即將進入船塢內部的潛艇負責此項系統工程的部門是德國海軍建設部(Marinebauwesens)。這個部門曾負責建造位於黑爾戈蘭的大規模海軍基地防禦工事,從中得到的一些有益經驗就用在了1941年占領法國後得到的部分港口工事的建造中。具體的工程施工則延續了第一次世界大戰期間德國海軍在布魯日建造潛艇基地時確立的設計方案和施工體系。
由士兵把守的一個位於洛里昂的潛艇洞庫在整個工程中,不少德國公司都涉足其中,包括西門子-鮑爾聯合公司在內的幾家公司承包了混凝土工程,電力設施的施工則由西門子-舒克公司負責,機械生產的任務則由著名的MAN公司承包,該公司為工程提供用於碼頭和船塢所用的混凝土澆灌機械。此外還有一些小的項目交給了工程所在地的相關公司。
工程的選址一般遵循以下原則:儘量在當地原有的海軍碼頭上建造,如法國的布累斯特和洛里昂,這些地點受潮汐的影響,水深符合要求。另外還有一些不受潮汐影響的海軍碼頭,如法國的聖·納塞爾、波爾多等地,一些潛艇洞庫也在民用港口施工建造。所有這些施工工地都有嚴格的出入限制。
位於挪威的一個正在建造的潛艇洞庫除了為潛艇提供碼頭和庇護所以外,潛艇洞庫還建有修理車間、發電站、泵站、倉庫、辦公室和宿舍、通風和取暖裝置、電話和通信站等等設施。出於安全考慮,象魚雷這樣的軍火彈藥則儲藏在潛艇洞庫之外的加固工事內,需要的時候可迅速運到船塢碼頭裝卸。
位於波爾多的一個正在建造的潛艇洞庫基地
一艘正在乾船塢內修理的IX型潛艇