別爾扎林上將偉大衛國戰爭開始後,別爾扎林擔任波羅的海沿岸特別軍區第27集團軍司令。後任西北方面軍第34集團軍司令,在西方面軍、加里寧方面軍和波羅的海沿岸第1方面軍內,分別任第61集團軍副司令、第20集團軍副司令和第39集團軍司令。1944年5月起任突擊第5集團軍司令,參加了蘇軍的雅西—基什尼奧夫戰役、維斯瓦河—奧得河戰役和柏林戰役。1945年4月6日被授予“蘇聯英雄”稱號。
在攻打柏林時,別爾扎林指揮的突擊第5集團軍擔負攻占包括希特勒大本營所在地-帝國辦公廳在內的市中心政府街區這一重要任務。由於他的出色表現,使該戰役進展十分順利。1945年4月24日,他被統帥部授予上將軍銜,並被任命為蘇聯第一任柏林城防司令兼柏林蘇聯衛戍部隊司令。4月28日,他簽署和頒布了關於柏林的全部權力移歸蘇聯城防司令部的第1號命令。同時他領導城防司令部在複雜情況下,開始解決建立城市正常生活秩序的困難任務。正當此項工作緊張進行時,他不幸於6月16日以身殉職,年僅41歲。遺體被運往莫斯科,葬於新聖母公墓。在27年的戎馬生涯中,他功勳卓著,是一位傑出的指揮將才。曾先後獲得列寧勳章2枚,紅旗勳章2枚,一級蘇沃洛夫勳章、一級庫圖佐夫勳章、一級波格丹·赫梅利尼茨基勳章、二級蘇沃洛夫勳章和紅星勳章各1枚,獎章多枚。
