方理存1926年投身農民運動，次年任平陽縣農民協會委員和白沙農（鹽）民協會副會長，積極進行反對土豪劣紳、減租減息、糧食平糶鬥爭。1928年中共平陽縣委成立，他獻出200元積蓄作經費，同年冬加入中國共產黨。1933年，重組農會投入鬥爭，次年春被捕，後保釋。1937年，因反抗宜山壯丁隊亂抓人，發動村人與之搏鬥，又被捕。9月，閩浙邊臨時省委與國民黨和平談判達成協定，始出獄。次年任中共繆家橋支部書記。1948年1月，平陽縣委派員到對口開展工作，擊斃國民黨便衣隊員1人，對口等地遭到國民黨摧殘，方理存又被捕。2月，在鳴山就義，年76歲 。
