劇情簡介
華陀(林文龍飾)自幼聰慧過人，醉心醫學，在因緣際遇下拜名醫張仲景為師，一次關雲長(尹陽明飾)帶同鄉求醫，華陀發現此人的症狀有異，不是普通傷寒故將傷寒論與滋陰論結合，成功研究出治療瘟疫之法，藉百姓迷信鬼神之說，加上小人得志，對華陀諸多加害，使其惹上殺身之禍，時張仲景之長女張妙心(伍詠薇飾)與華陀兩情相悅，決心下嫁並隨夫逃亡。
華陀移居許昌後行醫，不論病得多重的人也全力拯救，結果往往失敗，被評為‘醫死人大夫’生活每況愈下，而後華陀替曹操(黃日華飾)的幼兒醫好多年頑疾，得曹操賞識封為太醫院監，著手撰寫醫學大全，不過好景不常，曹操的奸雄本色漸露，命華陀製毒藥殺害關羽之士兵，華陀不恥曹操所為，因而投靠關羽，又因曹操偏頭痛病發作，老羞成怒，以斬殺太醫院內三百餘人作為要脅，逼迫華陀返回許昌治病，華陀此行兇多吉少，莫非這就是命運的安排？
分集劇情
第1集
東漢末年，各地瘟疫蔓延，大夫芝與家人前往涿州城避難。芝與子佗在街頭行醫，名醫景用紅線替一未婚女子把脈，佗對景十分仰慕。佗因芝不肯將醫術傳授，遂決拜景為師。關羽的鄉里林被神棍普所騙，關找普理論，卻反被押入天牢。另邊廂，佗知景大女兒妙乃其未婚妻，但妙對佗並無好感，佗乘機要脅要她引薦己給景為徒。普被關打至重傷，被佗所救，佗對關承諾替林治病以換普性命。佗過了景三關，終得入景門下。佗醫治林時，發現一場大瘟疫正急速地散播開來。
第2集
佗擅闖景書房偷看醫書，景氣得要縣官鎖他入天牢，時關到來不見佗，唯有強拉景幫林治病。景替林把脈時，知佗所言非虛，遂連夜出走，卻被妙悉穿，妙更到天牢將佗保釋。芝說出若"滋陰論"加上"傷寒論"，或可找到醫治疫症之法。醫廬內，官限景兩天內要將其父治好，景見其父染上瘟疫，大感頭痛，剛巧佗前來要景傳授"傷寒論"，景遂順水推舟，答應佗要求，但是要他研究出醫治疫症之法。一陣鑼鼓聲從佗房間傳來，眾人均以為佗已找出醫治之法。
第3集
景二女兒蘭及三女兒蕙替佗找來兩頭豬作試驗，回來時卻不見佗蹤影。官父病發身亡，景遷怒於佗身上，妙卻認為佗不是背信棄義之人。景擔心官會報復，竟受普的唆擺，二人合演瘟神報夢鬧劇，令眾村民以為捐獻錢財，便可令瘟神停止瘟疫。佗得芝之助，與妙及關等人前往找"官材鞠"作治病藥引，經一番努力下，終將林之瘟疫治好。當佗得知景與普之惡行後，遂與關等人合力製造一場好戲，待普自揭瘟神騙局。
第4集
普以為自己染上瘟疫，於是將騙來之錢財退回給村民，望佗肯給他醫治。景因生意淡泊，決定舉家遷往洛陽發展。另外，芝亦希望佗到洛陽考入太醫院，更向佗說出當年曹操救他一命事跡。景及芝等人同在許昌落腳，景世交伍招待景一家，還對妙十分傾慕。妙要佗寫情信給她，佗在家閉關多日鑽研，而伍亦對妙展開強烈追求。佗多日不見，妙擔心前往探望，卻見佗埋首書寫情信，但內容卻似一條藥方，普更拿給眾人觀看，妙雖感尷尬，卻亦覺心甜。
第5集
妙勸佗到景醫蘆內打工，為二人美好將來鋪路。佗替景送藥時，行經太醫院門外，情不自禁下混了進去，期間卻被人誤認為刺客，幸操深明大意，放佗離去，佗離去時見操似有隱疾。佗在街上重遇操，並稱可醫治其隱疾，操卻一笑置之。佗自覺在醫蘆內欠缺發展，決定離去，妙不惜向伍借銀兩給佗自立門戶，惜佗經常贈醫施藥，令經濟陷入窘境，後景更到醫蘆內要佗歸還銀兩，佗才明白妙所受之委屈。
