主要職責
根據《中共重慶市委辦公廳重慶市人民政府辦公廳關於巫溪縣人民政府機構改革方案的通知》（渝委辦〔2009〕183號）和《中共巫溪縣委巫溪縣人民政府關於巫溪縣政府機構改革的實施意見》（巫溪委發〔2009〕32號），設立巫溪縣移民局，為縣政府工作部門。一、主要職責
（一）貫徹執行三峽水庫移民法律、法規和方針政策；擬訂三峽工程重慶庫區巫溪縣移民後續工作的實施方案，並組織實施；綜合協調解決移民工作中的重大問題。
（二）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣後續規劃的編制和實施工作。
（三）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣移民搬遷安置工作，編制移民安置實施計畫，檢查鄉鎮移民年度計畫和項目投資計畫執行情況，審核和監管項目使用計畫，安排和管理移民資金和物資，處理移民搬遷安置規劃中的遺留問題；組織協調移民外遷、對口支援和經濟合作等工作；承擔移民概算資金中安排環境保護和高切坡治理資金的管理工作。
（四）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣移民後期發展扶持工作，編制規劃並組織實施，使用和管理三峽庫區基金，審核和監管重大扶持和發展項目。
（五）負責三峽水庫重慶庫區巫溪縣段綜合管理工作。
（六）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣移民信訪工作，協助鄉鎮做好移民穩定工作。
（七）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣移民就業培訓工作。
（八）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣移民宣傳工作，組織協調對外宣傳。
（九）負責三峽工程重慶庫區巫溪縣移民資金使用的監督檢查，會同有關部門對移民工程質量進行監督檢查。
（十）承辦縣政府交辦的其他事項。
內設機構
根據上述職責，巫溪縣移民局設3個內設機構。（一）辦公室（對口支援培訓就業科）
負責文電、會務、機要、檔案、財務等機關日常運轉工作；負責機關日常工作的協調和督查；承擔機關信息、統計、安全、保密、制度建設及年度目標考核工作；承擔移民行管費的監管工作；承擔移民資金撥付及使用監督工作；承擔移民資金財務專項檢查工作；負責內部審計工作；負責移民統計系統計算機網路建設和維護工作；負責機關的機構編制、幹部、組織、人事和退休幹部的管理工作；負責機關的普法教育等工作。
負責與對口支援省市協商每年無償援助的對口支援項目資金工作；負責對口支援省市支援和經濟合作有關單位的接待和協調工作；負責對口支援項目的監督管理工作。負責移民就業、培訓規劃、年度計畫擬訂和管理工作；負責移民就業、培訓優惠政策的實施工作；承擔移民勞動力轉移就業工作；調研和協調移民就業、培訓中的重大問題。
（二）規劃發展扶持科
負責三峽工程移民年度計畫的申報和審批工作；負責移民資金價差的測算工作；負責移民計畫的管理工作；處理移民搬遷安置規劃中的遺留問題；負責移民安置規劃概算調整和新增投資項目的規劃管理；承擔移民項目的申報工作；負責移民安置區的項目管理工作；負責三峽工程移民後續規劃及後期扶持規劃的編制工作並組織實施；負責三峽工程移民後期扶持的資格審查和計畫工作；負責移民困難扶助工作；承擔三峽庫區基金的使用管理工作；負責移民重大扶持項目審核和監管工作；參與三峽庫區產業發展基金的使用監管和移民重點人群的社會保障工作。
（三）三峽水庫綜合管理科
負責三峽水庫巫溪庫段綜合管理規劃和年度計畫的編制和實施工作；負責三峽水庫管理制度建設；負責水庫消落區的管理和水庫資源開發利用及保護治理情況的監督檢查工作；承擔生態屏障區建設規劃的實施工作；負責對移民信訪工作的調查研究和鄉鎮業務指導；負責移民來信、來訪的政策解釋和處置工作；協助鄉鎮做好移民穩定工作。
