.2.1 UniProt
2.2.2 InterPro
2.2.3 Proteome-Analysis I)atabase
2.2.4 Inteinational Protein Index
2.2.5 Reactome
2.3 數據的存儲和提取
2.4 蛋白質組學標準化預案
2.5 通用蛋白質組學標準(GPS)
2.6 質譜分析
2.7 分子間的相互作用
2.8 總結
第二篇 蛋白質組技術
3 差異凝膠電泳(DIGE):臨床研究的新一代二維凝膠電泳
3.1 引言
3.2 差異凝膠電泳(新一代蛋白質2-DE檢測技術)
3.2.1 DIGE CyDye最小量螢光標記的套用(CyDye最小量螢光的最小量標記)
3.2.2 DIGE CyDye飽和量螢光標記的套用
3.2.3 DIGE蛋白質組分析中統計學的套用
4 生物質譜:基礎研究及藥物研發相關技術
4.1 引言
4.2 電離理論
4.2.1 基質輔助雷射解吸電離(MALDI)
4.2.2 電極噴射電離
4.3 質譜設備介紹
4.4 蛋白質鑑定方法
4.5 用於比較和功能蛋白質組學的定量質譜
4.6 代謝標記法
4.6.1 N標記
4.6.2 細胞培養中含有穩定同位素的胺基酸標記(SILAC)
4.7 化學標記法
4.7.1 蛋白質水平的化學法同位素標記
4.7.2 肽段水平的穩定同位素標記
4.8 定量MS:解密蛋白質-蛋白質相互作用
4.9 總結
5 蛋白質組學中的多維液相柱色譜——我們身在何處?
5.1 引言
5.2 為何需要MD-LC/MS?
5.3 MD-LC/MS方法的基本內容
5.3.1 概述
5.3.2 需要考慮的問題
5.3.3 樣品的純化
5.3.4 MD-LC的多相系統選擇
5.3.5 操作部分
5.3.6 尖端技術 含酶解技術
5.4 MD-LC在蛋白質組學中的套用——現狀簡介
5.5 樣品的純化:克服蛋白質組學分析“瓶頸”的方法
5.6 總結
6 多肽組學技術及其在藥物研究中的套用
6.1 引言
6.2 藥物研究中的肽
6.2.1 肽的研究歷史
6.2.2 多肽的簡易生化特性
6.2.3 多肽藥物
6.2.4 多肽生物標記物
6.2.5 臨床多肽組學
6.3 多肽組學技術的發展
6.3.1 多肽分析方法進展
6.3.2 多肽組學概論
6.3.3 對內源性多肽的Top-Down鑑定
6.4 差異多肽組學的套用
6.4.1 藥物開發中的多肽組學
6.4.2 多肽組學在體內實驗中的套用
6.5 展望
7 蛋白質生物晶片在蛋白質組學中的套用
7.1 引言
7.2 技術概況
7.2.1 蛋白質的固定和表面化學
7.2.2 蛋白質的轉印和檢測
7.2.3 晶片內含物
7.3 蛋白質晶片的套用
7.4 對藥物研究和開發的貢獻
8 體外鑑定蛋白質相互作用的研究進展
8.1 引言
8.2 cAMP-依賴性蛋白激酶模型系統
8.3 用SPR生物感測器實時監控相互作用
8.4 藥物設計中的ITC
8.5 高通量篩選工具一螢光極化
8.6 Alpha篩選在藥物篩選上的套用
8.7 總結
9 完整細胞和組織中的分子網絡——生物學和藥物開發中的機遇
9.1 引言
9.2 一個關於細胞的比喻
9.3 分子調控網路圖:理論基礎
9.4 構想會騎車的機器人
9.5 以分子網路模組標準化為幾何目標
9.6 獲取功能信息:展望藥物研發
第三篇 套用
10 從靶標到先導化合物
10.1 引言
10.2 材料和方法
10.2.1 細胞和培養條件
10.2.2 體外活性檢測
10.2.3 親和色譜
10.2.4 電泳和蛋白質鑑定
10.2.5 BIAcore分析
10.2.6 醯基氰化物的合成
10.3 結果
10.4 討論
11 藥物研究中的差異磷酸化蛋白質組分析法
11.1 引言
11.2 人類血小板的磷酸化蛋白質組學
11.2.1 皮層肌動蛋白
11.2.2 調節性肌球蛋白輕鏈
11.2.3 蛋白質二硫鍵異構酶
11.3 鑑定人體血小板中cAMp-和cGMP-依賴性蛋白質激酶的底物
11.4 分析野生型和基因敲除型小鼠的磷酸化蛋白質組差異,鑑定抗炎治療的新型治療靶點
11.5 總結
12 血清學與蛋白質組學技術在腎細胞癌生物標記物開發中的套用
12.1 引言
12.1.1 腎細胞癌
12.2 開發生物標記物的方法
12.3 採用不同蛋白質組學技術鑑定生物標記物的優點
12.4 生物標記物的類型
12.5 腎細胞癌細胞系和活組織切片的蛋白質組分析
12.6 鑑定有差異表達的蛋白質
12.7 總結
13 細胞器蛋白質組學在抗藥性研究中的套用
13.1 引言
13.1.1 臨床問題及蛋白質組學對策
13.2 實驗目的和實驗設計
13.2.1 細胞系
13.2.2 細胞器分離
13.2.3 蛋白質組分分離和鑑定
13.2.4 蛋白質豐度的定量比較
13.3 二羥葸二酮耐受型MC卜7細胞中膜蛋白質和核蛋白質的變化
14 人體體液的臨床神經蛋白質組學:痴呆早期和鑑別診斷中的腦脊液和血液分析
14.1 引言
14.2 阿爾茨海默症的神經化學標記物
14.2.1 p澱粉樣蛋白質前體(p_APP):代謝和對AD診斷的影響
14.2.2 Tau蛋白質及其磷酸化形式
14.2.3 ApoE的基因型
14.2.4 其他可能的因子
14.2.5 CST參數的綜合分析
14.2.6 展望:尋找生物標記物的新技術——質譜(MS)、二維螢光差異凝膠電泳(DIGE)及多路技術(multiplexing)
14.3 總結
15 蛋白質組學在阿爾茨海默症中的套用
15.1 引言
15.2 蛋白質組學分析
15.2.1 樣品製備
15.2.2 二維電泳
15.2.3 蛋白質定量
15.2.4 基質輔助雷射解吸/電離飛行時間質譜
15.3 在AD中發生表達下調和修飾的蛋白質
15.3.1 突觸蛋白
15.3.2 導向蛋白
15.3.3 信號傳導蛋白質
15.3.4 氧化蛋白
15.3.5 熱激蛋白
15.3.6 在澱粉樣斑中富集的蛋白質
15.4 不足之處
16 心臟蛋白質組學
16.1 心臟蛋白質組學
16.1.1 心臟2一D蛋白質資料庫
16.1.2 擴張型心肌病
16.1.3 心臟病的動物模型
16.1.4 心臟亞蛋白質組學
16.1.5 人工培養心肌細胞的蛋白質組學
16.1.6 心臟疾病和移植後心臟抗原的蛋白質組學特性
16.1.7 急性移植排斥反應的標記物
16.2 血管蛋白質組
16.2.1 血管的蛋白質組學
16.2.2 血管細胞的蛋白質組學
16.2.3 雷射捕獲顯微分離(LCM)
16.3 總結
第四篇 市場
17 創新過程
17.1 引言
17.2 創新過程評價標準
17.3 計畫
17.4 市場吸引力
17.5 市場競爭地位
17.6 技術競爭地位
17.7 加強契合性
17.8 收益
17.9 風險
17.10 創新過程各個階段的應交付成1
17.11 篩選式過程
17.11.1 確立評估項目(EvP)
17.11.2 晉升為探索性項目(EP)
17.11.3 發展為進展型項目(PP)
17.11.4 進入入市準備階段
17.12 總結
索引

相關詞條

熱門詞條

聯絡我們