機理
脂肪酸代謝的過程是從腸道開始，來自膽管的分泌物開始使脂肪酸溶解，以便於讓身體通過腸壁吸收。肝臟和胰腺產生的酶能把脂肪酸分解成可用的塊，並且這些脂肪成分在血液中循環。身體會存儲一部分脂肪以滿足未來對能量的需求，其餘部分則用於構建新組織模組。不需要的脂肪會返迴腸道或腎臟被清除掉，這樣它們就不會積聚在體內。
脂肪酸代謝產生可用的化合物，身體會以新的方式形成細胞膜，荷爾蒙和其它化學品成分。沒有適當的脂肪酸，身體難以找到修復損傷，沿荷爾蒙通道傳遞信息，以及從事其它活動的能量供給。長期如此，就會導致疾病。
功能
除了是用於構建體內組織的材料以外，脂肪酸的能量密集，因此還是存儲能量的理想方式。燃燒脂肪獲取熱量比使用其它結構（如碳水化合物）更有效。脂肪酸代謝能讓身體為未來存儲脂肪，並直接供應給大腦等需要能量的部位。運動員等需要高能量的人需要吃足夠數量的脂肪酸才能滿足能量需求。
代謝脂肪酸會產生好和不好的成分。一些脂肪酸是有益的，因此能減少體內的有害成分數量。其它一些則有危害，如增加患心血管疾病的風險等。人的日常飲食決定了脂肪酸在體內的構成，因為脂肪酸代謝取決於可以獲得的生材料。有些飲食中包含大量有害成分，因此會使人產生更多難以加工或處理的壞脂肪酸。
