辦刊歷史
1974年，《微生物學通報》創刊，為季刊。
1978年，改為雙月刊。
2008年，改為月刊。
2012年4月20日，《微生物學通報》第九屆編委會第一次會議在合肥安徽大學舉行。
2014年10月，該刊入選原國家新聞出版廣電總局第一批認定學術期刊。
2017年7月20日，《微生物學通報》第十屆編委會第一次會議在河北省保定市河北大學舉行。
辦刊條件
資源平台
•主辦單位
中國科學院微生物研究所成立於1958年12月3日，其前身是中國科學院套用真菌研究所和中國科學院北京微生物研究室，是綜合性微生物學研究和微生物技術研發機構。截止到2017年底，全所在編職工477人，其中中國科學院院士6名，國家傑出青年基金獲得者12名。據2018年5月研究所官網顯示，微生物研究所設有2個一級學科、5個二級學科專業博士、碩士學位研究生培養點，設有生物工程領域專業碩士學位研究生培養點、3個二級學科專業博士後流動站；設有3個國家重點實驗室、2箇中國科學院重點實驗室；擁有亞洲最大的、近52萬號標本的菌物標本館和中國國內最大的、保藏了近6.1萬株菌的中國普通微生物菌種保藏管理中心，圖書館藏書（刊）5萬餘冊。
中國微生物學會是由全國微生物學科技工作者和單位自願組成、中華人民共和國民政部依法登記的全國性、學術性、公益性法人社會團體成立於1952年12月18日。據2018年5月學會官網顯示，學會有會員近1.6萬人、設21個專業委員會和5個工作委員會。
欄目方向
《微生物學通報》刊登內容涉及工業、環境、農業、食品、獸醫、藥物、醫學微生物學，微生物蛋白質組學、功能基因組、工程與藥物、技術成果產業化研究，以及微生物學教學研究改革等諸多領域。
《微生物學通報》設定的欄目有：研究報告、研究快報、簡報、專論與綜述、生物實驗室、高校教改縱橫、名課講堂、主編點評、顯微世界以及企業高科技信息與新產品介紹、專題專欄、專家論壇、書訊、會訊等。
《微生物學通報》的讀者主要來自科研院所、大專院校、醫院、衛生防疫（檢疫監察部門）、生物工程公司、環境保護、企業廠礦等單位。發行範圍涵蓋教育、科研、工業、農業、醫藥、環境、食品保健等領域。
人員編制
據2018年5月《微生物學通報》官網顯示，《微生物學通報》第十屆編委會擁有6位常務編委、40位編委。
| 姓名 | 所在單位 | 職稱 |
| 丁家波 | 中國獸醫藥品監察所 | 研究員 |
| 李震 | 上海市農業科學院畜牧獸醫研究所 | 研究員 |
| 劉巍峰 | 山東大學 | 教授 |
| 孫萬儒 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 |
| 張建中 | 中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所 | 研究員 |
| 朱陽 | 荷蘭瓦赫寧根大學 | 資深研究員 |
| 姓名 | 所在單位 | 職稱 |
| 陳雯莉 | 華中農業大學生命科學技術學院 | 教授 |
| 陳義華 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 |
| 陳中元 | 中國科學院水生生物研究所 | 副研究員 |
| 董金皋 | 河北農業大學生命科學學院 | 教授 |
| 韓黎 | 軍事醫學科學院疾病預防控制所 | 副研究員 |
| 韓雪琳 | 解放軍軍事醫學科學院疾病預防控制所 | 副研究員 |
| 何秀萍 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 |
| 賀紀正 | 中國科學院生態環境研究中心 | 研究員 |
| 黃志勇 | 中國科學院天津工業生物技術研究所 | 研究員 |
| 姜怡 | 雲南大學 | 副研究員 |
| 李俊 | 中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所 | 研究員 |
| 李明春 | 南開大學 | 教授 |
| 李文利 | 中國海洋大學醫藥學院 | 教授 |
| 林雙君 | 上海交通大學 | 教授 |
| 劉潤進 | 青島農業大學 | 教授 |
| 劉志培 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 |
| 呂鎮梅 | 浙江大學 | 教授 |
| 歐竑宇 | 上海交通大學生命科學技術學院 | 教授 |
| 宋淵 | 中國農業大學生物學院 | 教授 |
| 孫國萍 | 廣東省微生物研究所 | 研究員 |
| 譚天偉 | 北京化工大學 | 院士 |
| 唐鴻志 | 上海交通大學 | 教授 |
| 唐曉峰 | 武漢大學生命科學學院 | 教授 |
| 王琳淇 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 |
| 王志偉 | 南京農業大學 | 教授 |
| 夏立秋 | 湖南師範大學生命科學院 | 教授 |
| 許玫英 | 廣東省微生物研究所 | 研究員 |
| 許學偉 | 國家海洋局第二海洋研究所 | 研究員 |
| 楊柳燕 | 南京大學 | 教授 |
| 楊素萍 | 華僑大學 | 教授 |
| 楊雲鋒 | 清華大學 | 教授 |
| 餘利岩 | 中國醫學科學院醫藥生物技術研究所 | 研究員 |
| 張柏林 | 北京林業大學 | 教授 |
| 張博潤 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 |
| 張利平 | 河北大學 | 研究員 |
| 張奇亞 | 中國科學院水生生物研究所 | 研究員 |
| 張曉君 | 上海交通大學 | 副教授 |
| 張永明 | 上海師範大學 | 教授 |
| 趙百鎖 | 中國農業科學院研究生院 | 副研究員 |
| 諸葛斌 | 江南大學生物工程學院 | 教授 |
辦刊成果
研究發表
據2018年5月20日中國知網顯示，《微生物學通報》共出版文獻8915篇。
據2018年5月20日萬方數據知識服務平台顯示，《微生物學通報》共載文4943篇。
收錄情況
《微生物學通報》被CA化學文摘（美）（2014）收錄，是CSCD中國科學引文資料庫來源期刊（2017-2018年度）（含擴展版）、北京大學《中文核心期刊要目總覽》來源期刊（1992年（第一版）、1996年（第二版）、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）。
影響因子
據2018年5月20日中國知網顯示，《微生物學通報》總被下載1857309次、總被引次數82325次，（2017版）複合影響因子為1.336、（2017版）綜合影響因子為0.933。
據2018年5月20日萬方數據知識服務平台顯示，《微生物學通報》被引量為46533、下載量為133223；據2015年中國期刊引證報告（擴刊版）數據顯示，《微生物學通報》影響因子為1.052，在全部統計源期刊（6735種）中排第945名，在生物科學（93種）中排第14名。
榮譽表彰
據中國科學技術信息研究所信息統計，《微生物學通報》2012、2013、2014、2015、2016年以國內“微生物、病毒學類”期刊中綜合評價總分第一名而連續獲得“百種中國傑出學術期刊獎”，併入選300種“中國精品科技期刊”，成為“中國精品科技期刊頂尖學術論文（F5000）”項目來源期刊。
2014-2016年，《微生物學通報》進入中國科學院期刊排行榜。
2015年，《微生物學通報》獲得中國科協精品科技期刊工程項目資助。
2017年10月，中國科學技術信息研究所發布了《2017年版中國科技期刊引證報告（核心版）》，《微生物學通報》榮獲“2016年百種中國傑出學術期刊”獎項，這是《微生物學通報》連續5年獲該獎項。
文化傳統
形象標識
刊名辦刊理念
《微生物學通報》為微生物學及相關領域學者專家提供學術成果、高新技術及教改經驗交流的平台，同時讓作者和讀者享受到高效認真、熱情周到的服務。
期刊領導
現任領導
| 職務 | 姓名 | 所在單位 | 職稱 |
| 主編 | 赫榮喬 | 中國科學院生物物理研究所 | 研究員 |
| 副主編 | 陳向東 | 武漢大學生命科學學院 | 教授 |
| 陳曉英 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 | |
| 東秀珠 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 | |
| 范黎 | 首都師範大學 | 教授 | |
| 金城 | 廣西科學院 | 研究員 | |
| 邱並生 | 中國科學院微生物研究所 | 研究員 | |
| 吳清平 | 廣東省微生物研究所 | 院士 | |
| 肖亞中 | 安徽大學生命科學學院 | 教授 | |
| 閻錫蘊 | 中國科學院生物物理研究所 | 院士 | |
| 周寧一 | 上海交通大學 | 教授 |
歷任領導
| 屆次 | 主編姓名 |
| 第二屆 | 阮繼生 |
| 第八屆 | 赫榮喬 |
| 第九屆 | 赫榮喬 |
