命名的規則
由於許多星座中最明亮的恆星都被選定為α星，使許多人錯誤的認為拜耳是以恆星的亮度來排順序。但是，在當時還沒有辦法精確測量恆星的亮度，傳統上只能將恆星分為六級，在同一級內並沒有相對的亮度順序。拜耳也只是先列出一等星，然後是二等星。通常的做法是大致上依循亮度由頭至腳（或尾）來排列（例如在大熊座的北斗七星）。
由上而下法獵戶座是拜耳命名法的一個好例子，（請記住數值越小的恆星越明亮，2等星精確的亮度是在1.51至2.50之間。）拜耳先為最亮的兩顆1等星命名，參宿七和參宿四，肩上的參宿四(Betelgeuse)是α星，膝蓋上的參宿七(Rigel)是β星，而後者是比較亮的。
先來後到法先在東方升起的先命名也是拜耳採用的一種方法，北河二（雙子座α）和北河三（雙子座β）就是一個例子。雖然同屬雙子座的北河三比北河二明亮，但因為北河二先在東邊升起，所以是雙子座的α星。
拜耳也許熟知西方的歷史或神話故事，因為在這些歷史和神話中，北河二總是在北河三之前被提及，或許這也是讓拜耳如此命名的原因之一。
在天龍座中最明亮的恆星是天棓四（天龍座γ），但是右樞卻是天龍座的α星，因為右樞在是歷史上曾是4,000年前的北極星。幾乎在歷史上曾是北極星的，包括織女星，都被拜耳選做所在星座的α星。
有時的確沒有明顯的順序，舉例來說，在天秤座和人馬座，拜耳都是隨機的分配了恆星的名稱。但希臘字母在字母表上的順序，在上古時代曾用於表示連續的整數，這也許就是拜耳系統會被視為數值系統的原因。
所以，字母α總是被命名給星座內最明亮的恆星，而且經常有些例外，有些恆星已經不在原先的星座內（根據現代星座界限）。無論如何，這套命名法在今天依然被廣泛的使用著。
被重複命名的恆星
有兩顆非常靠近星座邊界的恆星被重複的命名：
五車五：金牛座β，也是御夫座γ。
壁宿二：仙女座α，也是飛馬座δ。
另一顆恆星折威七：天秤座σ，也被重複命名為天蠍座γ。可是他並不在天蠍座和天秤座的邊界上，而是很明確的在天秤座之內
表示法
在英文，拜耳命名法通常有兩種呈現的方式：完整的表示或簡潔的表示，但在中文中就沒有差別了，採用完整的星座名稱和字母的組合（中間不留空格），而且在引用英文時時都會採用簡潔的表示法。
完整的表示在英文中以完整的星座名稱和小寫字母希臘字母組合，例如天狼星是Alpha Canis Majoris（大犬座α），大陵五是Beta Persei（英仙座β）。
簡潔的表示簡潔的表視則是以希臘小寫字母與星座名稱的三個字母縮寫來顯示，例如前述的天狼星是α CMa，大陵五是β Per。在早期，還曾以4個字母的縮寫(比如α CMaj)來呈現，但現在已經很少用了。
進階的用法
雖然在拜耳系統中最常用的是小寫的希臘字母，但還是要提一下系統延伸的部分：在24個小寫的希臘之後，先使用小寫的拉丁字母，然後才使用大寫的拉丁字母。這些字母都很少被用到，但有個例外就是英仙座 h（實際上是個星團）和天鵝座 P。還要注意的是在拜耳的命名法中沒有Q之後的字母，像是天兔座 R和大熊座 W都是變星的命名，不是拜耳命名的。
進一步的複雜性是出現在同一個拜耳字母上的上標數字。通常這是代表雙星（主要是光學的雙星而不是真實的聯星），但也是有例外的情形。像是一串的獵戶座π1、π2、π3、π4、π5和π6，則是多顆恆星在一起的聚星。
