水生箱龜許多的文獻中指出馬來箱龜生活在熱帶雨林中，其實這資訊並不完整，應是生活在雨林中的沼澤或是沿岸的湖泊，且棲息在河流中的較少，雖然馬來箱龜屬於高度親水的龜種，但其實泳技比起澤龜來說，仍差了一截，所以常棲息於流動較緩慢的湖泊沼澤。平時馬來箱龜大多棲息於水中，並藏匿在水草中或是埋在河底的泥中，因此容易在岸邊的一些挺水性植物叢中發現其蹤跡，並較少到過深的水裡(2m)，也少上岸，上岸時大多是為了曬太陽或是覓食。
對馬來箱龜而言，要先考慮到飼養澤龜水質維護的問題，不過馬來箱龜棲地的氣溫都相當高，所以容易因氣溫驟降或長時間在低於20度的氣溫(水溫)下而感染到肺炎，為避免龜因此生病或死亡，筆者建議在平均氣溫超過24度的季節放養在室外，而冬季或秋季要收進室內給予加溫．．．．．
作為寵物的馬來箱龜多是從市場中挑選出來較完整的個體，不過僅是外觀完整，但仍需飼主自行分辨健康與否。在判斷上，筆者會觀察龜是否有皮膚或四肢的外傷，腹甲或背甲有無爛殼的跡象(通常腹甲較多出現爛殼)，以及是否有脫水的徵兆、龜是否一直緊閉著眼睛以及腳趾甲有無脫落，若是脫落則需要注意腳趾及蹼是否有爛爛的或嚴重的皮屑現象，此症狀可能是細菌感染，最後再投少量飼料觀察龜是否有進食，其實馬來箱龜相當貪吃，只有少數會因緊迫而拒食，通常有拒食的情況都是不健康的個體或是病體。觀察上述外觀症狀後，再將龜放入水中，水要深一點(10公分以上)，觀察龜是否會正常的下沉，通常不會立刻下沉，會漸漸的呼出幾口氣泡後才緩緩下沉，並且不一定會沉到水底，有時會在水面上遊動，只要游泳動作正常，就為正常個體。但如果會不正常的漂浮在水面，像是保利龍物體漂在水面上，就代表這隻龜已經感染了肺炎．．．．．
馬來箱龜