生髮中心微環境中進入中央母細胞階段的活化B細胞， 重鏈和輕鏈的V區基因可發生高頻率的點突變，稱為體細胞高頻突變(somatic hypermutation)或體細胞超突變。突變後產生的各種B細胞克隆，BCR親和力各不相同。然後在中央細胞階段，經過FDC捕獲抗原的選擇，使表達高親和力的B細胞免於凋亡。其總體結果是，後代B細胞及其產生的抗體對抗原的平均親和力得到了提升，稱為抗體的親和力成熟(affinity maturation)，使所分泌的抗體可更有效地保護機體免受外來抗原的再次侵襲。
點突變的位置並非完全隨機分布，主要發生於重排後的可變區基因3'和5'端300個左右的鹼基內，其突變頻率較細胞中正常基因突變頻率高100000倍，這樣既能產生最大序列的多樣性，又不會破壞蛋白質的結構。突變後有些Ig分子的親和力會遠高於原先的分子。抗體親和力成熟(antibody affinity maturation)就是在生髮中心中B細胞發生高頻突變，並經抗原選擇的結果。
總之，體細胞高頻突變有以下特點：
①出現於已發生基因重排的成熟B細胞；
②突變頻率特別高；
③有突變熱點位置，且不局限於CDR；
④主要發生於二次免疫應答，但B細胞向漿細胞分化完成後突變即停止發生；
⑤為T細胞依賴性，只針對TD抗原誘導的免疫應答。
