起因
事件前的先兆
科倫拜中學 階梯頂端便是槍擊開始的地點1996年，埃里克·哈里斯在美國線上(AOL)建立了一個個人網站。原本這個網站是用於存放他和克萊伯德共同設計的毀滅戰士遊戲關卡檔案，以供朋友們下載。在那一年裡，哈里斯在網站上建立了一個簡單的部落格，包括笑話、日記，記載了他對父母、學校和朋友的一些看法。1996年年底，網站包含了教導他人如何惡作劇的指示、製作爆炸物的教學，並記載了許多他和克萊伯德以此惡作劇的過程。到了1997年初，在部落格中顯現出哈里斯對當時美國社會越來越多不滿的內容。
哈里斯曾在網站上曾向另一位同學布魯克斯·布朗發出死亡恐嚇，布朗的父母在1997年底發現了網站上的恐嚇訊息，告知了傑佛遜郡警方的調查員麥可·格拉。格拉發現網站上也包含了針對許多哥倫拜恩中學的學生和教師的暴力恐嚇。在接近槍擊事件的前夕，哈里斯也在網站上記載了自製炸彈完工的紀錄以及累積的槍械彈藥數量，並製作一份“射擊名單”以紀錄那些他想殺害的人，不過他並沒有透露完整的計畫過程。由於哈里斯承認擁有爆炸物，格拉決定起草一份宣誓書以申請針對哈里斯家的搜查證，但最後並沒有提出申請。（事件發生後，傑佛遜郡官方隱瞞這份宣誓書的存在，直到2001年9月才曝光）
1999年9月，一名調查員秘密搜尋傑佛遜郡政府的電腦系統，但也沒有找到檔案。到了2000年底第二次搜尋時在郡政府的檔案庫里找到了幾份拷貝檔案，檔案在經過重建後於2001年9月被揭露，但原始的檔案仍未被找到。大陪審團在2004年9月提出了最後的調查結果。
部落格和錄像帶
在1998年1月30日，哈里斯和克萊伯德兩人由於偷竊電腦零件而被逮捕。兩人在被從精神治療中心釋放後都開始於部落格中記載計畫的準備過程。兩人也秘密地以錄像帶來記載他們軍火庫的場景。
部落格內容顯示了兩人計畫進行一次與1995年奧克拉荷馬市聯邦大樓爆炸案同樣規模的爆炸。部落格中也包含了如事成後逃跑至墨西哥、在丹佛國際機場劫持飛機飛往紐約市撞擊大樓等大話，也包含實際攻擊計畫的細節。兩人原本的計畫是：在自助餐廳放置炸彈並埋伏在大門口，在炸彈爆炸後射擊所有慌張逃出的人，並接著攻擊學校周遭住宅區那些因為爆炸而跑出門看熱鬧的人；但這個計畫因為炸彈沒有成功引爆而被迫臨時更改。
兩人也拍攝了他們非法囤積的爆炸物和槍械彈藥。在這些錄像帶中，兩人顯示出他們如何巧妙而富創造力地將他們的武器庫藏匿在家中，而不會讓父母發現他們的行動。一些錄像帶還包含他們在附近山丘進行射擊練習的連續鏡頭，以及拍攝他們計畫攻擊的學校地點的鏡頭。最後一段錄像帶中兩人一起向他們的家人道歉，並吹噓他們很快便會成為惡名昭彰的人物。
槍械
在攻擊的一個月前，哈里斯和克萊伯德非法取得了一把英特拉泰克公司（Intratec）生產的TEC-DC9自動手槍、一把Hi-Point公司生產的9公厘半自動卡賓槍、和兩把散彈槍，他們還將散彈槍的槍管給鋸短了（能增加殺傷力並更易於隱藏），他們以網際網路上的炸彈製作教學，製作了99個各種設計和規模的即時引爆裝置。在屠殺開始之前，兩人在這些準備過程中就已經違反了各式各樣聯邦和州的槍械管理法律。
由於兩人的年紀，他們取得的全部四把槍在法律上都是非法的。克萊伯德說服一個較年長的朋友羅賓·安德森替他們購買卡賓槍和兩把散彈槍，但安德森至今仍未因此而被起訴過。其他兩名提供他們手槍的人—馬克·馬內斯和菲利普·杜蘭後來則被定罪判了幾年刑期。在取得槍械彈藥的過程中，兩人一共違反了高達21條聯邦、州、和地方的法律。
犯罪經過
槍擊案當天哥倫拜恩中學的空照圖。停車場旁便是主要校舍，綠色窗戶的一樓為自助餐廳，
二樓為圖書館
1999年4月20日星期二上午11:00（美國時間），埃里克·哈里斯和迪倫·克萊伯德各自駕車前往科倫拜高級中學。哈里斯和克萊伯德分別將車停在不屬於他們的停車場車位上，藉由那兩個位置兩人能徹底掌握一樓自助餐廳的動向，並能各自掌握學校的兩個主要出口。在抵達學校後不久，哈里斯和克萊伯德在距離學校半英哩的地方設定了一個小型燃燒彈，炸彈被定時在上午11:14分引爆，計畫以此處的爆炸來轉移緊急人員的注意力。炸彈確實引爆且引起了小規模火災，並在稍後被消防人員撲滅。
兩人接著進入校園，在第一批次的午餐開始之前抵達自助餐廳，放置了兩個裝有20磅（9公斤）丙烷炸彈的行李袋，由於午餐尚未開始而沒有被監視器拍攝到。不過在監視器開始拍攝後，行李袋在鏡頭上清楚可見。炸彈有足夠的爆炸威力以摧毀整個自助餐廳，並能讓圖書館塌陷。安置炸彈後兩人回到車上埋伏，準備在炸彈爆炸後向所有驚慌逃出學校大門的人開火。
開槍射擊
當自助餐廳的炸彈引爆失敗後，哈里斯和克萊伯德在哈里斯的停車處旁集合，取出裝在行李袋和背包里的兩把散彈槍、一把9公厘半自動卡賓槍、一把9公厘自動手槍以武裝自身，並開始走向自助餐廳。他們前往西邊大門的階梯頂端，那裡是整個校園最高的地方。在這個有利位置下，自助餐廳一邊的入口便在樓梯的底部，學校主要的西邊大門便在他們左邊，而運動場便在他們的右邊。
上午11:19，一個目擊者聽到哈里斯大喊：“上啊！上啊！”接著哈里斯和克萊伯德就抽出他們的散彈槍，開始射擊正坐在他們左邊草地上（學校西邊大門的旁邊）吃著午餐的瑞吉兒·史考特和理查·卡塔多，兩人都中了彈而嚴重受傷。在最初一輪射擊後，其中一名槍手再次射擊史考特，殺害了她。不過是誰最先開槍、誰殺了史考特並不清楚。
緊接著，哈里斯脫下他的軍用外衣，取出他的9公厘半自動卡賓槍，瞄準西邊樓梯間的底端。丹尼爾·魯爾布和他的兩個朋友肖恩·格拉弗、蘭斯·柯克林正一同走上樓梯，柯克林指稱曾見到槍手們站在樓梯間的頂端。槍手們迅速朝三人開火，魯爾布胸部中彈後向後跌倒壓在格拉弗的身上；格拉弗足部也中了彈，接著槍手又對柯克林射擊，很快三人便都倒在血泊中了。哈里斯和克萊伯德接著轉向射擊南邊（與學校相反的方向）正坐在階梯旁草地上的五名學生，麥可·詹森被數發子彈擊中但仍繼續奔跑而得以逃離，馬可·泰勒在被擊中腿部後倒在地上裝死，其他三名學生則毫髮無傷地逃離。在兩名槍手朝別的方向射擊時，肖恩·格拉弗站了起來一瘸一跛地走向自助餐廳的入口並倒在那裡，還拖垮了整片前門。克萊伯德開始走下階梯朝向自助餐廳，離開時又射擊了蘭斯·柯克林的臉部，導致他嚴重受傷。
就在稍早的時候，戴夫·桑德斯經由通往二樓的樓梯撤離了自助餐廳里的所有學生，這個樓梯就在圖書館走廊與主要南邊走廊之間的轉角附近，當他和一名學生正越過轉角走下圖書館走廊時，卻看見槍手們正從北邊走廊的轉角走來時。兩名槍手迅速轉向追趕（雖沒有經證實，但一般認為桑德斯之所以冒險前往圖書館，是為了協助撤離那裡的學生）並射擊他們，在戴夫·桑德斯逃至南方走廊時擊中他的胸部，但沒有擊中另一名學生。學生跑進了編號SCI-1的科學教室並警告在裡面的教師們，同時槍手們也走回北方的走廊。桑德斯掙扎著走到科學教室區域，其他的教師們將他帶至另一間無人的SCI-3科學教室。兩名學生對他進行急救，並試著聯絡外面的警方。不過桑德斯還是在下午3:00左右因流血過多而死。
圖書館屠殺
哈里斯和克萊伯德在自助餐廳被監視器拍攝到的畫面，幾分鐘後兩人便自殺了
在槍手們進入圖書館後，哈里斯首先射擊管理櫃檯旁的展示櫃，使得躲在展示櫃後的伊凡·陶德被桌子爆裂時的碎片刺傷。哈里斯接著大喊命令所有人“站起來！”，聲音之大連9-1-1里的錄音都能聽到（在11:29:18）。凱爾·維拉斯貴玆正坐在北邊一排電腦的其中一台；他沒有趴在電腦桌下，克萊伯德首先對他開火，擊中他的頭部和背部，殺害了他。接著兩人將他們裝滿彈藥的行李袋放在南邊一排電腦桌上，並開始重新裝填彈藥。接下來他們走向窗戶，正對著外面他們不久前才經過的西邊樓梯間。他們注意到外面的警方正在疏散學生，於是透過窗戶對警方開火；警方也開火反擊，但都沒有擊中對方。
幾秒鐘後，克萊伯德離開窗戶旁，以散彈槍朝旁邊的桌子射擊，擊傷了派翠克·愛爾蘭、丹尼爾·史蒂普林頓和馬凱·霍爾，接著他脫下了軍用外衣。哈里斯拿起他的散彈槍並走向南邊一排的電腦桌，也沒檢查桌下是否有人，直接將他的槍扔在桌下。接著他射殺了躲在桌下的史蒂文·克諾，並射擊旁邊的電腦桌，擊傷卡西·魯塞格。
哈里斯轉向另一個桌子，布麗·帕斯奎萊正趴在桌子旁（因為桌子下空間過小，她沒有辦法躲進去），哈里斯問她是否想死，帕斯奎萊則懇求哈里斯饒她一命。目擊者指稱這時哈里斯似乎顯得意識不清，或許是因為剛才鼻子的創傷，目擊者還指稱哈里斯的鼻子不斷地流血。在哈里斯辱罵帕斯奎萊的同時，派翠克·愛爾蘭開始對他身邊兩名受傷學生的其中一名施行急救，克萊伯德瞧見後便對他射擊，兩發子彈擊中他的頭部、一發子彈擊中足部，擊中足部的子彈力道還打飛了他的鞋子。愛爾蘭被擊中後便昏迷不醒，但後來仍活了下來。
兩名槍手接著離開書桌區域，走向圖書館北邊的管理櫃檯。哈里斯朝西南方的書桌區域扔擲了一個莫諾托夫雞尾酒，但沒有爆炸。接著哈里斯從東邊、克萊伯德則從西邊繞至管理櫃檯的後方集合，也就是伊凡·陶德躲藏的地方。兩人開始嘲笑伊凡·陶德，並討論要不要殺掉他，但最後兩人走開了。接著克萊伯德朝旁邊的圖書館工作人員休息室射擊，打爆了一個小型電視。哈里斯拿起一把椅子摔在管理櫃檯的電腦上，也就是帕提·尼爾森躲藏處的正上方。兩人在上午11:42離開圖書館，結束了這場血腥的屠殺。
槍手自殺
離開了圖書館後，兩人走到科學教室區域，朝一個空的貯藏櫃扔擲了一枚小型燃燒炸彈。炸彈爆炸時，他們跑開了，一名躲在旁邊房間裡的教師出來撲滅火勢。接著他們前往南方走廊，途中還停下來射擊一間在大廳盡頭無人的科學教室（SCI-8）。接下來他們走下樓梯進入自助餐廳，在那裡他們被監視器首次拍攝到，錄像帶中顯示哈里斯試圖引爆之前沒有爆炸的丙烷炸彈，但也沒有成功；他還拿起一罐逃離學生留在餐桌上的飲料啜飲。
下午12:02至12:05之間的某段時間裡，兩名槍手再次進入圖書館，但除了昏迷的派翠克·愛爾蘭和麗莎·克羅茲（她躺著裝死）以外，所有活著的學生都逃跑了。他們離開自助餐廳和重新進入圖書館的詳細時間並不清楚。一進入圖書館，他們試著透過窗戶射擊外頭的警方人員，但都沒有擊中。接著他們走到靠窗的書桌區域最南邊的一張桌子旁，也就是馬修·蓋傑特和艾賽亞·休爾斯陳屍的地方；在那裡他們雙雙舉槍自盡，堅定地自殺了。下午2:38，派翠克·愛爾蘭恢復了意識並爬向窗戶，試著從窗戶逃離。他後來被特警隊成員從窗戶拉出，這個畫面成為電視上出名的鏡頭。麗莎·克羅茲一直負傷躺在原地裝死，直到警方在下午3:25進入圖書館，將她和帕提·尼爾森、布萊恩·安德森和其他三名圖書館員工一起救出。
槍案結束
學校西邊大門在槍擊後的景像到了中午，特種警察部隊開始部署於學校外，大量救護車將傷者們送至地方的醫院。同時，學生和職員的的家屬們被安排在鄰近的黎霧國小（Leawood Elementary School）集合等待訊息。
在下午12:20分在外頭部署的警方呼叫總部要求支援更多彈藥，以應付接下來的槍戰。不過一分鐘後建築物里的槍手便停止射擊了。下午12:45，數支特警隊小組開始分頭進入校舍，徹底掃蕩每一個房間並檢查所有桌子和背包。在下午1:00報告發現了土製炸彈。特警隊小組在下午2:30開始疏散躲藏的學生們，所有的學生、教師和受僱員工都被疏散，在外頭的一處安全地帶接受醫療、審問，之後才將他們送至黎霧國小與家人團聚。警方直到下午3:30報告在圖書館發現大量屍體。
槍擊之後
4月21日，炸彈處理小組徹底搜尋了整個學校。官方在早上8:30宣布死亡人數為15人。早上10:00，炸彈處理小組宣布整棟建築物都安全了。到了早上11:30，警方發言人宣布警方已經在進行調查，13具屍體都還在學校里以供刑事鑑定人員拍攝現場。
下午2:30，傑佛遜郡地方檢察官大衛·湯瑪斯和警長約翰·史東召開記者會，稱他們懷疑有其他人協助策劃這起槍擊。正式的屍體身分識別還沒展開，但被推測死亡的學生家屬都已被告知。在整個下午和傍晚，剩餘的屍體逐漸被運離學校，送至傑佛遜郡法醫停屍處以供鑑定和驗屍。到下午5:00，死者的姓名開始公布，官方的正式報告也出爐了，宣布總共15人死亡、27人因槍擊事件而受傷。
第三名槍手陰謀論
在屠殺過後不久，一則新聞報導以對7名目擊者的採訪，主張有著第三名槍手存在。另一則採訪鄰近地區住宅的報導則主張，當天上午10:40左右，在幾個街區外有人目擊到克萊伯德的BMW轎車載著四個人，還稱BMW後方跟著一輛載著兩個人的棕褐色轎車。警方決定要注重這些傳聞，因為他們也懷疑為何哈里斯和克萊伯德兩人能攜帶如此之多的炸藥進入建築物。
兩名槍手的親密朋友和保齡球隊友南森·戴克曼，在接受測謊器測驗失敗了兩次後，也曾被懷疑是第三名槍手。但幾個目擊者證實他在屠殺開始前便已離開學校，而且也有目擊者在屠殺開始時看見他正在學校以外的地方，於是他被從嫌疑名單里移除。他在學校外頭打的報警電話和打給克萊伯德父親的電話也與屠殺時間衝突，證明他當時不可能在學校里。
另一個陰謀論指稱有狙擊手在屋頂上，一些警官和學生在屠殺開始時見到有人在圖書館上方的屋頂走動。但這後來被證實是一名學校雇用的屋頂修理工在圖書館屋頂進行定期的保養，在屠殺開始後他便一直躲在那裡直到整場事件結束。
事件之後
在事件之後，大量的爭論聚焦於殺手們的動機為何、以及該如何避免類似的悲劇再次發生。與其他校園槍擊案不同的，兩名槍手最後都自殺了，使得這場案件格外引人注目，受害者無法經由逮捕和審判來發泄他們的憤怒，同時人們也更難尋找他們的作案動機。校園裡學生間常見的小圈圈文化也成為討論的焦點。許多人主張他們兩人在學校被其他的同學所孤立，導致兩人的無助感、不安全感和沮喪感，也使他們強烈渴望作出引人注目的事情。一些學者也展開了揭露和阻止校園欺凌的計畫，避免再有青少年因此而累積憤怒和怨恨，作出類似哈里斯和克萊伯德的悲劇。
在槍擊案後的幾個禮拜，媒體報導將兩名殺手描述為“哥特文化（Goth）崇拜者”、被眾人排擠的“呆子”。但後來這種描述被發現是錯誤的，因為證據顯示哈里斯和克萊伯德都有親近的朋友圈子和非正式社交圈子，也絕非被孤立。由於媒體報導兩人與哥特文化的關聯，哈里斯和克萊伯德也被媒體誤認為與哥倫拜恩中學裡一個名為“軍衣黑手黨”的學生社團有所牽連，但事實上兩人跟這個社團並沒有關係，雖然他們的一些朋友的確加入了這個社團。由於這次槍擊事件，遍布美國各地的許多學生和教師展開了抵制“哥特文化”的活動。
由於兩人最初的攻擊計畫仍是未知數，許多關於日期的陰謀論也依然存在。有些人認為原本的日子是選在4月19日——也就是克萊伯德的朋友羅賓·安德森幫他們購買其中幾把槍枝的日子，但因為丙烷炸彈製作的耽擱而改至4月20日進行。一些分析注意到這一天與阿道夫·希特勒的生日是同一天，距離4年前的奧克拉荷馬市聯邦大樓爆炸案（4月19日）也只相差1天，同時距離大衛教派在韋科鎮事件中被剿滅（4月19日）也只相差一天，這些分析更進一步主張原本的計畫是在4月19日進行，兩名槍手都曾在錄像帶中提起他們將會作出比這些更為驚人的事件。一些人則認為他們選在這天是因為一年的學期即將結束了。
影響
當初槍擊開始的地點現在建立了紀念碑，屠殺中最多人遇難的圖書館則被拆除
由於這起事件和其他校園屠殺的震撼，許多學校開始實行反欺凌的政策，以及新的“零容忍政策”(zero tolerance)立即處罰所有攜帶武器和表現出威脅態度的行為。儘管哥倫拜恩校園帶來的恐懼影響，一些社會科學家認為絕不寬容政策實行得太過頭了。在槍擊後不久，一些基督徒開始著迷於報導中凱西·伯娜死前的對話，認為她在死前曾被其中一位槍手問道“你相信上帝嗎？”而她回答道“我相信。”於是便被殺害。但另一個說法則認為這是第一名遇難者瑞吉兒·史考特所說的。伯娜和史考特都被許多人視為是因信仰而死的烈士。但官方的調查則認為這段對話是由生還的瓦琳·施努爾說的。
當初槍擊開始的地點現在建立了紀念碑，屠殺中最多人遇難的圖書館則被拆除。在槍擊事件後，“哥倫拜恩”一詞成為家喻戶曉的校園槍擊代名詞。在後來的聖塔娜中學(Santana High School)槍擊案中，槍手查理斯·安德森·威廉斯據稱曾經向他的朋友說他要“再乾一筆哥倫拜恩”，但就如同哥倫拜恩事件發生前一般，事先沒有任何人相信威廉斯會真的去做。許多之後的校園槍擊案的計畫也提起哥倫拜恩的例子，有的甚至還計畫要“勝過哈里斯和克萊伯德”。
儘管依據當時的法條，哈里斯和克萊伯德在取得武器的過程中便已觸犯各種法律，但槍擊事件產生了要求更多槍械管制的聲浪。2000年，聯邦和州立法機構採行更多槍械的限制，要求槍械加裝安全鎖，並禁止進口高彈匣容量的槍械。雖然法條規定提供槍械給罪犯和小孩是犯法的行為，但在購槍者背景檢查和槍械展覽會的管理細節上卻有許多爭論。槍枝遊說團也竭力阻止這類立法，以免確保人民持槍權利的《美國憲法》第二修正案被進一步侵蝕。
