國內大事
1999年6月6日，《華南國防醫學雜誌》第一次編委會在廣州軍區醫學高等專科學校召開。會議由雜誌副主編、廣州軍區聯勤部衛生部易仲才副部長主持。雜誌主編廣州軍區聯勤部衛生部江建榮部長作了重要講話。廣州軍區政治部宣傳部陳光義秘書做了相關發言。
1999年6月6日，在安徽省農業環境保護監測站的積極推動下，《安徽省農業生態環境保護條例》經安徽省九屆人大常務委員會第十次會議審議通過，1999年8月1日起正式頒布實施。
1999年6月6日，北京華大基因研究中心正式成立，並簽約入駐空港工業區。
小小鳥打工互助熱線創始人魏偉1999年6月6日，第四屆“全國愛眼日”主題為“保護老年人視力，提高生活質量”。
1999年6月6日，經福州市工商管理局核准成立，“田野（福建）園林景觀工程有限公司”為有限責任公司。
1999年6月6日，“小小鳥打工互助熱線”在北京誕生了。
1999年6月6日，山東省第一家地方性股份制商業銀行——濟南市城市合作銀行正式掛牌開業。
1999年6月6日，國家社會綜合發展試驗區管理辦公室副主任宋征率有關專家，考察了湖北省武漢市江岸區可持續發展的有關項目。
1999年6月6日，洞庭湖大橋11號墩主塔封頂。
1999年6月6日，林立權老師開辦了溫州市龍灣區第一所專業“音樂教室”。
1999年6月6日至8日，昆明與清邁市在昆明舉行了締結友好城市關係的簽字儀式。
1999年6月6日，淮安新安國小舉行建校70周年慶祝大會。
1999年6月6日，按吉林省電力有限公司統一部署，由鎮賚供電分公司和鎮賚縣農電局合併成鎮賚縣供電公司。
1999年6月6日，國際人類基因組組織在網上公布了中國加入國際測序組織的註冊，標誌著中國成為繼美、英、日、德、法後第六個加入該組織的國家。中國承擔的人類基因組計畫由華大基因、國家基因組南方中心、北方中心共同承擔並完成。
1999年6月6日，國家日用五金製品監督檢測中心為“非常小器·聖雅倫”頒發有史以來第一張“指甲鉗質量檢測合格證書”。
1999年6月6日，江澤民主席親自出席了在北京舉行的紀念普希金誕辰200周年詩歌音樂會，與中國藝術家和中國觀眾共同欣賞普希金那不朽的詩作。
國際大事
塞雷娜·威廉士1999年6月6日，法網，安娜·庫爾尼科娃與瑞士選手馬丁娜•欣吉斯合作，獲得女子雙打亞軍。
1999年6月6日，在法國網球公開賽上，安德烈·阿加西以3:2（1:6，2:6，6:4，6:3，6:4）的比分戰勝了烏克蘭的安德烈·梅德韋傑夫，獲得冠軍，從而成為男子網球史上第5位獲得過四大滿貫賽事冠軍的選手。
1999年6月6日至6月13日，新加坡現代企業管理協會組織“中國工商考察團”，由第八屆會長鄭來發及前會長郭文龍親自率領，參觀了上海、蘇州、 南京、無錫的多個相關企業和政府單位。
1999年6月6日，在法國網球公開賽上，塞雷娜·威廉士與姐姐維納斯·威廉士搭檔，以2:1（6:3，6:7，8:6）的成績戰勝了欣吉斯和庫爾尼科娃的組合，獲得女子雙打冠軍。
1999年6月6日，旅阿華僑上海同鄉會在阿根廷首都布宜諾斯艾利斯成立，創始人為陳峰和王有餘、錢竺根。會員168人。該會宗旨是，團結上海旅阿華僑，熱愛祖國，熱愛中華民族，努力促進阿根廷與上海兩地政治、經濟、文化等方面的交流。
1999年6月6日至13日，林雪平市市長伊娃•尤埃爾松、國際關係部主任羅蘭•約翰松、以及兩位友好小姐勞塔、黃潔應邀來穗參加了“姐妹城市姐妹情”活動。
1999年6月6日─８日，第29屆美洲國家組織大會在瓜地馬拉首都附近的舊瓜地馬拉城召開，該組織35個成員國的外長或代表出席了會議。與會代表在會議上就掃毒和國際金融危機等重大問題達成了共識，一致表示支持在美洲國家組織範圍內建立多邊掃毒評估機制。
