經過
當天的5390航班由正機長添·蘭開斯特（Tim Lancaster）及副機長艾奇森（Alastair Atchison）負責。飛機機型是英國航太生產的BAC-111，機身編號G-BJRT。於當地時間早上7時20分起飛，載著81名乘客及連駕駛員在內共6名機組人員。飛機起飛程式由艾奇森負責，直至飛機爬升至設定高度，才轉由機長蘭開斯特負責往後航段。兩位機長於飛機到達指定高度後，都鬆開了安全帶。7時33分，機組員準備用餐，當時飛機已爬升至17,300呎的高度，位置於牛津郡迪考特市（Didcot）上空。突然，駕駛室發出巨響，機身立即在高空失壓。當時，位於駕駛室左方，即正機長位置的擋風玻璃脫落，蘭開斯特立即被氣流從座位扯出駕駛室外，腳部被纏在控制盤上，這令他的上半身都在機外，只有雙腿仍在駕駛室內。駕駛室門亦被無線電等儀器衝破，客艙內包括紙等雜物全被湧進駕駛室中。這時，飛機的高度急劇下降，客艙內一片恐慌。空中服務員柯登（Nigel Ogden）立即上前摟著蘭開斯特的腳踝。另一位空服員佩絲（Susan Price）及其他空服員則負責安慰受驚的乘客，並收拾凌亂的機艙。同一時間，蘭開斯特在機艙外面對著冰冷低溫、稀薄的空氣及時速每小時500公里的衝擊下，明顯已失去意識。
傷者
蘭開斯特被送往南安普敦綜合醫院（Southampton General Hospital），他的身體多處受傷。包括凍傷、割傷，及撞擊引致身體多處骨折。負責摟著蘭開斯特的空服員柯登則被輕微割傷及手臂被擊傷。至於機上其他人則沒有受傷。事故發生後不足半年，蘭開斯特繼續工作。後來他到了英航退休年齡而離開英航。現時，他在另一間英國航空公司易捷航空（EasyJet）服務。
調查
調查員發現，該飛機於出事前27小時曾被更換擋風玻璃，而且被維修部通過。可是，90顆安在擋風玻璃的螺絲釘中的84顆的直徑有0.026英寸（1毫米），都比標準的為小；而其餘的6顆的長度是0.1英寸（3毫米），則比標準的短。調查員透露，早前被更換了的擋風玻璃已經被安裝上了不合規格的螺絲釘，當時的維修部門以“儘量相似”為準則，而沒有參考飛機的維修檔案。當機艙內及機外的氣壓有異，擋風玻璃最終承受不了這股氣壓而導致爆炸性減壓。這次事件也令人關注到飛機擋風玻璃的設計瑕疵，是否應該安裝更大的螺絲釘以抵受強大的氣壓。調查員批評英航位於伯明罕國際機場的維修部門，因為他們沒有按照英航的維修程式，並使用了不合規格的零件。同時，他們也發現英航的維修程式亦存在缺點：飛機維修完畢後，他們沒有一個獨立部門負責檢驗及確認。最後，調查局亦譴責伯明罕國際機場管理層，並沒有好好監督維修部門的工作手法。
