分類與命名
球藻球藻最早是在1824年被安東·紹特博士在瑞士、奧地利和德國三國交界處的康斯坦茨湖發現的。球藻屬(Aegagropila)在1843年為Kützing所建，模式標本即為球藻(A.linnaei)的球狀集合體。但在1849年，球藻屬被同一作者Kützing轉為剛毛藻屬(Cladophora)下的一個亞屬，所以隨後球藻的學名也被改為Cladophora aegagropila(也做Cl.sauteri)。
綠球藻但是，2002年的DNA研究又將球藻屬恢復為一個獨立的屬。原因球藻屬植物的細胞中含有幾丁質，而綱毛藻屬植物沒有。故球藻的學名又恢復為Aegagropila linnaei。
而最近日本的DNA研究發現了新的亞種，立山球藻(タテヤママリモ，Aegagropila linnaei sp.)，但尚未正式發表，故學名尚未確定。
日語
在日語中，毬藻被稱作マリモ(漢字：毬藻，拼音：marimo)。命名者是札幌農學校(現今的北海道大學)的川上瀧彌。他根據在阿寒湖的尻駒別灣發現的球狀集合體，於1898年(明治31年)定其名為マリモ。(まり是球，通常為橡皮製。も泛指所有水生植物及藻類)
愛奴語
北海道的原住民愛奴人將毬藻稱為 tōrasanpe (沼澤中的肝臟、心臟) 和 tōkarippu (沼澤中的球)。
冰島語
在冰島，毬藻被當地漁民稱為kúluskítur。(kúla = 球，skítur = 任何會被捲入漁網的水生植物)
生長形態
球藻冰島瑪花頓湖(Lake Mývatn)球藻群落的斷面
球藻有三種生長形態。
1. 生活在岩石上的個體，通常生活在岩石的背光面。
2. 在水中自由漂浮的絲狀個體，通常會集合成一簇，在湖泊泥濘的底部形成一片綠色的絨毯狀
3. 球狀集合體，絲狀的綠藻個體從中心輻射狀往外生長，形成大小不等的球體。
