展覽館的各廳堂採用鋼筋混凝土預製牆板和屋面板構成。各個展廳的長寬和高度略有差別，它們首尾相連，錯落有致，合成一個三合院。預製牆板上有凸出的肋條，它們構成簡化了的哥德式教堂的典型尖拱圖形。中世紀歐洲的教會曾是科學研究的發源地，近代美國的高等學府又曾盛行過仿哥德式的建築，因此設計者以這樣的圖樣暗示科學館的展覽內容。
水池在三合院的開口位置，池中布置了曲折的廊道，其上又聳立著5個瘦骨嶙峋的高高的骨架，它們也是哥德式骨架券的仿製物。前來參觀的人首先踏上水池中的“亭”、“廊”、“橋”，然後轉進展廳，依次參觀各廳之後，再經過水池離去。
美國1962年西雅圖世界博覽會建築大都拆除了，但雅馬薩奇設計的這座水院建築群完整保存至今。這座現代建築容易使中國人聯想到中國的一些傳統園林，如北京頤和園中的諧趣園等。
