線路簡介
東莞路段
莞惠城軌道滘站：位於道滘鎮南部外環路附近，可能是全線近期暫時的西起點。
西平西站（西平站、新城站）：位於東莞大道與西平二路交叉處；南城、新城中心；換乘東莞捷運2號線。
東城南站：位於莞長路和長泰路丁字路口的環島處；東華高級中學、東城汽車站；換乘東莞捷運1號線。
寮步站：位於龍勝路中的小橋附近，藥勒村西北部；小坑村，東風日產文體中心，香市動物園。
松山湖北站：位於迎賓路與新城路交匯處；松山湖工業園；遠期可換乘東莞捷運3號線。
大朗鎮站（大朗站）：位於莞樟路（銀朗南/北路）與常朗路交匯處；碧桂園。
常平南站：位於常平大道與板石大街交匯處；常平鎮區。
常平東站（東莞東站）：位於東站路與常東路交匯處；東莞東火車站，常平汽車站；換乘京九/廣梅汕鐵路。
樟木頭東站：位於東莞國際塑膠城附近，離樟木頭鎮區還有十公里；謝崗鎮西部。
銀瓶站（謝崗站）：位於花園大道東莞人民醫院謝崗分院對面；謝崗鎮東部。
常平東站至銀瓶站為高架站，其餘為地下站。
此路段主要平行公路為：水鄉大道-環城南路-松山湖大道-莞樟路-常朗路-常平大道-潮莞高速/莞惠公路。
惠州路段
瀝林北站（瀝林站）：位於京九鐵路北側；瀝林文化廣場；瀝林鎮西部。
仲愷站（陳江站）：位於仲愷大道五路、六路與甲子路、曙光路交匯處；陳江鎮南部。
惠環站：位於仲愷大道與和暢二路交匯處；中信惠州醫院，惠州仲愷高新區。
龍豐站（客運南站）：位於仲愷大道惠州社會主義學院和實驗中學路段中間；惠州汽車南站、南線汽車站。
西湖東站（西湖站）：位於環城西路麗日購物廣場對面；惠州西湖風景區，惠州中心醫院，步行街。
雲山站（市政府站）：位於雲山西路與文明一路交匯處；市民樂園，市政府，市文化藝術中心，意生廣場；未來可換乘惠州軌道交通1號線。
小金口站（惠州站）：位於惠州大道與京九鐵路之間；惠州火車站；換乘京九/廣梅汕鐵路。瀝林北站至惠環站為地面或高架站，其餘為地下站。
此路段主要平行公路為：潮莞高速/仲愷路-惠鹽高速/仲愷大道-鵝嶺北路-環城西路-雲山西路-惠州大道。
小金口站有延長線段設有動車組檢修站，並預留了與廣惠城際軌道、贛深高鐵惠州北站的接駁條件（百度地圖顯示線路已至小金口高速收費站）。
城軌結構
2010年7月，珠三角城際軌道網從以廣東地方投資為主改成由鐵道部和廣東省一起合作，成立了新的公司。莞惠城軌調整後有3個變化，一個是制式，當下改為和國鐵制式一樣；第二是設計運行速度，由原來的150～200公里每小時提升到今天的200～250公里每小時；第三是車廂，以前是掛4節車廂，當下考慮改掛8節車廂，這就要求將車站加長。
項目升級
2010年7月，珠三角城際軌道網從以廣東地方投資為主改成由鐵道部和廣東省一起合作，成立了新的公司。莞惠城軌調整後有3個變化：1、採用國鐵制式；2、全線設計速度由原來的140km/h提升到現在的200km/h；3、原4節車廂編組改為當下8節車廂編組，這就要求將車站加長。
大事記
2014年5月20日上午，莞惠城軌立起電氣化工程接觸網第一桿，莞惠城軌“四電”（通信、信號、電力、電氣）系統集成工程正式拉開帷幕。這也就標誌著莞惠城軌施工由站前進入到站後階段。到2015年6月則會進行實車試運行，明年底實現通車目標。
莞惠城軌原計畫“四電”工程完成並驗收合格後，於2013年9月對第一試驗段進行實車試運試驗。廣東珠三角城際軌道交通有限公司相關人士表示，實車試運試驗的推遲主要是受土建施工延期等方面的影響，只是建設工期的調整，對明年底通車的總工期目標基本沒有影響。據了解，莞惠城軌惠州段土建工程已完成85%，東莞段完成了80%。
2015年12月，瀝林北、仲愷、惠環等3座車站裝修、安裝工程已基本完成；龍豐、西湖東、雲山、小金口等4座車站主體結構已完成，正在進行裝修和設備安裝工作。
珠三角城際軌道交通公司昨日回應，廣佛肇項目2009年9月得到省環保廳的環評批覆，同月開工建設；莞惠項目2009年4月得到批覆，同年9月開工。兩項目開工建設後，2010年8月，原鐵道部、廣東省決定以部省合作形式建設莞惠、廣佛肇項目。隨後，部省雙方相繼聯合發文，對兩個項目的線位進行調整，對設計標準、工程內容進行部分變更，由此導致環境敏感點等發生變化。
據了解，截至目前，莞惠城軌惠州段累計完成投資106.4億元，完成總投資的86%。2016年03月30日開通運營東莞常平東至惠州小金口站段，東莞道滘段至常平南段暫未開通運營。
開通運營
在（廣東省）省委、省政府的高度重視和中國鐵路總公司的大力支持下，經有關各方的共同努力，珠三角城際鐵路建設取得積極進展，佛肇、莞惠（常平東至小金口段）城際鐵路工程建設已基本完成。中國鐵路總公司已對線路進行安全評估工作，並同意於2016年3月30日開始東段運營。
2016年3月30日開通運營
莞惠城際鐵路常平東站至小金口站區段（2016年3月30日）今天開通運營。昨天（2016年3月29日）15時起，旅客已可通過12306網站、電話訂票、車站售票視窗、自動售票機、代售點購買列車的車票，常平東至小金口全程票價35元。各趟列車車票均為當日當次有效，全程不對號入座。
快捷1分鐘自助刷卡購票
廣鐵集團副總經理郭吉安說，各車站共投入（新增）163台自動售取票機，所有自動售取票機內均安裝有詳細的操作演示視頻，每一位通過自動售取票機購票的旅客，可通過視頻演示快速入手，實現一分鐘刷卡購票。此外，沿線各車站共設64個人工售票視窗，並專門設定了方便殘障人士的矮窗，為旅客提供售票、改簽、退票等業務。
貼心建超大候車室
同時，為方便旅客進站乘車，廣州站在站前廣場修建約800m2的廣佛肇臨時候車室。肇慶站為城際客運專線大型站，候車室按照高鐵站要求設計，候車室面積達2600m2。常平東站為方便旅客進出站，對旅客進出區域進行合理分割，站內進出站區分工明確，防止上下車旅客對流。小金口站目前採取先候再檢的進站乘車模式。
安全雙門登車模式
另外，各車站站台採用雙門登車模式，即禁止門（安全門）、車廂門，兩門開關均由電腦操控，列車停穩旅客上車完畢後，經站台紅外線探測無異物，兩門自動關閉方可啟動列車，確保旅客安全。城際鐵路使用的動車組車型為CRH6A型動車組，每趟列車由8節二等座車廂組成，不設餐車。每列車設有557個座席，超員載客量可達1488人。
提速降價
莞惠城軌常平至小金口段運營初期存在票價高、速度慢、車次少的詬病。相鄰車站間距短的不足三五公里，起步價卻高達10元。京九鐵路惠州火車站（小金口站）至東莞東火車站（常平東站）現有的列車耗時約40分鐘，票價只需11塊或23塊；城軌列車耗時約70分鐘，票價35塊，其時間和車費性價比甚至低於私家車或大巴。
2016年7月1日起，莞惠城軌調整了列車運行圖。增開列車班次，站站停列車全程用時壓縮至53分鐘、大站停（小金口站、西湖東站、仲愷站、常平東站）列車耗時縮短至34分鐘；20公里內車程票價標準降低，不少站點間的票價由10元減至5元或8元。不過距離超過20公里的站點仍執行原有票價。
存在問題
速度一般
與汽車相比，由於惠州與東莞間的距離只有幾十公里，有大量筆直的高速路或免費快速主幹道串聯，加之汽車無需過早提前買票候車進站、也不會中途停靠，所以兩市大多居民乘坐城軌實際用時仍要比大巴或私家車多。
不夠便捷
與其他公共運輸相比，乘坐城際列車購票需刷身份證、僅限乘當次列車，遠不如公車和捷運快捷省心。
重複建設
莞惠城軌約一半路段緊貼京九鐵路，小金口段、以及陳江至常平段幾乎完全重疊，但城軌軌道並未充分利用既有鐵路和車站資源。例如沒有接入近在咫尺的東莞東站導致旅客轉乘長途列車時仍要步行相當長的一段距離。相比廣州，武廣高鐵和廣珠城軌、廣佛肇城軌站台線路均在廣州南站內，換乘無需出站、非常方便。
道路損毀
莞惠城軌施工期間使得原本寬敞暢通的仲愷大道變得破爛不堪，造成常年的汽車擁堵、事故和車損；常平大道一帶創下了“4年7塌方”的記錄，有的居民房屋也因地陷倒塌，嚴重影響了當地市民的正常生活。
票價過高
廣鐵集團制定的票價多年以來因'昂貴全國"而備受爭議。莞惠城軌的城際票價與大巴別無二致，不利於加強兩地市民公交化出行和共享城市資源。東段線路通車以來，除元宵節外，客流量基本上很稀少。
工程拖沓
莞惠城軌總工期從最初的3年半到後來的4年、5年，再到現在的7至8年；原本計畫2016年底前的全線通車如今又延遲至2017年春節後，目前仍無明確竣工時間。面對遙遙無期的工程、年年損壞的公路，莞惠城軌工程曾多次遭遇百姓質疑，就連一些省市領導都表示不滿。
站台間隙
莞惠城軌列車與站台之間的間隙太大，有18厘米，存在安全隱患，曾出現過旅客卡腳受傷的案例。
城軌優點
運力很大：每列動車組可承載1500人，高峰期行車間隔可壓縮至6分鐘。
速度較快：列車最高運行時速200公里，若是大站直達車，惠城到莞城只需半小時。
安全可靠：鐵路運輸的安全係數是公路運輸不可比擬的，不受常規天氣影響，不擔心堵車。
環保經濟：現代動車組使用電力，穿越繁華街道時速不超過100公里，既無尾氣污染也無噪聲污染。
站點較多：沿線每個鎮都至少有一個站點，可以結束沿途郊區城鎮不通鐵路的歷史，方便更多人出行。
認識誤區
莞惠城軌是按照國鐵一級標準建設的城際客運專線鐵路，屬於快速鐵路，採用標準軌道、高鐵控制系統、使用CRH6A型和諧號電力動車組，管理運營模式為國鐵制式。因此外界廣泛稱呼的“莞惠輕軌”是不科學的。輕軌屬於狹義城市軌道交通範疇內的一種公共運輸工具，與捷運相似，採用C型列車（詳見“輕軌”百科詞條）。珠三角目前已建成的城軌除了廣佛捷運，其餘均是以老廣深城際鐵路為樣板興建的；無論是結構技術還是管理制度都與廣深鐵路基本一致；從購票方式、軌道規格、和諧號列車等就能看出這些城軌皆屬於國鐵（採用國家鐵路技術標準建設並由國家鐵路局管理運營）。廣東不同線路城軌主要差異僅僅是車站密度和運營速度有所不同：例如廣珠城軌運營時速可達250公里，達到高鐵底線標準。
城軌，即城際軌道（交通），是指連線相鄰城市的專線鐵路系統，可以根據不同情況採用捷運輕軌或普鐵高鐵等各種軌道技術。隨著我國快速鐵路技術發展、CRH6型系列和諧號動車組的量產，傳統輕軌實際使用率不高。
項目作用
莞惠城際軌道加快珠三角城際軌道交通項目建設，是我省貫徹實施《珠三角改革發展綱要》的主要內容，是應對國際金融危機影響、保持經濟平穩較快發展的重要舉措。莞惠城際軌道是珠江口東岸地區軌道交通的骨幹項目之一。項目建成後，將進一步密切東莞和惠州的聯繫，對推動珠三角交通一體化，加快經濟一體化進程，提升珠三角地區整體競爭力和輻射帶動能力具有重要作用。
