定義以無脊椎動物為研究對象的胚胎學分支學科稱為無脊椎動物胚胎學。內容不僅腔腸、環節、軟體、棘皮等主要門類的代表性動物的胚胎髮育得到研究，在同一門動物中，各個綱的代表，甚至各個目的代表，都曾是研究的對象。當然有的細緻深入，有的比較膚淺，尤其是那些種類比較稀少，材料難得的類群。無脊椎動物胚胎學研究的內容包括：卵子的成熟、受精、卵裂、早期發育、幼蟲類型以至某種類的變態過程。套用20世紀以來，無脊椎胚胎髮育的知識，在人類日常生活中逐漸占有重要位置。一些有經濟價值的無脊椎動物，例如蝦、蟹、竹蟶、牡蠣等的人工養殖需要了解其胚胎髮育，甚至了解其幼蟲期的餌料，才能順利進行；對於一些有害的，例如：船蛆或藤壺等附著生物，也需要了解其生活史，才能有效地防治。
